Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS14240

Experiment: M9+glycerol

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	M9+glycerol
3,098,873	+		DZA65_RS14235	0.28	-0.3
3,098,873	+		DZA65_RS14235	0.28	+0.4
3,098,874	-		DZA65_RS14235	0.28	-0.2
3,098,874	-		DZA65_RS14235	0.28	-1.1
3,098,877	+		DZA65_RS14235	0.29	-2.1
3,098,877	+		DZA65_RS14235	0.29	+1.3
3,098,877	+				+1.8
3,098,878	-		DZA65_RS14235	0.29	-0.1
3,098,941	+		DZA65_RS14235	0.34	+0.3
3,098,941	+		DZA65_RS14235	0.34	+0.7
3,098,941	+		DZA65_RS14235	0.34	-0.6
3,098,941	+		DZA65_RS14235	0.34	+0.7
3,098,942	-				+0.4
3,098,942	-		DZA65_RS14235	0.34	+0.5
3,098,976	+		DZA65_RS14235	0.36	-0.2
3,098,977	-		DZA65_RS14235	0.36	-1.1
3,098,983	+		DZA65_RS14235	0.37	-0.1
3,099,047	+		DZA65_RS14235	0.42	-0.8
3,099,076	-		DZA65_RS14235	0.44	+0.8
3,099,088	+		DZA65_RS14235	0.45	-0.2
3,099,088	+		DZA65_RS14235	0.45	+1.2
3,099,088	+		DZA65_RS14235	0.45	-2.4
3,099,088	+		DZA65_RS14235	0.45	-0.1
3,099,088	+		DZA65_RS14235	0.45	-0.0
3,099,088	+		DZA65_RS14235	0.45	+2.8
3,099,088	+		DZA65_RS14235	0.45	-2.9
3,099,089	-		DZA65_RS14235	0.45	+0.2
3,099,089	-		DZA65_RS14235	0.45	+0.4
3,099,089	-		DZA65_RS14235	0.45	+0.7
3,099,089	-		DZA65_RS14235	0.45	+0.9
3,099,089	-		DZA65_RS14235	0.45	-0.7
3,099,089	-		DZA65_RS14235	0.45	-1.9
3,099,089	-		DZA65_RS14235	0.45	-0.7
3,099,089	-		DZA65_RS14235	0.45	+1.1
3,099,090	+		DZA65_RS14235	0.45	+0.0
3,099,090	+		DZA65_RS14235	0.45	-0.2
3,099,090	+		DZA65_RS14235	0.45	-0.0
3,099,090	+		DZA65_RS14235	0.45	-1.7
3,099,090	+		DZA65_RS14235	0.45	-1.3
3,099,091	-		DZA65_RS14235	0.45	-0.6
3,099,091	-		DZA65_RS14235	0.45	+0.4
3,099,091	-		DZA65_RS14235	0.45	-0.3
3,099,092	+		DZA65_RS14235	0.45	-0.4
3,099,092	+		DZA65_RS14235	0.45	+2.6
3,099,092	+		DZA65_RS14235	0.45	+1.8
3,099,092	+				+1.4
3,099,092	+		DZA65_RS14235	0.45	+0.3
3,099,092	+		DZA65_RS14235	0.45	-1.0
3,099,092	+		DZA65_RS14235	0.45	-0.0
3,099,092	+		DZA65_RS14235	0.45	+0.0
3,099,092	+		DZA65_RS14235	0.45	+0.4
3,099,093	-		DZA65_RS14235	0.45	-0.9
3,099,093	-		DZA65_RS14235	0.45	+0.3
3,099,093	-		DZA65_RS14235	0.45	-2.0
3,099,093	-		DZA65_RS14235	0.45	+0.4
3,099,093	-		DZA65_RS14235	0.45	-1.6
3,099,093	-		DZA65_RS14235	0.45	-1.6
3,099,093	-		DZA65_RS14235	0.45	+0.1
3,099,093	-		DZA65_RS14235	0.45	+0.4
3,099,117	+		DZA65_RS14235	0.47	-0.1
3,099,117	+		DZA65_RS14235	0.47	-1.9
3,099,123	+		DZA65_RS14235	0.48	-0.1
3,099,182	+		DZA65_RS14235	0.52	-0.2
3,099,182	+		DZA65_RS14235	0.52	+0.9
3,099,182	+		DZA65_RS14235	0.52	+0.7
3,099,182	+		DZA65_RS14235	0.52	-0.6
3,099,182	+		DZA65_RS14235	0.52	-1.8
3,099,182	+		DZA65_RS14235	0.52	-0.7
3,099,182	+		DZA65_RS14235	0.52	+1.7
3,099,185	+		DZA65_RS14235	0.52	+0.5
3,099,186	-		DZA65_RS14235	0.52	-2.4
3,099,186	-		DZA65_RS14235	0.52	-0.2
3,099,186	-		DZA65_RS14235	0.52	+0.4
3,099,186	-		DZA65_RS14235	0.52	-0.6
3,099,186	-		DZA65_RS14235	0.52	-0.9
3,099,188	+		DZA65_RS14235	0.52	+0.6
3,099,188	+		DZA65_RS14235	0.52	-1.6
3,099,201	+		DZA65_RS14235	0.53	+1.6
3,099,201	+		DZA65_RS14235	0.53	+0.4
3,099,201	+		DZA65_RS14235	0.53	+0.6
3,099,201	+		DZA65_RS14235	0.53	+0.4
3,099,201	+		DZA65_RS14235	0.53	+0.4
3,099,202	-		DZA65_RS14235	0.54	-0.2
3,099,202	-		DZA65_RS14235	0.54	+0.6
3,099,357	-		DZA65_RS14235	0.65	+0.8
3,099,390	+		DZA65_RS14235	0.68	-1.3
3,099,390	+		DZA65_RS14235	0.68	+0.6
3,099,391	-		DZA65_RS14235	0.68	-0.8
3,099,416	+		DZA65_RS14235	0.70	-1.0
3,099,416	+		DZA65_RS14235	0.70	-0.4
3,099,417	-		DZA65_RS14235	0.70	-1.6
3,099,509	+		DZA65_RS14235	0.77	-0.0
3,099,542	+		DZA65_RS14235	0.80	+0.4
3,099,542	+		DZA65_RS14235	0.80	+1.2
3,099,542	+		DZA65_RS14235	0.80	-1.0
3,099,542	+		DZA65_RS14235	0.80	-0.3
3,099,542	+		DZA65_RS14235	0.80	-0.6
3,099,542	+		DZA65_RS14235	0.80	+3.3
3,099,542	+		DZA65_RS14235	0.80	-1.3
3,099,543	-		DZA65_RS14235	0.80	+0.4
3,099,543	-				+1.4
3,099,543	-		DZA65_RS14235	0.80	+0.8
3,099,543	-		DZA65_RS14235	0.80	-1.7
3,099,558	+		DZA65_RS14235	0.81	-1.7
3,099,559	-		DZA65_RS14235	0.81	-1.0
3,099,569	+		DZA65_RS14235	0.82	-1.3
3,099,612	+		DZA65_RS14235	0.85	-0.1
3,099,615	+		DZA65_RS14235	0.85	-0.3
3,099,615	+		DZA65_RS14235	0.85	+0.6
3,099,616	-		DZA65_RS14235	0.85	+0.8
3,099,616	-		DZA65_RS14235	0.85	-0.3
3,099,648	-		DZA65_RS14235	0.88	-0.7
3,099,679	+				+0.4
3,099,680	-				-0.5
3,099,708	-				-1.3
3,099,716	+				+1.2
3,099,762	-				-0.6
3,099,780	+				-1.6
3,099,780	+				-0.4
3,099,780	+				+0.9
3,099,780	+				+0.4
3,099,781	-				+0.9
3,099,781	-				+0.4
3,099,799	+				-1.9
3,099,799	+				+0.5
3,099,799	+				-0.1
3,099,799	+				+1.7
3,099,799	+				+0.7
3,099,799	+				-0.9
3,099,800	-				+0.1
3,099,800	-				+0.2
3,099,800	-				-0.6
3,099,822	+				-1.7
3,099,822	+				+0.7
3,099,823	-				+0.2
3,099,840	+				-0.3
3,099,858	-				+0.2
3,099,937	+				-0.6
3,099,962	+				-0.9
3,099,978	-				-0.6
3,099,999	+				-0.4
3,099,999	+				-0.4
3,100,019	-				+0.1
3,100,037	+				-1.1
3,100,037	+				+1.4
3,100,037	+				+0.0
3,100,038	-				-1.1
3,100,133	+				-0.4
3,100,133	+				+0.4
3,100,133	+				+1.7
3,100,134	-				+0.2
3,100,134	-				+0.9
3,100,134	-				-1.0
3,100,141	+				-0.1
3,100,153	+				-0.6
3,100,153	+				+0.4
3,100,153	+				-0.0
3,100,153	+				-0.8
3,100,153	+				-0.2
3,100,153	+				-0.2
3,100,153	+				+0.0
3,100,154	-				-1.6
3,100,154	-				-1.6
3,100,309	+				+0.4
3,100,309	+				-1.8
3,100,310	-				+0.8
3,100,435	-				-0.1
3,100,478	+				-0.8
3,100,478	+				-0.1
3,100,478	+				-1.7
3,100,478	+				-0.7
3,100,503	+				-0.8
3,100,503	+				+1.4
3,100,503	+				-1.1
3,100,503	+				-0.1
3,100,503	+				+0.2
3,100,504	-				-0.6
3,100,504	-				-0.4
3,100,504	-				-1.0
3,100,504	-				+1.0
3,100,504	-				-2.1
3,100,505	+				+1.7
3,100,505	+				-0.2
3,100,505	+				+0.4
3,100,505	+				+1.3
3,100,505	+				+0.7
3,100,505	+				+1.0
3,100,505	+				-0.6
3,100,505	+				+0.2
3,100,505	+				-0.6
3,100,505	+				-0.6
3,100,505	+				+0.1
3,100,505	+				-0.6
3,100,506	-				+3.3
3,100,506	-				-0.6
3,100,506	-				+0.2
3,100,506	-				+1.0
3,100,506	-				+0.2
3,100,506	-				-0.6
3,100,506	-				-0.1
3,100,506	-				+0.0
3,100,506	-				+0.0
3,100,506	-				+1.8
3,100,506	-				+0.6
3,100,506	-				-0.4
3,100,506	-				+0.3
3,100,506	-				-2.3
3,100,506	-				-0.6
3,100,506	-				-0.9
3,100,515	+				+1.8
3,100,540	-				+0.6
3,100,563	+				+1.4
3,100,563	+				-0.3
3,100,565	+				-0.8
3,100,565	+				-1.6
3,100,565	+				-0.6
3,100,565	+				+0.5
3,100,565	+				+0.4
3,100,565	+				-0.3
3,100,565	+				+0.6
3,100,565	+				-1.4
3,100,566	-				+1.4
3,100,566	-				-0.6
3,100,566	-				+1.0
3,100,566	-				-0.8
3,100,566	-				+1.0
3,100,566	-				+2.8
3,100,599	+				+0.7
3,100,600	-				+1.6
3,100,669	+				+0.9
3,100,670	-				+1.2
3,100,670	-				+0.2
3,100,670	-				-0.8
3,100,749	+				-0.4
3,100,749	+				+0.9
3,100,749	+				-0.4
3,100,750	-				-2.1
3,100,750	-				-0.7
3,100,750	-				+1.0
3,100,750	-				+0.3
3,100,750	-				-0.5
3,100,753	+				-2.6
3,100,753	+				+0.2
3,100,753	+				+0.4
3,100,882	-				+0.2
3,100,976	+				+1.1
3,100,976	+				-0.0
3,100,976	+				-1.1
3,100,977	-				-0.3
3,100,977	-				-0.0
3,100,977	-				-1.6
3,100,977	-				+0.1
3,101,028	-				+0.4
3,101,047	-		DZA65_RS14240	0.10	+0.1
3,101,065	+		DZA65_RS14240	0.10	-0.7
3,101,088	+		DZA65_RS14240	0.11	+0.4
3,101,124	+		DZA65_RS14240	0.11	-0.1
3,101,124	+		DZA65_RS14240	0.11	+0.2
3,101,124	+		DZA65_RS14240	0.11	+1.3
3,101,124	+		DZA65_RS14240	0.11	+0.6
3,101,124	+		DZA65_RS14240	0.11	-1.9
3,101,124	+		DZA65_RS14240	0.11	+1.4
3,101,124	+		DZA65_RS14240	0.11	+0.2
3,101,124	+		DZA65_RS14240	0.11	-0.6
3,101,125	-		DZA65_RS14240	0.11	+0.1
3,101,125	-		DZA65_RS14240	0.11	-1.1
3,101,125	-		DZA65_RS14240	0.11	+0.4
3,101,125	-		DZA65_RS14240	0.11	+0.4
3,101,125	-		DZA65_RS14240	0.11	-0.6
3,101,125	-		DZA65_RS14240	0.11	-0.6
3,101,125	-		DZA65_RS14240	0.11	+0.1
3,101,125	-		DZA65_RS14240	0.11	+0.3
3,101,125	-		DZA65_RS14240	0.11	+1.1
3,101,169	+		DZA65_RS14240	0.11	-0.9
3,101,169	+		DZA65_RS14240	0.11	+1.0
3,101,169	+		DZA65_RS14240	0.11	-0.0
3,101,170	-		DZA65_RS14240	0.11	+1.0
3,101,170	-		DZA65_RS14240	0.11	-0.4
3,101,170	-		DZA65_RS14240	0.11	-1.1
3,101,170	-		DZA65_RS14240	0.11	+0.0
3,101,184	-		DZA65_RS14240	0.11	-1.1
3,101,188	+		DZA65_RS14240	0.11	-1.1
3,101,188	+		DZA65_RS14240	0.11	+0.4
3,101,188	+		DZA65_RS14240	0.11	-2.4
3,101,188	+		DZA65_RS14240	0.11	-1.1
3,101,189	-		DZA65_RS14240	0.11	-0.6
3,101,189	-		DZA65_RS14240	0.11	-2.1
3,101,232	+		DZA65_RS14240	0.12	-0.3
3,101,232	+		DZA65_RS14240	0.12	+0.1
3,101,232	+		DZA65_RS14240	0.12	+0.4
3,101,232	+		DZA65_RS14240	0.12	-1.9
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3,102,803	-		DZA65_RS14240	0.25	-0.4
3,102,841	+				-0.3
3,102,841	+		DZA65_RS14240	0.26	-0.7
3,102,842	-		DZA65_RS14240	0.26	-0.4
3,102,842	-		DZA65_RS14240	0.26	+0.6
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3,103,009	-		DZA65_RS14240	0.27	-0.2
3,103,081	+		DZA65_RS14240	0.28	+1.1
3,103,081	+		DZA65_RS14240	0.28	-2.6
3,103,081	+		DZA65_RS14240	0.28	-0.6
3,103,081	+		DZA65_RS14240	0.28	+1.2
3,103,081	+		DZA65_RS14240	0.28	+2.0
3,103,081	+		DZA65_RS14240	0.28	-0.4
3,103,082	-		DZA65_RS14240	0.28	-1.6
3,103,091	+		DZA65_RS14240	0.28	+0.3
3,103,091	+		DZA65_RS14240	0.28	-1.0
3,103,097	+		DZA65_RS14240	0.28	+0.2
3,103,097	+		DZA65_RS14240	0.28	-1.4
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3,103,097	+		DZA65_RS14240	0.28	-0.6
3,103,097	+		DZA65_RS14240	0.28	+1.5
3,103,097	+		DZA65_RS14240	0.28	+1.1
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-2.9
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-0.4
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	+0.3
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-0.7
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-2.4
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-1.2
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-0.7
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-0.8
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	+1.3
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-0.4
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-2.1
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-0.1
3,103,098	-		DZA65_RS14240	0.28	-0.8
3,103,099	+		DZA65_RS14240	0.28	-0.4
3,103,099	+		DZA65_RS14240	0.28	-1.9
3,103,099	+		DZA65_RS14240	0.28	-1.0
3,103,100	-		DZA65_RS14240	0.28	-1.1
3,103,100	-		DZA65_RS14240	0.28	-0.5
3,103,100	-		DZA65_RS14240	0.28	-0.1
3,103,100	-		DZA65_RS14240	0.28	-0.8
3,103,100	-		DZA65_RS14240	0.28	+0.2
3,103,270	+		DZA65_RS14240	0.29	-0.1
3,103,271	-		DZA65_RS14240	0.29	-1.0
3,103,394	-		DZA65_RS14240	0.30	-0.6
3,103,394	-		DZA65_RS14240	0.30	+0.2
3,103,420	-		DZA65_RS14240	0.31	+1.0
3,103,420	-		DZA65_RS14240	0.31	+0.6
3,103,431	+		DZA65_RS14240	0.31	-0.3
3,103,431	+		DZA65_RS14240	0.31	+0.4
3,103,431	+		DZA65_RS14240	0.31	-1.6
3,103,432	-		DZA65_RS14240	0.31	+0.2
3,103,432	-		DZA65_RS14240	0.31	-0.9
3,103,468	+		DZA65_RS14240	0.31	-0.4
3,103,468	+		DZA65_RS14240	0.31	-2.1
3,103,468	+		DZA65_RS14240	0.31	-0.2
3,103,469	-		DZA65_RS14240	0.31	+0.6
3,103,469	-		DZA65_RS14240	0.31	-0.4
3,103,469	-		DZA65_RS14240	0.31	+1.4
3,103,490	+		DZA65_RS14240	0.31	-1.0
3,103,491	-		DZA65_RS14240	0.31	-0.4
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3,103,540	-		DZA65_RS14240	0.32	+0.2
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3,105,087	-		DZA65_RS14240	0.45	-2.1
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3,105,605	+		DZA65_RS14240	0.50	-0.1
3,105,606	-		DZA65_RS14240	0.50	+0.4
3,105,678	+		DZA65_RS14240	0.50	-0.2
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3,105,678	+		DZA65_RS14240	0.50	-0.4
3,105,678	+		DZA65_RS14240	0.50	-0.0
3,105,678	+		DZA65_RS14240	0.50	-0.6
3,105,679	-		DZA65_RS14240	0.50	+0.3
3,105,679	-		DZA65_RS14240	0.50	+0.4
3,105,679	-		DZA65_RS14240	0.50	+0.1
3,105,679	-		DZA65_RS14240	0.50	-1.1
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3,105,755	+		DZA65_RS14240	0.51	+0.4
3,105,756	-		DZA65_RS14240	0.51	+0.4
3,105,756	-		DZA65_RS14240	0.51	-2.4
3,105,756	-		DZA65_RS14240	0.51	+1.4
3,105,756	-		DZA65_RS14240	0.51	-2.8
3,105,756	-		DZA65_RS14240	0.51	+0.7
3,105,756	-		DZA65_RS14240	0.51	-0.1
3,105,756	-		DZA65_RS14240	0.51	-0.7
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3,105,760	+		DZA65_RS14240	0.51	+1.0
3,105,760	+		DZA65_RS14240	0.51	-1.0
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3,105,761	-		DZA65_RS14240	0.51	+0.2
3,105,761	-		DZA65_RS14240	0.51	+0.1
3,105,772	-		DZA65_RS14240	0.51	-2.1
3,105,772	-		DZA65_RS14240	0.51	-0.2
3,105,772	-		DZA65_RS14240	0.51	-0.2
3,105,782	-		DZA65_RS14240	0.51	-1.1
3,105,785	+		DZA65_RS14240	0.51	+0.4
3,105,801	+		DZA65_RS14240	0.51	-0.9
3,105,802	-		DZA65_RS14240	0.51	-1.1
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3,107,929	-		DZA65_RS14240	0.70	+0.1
3,107,929	-		DZA65_RS14240	0.70	-0.6
3,107,959	-		DZA65_RS14240	0.70	-1.6
3,107,994	+		DZA65_RS14240	0.70	+1.0
3,107,994	+		DZA65_RS14240	0.70	-0.7
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3,107,994	+		DZA65_RS14240	0.70	+0.0
3,107,994	+		DZA65_RS14240	0.70	-0.8
3,107,994	+		DZA65_RS14240	0.70	+1.5
3,107,994	+		DZA65_RS14240	0.70	+0.3
3,107,995	-		DZA65_RS14240	0.70	+1.3
3,107,995	-		DZA65_RS14240	0.70	-0.6
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3,110,260	+		DZA65_RS14240	0.90	-0.4
3,110,313	+				-0.2
3,110,314	-				+0.7
3,110,314	-				+0.3
3,110,314	-				+0.2
3,110,347	+				-0.3
3,110,387	+				+0.8
3,110,387	+				-0.5
3,110,388	-				-0.1
3,110,388	-				-0.8
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