Strain Fitness in Escherichia coli BW25113

Strain Fitness in Escherichia coli BW25113 around b3172

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

download SVG

download strain data

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	limonene 2.5 vol%
					remove
3,316,026	-				+0.8
3,316,402	+				-0.2
3,316,506	-				-0.5
3,316,506	-				+0.3
3,316,732	+				+0.7
3,316,745	-				-0.4
3,316,749	-				+0.2
3,316,750	-				-0.3
3,316,750	-				+0.9
3,316,750	-				-0.9
3,316,775	+				+0.8
3,316,802	+	argG	b3172	0.11	+0.3
3,316,998	-	argG	b3172	0.25	+0.3
3,316,998	-	argG	b3172	0.25	-0.1
3,317,042	+	argG	b3172	0.28	-0.3
3,317,081	+	argG	b3172	0.31	+0.1
3,317,081	+	argG	b3172	0.31	+0.7
3,317,082	+	argG	b3172	0.31	+0.2
3,317,082	+	argG	b3172	0.31	-0.0
3,317,101	+	argG	b3172	0.33	-0.5
3,317,101	+	argG	b3172	0.33	-0.2
3,317,129	+	argG	b3172	0.35	-0.5
3,317,246	-	argG	b3172	0.44	+0.3
3,317,246	-	argG	b3172	0.44	-0.9
3,317,285	+	argG	b3172	0.47	+0.8
3,317,370	+	argG	b3172	0.53	+0.8
3,317,370	+	argG	b3172	0.53	+1.2
3,317,477	+	argG	b3172	0.61	-0.4
3,317,477	+	argG	b3172	0.61	+0.3
3,317,477	+	argG	b3172	0.61	+0.4
3,317,477	+	argG	b3172	0.61	+1.0
3,317,477	+	argG	b3172	0.61	+0.6
3,317,540	+	argG	b3172	0.66	-0.3
3,317,540	+	argG	b3172	0.66	+0.2
3,317,555	+	argG	b3172	0.67	+0.0
3,317,555	+	argG	b3172	0.67	+0.8
3,317,555	+	argG	b3172	0.67	+0.2
3,317,568	+	argG	b3172	0.68	+0.5
3,317,605	+	argG	b3172	0.70	+0.6
3,317,629	+	argG	b3172	0.72	-0.3
3,317,629	+	argG	b3172	0.72	+1.3
3,317,666	-	argG	b3172	0.75	-0.3
3,317,666	-	argG	b3172	0.75	-0.7
3,317,690	+	argG	b3172	0.77	+0.2
3,317,740	+	argG	b3172	0.80	+0.5
3,317,770	-	argG	b3172	0.83	+0.2
3,317,774	+	argG	b3172	0.83	+0.2
3,317,774	+	argG	b3172	0.83	+0.2
3,317,774	+	argG	b3172	0.83	+0.2
3,317,782	-	argG	b3172	0.84	+1.2
3,317,782	-	argG	b3172	0.84	+0.6
3,317,782	-	argG	b3172	0.84	-0.5
3,317,821	-	argG	b3172	0.86	+1.1
3,317,892	-				-0.5
3,318,002	-				-0.7
3,318,021	-				-1.8
3,318,021	-				+0.7
3,318,021	-				-0.1
3,318,021	-				-0.3
3,318,021	-				-0.0
3,318,026	-				+0.6
3,318,039	-				+0.1
3,318,040	-				-0.3
3,318,086	+				+0.1
3,318,115	-				-0.3
3,318,117	-				-0.9
3,318,119	+				-0.1
3,318,119	+				-0.2
3,318,125	-				+0.1
3,318,125	-				-0.5
3,318,127	-				-0.4
3,318,127	-				-0.4
3,318,241	+	yhbX	b3173	0.14	-0.3
3,318,249	-	yhbX	b3173	0.15	+0.1
3,318,258	-	yhbX	b3173	0.15	+0.7
3,318,260	-	yhbX	b3173	0.15	+0.7
3,318,260	-	yhbX	b3173	0.15	-0.0
3,318,263	+	yhbX	b3173	0.16	-0.1
3,318,263	+	yhbX	b3173	0.16	+0.2
3,318,266	-	yhbX	b3173	0.16	+0.7
3,318,266	-	yhbX	b3173	0.16	+0.7
3,318,271	-	yhbX	b3173	0.16	+0.9
3,318,285	+	yhbX	b3173	0.17	+0.9
3,318,285	+	yhbX	b3173	0.17	-1.5
3,318,303	+	yhbX	b3173	0.18	-0.3
3,318,303	+	yhbX	b3173	0.18	-0.5
3,318,303	-	yhbX	b3173	0.18	+0.1
3,318,311	-	yhbX	b3173	0.19	+0.3
3,318,311	-	yhbX	b3173	0.19	+0.3
3,318,311	-	yhbX	b3173	0.19	+1.0
3,318,315	-	yhbX	b3173	0.19	+0.5
3,318,332	-	yhbX	b3173	0.20	-0.1
3,318,332	-	yhbX	b3173	0.20	+0.0
3,318,342	+	yhbX	b3173	0.20	-0.2
3,318,342	+	yhbX	b3173	0.20	+0.6
3,318,342	+	yhbX	b3173	0.20	+0.6
3,318,352	-	yhbX	b3173	0.21	+1.0
3,318,352	-	yhbX	b3173	0.21	+0.7
3,318,353	+	yhbX	b3173	0.21	+0.0
3,318,361	+	yhbX	b3173	0.22	+1.1
3,318,362	-	yhbX	b3173	0.22	-0.1
3,318,362	-	yhbX	b3173	0.22	+0.7
3,318,362	-	yhbX	b3173	0.22	+0.0
3,318,382	-	yhbX	b3173	0.23	+0.5
3,318,386	-	yhbX	b3173	0.23	+0.3
3,318,437	-	yhbX	b3173	0.26	+0.6
3,318,445	-	yhbX	b3173	0.27	+0.3
3,318,453	+	yhbX	b3173	0.27	+0.3
3,318,454	+	yhbX	b3173	0.27	-0.1
3,318,454	+	yhbX	b3173	0.27	-0.3
3,318,454	+	yhbX	b3173	0.27	-0.1
3,318,454	+	yhbX	b3173	0.27	-0.7
3,318,454	+	yhbX	b3173	0.27	-0.3
3,318,491	-	yhbX	b3173	0.30	+0.7
3,318,492	+	yhbX	b3173	0.30	+0.3
3,318,492	+	yhbX	b3173	0.30	+1.3
3,318,512	-	yhbX	b3173	0.31	+0.8
3,318,512	-	yhbX	b3173	0.31	-0.6
3,318,515	+	yhbX	b3173	0.31	-0.6
3,318,515	+	yhbX	b3173	0.31	-0.2
3,318,567	+	yhbX	b3173	0.34	+0.2
3,318,579	+	yhbX	b3173	0.35	+0.3
3,318,610	-	yhbX	b3173	0.37	-0.7
3,318,633	+	yhbX	b3173	0.38	+0.5
3,318,638	+	yhbX	b3173	0.39	+0.6
3,318,649	+	yhbX	b3173	0.39	+0.7
3,318,649	+	yhbX	b3173	0.39	-0.1
3,318,654	+	yhbX	b3173	0.40	-0.3
3,318,660	-	yhbX	b3173	0.40	-3.6
3,318,660	-	yhbX	b3173	0.40	-1.0
3,318,662	+	yhbX	b3173	0.40	-0.6
3,318,665	-	yhbX	b3173	0.40	+0.1
3,318,669	+	yhbX	b3173	0.41	+0.7
3,318,669	+	yhbX	b3173	0.41	+0.3
3,318,669	+	yhbX	b3173	0.41	-1.3
3,318,669	+	yhbX	b3173	0.41	-0.5
3,318,669	+	yhbX	b3173	0.41	-1.3
3,318,669	+	yhbX	b3173	0.41	+0.8
3,318,669	+	yhbX	b3173	0.41	+0.3
3,318,671	-	yhbX	b3173	0.41	+1.0
3,318,671	-	yhbX	b3173	0.41	+0.2
3,318,672	+	yhbX	b3173	0.41	+0.5
3,318,672	+	yhbX	b3173	0.41	+1.0
3,318,677	-	yhbX	b3173	0.41	+0.1
3,318,679	+	yhbX	b3173	0.41	+0.1
3,318,679	-	yhbX	b3173	0.41	+0.9
3,318,689	+	yhbX	b3173	0.42	-0.2
3,318,689	+	yhbX	b3173	0.42	+0.3
3,318,702	+	yhbX	b3173	0.43	+0.7
3,318,705	-	yhbX	b3173	0.43	+1.2
3,318,705	-	yhbX	b3173	0.43	+0.0
3,318,732	+	yhbX	b3173	0.44	-0.5
3,318,743	+	yhbX	b3173	0.45	-0.2
3,318,743	+	yhbX	b3173	0.45	+0.0
3,318,751	+	yhbX	b3173	0.46	-0.1
3,318,751	-	yhbX	b3173	0.46	-0.1
3,318,780	-	yhbX	b3173	0.47	+0.0
3,318,805	-	yhbX	b3173	0.49	-0.1
3,318,805	-	yhbX	b3173	0.49	+0.3
3,318,805	-	yhbX	b3173	0.49	-0.5
3,318,808	-	yhbX	b3173	0.49	+0.0
3,318,817	-	yhbX	b3173	0.50	-0.4
3,318,817	-	yhbX	b3173	0.50	+1.3
3,318,817	-	yhbX	b3173	0.50	-1.3
3,318,821	+	yhbX	b3173	0.50	+0.5
3,318,821	+	yhbX	b3173	0.50	+0.5
3,318,822	-	yhbX	b3173	0.50	-0.6
3,318,822	-	yhbX	b3173	0.50	+0.6
3,318,822	-	yhbX	b3173	0.50	-0.2
3,318,823	+	yhbX	b3173	0.50	+0.4
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	+1.0
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	+1.4
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	+0.6
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	+0.1
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	+0.1
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	+0.2
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	+1.0
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	-0.2
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	-0.4
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	+0.6
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	-0.6
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	+0.1
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	+0.7
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	-1.1
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	-0.3
3,318,824	+	yhbX	b3173	0.50	-0.4
3,318,831	-	yhbX	b3173	0.50	+0.7
3,318,831	-	yhbX	b3173	0.50	+0.3
3,318,831	-	yhbX	b3173	0.50	+1.1
3,318,831	-	yhbX	b3173	0.50	+0.1
3,318,831	-	yhbX	b3173	0.50	+0.8
3,318,831	-	yhbX	b3173	0.50	+0.3
3,318,831	-	yhbX	b3173	0.50	+1.3
3,318,831	-	yhbX	b3173	0.50	-0.5
3,318,831	-	yhbX	b3173	0.50	+0.2
3,318,831	-	yhbX	b3173	0.50	+0.5
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	+0.5
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	-1.0
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	-0.3
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	-0.5
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	+0.5
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	+0.3
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	-0.0
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	+0.4
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	+0.2
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	-0.2
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	+0.9
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	+0.6
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	+0.3
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	-1.1
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	-0.2
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	+0.2
3,318,832	-	yhbX	b3173	0.51	+0.1
3,318,838	+	yhbX	b3173	0.51	+0.2
3,318,839	+	yhbX	b3173	0.51	-0.3
3,318,843	-	yhbX	b3173	0.51	-0.7
3,318,891	+	yhbX	b3173	0.54	+0.1
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.1
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.4
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.3
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.2
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.3
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.0
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.4
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.3
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.6
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+1.1
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.1
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.0
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.3
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.1
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.3
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.0
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+1.0
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.5
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.1
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.7
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.7
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.6
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.2
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.4
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.6
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.0
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.1
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.2
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.1
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-1.5
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.7
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.5
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.7
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.1
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.8
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	+0.3
3,318,893	+	yhbX	b3173	0.54	-0.3
3,318,899	+	yhbX	b3173	0.55	-0.5
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	+0.8
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	+0.2
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	-0.5
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	-0.0
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	+0.2
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	+0.3
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	+0.6
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	+0.0
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	+0.5
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	-0.0
3,318,901	-	yhbX	b3173	0.55	-0.8
3,318,903	+	yhbX	b3173	0.55	-0.4
3,318,903	-	yhbX	b3173	0.55	-1.4
3,318,903	-	yhbX	b3173	0.55	-0.5
3,318,911	-	yhbX	b3173	0.55	+0.7
3,318,911	-	yhbX	b3173	0.55	-0.2
3,318,912	+	yhbX	b3173	0.55	+0.1
3,318,912	-	yhbX	b3173	0.55	-0.1
3,318,913	+	yhbX	b3173	0.56	+0.1
3,318,913	+	yhbX	b3173	0.56	-0.1
3,318,918	+	yhbX	b3173	0.56	+1.3
3,318,925	+	yhbX	b3173	0.56	-0.5
3,318,932	+	yhbX	b3173	0.57	-0.2
3,318,933	+	yhbX	b3173	0.57	-0.0
3,318,933	+	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,933	+	yhbX	b3173	0.57	+0.4
3,318,933	+	yhbX	b3173	0.57	+1.1
3,318,933	+	yhbX	b3173	0.57	+0.4
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.5
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.5
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	-0.0
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	-0.0
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	-0.8
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.1
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.5
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.4
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	-0.4
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.8
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	-0.5
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.6
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+1.1
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+1.8
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.5
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	-0.0
3,318,935	+	yhbX	b3173	0.57	+0.5
3,318,936	+	yhbX	b3173	0.57	+0.6
3,318,936	+	yhbX	b3173	0.57	-0.4
3,318,936	+	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,936	+	yhbX	b3173	0.57	-0.3
3,318,936	+	yhbX	b3173	0.57	-0.4
3,318,941	+	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,941	-	yhbX	b3173	0.57	+0.8
3,318,941	-	yhbX	b3173	0.57	+0.4
3,318,941	-	yhbX	b3173	0.57	-0.2
3,318,943	+	yhbX	b3173	0.57	+1.0
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	-0.3
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	+0.2
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	-0.3
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	+2.0
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	-0.2
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	-0.1
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	+0.4
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	+0.9
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	-0.4
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	-0.5
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	-0.7
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	+0.2
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	+0.4
3,318,943	-	yhbX	b3173	0.57	-0.1
3,318,944	-	yhbX	b3173	0.57	+0.6
3,318,944	-	yhbX	b3173	0.57	+0.4
3,318,944	-	yhbX	b3173	0.57	-0.1
3,318,944	-	yhbX	b3173	0.57	+0.6
3,318,944	-	yhbX	b3173	0.57	+0.5
3,318,944	-	yhbX	b3173	0.57	+0.1
3,318,944	-	yhbX	b3173	0.57	+0.3
3,318,945	+	yhbX	b3173	0.58	+0.4
3,318,946	+	yhbX	b3173	0.58	+0.1
3,318,951	+	yhbX	b3173	0.58	-0.8
3,318,951	-	yhbX	b3173	0.58	-0.1
3,318,953	-	yhbX	b3173	0.58	+1.0
3,318,953	-	yhbX	b3173	0.58	+0.0
3,318,955	+	yhbX	b3173	0.58	+1.3
3,318,955	+	yhbX	b3173	0.58	-0.3
3,318,957	+	yhbX	b3173	0.58	+0.5
3,318,957	+	yhbX	b3173	0.58	+2.3
3,318,957	+	yhbX	b3173	0.58	+0.0
3,318,958	+	yhbX	b3173	0.58	+0.2
3,318,958	+	yhbX	b3173	0.58	+0.4
3,318,960	+	yhbX	b3173	0.58	+0.5
3,318,960	+	yhbX	b3173	0.58	+0.8
3,318,961	+	yhbX	b3173	0.58	+0.2
3,318,961	+	yhbX	b3173	0.58	+0.5
3,318,961	+	yhbX	b3173	0.58	+0.3
3,318,964	+	yhbX	b3173	0.59	+0.9
3,318,966	+	yhbX	b3173	0.59	+0.2
3,318,966	+	yhbX	b3173	0.59	+0.3
3,318,967	+	yhbX	b3173	0.59	+0.1
3,318,967	+	yhbX	b3173	0.59	+0.3
3,318,967	+	yhbX	b3173	0.59	-0.5
3,318,967	+	yhbX	b3173	0.59	+0.3
3,318,967	+	yhbX	b3173	0.59	-1.2
3,318,967	+	yhbX	b3173	0.59	-0.3
3,318,967	+	yhbX	b3173	0.59	+0.3
3,318,967	+	yhbX	b3173	0.59	-0.5
3,318,969	+	yhbX	b3173	0.59	-0.7
3,318,969	+	yhbX	b3173	0.59	-0.1
3,318,971	+	yhbX	b3173	0.59	+0.1
3,318,974	+	yhbX	b3173	0.59	-0.2
3,318,975	+	yhbX	b3173	0.59	+1.6
3,318,979	+	yhbX	b3173	0.60	-0.3
3,318,979	+	yhbX	b3173	0.60	+0.1
3,318,980	+	yhbX	b3173	0.60	+0.3
3,318,982	-	yhbX	b3173	0.60	-0.8
3,319,000	+	yhbX	b3173	0.61	-0.1
3,319,000	+	yhbX	b3173	0.61	+0.9

Or see this region's nucleotide sequence