Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS22490

Experiment: Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Atlantic
4,861,424	+		DZA65_RS22480	0.22	-1.6
4,861,424	+		DZA65_RS22480	0.22	-1.8
4,861,424	+		DZA65_RS22480	0.22	+1.3
4,861,424	+		DZA65_RS22480	0.22	+0.5
4,861,469	+		DZA65_RS22480	0.33	-1.5
4,861,469	+		DZA65_RS22480	0.33	+0.1
4,861,469	+		DZA65_RS22480	0.33	-0.3
4,861,469	+		DZA65_RS22480	0.33	+1.1
4,861,469	+		DZA65_RS22480	0.33	-0.8
4,861,469	+		DZA65_RS22480	0.33	-0.9
4,861,470	-		DZA65_RS22480	0.33	+0.1
4,861,470	-		DZA65_RS22480	0.33	-0.4
4,861,470	-		DZA65_RS22480	0.33	+0.5
4,861,470	-		DZA65_RS22480	0.33	-0.2
4,861,470	-		DZA65_RS22480	0.33	-2.3
4,861,470	-		DZA65_RS22480	0.33	-0.6
4,861,505	+		DZA65_RS22480	0.41	-1.1
4,861,506	-		DZA65_RS22480	0.41	-1.9
4,861,506	-		DZA65_RS22480	0.41	+1.1
4,861,526	-		DZA65_RS22480	0.46	-1.1
4,861,538	+		DZA65_RS22480	0.49	-0.3
4,861,556	+		DZA65_RS22480	0.53	-0.4
4,861,557	-		DZA65_RS22480	0.53	+0.6
4,861,557	-		DZA65_RS22480	0.53	-1.0
4,861,557	-		DZA65_RS22480	0.53	+0.3
4,861,557	-		DZA65_RS22480	0.53	+0.6
4,861,557	-		DZA65_RS22480	0.53	-0.3
4,861,557	-		DZA65_RS22480	0.53	+0.5
4,861,664	+		DZA65_RS22480	0.78	-0.5
4,861,664	+		DZA65_RS22480	0.78	+2.0
4,861,664	+		DZA65_RS22480	0.78	+1.3
4,861,665	-		DZA65_RS22480	0.79	+0.6
4,861,787	+				-0.1
4,861,787	+				+0.2
4,861,787	+				+0.2
4,861,787	+				+0.3
4,861,787	+				+0.0
4,861,787	+				+1.1
4,861,788	-				+1.3
4,861,788	-				-0.2
4,861,788	-				-1.3
4,861,788	-				-0.1
4,861,788	-				-2.0
4,861,788	-				+0.5
4,861,788	-				-1.9
4,861,795	-				+0.4
4,861,843	-				+1.1
4,861,917	+		DZA65_RS22485	0.22	+0.7
4,861,918	-		DZA65_RS22485	0.22	+0.4
4,861,918	-		DZA65_RS22485	0.22	+0.5
4,862,034	+		DZA65_RS22485	0.41	-0.1
4,862,034	+		DZA65_RS22485	0.41	-2.2
4,862,034	+		DZA65_RS22485	0.41	+1.0
4,862,035	-		DZA65_RS22485	0.41	-1.5
4,862,035	-		DZA65_RS22485	0.41	-0.5
4,862,035	-		DZA65_RS22485	0.41	+0.1
4,862,035	-		DZA65_RS22485	0.41	+0.1
4,862,069	+				-0.9
4,862,069	+		DZA65_RS22485	0.47	+0.2
4,862,069	+		DZA65_RS22485	0.47	+0.1
4,862,069	+		DZA65_RS22485	0.47	-0.0
4,862,208	-		DZA65_RS22485	0.70	-0.8
4,862,310	+		DZA65_RS22485	0.87	+0.6
4,862,340	+				+1.6
4,862,340	+				+1.5
4,862,340	+				+0.6
4,862,340	+				-0.8
4,862,341	-				+1.4
4,862,341	-				+0.9
4,862,341	-				+0.3
4,862,341	-				-0.6
4,862,341	-				-0.5
4,862,343	+				+2.0
4,862,343	+				+1.9
4,862,343	+				+0.6
4,862,344	-				+0.0
4,862,344	-				+0.4
4,862,344	-				-1.2
4,862,457	+				+0.5
4,862,457	+				-2.0
4,862,551	+				-0.7
4,862,552	-				+1.1
4,862,552	-				-1.3
4,862,552	-				-0.6
4,862,552	-				+0.0
4,862,552	-				+0.1
4,862,552	-				+0.4
4,862,811	-		DZA65_RS22490	0.19	-0.4
4,862,811	-		DZA65_RS22490	0.19	-3.5
4,862,956	+		DZA65_RS22490	0.26	-0.5
4,862,957	-		DZA65_RS22490	0.26	-0.2
4,862,957	-		DZA65_RS22490	0.26	+0.4
4,862,957	-		DZA65_RS22490	0.26	+1.5
4,862,963	+		DZA65_RS22490	0.26	-1.0
4,862,963	+		DZA65_RS22490	0.26	+0.4
4,862,964	-		DZA65_RS22490	0.26	-0.8
4,862,964	-		DZA65_RS22490	0.26	+0.4
4,863,004	+		DZA65_RS22490	0.28	+1.5
4,863,004	+		DZA65_RS22490	0.28	-0.3
4,863,005	-		DZA65_RS22490	0.28	-0.1
4,863,097	+		DZA65_RS22490	0.32	+0.1
4,863,097	+		DZA65_RS22490	0.32	-0.6
4,863,097	+		DZA65_RS22490	0.32	-1.5
4,863,097	+		DZA65_RS22490	0.32	-1.0
4,863,098	-		DZA65_RS22490	0.32	+1.4
4,863,098	-		DZA65_RS22490	0.32	-0.7
4,863,109	+		DZA65_RS22490	0.32	+0.4
4,863,116	+		DZA65_RS22490	0.32	-1.9
4,863,198	+		DZA65_RS22490	0.36	+0.1
4,863,198	+		DZA65_RS22490	0.36	-0.9
4,863,199	-		DZA65_RS22490	0.36	-1.3
4,863,225	+		DZA65_RS22490	0.37	-0.6
4,863,225	+		DZA65_RS22490	0.37	+1.0
4,863,226	-		DZA65_RS22490	0.37	+1.1
4,863,226	-		DZA65_RS22490	0.37	-1.5
4,863,294	+		DZA65_RS22490	0.40	-0.3
4,863,294	+		DZA65_RS22490	0.40	-1.9
4,863,294	+		DZA65_RS22490	0.40	-0.5
4,863,295	-		DZA65_RS22490	0.40	-2.0
4,863,295	-		DZA65_RS22490	0.40	+0.2
4,863,295	-		DZA65_RS22490	0.40	+0.8
4,863,295	-		DZA65_RS22490	0.40	+2.0
4,863,295	-		DZA65_RS22490	0.40	+0.4
4,863,326	-		DZA65_RS22490	0.42	-1.1
4,863,326	-		DZA65_RS22490	0.42	+0.2
4,863,326	-		DZA65_RS22490	0.42	+1.9
4,863,326	-		DZA65_RS22490	0.42	+0.0
4,863,326	-		DZA65_RS22490	0.42	-1.9
4,863,326	-		DZA65_RS22490	0.42	+0.9
4,863,326	-		DZA65_RS22490	0.42	+0.3
4,863,347	+		DZA65_RS22490	0.42	-1.4
4,863,347	+		DZA65_RS22490	0.42	-1.7
4,863,347	+		DZA65_RS22490	0.42	+1.6
4,863,347	+		DZA65_RS22490	0.42	+1.7
4,863,348	-		DZA65_RS22490	0.42	-0.3
4,863,348	-		DZA65_RS22490	0.42	-0.9
4,863,348	-		DZA65_RS22490	0.42	+1.3
4,863,348	-		DZA65_RS22490	0.42	-1.2
4,863,348	-		DZA65_RS22490	0.42	-0.6
4,863,356	+		DZA65_RS22490	0.43	-0.4
4,863,356	+		DZA65_RS22490	0.43	+1.7
4,863,356	+		DZA65_RS22490	0.43	-1.4
4,863,356	+		DZA65_RS22490	0.43	+0.5
4,863,356	+		DZA65_RS22490	0.43	-0.3
4,863,356	+		DZA65_RS22490	0.43	-1.5
4,863,356	+		DZA65_RS22490	0.43	-0.7
4,863,357	-		DZA65_RS22490	0.43	+1.2
4,863,357	-		DZA65_RS22490	0.43	+1.5
4,863,357	-		DZA65_RS22490	0.43	-1.6
4,863,357	-		DZA65_RS22490	0.43	-0.5
4,863,357	-		DZA65_RS22490	0.43	+2.1
4,863,357	-		DZA65_RS22490	0.43	+1.4
4,863,357	-		DZA65_RS22490	0.43	+1.4
4,863,359	+		DZA65_RS22490	0.43	-2.0
4,863,359	+		DZA65_RS22490	0.43	+0.5
4,863,359	+		DZA65_RS22490	0.43	-1.2
4,863,359	+		DZA65_RS22490	0.43	+0.1
4,863,359	+		DZA65_RS22490	0.43	+0.2
4,863,360	-		DZA65_RS22490	0.43	+0.7
4,863,360	-		DZA65_RS22490	0.43	+1.9
4,863,360	-		DZA65_RS22490	0.43	-0.3
4,863,360	-		DZA65_RS22490	0.43	-0.1
4,863,378	+		DZA65_RS22490	0.44	-0.8
4,863,378	+		DZA65_RS22490	0.44	-0.7
4,863,378	+		DZA65_RS22490	0.44	-0.8
4,863,378	+		DZA65_RS22490	0.44	-0.5
4,863,378	+		DZA65_RS22490	0.44	+1.4
4,863,378	+		DZA65_RS22490	0.44	-0.5
4,863,378	+		DZA65_RS22490	0.44	+1.4
4,863,379	-		DZA65_RS22490	0.44	-0.1
4,863,464	+		DZA65_RS22490	0.47	-0.6
4,863,464	+		DZA65_RS22490	0.47	+0.3
4,863,472	+		DZA65_RS22490	0.48	-0.2
4,863,499	-		DZA65_RS22490	0.49	-1.8
4,863,513	+		DZA65_RS22490	0.50	+0.9
4,863,513	+		DZA65_RS22490	0.50	+1.0
4,863,513	+		DZA65_RS22490	0.50	+0.1
4,863,514	-		DZA65_RS22490	0.50	-0.6
4,863,823	+		DZA65_RS22490	0.63	+1.5
4,863,823	+		DZA65_RS22490	0.63	+1.1
4,863,823	+		DZA65_RS22490	0.63	+0.5
4,863,823	+		DZA65_RS22490	0.63	-0.7
4,863,823	+		DZA65_RS22490	0.63	-0.2
4,863,824	-		DZA65_RS22490	0.63	+2.3
4,863,824	-		DZA65_RS22490	0.63	+0.8
4,863,824	-		DZA65_RS22490	0.63	-0.5
4,863,824	-		DZA65_RS22490	0.63	-0.9
4,863,830	+		DZA65_RS22490	0.63	-0.1
4,863,830	+		DZA65_RS22490	0.63	-0.9
4,863,830	+		DZA65_RS22490	0.63	+0.4
4,863,830	+		DZA65_RS22490	0.63	+1.1
4,863,830	+		DZA65_RS22490	0.63	-2.0
4,863,831	-		DZA65_RS22490	0.63	+0.1
4,863,831	-		DZA65_RS22490	0.63	-0.1
4,863,831	-		DZA65_RS22490	0.63	-0.8
4,863,908	+		DZA65_RS22490	0.67	-0.9
4,863,909	-		DZA65_RS22490	0.67	+0.4
4,863,921	-		DZA65_RS22490	0.67	+0.3
4,864,024	+		DZA65_RS22490	0.72	-0.9
4,864,025	-		DZA65_RS22490	0.72	+0.1
4,864,147	-		DZA65_RS22490	0.77	+0.1
4,864,147	-		DZA65_RS22490	0.77	-0.9
4,864,212	+		DZA65_RS22490	0.80	-0.5
4,864,212	+		DZA65_RS22490	0.80	-1.4
4,864,212	+		DZA65_RS22490	0.80	-0.2
4,864,212	+		DZA65_RS22490	0.80	+0.3
4,864,213	-		DZA65_RS22490	0.80	-1.1
4,864,229	-		DZA65_RS22490	0.80	+0.9
4,864,229	-		DZA65_RS22490	0.80	+0.1
4,864,248	+		DZA65_RS22490	0.81	+0.8
4,864,248	+		DZA65_RS22490	0.81	-1.0
4,864,248	+		DZA65_RS22490	0.81	-1.7
4,864,248	+		DZA65_RS22490	0.81	+0.1
4,864,249	-		DZA65_RS22490	0.81	-2.9
4,864,249	-		DZA65_RS22490	0.81	+0.5
4,864,249	-		DZA65_RS22490	0.81	-1.5
4,864,264	+		DZA65_RS22490	0.82	-1.3
4,864,264	+		DZA65_RS22490	0.82	-1.9
4,864,264	+		DZA65_RS22490	0.82	+0.2
4,864,265	-		DZA65_RS22490	0.82	-0.5
4,864,265	-		DZA65_RS22490	0.82	-1.8
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-0.4
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-0.5
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-0.8
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	+0.1
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-2.0
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-1.8
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	+0.4
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-0.7
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	+0.2
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	+0.4
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-0.8
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-0.1
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-0.9
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-0.7
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-1.2
4,864,316	+		DZA65_RS22490	0.84	-0.5
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	-1.3
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	+2.1
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	+0.1
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	-1.2
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	-0.3
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	+1.9
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	+0.7
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	-0.8
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	-0.9
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	-1.9
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	+0.1
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	+0.9
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	+0.8
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	-1.5
4,864,317	-		DZA65_RS22490	0.84	+0.3
4,864,472	+				-0.9
4,864,472	+				-1.0
4,864,472	+				+0.2
4,864,472	+				-1.4
4,864,472	+				+0.1
4,864,473	-				-1.0
4,864,473	-				+0.9
4,864,473	-				+1.0
4,864,473	-				+1.7
4,864,473	-				+0.7
4,864,543	+				+0.4
4,864,543	+				+0.5
4,864,543	+				+1.1
4,864,543	+				+0.2
4,864,543	+				-1.7
4,864,543	+				-1.3
4,864,544	-				+0.3
4,864,544	-				+1.7
4,864,544	-				-0.1
4,864,582	+				+0.1
4,864,582	+				+0.6
4,864,582	+				-0.2
4,864,582	+				+1.1
4,864,582	+				-0.5
4,864,583	-				+0.5
4,864,583	-				+0.1
4,864,583	-				-1.2
4,864,583	-				-0.5
4,864,780	-		DZA65_RS22495	0.17	-2.2
4,864,780	-		DZA65_RS22495	0.17	-0.5
4,864,829	+		DZA65_RS22495	0.25	-1.5
4,864,858	+		DZA65_RS22495	0.30	-1.3
4,864,858	+		DZA65_RS22495	0.30	+1.1
4,864,858	+		DZA65_RS22495	0.30	-0.5
4,864,858	+		DZA65_RS22495	0.30	+0.2
4,864,859	-		DZA65_RS22495	0.31	+1.1
4,864,859	-		DZA65_RS22495	0.31	+0.3
4,864,892	+		DZA65_RS22495	0.36	+2.8
4,864,893	-		DZA65_RS22495	0.36	+1.1
4,864,893	-		DZA65_RS22495	0.36	-0.4
4,864,893	-		DZA65_RS22495	0.36	-1.2
4,864,963	+		DZA65_RS22495	0.49	+1.3
4,864,963	+		DZA65_RS22495	0.49	-0.6
4,864,963	+		DZA65_RS22495	0.49	+0.1
4,864,963	+		DZA65_RS22495	0.49	-0.5
4,864,963	+		DZA65_RS22495	0.49	+0.1
4,864,963	+		DZA65_RS22495	0.49	-1.9
4,864,963	+		DZA65_RS22495	0.49	+1.7
4,864,963	+		DZA65_RS22495	0.49	-0.3
4,864,964	-		DZA65_RS22495	0.49	-1.1
4,864,964	-		DZA65_RS22495	0.49	-2.2
4,864,964	-		DZA65_RS22495	0.49	+0.9
4,864,964	-		DZA65_RS22495	0.49	-0.9
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	+0.9
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	+0.0
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	-0.5
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	-0.8
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	-0.3
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	-0.9
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	+0.4
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	+0.1
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	+1.1
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	-1.2
4,864,979	+		DZA65_RS22495	0.51	+1.5
4,864,980	-		DZA65_RS22495	0.52	-2.7
4,864,980	-		DZA65_RS22495	0.52	+0.5
4,864,980	-		DZA65_RS22495	0.52	+2.2
4,864,980	-		DZA65_RS22495	0.52	-2.3
4,864,980	-		DZA65_RS22495	0.52	-0.3
4,864,980	-		DZA65_RS22495	0.52	-0.3
4,864,980	-		DZA65_RS22495	0.52	+1.4
4,864,983	+		DZA65_RS22495	0.52	+1.1
4,864,983	+		DZA65_RS22495	0.52	+1.1
4,864,983	+		DZA65_RS22495	0.52	+0.3
4,864,983	+		DZA65_RS22495	0.52	+0.3
4,864,983	+		DZA65_RS22495	0.52	+1.0
4,864,984	-		DZA65_RS22495	0.52	-1.7
4,864,984	-		DZA65_RS22495	0.52	+0.5
4,865,177	+		DZA65_RS22495	0.86	-0.3
4,865,178	+		DZA65_RS22495	0.86	+1.4
4,865,178	+		DZA65_RS22495	0.86	-1.5
4,865,179	-		DZA65_RS22495	0.86	-1.7
4,865,179	-		DZA65_RS22495	0.86	-1.5
4,865,179	-		DZA65_RS22495	0.86	+0.4
4,865,179	-		DZA65_RS22495	0.86	-0.9
4,865,179	-		DZA65_RS22495	0.86	+0.1
4,865,179	-		DZA65_RS22495	0.86	+0.5
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	+0.4
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	+1.5
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	-1.5
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	+0.4
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	+1.0
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	-1.1
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	+0.1
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	-0.3
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	-1.7
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	+0.9
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	-1.2
4,865,181	+		DZA65_RS22495	0.87	-0.5
4,865,182	-		DZA65_RS22495	0.87	-1.6
4,865,242	+				-1.9
4,865,242	+				-0.7
4,865,243	-				+0.2
4,865,243	-				-1.2
4,865,243	-				-0.1
4,865,243	-				+1.1
4,865,243	-				-0.9
4,865,254	+				+0.6
4,865,255	-				-2.2
4,865,264	+				-0.7
4,865,264	+				+1.1
4,865,264	+				-1.5
4,865,264	+				-0.1
4,865,264	+				-0.5
4,865,264	+				-0.1
4,865,264	+				+2.4
4,865,264	+				+0.3
4,865,264	+				+0.5
4,865,264	+				-0.4
4,865,264	+				+0.4
4,865,264	+				+1.3
4,865,265	-				-0.1
4,865,265	-				-0.9
4,865,265	-				+0.5
4,865,265	-				-1.9
4,865,265	-				-0.4
4,865,265	-				-2.0
4,865,265	-				-0.5
4,865,265	-				+1.3
4,865,265	-				+1.7
4,865,265	-				-0.6
4,865,265	-				-1.5
4,865,265	-				+0.1
4,865,265	-				-2.0
4,865,265	-				+0.6
4,865,265	-				-1.9
4,865,265	-				+0.1
4,865,265	-				+0.5
4,865,266	+				-1.1
4,865,266	+				+0.0
4,865,266	+				+0.1
4,865,267	-				+0.4
4,865,383	+		DZA65_RS22500	0.11	+1.4
4,865,384	-		DZA65_RS22500	0.11	+1.5
4,865,384	-		DZA65_RS22500	0.11	+0.9
4,865,384	-		DZA65_RS22500	0.11	+1.1
4,865,384	-		DZA65_RS22500	0.11	-0.7
4,865,384	-		DZA65_RS22500	0.11	-0.2
4,865,406	+		DZA65_RS22500	0.13	+1.0
4,865,406	+		DZA65_RS22500	0.13	-1.5
4,865,406	+		DZA65_RS22500	0.13	-1.7
4,865,406	+		DZA65_RS22500	0.13	+0.3
4,865,406	+		DZA65_RS22500	0.13	+0.1
4,865,407	-		DZA65_RS22500	0.13	-1.1
4,865,407	-		DZA65_RS22500	0.13	-1.5
4,865,407	-		DZA65_RS22500	0.13	+0.9
4,865,407	-		DZA65_RS22500	0.13	-1.7
4,865,549	-		DZA65_RS22500	0.25	-0.5
4,865,615	+		DZA65_RS22500	0.31	-1.3
4,865,615	+		DZA65_RS22500	0.31	+0.5
4,865,615	+		DZA65_RS22500	0.31	+0.2
4,865,615	+		DZA65_RS22500	0.31	-2.0
4,865,616	-		DZA65_RS22500	0.31	-2.2
4,865,616	-		DZA65_RS22500	0.31	+0.0
4,865,616	-		DZA65_RS22500	0.31	-0.5
4,865,616	-		DZA65_RS22500	0.31	+0.2
4,865,621	+		DZA65_RS22500	0.31	+0.1
4,865,622	-		DZA65_RS22500	0.31	-1.5
4,865,666	+		DZA65_RS22500	0.35	-0.8
4,865,666	+		DZA65_RS22500	0.35	+0.7
4,865,667	-		DZA65_RS22500	0.35	-0.1
4,865,677	-		DZA65_RS22500	0.36	+1.7