Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS07480

Experiment: Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Atlantic
1,553,889	-		DZA65_RS07475	0.20	-1.3
1,553,889	-		DZA65_RS07475	0.20	-0.3
1,553,889	-		DZA65_RS07475	0.20	-0.8
1,553,889	-		DZA65_RS07475	0.20	+1.4
1,553,892	+		DZA65_RS07475	0.20	+1.0
1,553,892	+		DZA65_RS07475	0.20	+1.7
1,553,893	-		DZA65_RS07475	0.20	+0.1
1,553,893	-		DZA65_RS07475	0.20	+0.5
1,553,893	-		DZA65_RS07475	0.20	-2.5
1,553,900	+		DZA65_RS07475	0.21	-1.5
1,553,901	-		DZA65_RS07475	0.21	-1.5
1,553,901	-		DZA65_RS07475	0.21	-1.0
1,553,901	-		DZA65_RS07475	0.21	-0.0
1,553,955	+		DZA65_RS07475	0.26	-0.6
1,553,980	-		DZA65_RS07475	0.28	+0.5
1,553,980	-		DZA65_RS07475	0.28	-0.5
1,554,004	-		DZA65_RS07475	0.30	+0.5
1,554,004	-		DZA65_RS07475	0.30	+1.2
1,554,014	+		DZA65_RS07475	0.31	-0.8
1,554,015	-		DZA65_RS07475	0.31	+0.5
1,554,015	-		DZA65_RS07475	0.31	-0.8
1,554,015	-		DZA65_RS07475	0.31	-1.3
1,554,078	+		DZA65_RS07475	0.37	-1.5
1,554,078	+		DZA65_RS07475	0.37	-0.6
1,554,078	+		DZA65_RS07475	0.37	+0.9
1,554,078	+		DZA65_RS07475	0.37	-0.8
1,554,078	+		DZA65_RS07475	0.37	-0.8
1,554,079	-		DZA65_RS07475	0.37	-0.3
1,554,079	-		DZA65_RS07475	0.37	-0.8
1,554,102	+		DZA65_RS07475	0.39	-1.3
1,554,102	+		DZA65_RS07475	0.39	-0.2
1,554,102	+		DZA65_RS07475	0.39	+0.1
1,554,102	+		DZA65_RS07475	0.39	-0.2
1,554,271	-		DZA65_RS07475	0.54	+1.0
1,554,297	+		DZA65_RS07475	0.56	-1.5
1,554,297	+		DZA65_RS07475	0.56	+0.0
1,554,298	-		DZA65_RS07475	0.56	-0.0
1,554,309	+		DZA65_RS07475	0.57	-1.6
1,554,309	+		DZA65_RS07475	0.57	-2.8
1,554,315	-		DZA65_RS07475	0.58	-0.2
1,554,346	+		DZA65_RS07475	0.61	-1.0
1,554,379	+		DZA65_RS07475	0.64	-0.5
1,554,380	-		DZA65_RS07475	0.64	+1.9
1,554,380	-		DZA65_RS07475	0.64	+0.1
1,554,380	-		DZA65_RS07475	0.64	+1.5
1,554,393	+		DZA65_RS07475	0.65	+1.6
1,554,393	+		DZA65_RS07475	0.65	+0.5
1,554,445	-		DZA65_RS07475	0.69	+0.1
1,554,464	+		DZA65_RS07475	0.71	+1.0
1,554,464	+		DZA65_RS07475	0.71	-0.2
1,554,464	+		DZA65_RS07475	0.71	-1.5
1,554,464	+		DZA65_RS07475	0.71	-0.0
1,554,465	-		DZA65_RS07475	0.71	+0.4
1,554,465	-		DZA65_RS07475	0.71	-1.0
1,554,499	-		DZA65_RS07475	0.74	+0.3
1,554,508	+		DZA65_RS07475	0.75	-0.8
1,554,508	+		DZA65_RS07475	0.75	+1.9
1,554,508	+		DZA65_RS07475	0.75	-0.1
1,554,508	+		DZA65_RS07475	0.75	-0.1
1,554,508	+		DZA65_RS07475	0.75	+0.5
1,554,508	+		DZA65_RS07475	0.75	-0.8
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	+1.5
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	-0.9
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	+0.5
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	-0.8
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	-0.4
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	+0.1
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	+0.7
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	-1.0
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	-2.3
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	-0.4
1,554,509	-		DZA65_RS07475	0.75	-0.2
1,554,581	-		DZA65_RS07475	0.82	-3.0
1,554,582	+		DZA65_RS07475	0.82	+0.1
1,554,582	+		DZA65_RS07475	0.82	-0.7
1,554,582	+		DZA65_RS07475	0.82	-0.4
1,554,582	+		DZA65_RS07475	0.82	-0.5
1,554,582	+		DZA65_RS07475	0.82	-2.0
1,554,583	-		DZA65_RS07475	0.82	-0.6
1,554,583	-		DZA65_RS07475	0.82	+0.2
1,554,583	-		DZA65_RS07475	0.82	-1.8
1,554,583	-		DZA65_RS07475	0.82	+1.4
1,554,595	+		DZA65_RS07475	0.83	-2.0
1,554,595	+		DZA65_RS07475	0.83	-1.1
1,554,595	+		DZA65_RS07475	0.83	-1.0
1,554,596	-		DZA65_RS07475	0.83	-0.3
1,554,628	+		DZA65_RS07475	0.86	-0.0
1,554,629	-		DZA65_RS07475	0.86	+0.4
1,554,678	+				-2.3
1,554,714	+				-2.3
1,554,720	+				+0.4
1,554,799	+				-0.1
1,554,800	-				-2.5
1,554,814	+				-0.2
1,554,814	+				+1.3
1,554,815	-				-0.3
1,554,820	+				-2.3
1,554,820	+				+1.0
1,554,820	+				+2.1
1,554,821	-				-0.5
1,554,821	-				-0.1
1,554,824	+				+0.9
1,554,824	+				+0.5
1,554,825	-				-0.7
1,554,825	-				+0.6
1,554,825	-				+1.3
1,554,870	+				+0.3
1,554,870	+				+0.3
1,554,870	+				+0.8
1,554,871	-				-1.5
1,554,871	-				-1.5
1,554,927	+				-0.2
1,554,927	+				+1.0
1,554,928	-				+0.5
1,554,980	+		DZA65_RS07480	0.14	+0.1
1,554,980	+		DZA65_RS07480	0.14	-2.8
1,555,123	+		DZA65_RS07480	0.26	+1.7
1,555,123	+		DZA65_RS07480	0.26	-1.8
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	+1.4
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	+0.8
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-3.2
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-1.5
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-1.6
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-2.0
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-0.0
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-2.5
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	+1.0
1,555,124	-		DZA65_RS07480	0.26	-1.6
1,555,126	+		DZA65_RS07480	0.26	-0.9
1,555,126	+		DZA65_RS07480	0.26	+1.6
1,555,126	+		DZA65_RS07480	0.26	+1.2
1,555,127	-		DZA65_RS07480	0.26	+1.0
1,555,127	-		DZA65_RS07480	0.26	-1.0
1,555,127	-		DZA65_RS07480	0.26	+0.5
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.8
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.0
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.6
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.0
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.5
1,555,166	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.8
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.3
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.7
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.8
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.3
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	+1.5
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.7
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	+1.8
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-2.3
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.5
1,555,167	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.3
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.5
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.7
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.1
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.5
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.5
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-1.6
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-2.0
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.5
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.3
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.3
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.5
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.5
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.4
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.2
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.0
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-0.3
1,555,168	+		DZA65_RS07480	0.30	-1.8
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.6
1,555,169	-				-1.5
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.5
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.2
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+1.3
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-1.6
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-1.3
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.5
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-1.5
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.8
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.3
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.6
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.4
1,555,169	-				-0.5
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.5
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+2.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.2
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.1
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.5
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+0.6
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	+1.5
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-0.3
1,555,169	-		DZA65_RS07480	0.30	-2.9
1,555,175	+		DZA65_RS07480	0.30	+0.2
1,555,175	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.6
1,555,175	+		DZA65_RS07480	0.30	+1.3
1,555,176	-		DZA65_RS07480	0.31	-2.0
1,555,176	-		DZA65_RS07480	0.31	+0.2
1,555,230	+		DZA65_RS07480	0.35	+0.2
1,555,230	+		DZA65_RS07480	0.35	-0.2
1,555,244	+		DZA65_RS07480	0.36	+0.1
1,555,245	-		DZA65_RS07480	0.36	-1.0
1,555,284	+		DZA65_RS07480	0.40	+0.0
1,555,284	+		DZA65_RS07480	0.40	+1.1
1,555,284	+		DZA65_RS07480	0.40	-0.3
1,555,284	+		DZA65_RS07480	0.40	-1.5
1,555,285	-		DZA65_RS07480	0.40	-1.0
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	-1.8
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	+0.2
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	+0.1
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	-1.2
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	+0.4
1,555,334	+		DZA65_RS07480	0.44	-0.6
1,555,401	+		DZA65_RS07480	0.50	+1.5
1,555,401	+		DZA65_RS07480	0.50	+0.3
1,555,401	+		DZA65_RS07480	0.50	+0.1
1,555,401	+		DZA65_RS07480	0.50	-0.5
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	-1.0
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	-2.3
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	+2.4
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	+0.5
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	-0.9
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	+0.3
1,555,402	-		DZA65_RS07480	0.50	+1.0
1,555,415	+		DZA65_RS07480	0.51	+1.4
1,555,416	-		DZA65_RS07480	0.51	-1.3
1,555,430	+		DZA65_RS07480	0.52	+0.1
1,555,430	+		DZA65_RS07480	0.52	+2.5
1,555,430	+		DZA65_RS07480	0.52	+0.8
1,555,430	+		DZA65_RS07480	0.52	-0.5
1,555,433	-		DZA65_RS07480	0.52	-0.7
1,555,455	+		DZA65_RS07480	0.54	+0.3
1,555,528	-		DZA65_RS07480	0.60	-0.5
1,555,553	-		DZA65_RS07480	0.62	-0.1
1,555,567	+		DZA65_RS07480	0.64	-1.2
1,555,589	+		DZA65_RS07480	0.65	+1.2
1,555,590	-		DZA65_RS07480	0.66	-1.1
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