Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS08085

Experiment: LB

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	LB
1,690,947	+		DZA65_RS08080	0.48	+0.3
1,690,948	-		DZA65_RS08080	0.48	+0.6
1,690,978	+		DZA65_RS08080	0.50	-0.5
1,690,979	-		DZA65_RS08080	0.50	-0.1
1,690,979	-		DZA65_RS08080	0.50	-0.9
1,691,206	-		DZA65_RS08080	0.62	-0.7
1,691,206	-		DZA65_RS08080	0.62	+0.6
1,691,266	+		DZA65_RS08080	0.65	+0.0
1,691,266	+		DZA65_RS08080	0.65	+0.3
1,691,483	-		DZA65_RS08080	0.76	+0.2
1,691,483	-		DZA65_RS08080	0.76	-1.1
1,691,484	+		DZA65_RS08080	0.77	+0.5
1,691,485	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.3
1,691,485	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.3
1,691,485	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.3
1,691,485	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.7
1,691,485	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.1
1,691,498	+		DZA65_RS08080	0.77	-0.7
1,691,499	-		DZA65_RS08080	0.77	-0.2
1,691,499	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.5
1,691,499	-		DZA65_RS08080	0.77	+0.3
1,691,499	-		DZA65_RS08080	0.77	-0.9
1,691,527	+		DZA65_RS08080	0.79	-0.6
1,691,527	+		DZA65_RS08080	0.79	-2.0
1,691,528	-		DZA65_RS08080	0.79	-0.7
1,691,560	+		DZA65_RS08080	0.81	+1.1
1,691,560	+		DZA65_RS08080	0.81	-0.2
1,691,560	+		DZA65_RS08080	0.81	+2.3
1,691,560	+		DZA65_RS08080	0.81	-0.1
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-0.1
1,691,561	-				-0.1
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	+0.3
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-1.1
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-0.1
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-0.3
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	+0.8
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-1.4
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-1.9
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	+0.9
1,691,561	-		DZA65_RS08080	0.81	-0.9
1,691,788	+				-0.0
1,691,788	+				-0.9
1,691,788	+				-0.0
1,691,788	+				-0.7
1,691,788	+				+0.3
1,691,788	+				-0.2
1,691,788	+				+0.5
1,691,788	+				-1.0
1,691,788	+				-0.3
1,691,789	-				-0.9
1,691,789	-				-0.2
1,691,789	-				-2.0
1,691,789	-				-0.3
1,691,789	-				+0.2
1,691,789	-				-0.2
1,691,789	-				-0.4
1,691,789	-				-0.3
1,691,789	-				-1.2
1,691,846	+				-0.0
1,691,847	-				+1.9
1,691,847	-				+0.8
1,691,847	-				-1.0
1,691,849	+				-0.4
1,691,849	+				-0.0
1,691,850	-				+1.1
1,691,850	-				+1.1
1,691,850	-				+0.3
1,691,864	+				+0.3
1,691,865	-				-1.0
1,691,865	-				+0.9
1,691,865	-				+0.6
1,691,865	-				-0.1
1,691,894	+				-0.6
1,691,894	+				-0.7
1,691,895	-				+0.3
1,691,895	-				+0.4
1,691,895	-				+0.0
1,691,895	-				+0.4
1,691,920	+				-0.3
1,691,920	+				+0.4
1,691,921	-				+1.9
1,691,921	-				-2.6
1,691,921	-				-0.9
1,691,923	+				+0.1
1,691,923	+				-1.0
1,691,924	-				+0.2
1,691,924	-				-0.5
1,691,924	-				-0.4
1,691,999	+				-1.3
1,692,037	-				+0.5
1,692,068	+		DZA65_RS08085	0.11	-0.6
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-0.5
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-0.1
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	+0.2
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	+0.5
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	+0.4
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-1.5
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	-0.4
1,692,069	-		DZA65_RS08085	0.11	+1.2
1,692,071	+		DZA65_RS08085	0.12	-0.6
1,692,071	+		DZA65_RS08085	0.12	-1.1
1,692,071	+		DZA65_RS08085	0.12	+0.5
1,692,071	+		DZA65_RS08085	0.12	-1.3
1,692,072	-		DZA65_RS08085	0.12	-0.4
1,692,072	-		DZA65_RS08085	0.12	+0.3
1,692,072	-		DZA65_RS08085	0.12	-0.6
1,692,270	+		DZA65_RS08085	0.27	+1.5
1,692,270	+		DZA65_RS08085	0.27	-1.1
1,692,271	-				-0.3
1,692,271	-		DZA65_RS08085	0.28	-0.5
1,692,271	-		DZA65_RS08085	0.28	+0.5
1,692,492	+		DZA65_RS08085	0.45	+0.2
1,692,492	+		DZA65_RS08085	0.45	+0.8
1,692,492	+		DZA65_RS08085	0.45	-0.2
1,692,493	-		DZA65_RS08085	0.45	-0.6
1,692,493	-		DZA65_RS08085	0.45	+0.5
1,692,493	-		DZA65_RS08085	0.45	+0.4
1,692,493	-		DZA65_RS08085	0.45	-0.0
1,692,548	+		DZA65_RS08085	0.50	-0.4
1,692,549	-		DZA65_RS08085	0.50	+0.5
1,692,598	+		DZA65_RS08085	0.54	+1.0
1,692,598	+		DZA65_RS08085	0.54	-1.0
1,692,599	-		DZA65_RS08085	0.54	-2.6
1,692,599	-		DZA65_RS08085	0.54	-0.4
1,692,599	-		DZA65_RS08085	0.54	-0.6
1,692,755	+		DZA65_RS08085	0.66	+0.3
1,692,755	+				+1.1
1,692,767	+		DZA65_RS08085	0.67	-0.6
1,692,767	+		DZA65_RS08085	0.67	-2.0
1,692,767	+		DZA65_RS08085	0.67	+0.9
1,692,767	+		DZA65_RS08085	0.67	+0.1
1,692,767	+		DZA65_RS08085	0.67	+0.8
1,692,768	-		DZA65_RS08085	0.67	+0.3
1,692,768	-		DZA65_RS08085	0.67	-0.5
1,692,768	-		DZA65_RS08085	0.67	+0.5
1,692,768	-		DZA65_RS08085	0.67	-1.2
1,692,952	+		DZA65_RS08085	0.82	-0.5
1,692,970	+		DZA65_RS08085	0.84	+0.8
1,693,001	-		DZA65_RS08085	0.86	-0.2
1,693,043	+		DZA65_RS08085	0.89	+0.5
1,693,044	-		DZA65_RS08085	0.90	-0.2
1,693,091	+				+0.5
1,693,091	+				-0.5
1,693,092	-				-0.5
1,693,092	-				+0.3
1,693,146	+				-0.8
1,693,147	-				-0.2
1,693,147	-				+0.1
1,693,238	+				+1.5
1,693,244	+				-2.6
1,693,244	+				-0.6
1,693,245	-				+0.3
1,693,245	-				+0.6
1,693,245	-				+0.0
1,693,245	-				+0.6
1,693,245	-				+0.3
1,693,245	-				-0.1
1,693,354	+		DZA65_RS08090	0.12	-2.9
1,693,395	+		DZA65_RS08090	0.15	+0.1
1,693,396	-		DZA65_RS08090	0.15	+0.9
1,693,542	+		DZA65_RS08090	0.26	+0.3
1,693,543	-		DZA65_RS08090	0.26	+1.5
1,693,755	-		DZA65_RS08090	0.40	+0.9
1,693,910	+		DZA65_RS08090	0.51	-1.6
1,693,937	+		DZA65_RS08090	0.53	-1.2
1,693,938	-		DZA65_RS08090	0.53	+1.8
1,694,049	+		DZA65_RS08090	0.61	-0.2
1,694,050	-		DZA65_RS08090	0.61	+1.5
1,694,050	-		DZA65_RS08090	0.61	-0.5
1,694,085	-		DZA65_RS08090	0.64	+0.8
1,694,174	-		DZA65_RS08090	0.70	+0.3