Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS07385

Experiment: LB

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	LB
1,536,592	+		DZA65_RS07375	0.80	-0.1
1,536,658	+				-0.6
1,536,658	+				-1.5
1,536,658	+				+0.9
1,536,658	+				+0.2
1,536,658	+				-0.5
1,536,659	-				+0.2
1,536,659	-				+0.3
1,536,659	-				+1.1
1,536,659	-				-1.8
1,536,671	+				-1.1
1,536,703	+				+0.7
1,536,703	+				-1.3
1,536,704	-				+1.9
1,536,711	+				-1.3
1,536,711	+				-0.2
1,536,712	-				-1.0
1,536,712	-				-0.6
1,536,712	-				+0.3
1,536,712	-				-0.5
1,536,712	-				+0.9
1,536,712	-				+0.5
1,536,847	+				-1.8
1,536,847	+				+0.5
1,536,847	+				+0.3
1,536,847	+				+0.2
1,536,847	+				-0.5
1,536,848	-				-0.6
1,536,848	-				-1.3
1,536,848	-				-0.7
1,536,848	-				-0.3
1,536,848	-				-1.2
1,536,848	-				-1.2
1,536,848	-				-2.0
1,536,848	-				-0.3
1,536,851	+				+1.5
1,536,851	+				-0.1
1,536,851	+				-0.1
1,536,851	+				-0.1
1,536,864	+				+0.9
1,536,865	-				-2.2
1,536,866	+				-0.5
1,536,906	+				+0.8
1,536,906	+				-0.2
1,536,914	-				-0.8
1,537,016	+		DZA65_RS07380	0.15	+0.5
1,537,016	+		DZA65_RS07380	0.15	-1.5
1,537,016	+		DZA65_RS07380	0.15	-1.5
1,537,016	+		DZA65_RS07380	0.15	+1.5
1,537,017	-		DZA65_RS07380	0.15	-0.1
1,537,017	-		DZA65_RS07380	0.15	-0.2
1,537,019	+		DZA65_RS07380	0.15	-0.7
1,537,051	+		DZA65_RS07380	0.22	-1.2
1,537,051	+		DZA65_RS07380	0.22	-1.1
1,537,052	-		DZA65_RS07380	0.22	-0.1
1,537,052	-		DZA65_RS07380	0.22	+0.2
1,537,053	+		DZA65_RS07380	0.22	+0.5
1,537,073	+		DZA65_RS07380	0.26	-1.1
1,537,073	+				+0.5
1,537,094	+		DZA65_RS07380	0.30	-0.4
1,537,094	+		DZA65_RS07380	0.30	-0.1
1,537,095	-		DZA65_RS07380	0.30	+0.7
1,537,095	-		DZA65_RS07380	0.30	-0.5
1,537,116	+		DZA65_RS07380	0.35	-1.6
1,537,116	+		DZA65_RS07380	0.35	-1.8
1,537,117	-		DZA65_RS07380	0.35	+1.1
1,537,117	-		DZA65_RS07380	0.35	-0.8
1,537,135	-		DZA65_RS07380	0.38	-0.3
1,537,204	-		DZA65_RS07380	0.52	-1.3
1,537,204	-		DZA65_RS07380	0.52	+0.8
1,537,204	-		DZA65_RS07380	0.52	+0.8
1,537,232	+		DZA65_RS07380	0.58	-1.3
1,537,232	+		DZA65_RS07380	0.58	-1.3
1,537,278	-		DZA65_RS07380	0.67	-2.8
1,537,278	-		DZA65_RS07380	0.67	-1.3
1,537,301	+				+1.5
1,537,320	+		DZA65_RS07380	0.75	-0.5
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	-0.1
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	+0.3
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	+1.8
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	+0.7
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	+0.5
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	+0.7
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	-1.1
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	-1.2
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	-0.7
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	+0.2
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	-0.7
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	-2.0
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	+0.5
1,537,387	+		DZA65_RS07380	0.89	-0.8
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+0.2
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+0.5
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+1.1
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	-0.1
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	-1.1
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+0.3
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+0.1
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+0.5
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	-1.6
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	-1.1
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+0.3
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	-0.7
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+0.3
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	-2.3
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+0.5
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	-0.5
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+0.2
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	-0.3
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+1.5
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	-0.0
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	+0.3
1,537,388	-		DZA65_RS07380	0.89	-1.5
1,537,389	+		DZA65_RS07380	0.89	+2.3
1,537,390	-		DZA65_RS07380	0.89	-1.1
1,537,430	+				-1.1
1,537,430	+				-1.2
1,537,430	+				-0.3
1,537,430	+				-0.5
1,537,441	+				+0.8
1,537,441	+				+0.5
1,537,442	-				-0.3
1,537,484	+				-0.8
1,537,484	+				-0.5
1,537,484	+				-0.8
1,537,485	-				+0.2
1,537,485	-				-0.3
1,537,485	-				-2.8
1,537,543	+				+0.8
1,537,543	+				+0.2
1,537,544	-				+0.6
1,537,544	-				+1.1
1,537,565	+				-2.4
1,537,565	+				-0.4
1,537,565	+				-1.1
1,537,565	+				-0.5
1,537,565	+				+1.0
1,537,566	-				-1.5
1,537,566	-				+0.8
1,537,566	-				+0.1
1,537,566	-				+0.0
1,537,569	+				-1.6
1,537,569	+				-0.4
1,537,569	+				+0.3
1,537,569	+				+0.8
1,537,569	+				-1.7
1,537,569	+				-1.1
1,537,569	+				+0.6
1,537,569	+				-1.8
1,537,569	+				+0.2
1,537,570	-				+0.5
1,537,570	-				-0.3
1,537,575	+				+0.9
1,537,575	+				-2.6
1,537,575	+				-0.7
1,537,576	-				-0.8
1,537,576	-				-1.1
1,537,576	-				-0.7
1,537,604	+				-1.1
1,537,614	+				+0.5
1,537,614	+				+2.4
1,537,615	-				-0.3
1,537,615	-				+0.8
1,537,615	-				-1.7
1,537,704	+		DZA65_RS07385	0.18	-0.5
1,537,704	+		DZA65_RS07385	0.18	-2.2
1,537,704	+		DZA65_RS07385	0.18	-1.5
1,537,704	+		DZA65_RS07385	0.18	-1.3
1,537,704	+		DZA65_RS07385	0.18	+0.2
1,537,704	+		DZA65_RS07385	0.18	-1.7
1,537,705	-		DZA65_RS07385	0.18	-0.6
1,537,705	-		DZA65_RS07385	0.18	-1.7
1,537,705	-		DZA65_RS07385	0.18	+0.8
1,537,705	-		DZA65_RS07385	0.18	-0.3
1,537,705	-		DZA65_RS07385	0.18	-1.5
1,537,705	-		DZA65_RS07385	0.18	-0.9
1,537,707	+		DZA65_RS07385	0.18	-0.7
1,537,708	-		DZA65_RS07385	0.18	+0.1
1,537,791	+		DZA65_RS07385	0.31	-0.8
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	-1.6
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	-0.1
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	+0.2
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	-0.4
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	+1.2
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	-0.5
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	-0.5
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	+0.2
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	-0.1
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	-0.1
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	+1.2
1,537,793	+		DZA65_RS07385	0.31	-1.0
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	-0.2
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	-0.1
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	+0.8
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	-0.5
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	-2.1
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	-3.0
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	+0.0
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	+0.5
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	-0.8
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	-1.0
1,537,794	-		DZA65_RS07385	0.31	-0.3
1,537,826	+		DZA65_RS07385	0.36	-1.5
1,537,826	+		DZA65_RS07385	0.36	+2.5
1,537,827	-		DZA65_RS07385	0.37	-0.5
1,537,827	-		DZA65_RS07385	0.37	-0.6
1,537,827	-		DZA65_RS07385	0.37	-0.5
1,537,832	-		DZA65_RS07385	0.37	-0.6
1,537,859	-		DZA65_RS07385	0.42	-0.8
1,538,050	+		DZA65_RS07385	0.71	+0.1
1,538,050	+		DZA65_RS07385	0.71	-0.1
1,538,051	-				-0.5
1,538,051	-		DZA65_RS07385	0.71	-2.0
1,538,051	-		DZA65_RS07385	0.71	-0.8
1,538,138	+		DZA65_RS07385	0.85	-0.5
1,538,138	+		DZA65_RS07385	0.85	-0.8
1,538,138	+		DZA65_RS07385	0.85	-0.1
1,538,139	-		DZA65_RS07385	0.85	-0.8
1,538,139	-		DZA65_RS07385	0.85	-0.3
1,538,169	-		DZA65_RS07385	0.90	-1.3
1,538,234	-				-0.4
1,538,351	-				-0.3
1,538,451	+		DZA65_RS07390	0.20	-1.0
1,538,451	+		DZA65_RS07390	0.20	-1.5
1,538,452	-		DZA65_RS07390	0.20	-0.8
1,538,452	-		DZA65_RS07390	0.20	-2.8
1,538,545	+		DZA65_RS07390	0.39	-0.3
1,538,545	+		DZA65_RS07390	0.39	+1.5
1,538,545	+		DZA65_RS07390	0.39	-1.3
1,538,546	-		DZA65_RS07390	0.39	+1.2
1,538,546	-		DZA65_RS07390	0.39	-1.0
1,538,675	-		DZA65_RS07390	0.66	-2.2
1,538,742	+		DZA65_RS07390	0.79	-0.1
1,538,742	+		DZA65_RS07390	0.79	-1.1
1,538,743	-		DZA65_RS07390	0.80	-1.1
1,538,807	+				-1.1
1,538,807	+				-0.3
1,538,807	+				+0.4
1,538,807	+				+0.5
1,538,807	+				+0.3
1,538,808	-				-0.2
1,538,808	-				-0.1
1,538,808	-				+0.5
1,538,808	-				+1.5
1,538,839	+				-1.4
1,538,840	-				-1.5
1,538,840	-				-2.1
1,538,840	-				-2.2
1,538,877	+				+1.2
1,538,877	+				+1.1
1,538,877	+				-1.5
1,538,878	-				-1.1
1,538,878	-				-0.5
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	+0.1
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	-1.3
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	+1.0
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	+1.9
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	-0.5
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	-1.5
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	+0.1
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	-0.5
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	-0.2
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	-0.5
1,538,898	+		DZA65_RS07395	0.11	-0.5
1,538,899	-		DZA65_RS07395	0.11	+1.5
1,538,899	-		DZA65_RS07395	0.11	+1.5
1,538,899	-		DZA65_RS07395	0.11	-0.9
1,538,899	-		DZA65_RS07395	0.11	-0.2
1,538,902	+		DZA65_RS07395	0.11	-1.7
1,538,902	+				+0.5
1,538,902	+				+1.1
1,538,902	+		DZA65_RS07395	0.11	-0.3
1,538,902	+		DZA65_RS07395	0.11	-0.1
1,538,902	+		DZA65_RS07395	0.11	-0.7
1,538,902	+		DZA65_RS07395	0.11	-0.8
1,538,902	+		DZA65_RS07395	0.11	+1.2
1,538,902	+		DZA65_RS07395	0.11	-0.7
1,538,902	+		DZA65_RS07395	0.11	+3.5
1,538,902	+		DZA65_RS07395	0.11	-1.8
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