Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS18770

Experiment: LB

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	LB
4,046,849	-				-0.8
4,046,871	+				+0.4
4,046,914	+				-1.4
4,046,914	+				-0.2
4,046,914	+				-0.5
4,046,915	-				-0.1
4,046,915	-				-0.7
4,046,970	+		DZA65_RS18765	0.15	-1.4
4,046,971	-		DZA65_RS18765	0.16	-0.4
4,046,971	-		DZA65_RS18765	0.16	-0.5
4,046,993	+		DZA65_RS18765	0.18	-0.9
4,046,993	+		DZA65_RS18765	0.18	-0.9
4,046,994	-		DZA65_RS18765	0.18	-1.7
4,047,126	+		DZA65_RS18765	0.34	-0.4
4,047,163	+		DZA65_RS18765	0.38	-0.0
4,047,172	+		DZA65_RS18765	0.39	-1.7
4,047,205	+		DZA65_RS18765	0.43	+0.3
4,047,205	+		DZA65_RS18765	0.43	+0.3
4,047,205	+		DZA65_RS18765	0.43	-0.2
4,047,205	+		DZA65_RS18765	0.43	+2.1
4,047,205	+		DZA65_RS18765	0.43	+0.4
4,047,205	+		DZA65_RS18765	0.43	-0.7
4,047,205	+		DZA65_RS18765	0.43	-1.4
4,047,205	+				+0.6
4,047,205	+		DZA65_RS18765	0.43	+0.6
4,047,206	-		DZA65_RS18765	0.43	+0.4
4,047,206	-		DZA65_RS18765	0.43	-0.7
4,047,206	-		DZA65_RS18765	0.43	+0.3
4,047,206	-		DZA65_RS18765	0.43	-0.1
4,047,206	-		DZA65_RS18765	0.43	-0.2
4,047,206	-		DZA65_RS18765	0.43	+0.7
4,047,258	+		DZA65_RS18765	0.50	-0.0
4,047,259	-		DZA65_RS18765	0.50	-0.0
4,047,259	-		DZA65_RS18765	0.50	+0.8
4,047,309	+		DZA65_RS18765	0.56	-0.3
4,047,310	-		DZA65_RS18765	0.56	+0.6
4,047,359	+		DZA65_RS18765	0.61	-0.4
4,047,359	+		DZA65_RS18765	0.61	-0.8
4,047,359	+		DZA65_RS18765	0.61	-0.9
4,047,359	+		DZA65_RS18765	0.61	-0.4
4,047,360	-		DZA65_RS18765	0.62	-0.7
4,047,360	-		DZA65_RS18765	0.62	+0.1
4,047,398	-		DZA65_RS18765	0.66	+1.1
4,047,398	-		DZA65_RS18765	0.66	-0.7
4,047,415	+		DZA65_RS18765	0.68	+0.6
4,047,416	-		DZA65_RS18765	0.68	-0.1
4,047,416	-		DZA65_RS18765	0.68	-0.1
4,047,457	-		DZA65_RS18765	0.73	-0.8
4,047,486	-		DZA65_RS18765	0.76	-0.8
4,047,591	-		DZA65_RS18765	0.89	-1.5
4,047,621	+				+0.4
4,047,733	+				-0.2
4,047,733	+				-1.1
4,047,734	-				-0.2
4,047,737	-				+0.1
4,047,741	+				+0.9
4,047,799	-				-1.2
4,047,853	-				+0.5
4,047,854	+				-0.1
4,047,918	-				+0.6
4,047,927	-				-1.3
4,047,981	-		DZA65_RS18770	0.10	-1.1
4,047,986	+		DZA65_RS18770	0.10	+0.6
4,047,986	+		DZA65_RS18770	0.10	-1.2
4,047,986	+		DZA65_RS18770	0.10	-0.4
4,047,986	+		DZA65_RS18770	0.10	-1.9
4,047,986	+		DZA65_RS18770	0.10	+0.8
4,047,987	-		DZA65_RS18770	0.10	-0.4
4,047,987	-		DZA65_RS18770	0.10	+0.1
4,047,987	-		DZA65_RS18770	0.10	-0.7
4,047,987	-		DZA65_RS18770	0.10	+0.1
4,047,987	-		DZA65_RS18770	0.10	+0.1
4,047,987	-		DZA65_RS18770	0.10	+0.2
4,047,987	-		DZA65_RS18770	0.10	-0.4
4,048,006	-		DZA65_RS18770	0.12	-1.2
4,048,028	+		DZA65_RS18770	0.13	-0.8
4,048,028	+		DZA65_RS18770	0.13	-0.5
4,048,029	-		DZA65_RS18770	0.13	+0.4
4,048,029	-		DZA65_RS18770	0.13	+0.1
4,048,098	+		DZA65_RS18770	0.18	-1.1
4,048,098	+		DZA65_RS18770	0.18	-0.6
4,048,098	+		DZA65_RS18770	0.18	+0.3
4,048,098	+		DZA65_RS18770	0.18	-1.4
4,048,099	-		DZA65_RS18770	0.18	+0.1
4,048,099	-		DZA65_RS18770	0.18	-1.2
4,048,134	+		DZA65_RS18770	0.20	-0.4
4,048,134	+		DZA65_RS18770	0.20	-0.2
4,048,135	-		DZA65_RS18770	0.20	-0.2
4,048,135	-		DZA65_RS18770	0.20	-1.4
4,048,135	-		DZA65_RS18770	0.20	+0.6
4,048,135	-		DZA65_RS18770	0.20	+0.3
4,048,135	-		DZA65_RS18770	0.20	-1.8
4,048,137	+		DZA65_RS18770	0.20	-0.4
4,048,137	+		DZA65_RS18770	0.20	-0.1
4,048,137	+		DZA65_RS18770	0.20	-0.7
4,048,137	+		DZA65_RS18770	0.20	-0.4
4,048,137	+		DZA65_RS18770	0.20	-0.2
4,048,137	+		DZA65_RS18770	0.20	-0.2
4,048,137	+		DZA65_RS18770	0.20	-0.9
4,048,138	-		DZA65_RS18770	0.20	+0.2
4,048,138	-		DZA65_RS18770	0.20	+0.1
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	-0.7
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	-0.7
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	+1.4
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	-0.4
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	+0.2
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	+0.1
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	-0.1
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	-0.4
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	+0.1
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	-1.5
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	-1.5
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	-1.8
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	+2.3
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	-0.2
4,048,179	+		DZA65_RS18770	0.23	+0.3
4,048,180	-		DZA65_RS18770	0.23	-0.7
4,048,180	-		DZA65_RS18770	0.23	-0.1
4,048,180	-		DZA65_RS18770	0.23	-1.8
4,048,180	-		DZA65_RS18770	0.23	+0.2
4,048,398	+		DZA65_RS18770	0.37	-0.4
4,048,398	+		DZA65_RS18770	0.37	+0.1
4,048,398	+		DZA65_RS18770	0.37	+1.4
4,048,399	-		DZA65_RS18770	0.37	-0.9
4,048,399	-		DZA65_RS18770	0.37	-1.3
4,048,399	-		DZA65_RS18770	0.37	+0.1
4,048,399	-		DZA65_RS18770	0.37	+0.1
4,048,400	+		DZA65_RS18770	0.37	-1.2
4,048,401	-		DZA65_RS18770	0.37	+0.2
4,048,401	-		DZA65_RS18770	0.37	+0.2
4,048,401	-		DZA65_RS18770	0.37	-0.7
4,048,464	+		DZA65_RS18770	0.41	-1.2
4,048,465	-		DZA65_RS18770	0.41	-0.5
4,048,465	-		DZA65_RS18770	0.41	+1.5
4,048,465	-		DZA65_RS18770	0.41	-2.7
4,048,465	-		DZA65_RS18770	0.41	-0.8
4,048,465	-		DZA65_RS18770	0.41	+2.1
4,048,473	+		DZA65_RS18770	0.42	-0.0
4,048,485	+		DZA65_RS18770	0.42	-0.4
4,048,486	-		DZA65_RS18770	0.43	-0.7
4,048,489	-		DZA65_RS18770	0.43	-1.4
4,048,541	+		DZA65_RS18770	0.46	+0.6
4,048,541	+		DZA65_RS18770	0.46	+0.1
4,048,542	-		DZA65_RS18770	0.46	-0.6
4,048,764	+		DZA65_RS18770	0.60	+2.5
4,048,764	+		DZA65_RS18770	0.60	-0.3
4,048,765	-		DZA65_RS18770	0.60	+0.6
4,048,836	+		DZA65_RS18770	0.65	+0.1
4,048,836	+		DZA65_RS18770	0.65	-1.5
4,048,836	+		DZA65_RS18770	0.65	-0.2
4,048,836	+		DZA65_RS18770	0.65	-0.9
4,048,836	+		DZA65_RS18770	0.65	+0.1
4,048,836	+		DZA65_RS18770	0.65	-1.4
4,048,836	+		DZA65_RS18770	0.65	+2.1
4,048,836	+		DZA65_RS18770	0.65	+1.4
4,048,836	+		DZA65_RS18770	0.65	-0.4
4,048,837	-		DZA65_RS18770	0.65	+0.1
4,048,837	-		DZA65_RS18770	0.65	-1.8
4,048,837	-		DZA65_RS18770	0.65	-0.8
4,048,837	-		DZA65_RS18770	0.65	-1.5
4,048,837	-		DZA65_RS18770	0.65	-0.1
4,048,837	-		DZA65_RS18770	0.65	+0.3
4,048,901	+		DZA65_RS18770	0.69	+0.6
4,048,902	-		DZA65_RS18770	0.69	-0.2
4,049,039	+		DZA65_RS18770	0.78	+0.5
4,049,055	+		DZA65_RS18770	0.79	-1.2
4,049,056	-		DZA65_RS18770	0.79	-1.8
4,049,118	+		DZA65_RS18770	0.83	-1.4
4,049,118	+		DZA65_RS18770	0.83	+0.8
4,049,118	+		DZA65_RS18770	0.83	-0.7
4,049,118	+		DZA65_RS18770	0.83	+0.6
4,049,118	+		DZA65_RS18770	0.83	+0.1
4,049,118	+		DZA65_RS18770	0.83	+0.9
4,049,118	+		DZA65_RS18770	0.83	+0.6
4,049,119	-		DZA65_RS18770	0.83	-0.7
4,049,119	-		DZA65_RS18770	0.83	-0.9
4,049,119	-		DZA65_RS18770	0.83	+0.1
4,049,144	+		DZA65_RS18770	0.85	-0.8
4,049,145	-		DZA65_RS18770	0.85	-1.0
4,049,145	-		DZA65_RS18770	0.85	-1.1
4,049,236	-				-0.4
4,049,296	+				+1.6
4,049,296	+				+1.8
4,049,297	-				-1.8
4,049,297	-				-0.7
4,049,398	+				-0.8
4,049,399	-				+0.2
4,049,399	-				-0.7
4,049,399	-				-0.4
4,049,405	+				-0.7
4,049,406	-				-0.1
4,049,602	+		DZA65_RS18775	0.37	+1.3
4,049,688	+		DZA65_RS18775	0.55	+2.4
4,049,689	-		DZA65_RS18775	0.55	+0.6
4,049,689	-		DZA65_RS18775	0.55	-1.7
4,049,707	+		DZA65_RS18775	0.59	+1.6
4,049,899	-				-1.4
4,049,913	+				+0.4
4,049,913	+				+0.3
4,049,913	+				-0.7
4,049,913	+				-0.7
4,049,913	+				+0.2
4,049,913	+				+0.4
4,049,913	+				-0.2
4,049,914	-				-0.5
4,049,914	-				+0.1
4,049,914	-				-1.7
4,049,914	-				+0.1
4,049,914	-				+0.9
4,049,914	-				-0.2
4,049,914	-				+0.1
4,049,914	-				-1.4
4,049,914	-				-0.1
4,049,915	+				-0.5
4,049,915	+				-1.1
4,049,915	+				+0.5
4,049,915	+				-0.4
4,049,915	+				-0.7
4,049,915	+				+0.6
4,049,915	+				+0.1
4,049,915	+				-0.9
4,049,916	-				-0.5
4,049,916	-				-0.4
4,049,916	-				-0.7
4,049,916	-				-1.7
4,049,916	-				-1.9
4,049,916	-				+0.6
4,049,917	+				-0.7
4,049,918	-				-0.7
4,049,925	+				+2.1
4,050,024	+		DZA65_RS18780	0.11	-1.8
4,050,128	+		DZA65_RS18780	0.33	-1.4
4,050,138	+		DZA65_RS18780	0.35	+1.1
4,050,138	+		DZA65_RS18780	0.35	+0.4
4,050,138	+		DZA65_RS18780	0.35	-0.5
4,050,138	+		DZA65_RS18780	0.35	-0.3
4,050,138	+		DZA65_RS18780	0.35	-1.1
4,050,138	+		DZA65_RS18780	0.35	-0.4
4,050,139	-		DZA65_RS18780	0.36	-1.7
4,050,139	-		DZA65_RS18780	0.36	-0.1
4,050,139	-		DZA65_RS18780	0.36	+1.2
4,050,139	-		DZA65_RS18780	0.36	-0.9
4,050,139	-		DZA65_RS18780	0.36	-1.1
4,050,139	-		DZA65_RS18780	0.36	-0.3
4,050,141	+		DZA65_RS18780	0.36	+0.1
4,050,141	+		DZA65_RS18780	0.36	-0.7
4,050,141	+		DZA65_RS18780	0.36	-0.7
4,050,142	-		DZA65_RS18780	0.36	-0.2
4,050,142	-		DZA65_RS18780	0.36	+1.6
4,050,142	-		DZA65_RS18780	0.36	+1.1
4,050,274	+		DZA65_RS18780	0.65	-1.8
4,050,274	+		DZA65_RS18780	0.65	-0.3
4,050,274	+		DZA65_RS18780	0.65	+0.3
4,050,274	+		DZA65_RS18780	0.65	-0.5
4,050,275	-		DZA65_RS18780	0.65	-1.1
4,050,327	+		DZA65_RS18780	0.76	-0.7
4,050,327	+		DZA65_RS18780	0.76	-0.8
4,050,327	+		DZA65_RS18780	0.76	+1.1
4,050,327	+		DZA65_RS18780	0.76	-0.1
4,050,327	+		DZA65_RS18780	0.76	+0.1
4,050,328	-		DZA65_RS18780	0.76	+1.0
4,050,328	-		DZA65_RS18780	0.76	+0.1
4,050,328	-		DZA65_RS18780	0.76	-1.5
4,050,328	-		DZA65_RS18780	0.76	+1.6
4,050,328	-		DZA65_RS18780	0.76	+1.2
4,050,328	-		DZA65_RS18780	0.76	-1.6
4,050,336	+		DZA65_RS18780	0.78	+0.5