Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS11140

Experiment: Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Atlantic
2,360,555	+		DZA65_RS11135	0.31	-1.2
2,360,555	+		DZA65_RS11135	0.31	+0.5
2,360,555	+		DZA65_RS11135	0.31	-0.6
2,360,555	+		DZA65_RS11135	0.31	-0.4
2,360,570	+		DZA65_RS11135	0.32	+1.1
2,360,591	-		DZA65_RS11135	0.34	-0.8
2,360,612	+		DZA65_RS11135	0.36	+0.2
2,360,612	+		DZA65_RS11135	0.36	-0.1
2,360,612	+		DZA65_RS11135	0.36	+0.4
2,360,612	+		DZA65_RS11135	0.36	+0.4
2,360,612	+		DZA65_RS11135	0.36	-1.4
2,360,612	+		DZA65_RS11135	0.36	-0.3
2,360,613	-				+0.6
2,360,613	-		DZA65_RS11135	0.36	-1.8
2,360,613	-		DZA65_RS11135	0.36	+0.1
2,360,642	+		DZA65_RS11135	0.38	-0.1
2,360,642	+		DZA65_RS11135	0.38	-1.2
2,360,642	+		DZA65_RS11135	0.38	-0.7
2,360,643	-		DZA65_RS11135	0.38	-1.4
2,360,643	-		DZA65_RS11135	0.38	-1.6
2,360,643	-		DZA65_RS11135	0.38	+0.2
2,360,643	-		DZA65_RS11135	0.38	+1.6
2,360,643	-		DZA65_RS11135	0.38	-0.2
2,360,696	-		DZA65_RS11135	0.43	-0.6
2,360,910	+		DZA65_RS11135	0.60	+0.3
2,360,910	+		DZA65_RS11135	0.60	-0.3
2,360,910	+		DZA65_RS11135	0.60	-1.0
2,360,910	+		DZA65_RS11135	0.60	-1.2
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	+0.3
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	+0.2
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	-1.2
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	+0.2
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	+0.6
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	-0.7
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	-0.2
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	-0.5
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	-0.7
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	-1.0
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	-0.7
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	+0.4
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	+0.2
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	+0.2
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	-1.2
2,360,927	+		DZA65_RS11135	0.61	-0.0
2,360,928	-		DZA65_RS11135	0.61	-0.0
2,360,928	-		DZA65_RS11135	0.61	-1.1
2,360,928	-		DZA65_RS11135	0.61	-0.0
2,360,928	-		DZA65_RS11135	0.61	-1.3
2,360,928	-		DZA65_RS11135	0.61	-0.6
2,360,928	-		DZA65_RS11135	0.61	-0.1
2,360,928	-		DZA65_RS11135	0.61	-0.4
2,360,928	-		DZA65_RS11135	0.61	-1.6
2,360,928	-		DZA65_RS11135	0.61	-0.8
2,360,928	-		DZA65_RS11135	0.61	-1.2
2,360,929	+		DZA65_RS11135	0.61	-0.0
2,360,929	+		DZA65_RS11135	0.61	-0.4
2,360,929	+		DZA65_RS11135	0.61	-2.0
2,360,930	-		DZA65_RS11135	0.61	+0.9
2,360,978	+		DZA65_RS11135	0.65	-2.1
2,360,978	+		DZA65_RS11135	0.65	-3.0
2,361,054	+		DZA65_RS11135	0.71	+0.8
2,361,055	-		DZA65_RS11135	0.71	+1.9
2,361,154	+		DZA65_RS11135	0.79	-0.1
2,361,154	+		DZA65_RS11135	0.79	+0.3
2,361,155	-		DZA65_RS11135	0.79	+1.3
2,361,155	-		DZA65_RS11135	0.79	-0.4
2,361,155	-		DZA65_RS11135	0.79	-0.7
2,361,155	-		DZA65_RS11135	0.79	-1.8
2,361,155	-		DZA65_RS11135	0.79	+0.2
2,361,171	+		DZA65_RS11135	0.80	-0.2
2,361,171	+		DZA65_RS11135	0.80	+0.2
2,361,172	-		DZA65_RS11135	0.81	+0.2
2,361,174	+		DZA65_RS11135	0.81	-1.6
2,361,174	+		DZA65_RS11135	0.81	+0.0
2,361,175	-		DZA65_RS11135	0.81	-0.8
2,361,175	-		DZA65_RS11135	0.81	+0.6
2,361,175	-		DZA65_RS11135	0.81	-0.9
2,361,175	-		DZA65_RS11135	0.81	+0.5
2,361,264	-		DZA65_RS11135	0.88	+0.5
2,361,264	-		DZA65_RS11135	0.88	+0.5
2,361,264	-		DZA65_RS11135	0.88	-0.7
2,361,264	-		DZA65_RS11135	0.88	-1.9
2,361,264	-		DZA65_RS11135	0.88	+0.2
2,361,264	-		DZA65_RS11135	0.88	-0.2
2,361,264	-		DZA65_RS11135	0.88	-0.0
2,361,268	+		DZA65_RS11135	0.88	-0.4
2,361,356	+				-1.0
2,361,357	-				-0.5
2,361,466	-				-0.0
2,361,493	+				-1.8
2,361,493	+				-0.4
2,361,494	-				+0.2
2,361,518	-				-0.0
2,361,541	+				-1.0
2,361,575	+				-1.1
2,361,575	+				+1.1
2,361,576	-				+0.4
2,361,576	-				-1.6
2,361,581	-				+0.6
2,361,636	+				+3.0
2,361,636	+				-0.6
2,361,637	-				-0.5
2,361,637	-				-0.3
2,361,666	-		DZA65_RS11140	0.12	-1.0
2,361,708	+		DZA65_RS11140	0.17	+0.1
2,361,784	-		DZA65_RS11140	0.25	-1.4
2,361,910	+		DZA65_RS11140	0.39	+1.6
2,361,911	-		DZA65_RS11140	0.39	+0.5
2,362,026	-		DZA65_RS11140	0.52	+0.7
2,362,067	+		DZA65_RS11140	0.56	-2.3
2,362,067	+		DZA65_RS11140	0.56	-1.3
2,362,067	+		DZA65_RS11140	0.56	-0.0
2,362,067	+		DZA65_RS11140	0.56	+0.6
2,362,068	-		DZA65_RS11140	0.56	-1.3
2,362,068	-		DZA65_RS11140	0.56	+1.1
2,362,068	-		DZA65_RS11140	0.56	-1.8
2,362,068	-		DZA65_RS11140	0.56	-1.9
2,362,110	+		DZA65_RS11140	0.61	-0.8
2,362,110	+		DZA65_RS11140	0.61	-1.6
2,362,110	+		DZA65_RS11140	0.61	-1.8
2,362,110	+		DZA65_RS11140	0.61	+0.6
2,362,110	+		DZA65_RS11140	0.61	-0.5
2,362,110	+		DZA65_RS11140	0.61	-0.3
2,362,110	+		DZA65_RS11140	0.61	+1.3
2,362,111	-		DZA65_RS11140	0.61	-0.4
2,362,111	-		DZA65_RS11140	0.61	-0.0
2,362,111	-		DZA65_RS11140	0.61	-0.3
2,362,111	-		DZA65_RS11140	0.61	+0.4
2,362,111	-		DZA65_RS11140	0.61	-1.3
2,362,113	+		DZA65_RS11140	0.61	-2.0
2,362,113	+		DZA65_RS11140	0.61	+0.3
2,362,114	-		DZA65_RS11140	0.61	-1.6
2,362,114	-		DZA65_RS11140	0.61	+0.7
2,362,114	-		DZA65_RS11140	0.61	-0.5
2,362,174	+		DZA65_RS11140	0.68	-1.0
2,362,204	+		DZA65_RS11140	0.71	+0.2
2,362,205	-		DZA65_RS11140	0.71	-0.7
2,362,205	-		DZA65_RS11140	0.71	-0.8
2,362,212	+		DZA65_RS11140	0.72	+0.6
2,362,219	+		DZA65_RS11140	0.73	-0.7
2,362,219	+		DZA65_RS11140	0.73	-1.0
2,362,219	+		DZA65_RS11140	0.73	-0.4
2,362,219	+		DZA65_RS11140	0.73	-0.0
2,362,219	+		DZA65_RS11140	0.73	+1.6
2,362,220	-		DZA65_RS11140	0.73	-0.2
2,362,220	-		DZA65_RS11140	0.73	-1.0
2,362,220	-		DZA65_RS11140	0.73	+0.5
2,362,220	-		DZA65_RS11140	0.73	+0.2
2,362,220	-		DZA65_RS11140	0.73	-0.3
2,362,333	+		DZA65_RS11140	0.85	-0.0
2,362,333	+		DZA65_RS11140	0.85	-1.0
2,362,334	-		DZA65_RS11140	0.85	+0.3
2,362,334	-		DZA65_RS11140	0.85	-1.6
2,362,334	-		DZA65_RS11140	0.85	-0.0
2,362,334	-		DZA65_RS11140	0.85	-1.9
2,362,334	-		DZA65_RS11140	0.85	+0.4
2,362,360	-		DZA65_RS11140	0.88	-0.0
2,362,362	+		DZA65_RS11140	0.88	-0.1
2,362,363	-		DZA65_RS11140	0.89	-0.3
2,362,431	+				+0.7
2,362,431	+				+1.8
2,362,431	+				+0.7
2,362,431	+				-0.8
2,362,432	-				+0.3
2,362,432	-				-0.4
2,362,432	-				+0.5
2,362,432	-				+1.3
2,362,486	-				-0.4
2,362,496	+				+0.3
2,362,557	-				+1.0
2,362,622	+				-0.8
2,362,630	+				+0.1
2,362,630	+				-1.9
2,362,631	-				+0.5
2,362,725	-		DZA65_RS11145	0.12	+0.1
2,362,776	+		DZA65_RS11145	0.16	-0.6
2,362,843	-		DZA65_RS11145	0.21	-2.2
2,362,843	-		DZA65_RS11145	0.21	-0.0
2,362,930	+		DZA65_RS11145	0.28	+2.2
2,362,935	-		DZA65_RS11145	0.29	-1.1
2,363,081	+		DZA65_RS11145	0.41	+0.0
2,363,082	-		DZA65_RS11145	0.41	-0.7
2,363,091	+		DZA65_RS11145	0.42	-0.8
2,363,151	+		DZA65_RS11145	0.47	+1.2
2,363,151	+		DZA65_RS11145	0.47	-0.8
2,363,165	+		DZA65_RS11145	0.48	-1.0
2,363,247	-		DZA65_RS11145	0.54	-0.3
2,363,247	-		DZA65_RS11145	0.54	+1.2
2,363,321	+		DZA65_RS11145	0.61	-0.1
2,363,352	+		DZA65_RS11145	0.63	-0.0
2,363,392	+		DZA65_RS11145	0.66	-0.0
2,363,392	+		DZA65_RS11145	0.66	-0.4
2,363,392	+		DZA65_RS11145	0.66	-0.8
2,363,393	-		DZA65_RS11145	0.66	-0.1
2,363,393	-		DZA65_RS11145	0.66	-0.2