Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS21315

Experiment: M9+glycerol

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	M9+glycerol
4,610,956	+		DZA65_RS21310	0.50	-1.9
4,610,956	+		DZA65_RS21310	0.50	-1.5
4,610,957	-		DZA65_RS21310	0.50	-2.9
4,610,957	-		DZA65_RS21310	0.50	-2.2
4,611,208	+		DZA65_RS21310	0.67	+0.2
4,611,208	+		DZA65_RS21310	0.67	-1.9
4,611,208	+		DZA65_RS21310	0.67	-2.2
4,611,208	+		DZA65_RS21310	0.67	-0.1
4,611,208	+		DZA65_RS21310	0.67	+0.5
4,611,208	+		DZA65_RS21310	0.67	-4.2
4,611,208	+		DZA65_RS21310	0.67	-0.2
4,611,209	-		DZA65_RS21310	0.67	-0.1
4,611,209	-		DZA65_RS21310	0.67	-2.8
4,611,209	-		DZA65_RS21310	0.67	-2.2
4,611,209	-		DZA65_RS21310	0.67	-1.5
4,611,255	+		DZA65_RS21310	0.70	-1.5
4,611,256	-		DZA65_RS21310	0.70	+1.1
4,611,256	-		DZA65_RS21310	0.70	+0.1
4,611,256	-		DZA65_RS21310	0.70	-2.1
4,611,256	-		DZA65_RS21310	0.70	-1.5
4,611,256	-		DZA65_RS21310	0.70	-1.2
4,611,269	+		DZA65_RS21310	0.71	-1.4
4,611,270	-		DZA65_RS21310	0.71	+0.3
4,611,349	-		DZA65_RS21310	0.76	-0.5
4,611,357	+		DZA65_RS21310	0.77	-1.5
4,611,358	-		DZA65_RS21310	0.77	-1.0
4,611,358	-		DZA65_RS21310	0.77	-1.9
4,611,358	-		DZA65_RS21310	0.77	-0.1
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	-1.2
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	-3.2
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	-2.2
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	-2.8
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	+0.8
4,611,427	+				-1.5
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	-4.1
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	-0.9
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	-0.1
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	-1.5
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	-1.9
4,611,427	+		DZA65_RS21310	0.81	-1.6
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	+0.6
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-1.5
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-0.5
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-1.9
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-1.9
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-1.2
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-0.7
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-2.7
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-1.7
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-2.3
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-2.1
4,611,428	-		DZA65_RS21310	0.81	-1.2
4,611,441	-		DZA65_RS21310	0.82	-5.0
4,611,441	-		DZA65_RS21310	0.82	-2.5
4,611,508	+		DZA65_RS21310	0.87	-1.5
4,611,573	+				-2.4
4,611,573	+				-2.1
4,611,574	-				-2.4
4,611,574	-				-3.2
4,611,601	+				-2.8
4,611,601	+				-1.9
4,611,602	-				-1.2
4,611,683	+				-0.8
4,611,683	+				-0.1
4,611,683	+				-1.2
4,611,683	+				-1.7
4,611,683	+				-2.6
4,611,683	+				-0.6
4,611,684	-				-3.1
4,611,684	-				-2.5
4,611,684	-				-1.2
4,611,684	-				-2.2
4,611,691	+				+0.3
4,611,691	+				+0.2
4,611,691	+				+0.3
4,611,691	+				+0.5
4,611,691	+				-1.9
4,611,692	-				-0.5
4,611,692	-				-2.2
4,611,692	-				-3.0
4,611,720	+				-2.2
4,611,721	-				+0.2
4,611,740	+				-1.5
4,611,740	+				-0.9
4,611,740	+				-1.2
4,611,741	-				-0.1
4,611,741	-				+0.9
4,611,741	-				-0.2
4,611,741	-				+1.7
4,611,781	+				-0.5
4,611,781	+				-1.9
4,611,781	+				+0.1
4,611,781	+				-2.4
4,611,781	+				+0.8
4,611,782	-				-0.0
4,611,786	+				-2.1
4,611,786	+				-1.7
4,611,786	+				-1.5
4,611,786	+				-1.7
4,611,786	+				-2.2
4,611,786	+				-2.1
4,611,786	+				-1.7
4,611,786	+				-3.2
4,611,786	+				-2.6
4,611,787	-				+1.1
4,611,787	-				-0.8
4,611,787	-				-0.5
4,611,787	-				+1.6
4,611,787	-				-0.6
4,611,798	+				-2.2
4,611,798	+				-1.2
4,611,799	-				-2.2
4,611,799	-				-0.5
4,611,799	-				+0.7
4,611,799	-				+0.3
4,611,817	+				-1.5
4,611,817	+				-1.7
4,611,817	+				-1.8
4,611,818	-				+1.1
4,611,818	-				-0.1
4,611,818	-				+1.0
4,611,820	+				-0.1
4,611,820	+				-1.5
4,611,820	+				-1.3
4,611,821	-				+1.1
4,611,821	-				-0.1
4,611,821	-				+0.2
4,611,821	-				-0.6
4,611,821	-				-0.6
4,611,851	+				-0.5
4,611,851	+				-0.7
4,611,852	-				+0.9
4,611,878	+				-0.1
4,611,879	-				+0.1
4,611,879	-				-0.9
4,611,879	-				-0.0
4,611,948	+				+0.3
4,611,948	+				-0.7
4,611,949	-				+1.1
4,611,949	-				-1.7
4,612,177	+		DZA65_RS21315	0.34	-0.5
4,612,177	+		DZA65_RS21315	0.34	-0.8
4,612,177	+		DZA65_RS21315	0.34	-0.2
4,612,177	+		DZA65_RS21315	0.34	-0.4
4,612,178	-		DZA65_RS21315	0.35	-0.1
4,612,178	-				+1.1
4,612,178	-		DZA65_RS21315	0.35	-0.0
4,612,178	-		DZA65_RS21315	0.35	+0.7
4,612,344	+		DZA65_RS21315	0.53	-1.6
4,612,344	+		DZA65_RS21315	0.53	+0.5
4,612,344	+		DZA65_RS21315	0.53	+0.1
4,612,345	-		DZA65_RS21315	0.53	+0.3
4,612,345	-		DZA65_RS21315	0.53	+0.7
4,612,345	-		DZA65_RS21315	0.53	-0.7
4,612,512	+		DZA65_RS21315	0.72	-0.6
4,612,512	+		DZA65_RS21315	0.72	+0.1
4,612,512	+		DZA65_RS21315	0.72	-2.8
4,612,512	+		DZA65_RS21315	0.72	-1.0
4,612,513	-		DZA65_RS21315	0.72	-1.7
4,612,528	+		DZA65_RS21315	0.74	-0.7
4,612,528	+		DZA65_RS21315	0.74	-0.5
4,612,529	-		DZA65_RS21315	0.74	+1.6
4,612,563	+		DZA65_RS21315	0.78	-0.9
4,612,563	+		DZA65_RS21315	0.78	+0.8
4,612,563	+		DZA65_RS21315	0.78	+0.9
4,612,563	+		DZA65_RS21315	0.78	-0.5
4,612,563	+		DZA65_RS21315	0.78	-1.9
4,612,564	-		DZA65_RS21315	0.78	-1.5
4,612,564	-		DZA65_RS21315	0.78	-0.6
4,612,565	-		DZA65_RS21315	0.78	+0.6
4,612,607	+		DZA65_RS21315	0.83	-1.2
4,612,607	+		DZA65_RS21315	0.83	+1.1
4,612,607	+		DZA65_RS21315	0.83	-1.3
4,612,607	+		DZA65_RS21315	0.83	-1.3
4,612,607	+		DZA65_RS21315	0.83	-1.2
4,612,607	+		DZA65_RS21315	0.83	+0.1
4,612,608	-		DZA65_RS21315	0.83	+0.5
4,612,608	-		DZA65_RS21315	0.83	-1.7
4,612,635	+		DZA65_RS21315	0.86	-1.0
4,612,635	+		DZA65_RS21315	0.86	-0.9
4,612,665	+		DZA65_RS21315	0.89	-0.5
4,612,665	+		DZA65_RS21315	0.89	-1.7
4,612,665	+		DZA65_RS21315	0.89	-0.3
4,612,666	-		DZA65_RS21315	0.90	+1.7
4,612,666	-		DZA65_RS21315	0.90	+1.1
4,612,666	-		DZA65_RS21315	0.90	+0.2
4,612,724	+				-0.1
4,612,725	-				+1.0
4,612,725	-				+0.5
4,612,746	-				+0.2
4,612,775	+				-0.9
4,612,775	+				-0.5
4,612,775	+				+1.4
4,612,775	+				-1.6
4,612,775	+				-1.2
4,612,775	+				-1.9
4,612,776	-				+1.4
4,612,776	-				-0.2
4,612,776	-				+0.2
4,612,776	-				+0.3
4,613,021	+		DZA65_RS21320	0.34	-0.5
4,613,055	+		DZA65_RS21320	0.39	-1.0
4,613,055	+		DZA65_RS21320	0.39	-2.4
4,613,055	+		DZA65_RS21320	0.39	-0.2
4,613,056	-		DZA65_RS21320	0.39	-0.5
4,613,056	-		DZA65_RS21320	0.39	-0.9
4,613,069	+		DZA65_RS21320	0.41	+0.7
4,613,070	-		DZA65_RS21320	0.41	+1.1
4,613,082	+		DZA65_RS21320	0.42	+0.4
4,613,160	+		DZA65_RS21320	0.53	+0.7
4,613,161	-		DZA65_RS21320	0.53	+0.5
4,613,161	-		DZA65_RS21320	0.53	-0.6
4,613,161	-		DZA65_RS21320	0.53	-0.8
4,613,166	+		DZA65_RS21320	0.53	+0.7
4,613,166	+		DZA65_RS21320	0.53	-0.3
4,613,166	+		DZA65_RS21320	0.53	-0.9
4,613,166	+		DZA65_RS21320	0.53	+0.3
4,613,167	-		DZA65_RS21320	0.53	-0.1
4,613,167	-		DZA65_RS21320	0.53	+0.7
4,613,172	+		DZA65_RS21320	0.54	+1.7
4,613,172	+		DZA65_RS21320	0.54	+0.3
4,613,172	+		DZA65_RS21320	0.54	+1.1
4,613,172	+		DZA65_RS21320	0.54	-1.3
4,613,173	-		DZA65_RS21320	0.54	+0.8
4,613,173	-		DZA65_RS21320	0.54	-2.4
4,613,175	+		DZA65_RS21320	0.55	+0.3
4,613,175	+		DZA65_RS21320	0.55	+1.0
4,613,175	+		DZA65_RS21320	0.55	+1.1
4,613,175	+		DZA65_RS21320	0.55	-1.2
4,613,176	-		DZA65_RS21320	0.55	+0.5
4,613,176	-		DZA65_RS21320	0.55	+0.3
4,613,176	-		DZA65_RS21320	0.55	-0.2
4,613,176	-				-0.2
4,613,200	-		DZA65_RS21320	0.58	-1.1
4,613,200	-		DZA65_RS21320	0.58	-1.4
4,613,217	+		DZA65_RS21320	0.60	+0.5
4,613,217	+		DZA65_RS21320	0.60	-0.7
4,613,217	+		DZA65_RS21320	0.60	-1.2
4,613,217	+		DZA65_RS21320	0.60	+1.0
4,613,217	+		DZA65_RS21320	0.60	-0.9
4,613,218	-		DZA65_RS21320	0.60	-0.3
4,613,218	-		DZA65_RS21320	0.60	+0.4
4,613,218	-		DZA65_RS21320	0.60	-0.3
4,613,218	-		DZA65_RS21320	0.60	+1.7
4,613,218	-		DZA65_RS21320	0.60	+0.3
4,613,232	+		DZA65_RS21320	0.62	+0.3
4,613,232	+		DZA65_RS21320	0.62	-0.9
4,613,232	+		DZA65_RS21320	0.62	+0.8
4,613,232	+		DZA65_RS21320	0.62	+1.1
4,613,232	+		DZA65_RS21320	0.62	-0.1
4,613,232	+		DZA65_RS21320	0.62	+0.2
4,613,233	-		DZA65_RS21320	0.62	-0.7
4,613,233	-		DZA65_RS21320	0.62	+0.1
4,613,233	-		DZA65_RS21320	0.62	+0.8
4,613,233	-		DZA65_RS21320	0.62	+1.1
4,613,233	-		DZA65_RS21320	0.62	-0.7
4,613,251	-		DZA65_RS21320	0.64	+1.1
4,613,291	+		DZA65_RS21320	0.70	-0.4
4,613,291	+		DZA65_RS21320	0.70	+0.4
4,613,291	+		DZA65_RS21320	0.70	+0.6
4,613,291	+		DZA65_RS21320	0.70	+0.4
4,613,291	+		DZA65_RS21320	0.70	+1.2
4,613,291	+		DZA65_RS21320	0.70	+0.1
4,613,292	-		DZA65_RS21320	0.70	+0.8
4,613,292	-		DZA65_RS21320	0.70	+0.1
4,613,295	-		DZA65_RS21320	0.70	+0.0
4,613,295	-		DZA65_RS21320	0.70	-2.1
4,613,295	-		DZA65_RS21320	0.70	-0.2
4,613,295	-		DZA65_RS21320	0.70	-0.1
4,613,295	-		DZA65_RS21320	0.70	+1.4
4,613,322	+		DZA65_RS21320	0.74	+1.0
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