Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS09960

Experiment: M9+glycerol

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	M9+glycerol
2,103,955	+		DZA65_RS09955	0.10	-0.0
2,104,005	+		DZA65_RS09955	0.16	+0.6
2,104,005	+		DZA65_RS09955	0.16	-0.1
2,104,005	+				-1.4
2,104,005	+		DZA65_RS09955	0.16	-0.2
2,104,006	-		DZA65_RS09955	0.16	-0.1
2,104,006	-		DZA65_RS09955	0.16	-0.3
2,104,008	+		DZA65_RS09955	0.16	-2.4
2,104,008	+		DZA65_RS09955	0.16	-1.7
2,104,008	+		DZA65_RS09955	0.16	-0.7
2,104,008	+		DZA65_RS09955	0.16	-1.4
2,104,008	+		DZA65_RS09955	0.16	-0.0
2,104,008	+		DZA65_RS09955	0.16	-0.1
2,104,009	-		DZA65_RS09955	0.16	-0.2
2,104,009	-		DZA65_RS09955	0.16	-0.1
2,104,009	-		DZA65_RS09955	0.16	-2.4
2,104,009	-		DZA65_RS09955	0.16	-0.3
2,104,009	-		DZA65_RS09955	0.16	+0.1
2,104,056	+		DZA65_RS09955	0.21	+0.6
2,104,199	+		DZA65_RS09955	0.37	-0.7
2,104,370	+		DZA65_RS09955	0.56	-1.3
2,104,371	-		DZA65_RS09955	0.56	-0.6
2,104,420	+		DZA65_RS09955	0.61	-1.4
2,104,420	+		DZA65_RS09955	0.61	-1.3
2,104,420	+		DZA65_RS09955	0.61	-2.2
2,104,421	-		DZA65_RS09955	0.61	-0.8
2,104,421	-		DZA65_RS09955	0.61	-0.1
2,104,421	-		DZA65_RS09955	0.61	-2.0
2,104,421	-		DZA65_RS09955	0.61	+0.2
2,104,421	-		DZA65_RS09955	0.61	-0.4
2,104,433	+		DZA65_RS09955	0.63	+1.6
2,104,433	+		DZA65_RS09955	0.63	+0.6
2,104,433	+		DZA65_RS09955	0.63	+0.4
2,104,433	+		DZA65_RS09955	0.63	-0.2
2,104,433	+		DZA65_RS09955	0.63	+0.4
2,104,433	+		DZA65_RS09955	0.63	-1.4
2,104,433	+		DZA65_RS09955	0.63	+0.5
2,104,434	-		DZA65_RS09955	0.63	-0.5
2,104,434	-		DZA65_RS09955	0.63	-0.7
2,104,465	+		DZA65_RS09955	0.66	-2.4
2,104,511	-		DZA65_RS09955	0.71	+0.2
2,104,563	+		DZA65_RS09955	0.77	-0.2
2,104,563	+		DZA65_RS09955	0.77	-1.0
2,104,563	+				-1.4
2,104,564	-		DZA65_RS09955	0.77	-0.1
2,104,564	-		DZA65_RS09955	0.77	+0.9
2,104,564	-		DZA65_RS09955	0.77	+1.1
2,104,564	-		DZA65_RS09955	0.77	-0.9
2,104,564	-		DZA65_RS09955	0.77	-2.0
2,104,564	-		DZA65_RS09955	0.77	+0.1
2,104,564	-		DZA65_RS09955	0.77	-1.3
2,104,616	-		DZA65_RS09955	0.83	-0.5
2,104,658	+		DZA65_RS09955	0.87	+0.2
2,104,658	+		DZA65_RS09955	0.87	-0.8
2,104,658	+		DZA65_RS09955	0.87	+0.8
2,104,658	+		DZA65_RS09955	0.87	-1.2
2,104,659	-		DZA65_RS09955	0.88	-0.3
2,104,659	-		DZA65_RS09955	0.88	-1.0
2,104,667	+		DZA65_RS09955	0.88	-1.1
2,104,668	-		DZA65_RS09955	0.89	-0.4
2,104,668	-		DZA65_RS09955	0.89	+0.3
2,104,770	-				+0.4
2,104,911	+				+0.6
2,104,912	-				+0.2
2,104,912	-				-0.6
2,104,913	+				-0.8
2,104,914	-				+0.6
2,104,927	+				+0.8
2,104,927	+				-2.0
2,104,927	+				-1.2
2,104,928	-				-2.4
2,104,928	-				+0.6
2,104,955	+				-0.4
2,104,955	+				-1.2
2,104,955	+				+1.5
2,104,956	-				-0.5
2,104,979	+				-1.0
2,104,980	-				-0.1
2,105,000	+				-0.4
2,105,001	-				-0.6
2,105,001	-				-1.7
2,105,049	+		DZA65_RS09960	0.13	-1.4
2,105,081	-		DZA65_RS09960	0.16	-0.1
2,105,103	+		DZA65_RS09960	0.17	+0.3
2,105,103	+		DZA65_RS09960	0.17	+0.2
2,105,121	+		DZA65_RS09960	0.19	-1.6
2,105,121	+		DZA65_RS09960	0.19	+1.0
2,105,122	-		DZA65_RS09960	0.19	-1.1
2,105,122	-		DZA65_RS09960	0.19	-0.4
2,105,122	-		DZA65_RS09960	0.19	+1.9
2,105,122	-		DZA65_RS09960	0.19	-1.3
2,105,122	-		DZA65_RS09960	0.19	+0.2
2,105,124	+		DZA65_RS09960	0.19	-1.7
2,105,124	+		DZA65_RS09960	0.19	+0.0
2,105,124	+		DZA65_RS09960	0.19	+0.6
2,105,124	+		DZA65_RS09960	0.19	+0.1
2,105,125	-		DZA65_RS09960	0.19	-1.1
2,105,125	-		DZA65_RS09960	0.19	+0.1
2,105,125	-		DZA65_RS09960	0.19	+0.1
2,105,125	-		DZA65_RS09960	0.19	+0.4
2,105,125	-		DZA65_RS09960	0.19	-1.3
2,105,270	+		DZA65_RS09960	0.32	+0.0
2,105,270	+		DZA65_RS09960	0.32	+0.4
2,105,304	+		DZA65_RS09960	0.35	-0.1
2,105,305	-		DZA65_RS09960	0.35	-1.2
2,105,316	+		DZA65_RS09960	0.36	-2.4
2,105,316	+		DZA65_RS09960	0.36	-0.4
2,105,317	-		DZA65_RS09960	0.36	-0.6
2,105,317	-		DZA65_RS09960	0.36	+0.9
2,105,319	+		DZA65_RS09960	0.36	+0.3
2,105,319	+		DZA65_RS09960	0.36	-0.3
2,105,320	-		DZA65_RS09960	0.36	-1.2
2,105,320	-		DZA65_RS09960	0.36	-2.2
2,105,320	-		DZA65_RS09960	0.36	+0.8
2,105,333	-		DZA65_RS09960	0.38	-0.1
2,105,333	-		DZA65_RS09960	0.38	+0.6
2,105,333	-		DZA65_RS09960	0.38	-1.4
2,105,333	-		DZA65_RS09960	0.38	-2.5
2,105,335	+		DZA65_RS09960	0.38	-1.1
2,105,483	+		DZA65_RS09960	0.51	+0.9
2,105,483	+		DZA65_RS09960	0.51	-0.3
2,105,483	+		DZA65_RS09960	0.51	-0.4
2,105,483	+		DZA65_RS09960	0.51	-0.9
2,105,483	+		DZA65_RS09960	0.51	+0.1
2,105,484	-		DZA65_RS09960	0.51	-1.3
2,105,484	-		DZA65_RS09960	0.51	+0.1
2,105,484	-		DZA65_RS09960	0.51	-0.5
2,105,527	+		DZA65_RS09960	0.54	+0.8
2,105,527	+		DZA65_RS09960	0.54	-0.4
2,105,527	+		DZA65_RS09960	0.54	-0.6
2,105,528	-		DZA65_RS09960	0.54	+0.9
2,105,556	+		DZA65_RS09960	0.57	-0.2
2,105,556	+		DZA65_RS09960	0.57	-1.0
2,105,556	+		DZA65_RS09960	0.57	-1.4
2,105,557	-		DZA65_RS09960	0.57	+0.2
2,105,574	+		DZA65_RS09960	0.58	-0.4
2,105,574	+		DZA65_RS09960	0.58	+0.3
2,105,574	+		DZA65_RS09960	0.58	+0.6
2,105,575	-		DZA65_RS09960	0.59	+0.6
2,105,643	-		DZA65_RS09960	0.64	+0.5
2,105,741	+		DZA65_RS09960	0.73	+0.4
2,105,742	-		DZA65_RS09960	0.73	-1.3
2,105,744	-		DZA65_RS09960	0.73	-2.5
2,105,761	-		DZA65_RS09960	0.75	+0.3
2,105,809	+		DZA65_RS09960	0.79	-1.4
2,105,809	+		DZA65_RS09960	0.79	+1.1
2,105,810	-		DZA65_RS09960	0.79	-0.3
2,105,810	-		DZA65_RS09960	0.79	+0.6
2,105,810	-		DZA65_RS09960	0.79	+0.5
2,105,812	-				+0.3
2,105,864	-		DZA65_RS09960	0.84	-3.4
2,105,892	+		DZA65_RS09960	0.86	-0.4
2,105,892	+		DZA65_RS09960	0.86	+0.2
2,105,892	+		DZA65_RS09960	0.86	+1.3
2,105,892	+		DZA65_RS09960	0.86	+1.8
2,105,892	+		DZA65_RS09960	0.86	-0.7
2,105,892	+		DZA65_RS09960	0.86	-0.4
2,105,893	-		DZA65_RS09960	0.86	-1.0
2,105,893	-		DZA65_RS09960	0.86	+0.0
2,105,893	-		DZA65_RS09960	0.86	-0.1
2,105,893	-		DZA65_RS09960	0.86	+0.6
2,105,893	-		DZA65_RS09960	0.86	-0.4
2,105,893	-		DZA65_RS09960	0.86	-0.2
2,105,894	+		DZA65_RS09960	0.86	-0.6
2,105,894	+		DZA65_RS09960	0.86	-0.1
2,105,894	+		DZA65_RS09960	0.86	+1.6
2,105,894	+		DZA65_RS09960	0.86	+0.4
2,105,894	+		DZA65_RS09960	0.86	-0.2
2,105,894	+		DZA65_RS09960	0.86	-1.0
2,105,894	+		DZA65_RS09960	0.86	-0.4
2,105,895	-		DZA65_RS09960	0.86	-0.4
2,105,895	-		DZA65_RS09960	0.86	-2.0
2,105,895	-		DZA65_RS09960	0.86	-0.6
2,105,895	-		DZA65_RS09960	0.86	-1.2
2,105,895	-		DZA65_RS09960	0.86	-0.4
2,105,946	+				-0.9
2,105,946	+				-0.7
2,105,946	+				+0.9
2,105,946	+				-1.0
2,105,946	+				+0.5
2,105,947	-				+0.2
2,105,947	-				-0.4
2,105,959	+				-0.4
2,105,959	+				-0.2
2,105,959	+				-2.2
2,105,959	+				-1.2
2,105,959	+				+0.1
2,105,960	-				-0.2
2,105,960	-				-1.0
2,105,968	+				+1.8
2,105,995	-				-0.9
2,106,004	+				-1.0
2,106,004	+				-0.7
2,106,005	-				-1.4
2,106,005	-				-1.4
2,106,005	-				-0.5
2,106,005	-				+0.1
2,106,126	+				-1.7
2,106,126	+				-0.8
2,106,127	-				-0.7
2,106,127	-				-0.2
2,106,261	-		DZA65_RS09965	0.20	+0.2
2,106,297	+		DZA65_RS09965	0.24	-0.1
2,106,298	-		DZA65_RS09965	0.24	-0.8
2,106,308	-		DZA65_RS09965	0.25	+0.4
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	+0.9
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	-0.2
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	+0.2
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	-0.4
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	+0.4
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	-0.6
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	-1.4
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	-1.1
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	-0.5
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	-0.9
2,106,309	+				+1.2
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	+1.6
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	+0.6
2,106,309	+		DZA65_RS09965	0.25	-0.1
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	-1.0
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	+2.0
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	+0.8
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	+0.3
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	-0.7
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	-0.4
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	-1.2
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	+0.3
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	-0.3
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	-2.0
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	-2.0
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	+0.0
2,106,310	-		DZA65_RS09965	0.25	+0.0
2,106,387	+		DZA65_RS09965	0.33	+0.6
2,106,387	+		DZA65_RS09965	0.33	-1.1
2,106,388	-		DZA65_RS09965	0.34	-0.1
2,106,477	-		DZA65_RS09965	0.43	+0.2
2,106,517	-		DZA65_RS09965	0.47	-1.0
2,106,651	+		DZA65_RS09965	0.62	+1.9
2,106,690	+		DZA65_RS09965	0.66	+0.4
2,106,694	-		DZA65_RS09965	0.66	-0.6
2,106,798	-		DZA65_RS09965	0.78	-0.0
2,106,862	+		DZA65_RS09965	0.85	-1.1
2,106,887	+		DZA65_RS09965	0.87	-0.3
2,106,888	-		DZA65_RS09965	0.87	-1.0
2,106,895	+		DZA65_RS09965	0.88	+0.4
2,106,895	+		DZA65_RS09965	0.88	+0.2
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