Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS08080

Experiment: Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Atlantic
1,689,078	+				+1.5
1,689,084	+		DZA65_RS08075	0.60	-1.0
1,689,084	+		DZA65_RS08075	0.60	+2.4
1,689,085	-		DZA65_RS08075	0.60	+0.6
1,689,085	-		DZA65_RS08075	0.60	+0.1
1,689,085	-		DZA65_RS08075	0.60	-0.5
1,689,085	-		DZA65_RS08075	0.60	-0.3
1,689,146	+		DZA65_RS08075	0.63	+1.2
1,689,195	+		DZA65_RS08075	0.65	+0.3
1,689,195	+		DZA65_RS08075	0.65	-0.1
1,689,196	-		DZA65_RS08075	0.65	+0.0
1,689,253	-		DZA65_RS08075	0.68	-0.2
1,689,253	-		DZA65_RS08075	0.68	+0.9
1,689,287	+		DZA65_RS08075	0.69	+0.3
1,689,287	+		DZA65_RS08075	0.69	-0.1
1,689,302	+		DZA65_RS08075	0.70	+0.5
1,689,302	+		DZA65_RS08075	0.70	-1.1
1,689,303	-		DZA65_RS08075	0.70	+0.5
1,689,411	+		DZA65_RS08075	0.75	+0.9
1,689,411	+		DZA65_RS08075	0.75	+1.1
1,689,411	+		DZA65_RS08075	0.75	-0.5
1,689,412	-		DZA65_RS08075	0.75	-0.9
1,689,412	-		DZA65_RS08075	0.75	-1.3
1,689,412	-		DZA65_RS08075	0.75	+0.6
1,689,412	-		DZA65_RS08075	0.75	-0.3
1,689,519	+		DZA65_RS08075	0.80	+0.7
1,689,520	-		DZA65_RS08075	0.80	-1.0
1,689,520	-		DZA65_RS08075	0.80	+0.1
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-0.7
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-1.6
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-1.0
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	+1.6
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-1.9
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	+0.7
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-0.3
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	+1.8
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	+0.5
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	-0.1
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	+0.0
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	+0.5
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	-0.9
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	+0.7
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	-0.9
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	-2.7
1,689,577	-		DZA65_RS08075	0.83	+0.2
1,689,627	-				-0.5
1,689,689	+		DZA65_RS08075	0.88	-1.9
1,689,690	-		DZA65_RS08075	0.89	-0.5
1,689,698	+		DZA65_RS08075	0.89	+0.5
1,689,702	+		DZA65_RS08075	0.89	-0.5
1,689,702	+		DZA65_RS08075	0.89	-1.0
1,689,702	+		DZA65_RS08075	0.89	-1.4
1,689,703	-		DZA65_RS08075	0.89	+0.7
1,689,750	+				+1.0
1,689,779	+				-1.4
1,689,795	-				+0.7
1,689,801	-				-0.1
1,689,801	-				-0.5
1,689,834	+				-1.9
1,689,834	+				+0.5
1,689,843	+				+0.5
1,689,844	-				+1.2
1,689,844	-				-0.5
1,689,846	+				-0.5
1,689,880	-				+0.5
1,689,910	+				+0.7
1,689,915	+				-0.3
1,689,916	-				-0.3
1,689,916	-				+2.2
1,689,918	-				+1.1
1,689,973	-				+1.6
1,689,988	+				+0.7
1,689,993	+				-1.9
1,689,993	+				-0.5
1,689,998	-				-0.7
1,690,014	+				-0.3
1,690,014	+				-2.3
1,690,015	-				+0.5
1,690,015	-				+0.4
1,690,047	-				+1.8
1,690,128	+				-0.5
1,690,129	-				-1.3
1,690,166	-				-1.7
1,690,207	+				-0.5
1,690,280	+		DZA65_RS08080	0.12	+1.0
1,690,280	+		DZA65_RS08080	0.12	-0.4
1,690,280	+		DZA65_RS08080	0.12	+0.7
1,690,280	+		DZA65_RS08080	0.12	+1.1
1,690,281	-		DZA65_RS08080	0.12	+0.5
1,690,296	+		DZA65_RS08080	0.13	+0.1
1,690,315	+		DZA65_RS08080	0.14	-1.9
1,690,315	+		DZA65_RS08080	0.14	-1.9
1,690,315	+		DZA65_RS08080	0.14	-1.7
1,690,315	+		DZA65_RS08080	0.14	+0.2
1,690,315	+		DZA65_RS08080	0.14	-0.1
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+0.5
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	-0.2
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+0.4
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+0.6
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	-0.0
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+0.5
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+0.5
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+2.6
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+0.5
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	-1.9
1,690,330	+		DZA65_RS08080	0.15	-0.5
1,690,331	-		DZA65_RS08080	0.15	+0.3
1,690,331	-		DZA65_RS08080	0.15	+1.0
1,690,331	-		DZA65_RS08080	0.15	+1.8
1,690,438	+		DZA65_RS08080	0.21	+0.6
1,690,439	-		DZA65_RS08080	0.21	-0.9
1,690,479	+		DZA65_RS08080	0.23	-0.3
1,690,479	+		DZA65_RS08080	0.23	-0.6
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	-1.1
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	+1.3
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	-1.5
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	+1.6
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	-1.9
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	+0.2
1,690,482	+		DZA65_RS08080	0.23	-0.1
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	+0.3
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	+0.6
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	+0.8
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	-1.9
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	+1.1
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	-1.0
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	+3.0
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	+0.9
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	-0.0
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	+0.0
1,690,526	-		DZA65_RS08080	0.25	-0.8
1,690,526	-		DZA65_RS08080	0.25	-1.9
1,690,526	-		DZA65_RS08080	0.25	-0.2
1,690,764	+		DZA65_RS08080	0.38	-1.9
1,690,770	+		DZA65_RS08080	0.38	-0.7
1,690,770	+		DZA65_RS08080	0.38	+0.7
1,690,770	+		DZA65_RS08080	0.38	+1.3
1,690,770	+		DZA65_RS08080	0.38	+0.0
1,690,771	-		DZA65_RS08080	0.38	+1.3
1,690,771	-		DZA65_RS08080	0.38	-0.5
1,690,771	-		DZA65_RS08080	0.38	-0.3
1,690,793	+		DZA65_RS08080	0.40	+0.4
1,690,793	+		DZA65_RS08080	0.40	+2.0
1,690,794	-		DZA65_RS08080	0.40	+0.8
1,690,794	-		DZA65_RS08080	0.40	-0.6
1,690,797	+		DZA65_RS08080	0.40	+1.3
1,690,797	+		DZA65_RS08080	0.40	-0.3
1,690,798	-		DZA65_RS08080	0.40	-1.0
1,690,798	-		DZA65_RS08080	0.40	-0.1
1,690,798	-		DZA65_RS08080	0.40	+1.2
1,690,903	-		DZA65_RS08080	0.46	+2.5
1,690,918	+		DZA65_RS08080	0.46	+0.1
1,690,918	+		DZA65_RS08080	0.46	+3.3
1,690,919	-		DZA65_RS08080	0.46	+2.5
1,690,919	-		DZA65_RS08080	0.46	+0.5
1,690,947	+		DZA65_RS08080	0.48	-2.5
1,690,948	-		DZA65_RS08080	0.48	+0.1
1,690,978	+		DZA65_RS08080	0.50	-1.3
1,690,979	-		DZA65_RS08080	0.50	+2.2
1,690,979	-		DZA65_RS08080	0.50	-0.0
1,691,206	-		DZA65_RS08080	0.62	+0.8
1,691,206	-		DZA65_RS08080	0.62	-0.3
1,691,266	+		DZA65_RS08080	0.65	-0.4
1,691,266	+		DZA65_RS08080	0.65	-1.5
1,691,483	-		DZA65_RS08080	0.76	-0.8
1,691,483	-		DZA65_RS08080	0.76	-1.3
1,691,484	+		DZA65_RS08080	0.77	+2.3
1,691,485	-		DZA65_RS08080	0.77	-2.1
1,691,485	-		DZA65_RS08080	0.77	-0.3
1,691,485	-		DZA65_RS08080	0.77	-0.7
1,691,485	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.5
1,691,485	-		DZA65_RS08080	0.77	-3.1
1,691,498	+		DZA65_RS08080	0.77	-0.3
1,691,499	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.3
1,691,499	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.5
1,691,499	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.7
1,691,499	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.7
1,691,527	+		DZA65_RS08080	0.79	-1.0
1,691,527	+		DZA65_RS08080	0.79	+0.9
1,691,528	-		DZA65_RS08080	0.79	-1.9
1,691,560	+		DZA65_RS08080	0.81	-0.8
1,691,560	+		DZA65_RS08080	0.81	-0.2
1,691,560	+		DZA65_RS08080	0.81	-0.7
1,691,560	+		DZA65_RS08080	0.81	-0.3
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-0.1
1,691,561	-				+1.5
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-1.0
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	+1.2
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-0.4
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-1.3
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	+0.6
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-1.1
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	+1.3
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-1.0
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	+2.4
1,691,788	+				-1.4
1,691,788	+				-0.5
1,691,788	+				-1.3
1,691,788	+				+0.5
1,691,788	+				+1.0
1,691,788	+				-1.0
1,691,788	+				+0.1
1,691,788	+				-0.3
1,691,788	+				+0.2
1,691,789	-				-0.5
1,691,789	-				+0.1
1,691,789	-				+0.2
1,691,789	-				-1.0
1,691,789	-				+0.9
1,691,789	-				+0.1
1,691,789	-				+3.5
1,691,789	-				+0.9
1,691,789	-				-1.3
1,691,846	+				+0.3
1,691,847	-				-1.3
1,691,847	-				+1.7
1,691,847	-				+1.3
1,691,849	+				+0.5
1,691,849	+				+0.8
1,691,850	-				-0.1
1,691,850	-				-0.3
1,691,850	-				-0.1
1,691,864	+				+1.5
1,691,865	-				+0.1
1,691,865	-				-1.1
1,691,865	-				+0.1
1,691,865	-				+0.0
1,691,894	+				-1.0
1,691,894	+				+0.3
1,691,895	-				-0.5
1,691,895	-				+0.2
1,691,895	-				-0.3
1,691,895	-				+0.5
1,691,920	+				-1.3
1,691,920	+				+0.7
1,691,921	-				-0.1
1,691,921	-				-0.3
1,691,921	-				-2.0
1,691,923	+				-0.5
1,691,923	+				+0.1
1,691,924	-				-0.1
1,691,924	-				-0.3
1,691,924	-				+0.5
1,691,999	+				+2.2
1,692,037	-				+1.7
1,692,068	+		DZA65_RS08085	0.11	-0.1
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-0.0
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-0.9
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-1.3
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-0.1
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-1.3
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-0.1
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-1.9
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-0.4
1,692,071	+		DZA65_RS08085	0.12	+1.2
1,692,071	+		DZA65_RS08085	0.12	-1.4
1,692,071	+		DZA65_RS08085	0.12	-1.0
1,692,071	+		DZA65_RS08085	0.12	+0.1
1,692,072	-		DZA65_RS08085	0.12	+0.6
1,692,072	-		DZA65_RS08085	0.12	-0.5
1,692,072	-		DZA65_RS08085	0.12	-2.9
1,692,270	+		DZA65_RS08085	0.27	-0.9
1,692,270	+		DZA65_RS08085	0.27	-0.5
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