Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS09975

Experiment: Stem-Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Stem-Atlantic
2,107,694	+		DZA65_RS09970	0.12	+0.7
2,107,694	+		DZA65_RS09970	0.12	+1.0
2,107,694	+		DZA65_RS09970	0.12	-1.6
2,107,694	+		DZA65_RS09970	0.12	+1.3
2,107,695	-		DZA65_RS09970	0.12	-0.4
2,107,695	-		DZA65_RS09970	0.12	-0.3
2,107,695	-		DZA65_RS09970	0.12	-0.9
2,107,841	+		DZA65_RS09970	0.32	-0.9
2,107,842	-		DZA65_RS09970	0.32	-0.3
2,107,842	-		DZA65_RS09970	0.32	-2.1
2,107,842	-		DZA65_RS09970	0.32	+0.4
2,107,842	-		DZA65_RS09970	0.32	-0.3
2,107,896	+		DZA65_RS09970	0.40	+0.7
2,107,897	-		DZA65_RS09970	0.40	-0.3
2,107,962	+		DZA65_RS09970	0.48	+1.1
2,107,963	-		DZA65_RS09970	0.49	+0.7
2,108,040	+		DZA65_RS09970	0.59	-1.5
2,108,040	+		DZA65_RS09970	0.59	+0.5
2,108,040	+		DZA65_RS09970	0.59	+0.7
2,108,040	+		DZA65_RS09970	0.59	+0.7
2,108,040	+		DZA65_RS09970	0.59	+0.7
2,108,040	+		DZA65_RS09970	0.59	-0.1
2,108,041	-		DZA65_RS09970	0.59	+0.2
2,108,041	-		DZA65_RS09970	0.59	-0.6
2,108,041	-		DZA65_RS09970	0.59	-1.6
2,108,041	-		DZA65_RS09970	0.59	-0.3
2,108,041	-		DZA65_RS09970	0.59	-0.3
2,108,041	-		DZA65_RS09970	0.59	-3.1
2,108,043	+		DZA65_RS09970	0.59	-0.4
2,108,043	+		DZA65_RS09970	0.59	+1.0
2,108,044	-		DZA65_RS09970	0.60	+0.4
2,108,044	-		DZA65_RS09970	0.60	-0.7
2,108,100	+		DZA65_RS09970	0.67	-0.0
2,108,101	-		DZA65_RS09970	0.67	-1.6
2,108,145	+		DZA65_RS09970	0.73	-2.5
2,108,146	-		DZA65_RS09970	0.73	-2.1
2,108,156	+		DZA65_RS09970	0.75	+0.1
2,108,156	+		DZA65_RS09970	0.75	+0.1
2,108,156	+		DZA65_RS09970	0.75	+1.3
2,108,238	-		DZA65_RS09970	0.86	+0.3
2,108,274	+				-0.5
2,108,296	+				-0.2
2,108,296	+				-0.7
2,108,334	+				+1.1
2,108,424	+				-1.5
2,108,424	+				-0.6
2,108,424	+				+0.3
2,108,424	+				+0.7
2,108,424	+				-1.3
2,108,425	-				+0.0
2,108,425	-				+1.3
2,108,591	+				-0.1
2,108,591	+				-0.3
2,108,593	+				-0.5
2,108,621	+				+1.9
2,108,622	-				+0.1
2,108,622	-				-0.9
2,108,622	-				+1.7
2,108,648	+				-1.5
2,108,648	+				-0.2
2,108,648	+				-1.2
2,108,649	-				-1.1
2,108,649	-				+0.1
2,108,649	-				-0.2
2,108,649	-				-0.4
2,108,652	+				+0.5
2,108,653	-				-2.5
2,108,671	+				-1.9
2,108,671	+				-2.8
2,108,671	+				-1.3
2,108,678	-				+0.1
2,108,856	+				-2.5
2,108,857	-				-2.1
2,108,857	-				-0.3
2,108,887	+		DZA65_RS09975	0.10	-2.0
2,108,888	-		DZA65_RS09975	0.10	-2.1
2,108,888	-		DZA65_RS09975	0.10	-0.7
2,108,888	-		DZA65_RS09975	0.10	-2.1
2,108,888	-		DZA65_RS09975	0.10	-0.3
2,108,891	+		DZA65_RS09975	0.11	-2.1
2,108,891	+		DZA65_RS09975	0.11	-0.3
2,108,892	-		DZA65_RS09975	0.11	-2.3
2,108,935	+		DZA65_RS09975	0.12	-1.3
2,108,935	+		DZA65_RS09975	0.12	-0.9
2,108,935	+		DZA65_RS09975	0.12	-1.1
2,108,935	+		DZA65_RS09975	0.12	-1.3
2,108,936	-		DZA65_RS09975	0.12	-0.9
2,108,936	-		DZA65_RS09975	0.12	-0.0
2,108,936	-		DZA65_RS09975	0.12	-0.5
2,108,936	-		DZA65_RS09975	0.12	-1.7
2,108,936	-		DZA65_RS09975	0.12	+1.7
2,108,936	-		DZA65_RS09975	0.12	-1.6
2,108,936	-		DZA65_RS09975	0.12	-0.7
2,108,937	+		DZA65_RS09975	0.13	+0.7
2,108,938	-		DZA65_RS09975	0.13	-2.3
2,108,938	-		DZA65_RS09975	0.13	-0.3
2,108,938	-		DZA65_RS09975	0.13	-0.9
2,108,944	+		DZA65_RS09975	0.13	-1.6
2,108,945	-		DZA65_RS09975	0.13	-0.1
2,108,945	-		DZA65_RS09975	0.13	-0.7
2,108,945	-		DZA65_RS09975	0.13	-0.8
2,108,974	+		DZA65_RS09975	0.14	+0.7
2,108,975	-		DZA65_RS09975	0.14	-0.2
2,108,975	-		DZA65_RS09975	0.14	-0.3
2,108,979	-		DZA65_RS09975	0.14	-0.9
2,109,096	+		DZA65_RS09975	0.19	+0.7
2,109,096	+		DZA65_RS09975	0.19	-2.1
2,109,096	+		DZA65_RS09975	0.19	-1.0
2,109,097	-		DZA65_RS09975	0.20	-0.3
2,109,097	-		DZA65_RS09975	0.20	-0.9
2,109,097	-		DZA65_RS09975	0.20	-0.9
2,109,097	-		DZA65_RS09975	0.20	-1.3
2,109,097	-		DZA65_RS09975	0.20	-0.2
2,109,150	+		DZA65_RS09975	0.22	-1.9
2,109,150	+		DZA65_RS09975	0.22	-1.2
2,109,151	-		DZA65_RS09975	0.22	+0.9
2,109,154	+		DZA65_RS09975	0.22	-0.3
2,109,155	-		DZA65_RS09975	0.22	-0.3
2,109,155	-		DZA65_RS09975	0.22	+0.7
2,109,155	-		DZA65_RS09975	0.22	-2.2
2,109,188	+		DZA65_RS09975	0.24	+1.7
2,109,188	+		DZA65_RS09975	0.24	-1.3
2,109,188	+		DZA65_RS09975	0.24	-0.8
2,109,188	+		DZA65_RS09975	0.24	-0.5
2,109,188	+		DZA65_RS09975	0.24	+0.7
2,109,189	-		DZA65_RS09975	0.24	-0.3
2,109,189	-		DZA65_RS09975	0.24	-1.6
2,109,189	-		DZA65_RS09975	0.24	-1.6
2,109,309	+		DZA65_RS09975	0.29	-0.3
2,109,309	+		DZA65_RS09975	0.29	-0.5
2,109,310	-		DZA65_RS09975	0.29	-1.1
2,109,310	-		DZA65_RS09975	0.29	-0.6
2,109,310	-		DZA65_RS09975	0.29	-1.9
2,109,371	-		DZA65_RS09975	0.32	-0.3
2,109,414	+		DZA65_RS09975	0.33	-0.6
2,109,414	+		DZA65_RS09975	0.33	-1.8
2,109,414	+		DZA65_RS09975	0.33	-0.1
2,109,414	+		DZA65_RS09975	0.33	-0.9
2,109,414	+		DZA65_RS09975	0.33	-0.3
2,109,414	+		DZA65_RS09975	0.33	-3.0
2,109,414	+		DZA65_RS09975	0.33	-1.1
2,109,414	+		DZA65_RS09975	0.33	-0.4
2,109,414	+		DZA65_RS09975	0.33	+0.7
2,109,415	-		DZA65_RS09975	0.33	-2.6
2,109,415	-		DZA65_RS09975	0.33	-0.3
2,109,415	-		DZA65_RS09975	0.33	+0.7
2,109,415	-		DZA65_RS09975	0.33	+0.7
2,109,420	+		DZA65_RS09975	0.34	-0.0
2,109,420	+		DZA65_RS09975	0.34	-0.7
2,109,420	+		DZA65_RS09975	0.34	-1.3
2,109,420	+		DZA65_RS09975	0.34	-1.0
2,109,420	+		DZA65_RS09975	0.34	-0.3
2,109,420	+		DZA65_RS09975	0.34	-0.9
2,109,421	-		DZA65_RS09975	0.34	-1.9
2,109,421	-		DZA65_RS09975	0.34	-1.1
2,109,421	-		DZA65_RS09975	0.34	-0.5
2,109,421	-		DZA65_RS09975	0.34	-1.6
2,109,421	-		DZA65_RS09975	0.34	+0.7
2,109,421	-		DZA65_RS09975	0.34	-0.8
2,109,421	-		DZA65_RS09975	0.34	-1.7
2,109,435	+		DZA65_RS09975	0.34	-0.1
2,109,435	+		DZA65_RS09975	0.34	+0.4
2,109,435	+		DZA65_RS09975	0.34	-2.5
2,109,435	+		DZA65_RS09975	0.34	-0.6
2,109,435	+		DZA65_RS09975	0.34	+0.7
2,109,435	+		DZA65_RS09975	0.34	+0.7
2,109,435	+		DZA65_RS09975	0.34	-2.3
2,109,435	+		DZA65_RS09975	0.34	-0.6
2,109,435	+		DZA65_RS09975	0.34	+0.7
2,109,436	-		DZA65_RS09975	0.34	+0.3
2,109,436	-		DZA65_RS09975	0.34	+0.5
2,109,436	-		DZA65_RS09975	0.34	-1.6
2,109,436	-		DZA65_RS09975	0.34	-0.6
2,109,462	+		DZA65_RS09975	0.36	-2.8
2,109,462	+		DZA65_RS09975	0.36	-0.9
2,109,462	+		DZA65_RS09975	0.36	-0.3
2,109,462	+		DZA65_RS09975	0.36	-1.6
2,109,462	+		DZA65_RS09975	0.36	+0.3
2,109,462	+		DZA65_RS09975	0.36	-1.8
2,109,462	+		DZA65_RS09975	0.36	-2.6
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	-0.7
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	-2.3
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	-0.5
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	-0.3
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	-0.6
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	-1.7
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	-0.1
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	-1.1
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	+0.7
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	-1.5
2,109,463	-		DZA65_RS09975	0.36	-0.6
2,109,497	-		DZA65_RS09975	0.37	+0.0
2,109,600	+		DZA65_RS09975	0.42	-2.5
2,109,600	+		DZA65_RS09975	0.42	+0.7
2,109,600	+		DZA65_RS09975	0.42	+0.2
2,109,600	+		DZA65_RS09975	0.42	-3.4
2,109,600	+		DZA65_RS09975	0.42	-2.6
2,109,600	+		DZA65_RS09975	0.42	+0.3
2,109,601	-		DZA65_RS09975	0.42	-1.3
2,109,601	-		DZA65_RS09975	0.42	-0.1
2,109,601	-		DZA65_RS09975	0.42	-1.3
2,109,622	+		DZA65_RS09975	0.43	-0.3
2,109,659	+		DZA65_RS09975	0.44	-0.5
2,109,660	-				+0.3
2,109,660	-		DZA65_RS09975	0.44	-0.3
2,109,660	-		DZA65_RS09975	0.44	-1.2
2,109,660	-		DZA65_RS09975	0.44	-0.3
2,109,660	-		DZA65_RS09975	0.44	+0.5
2,109,671	+		DZA65_RS09975	0.45	+3.0
2,109,671	+		DZA65_RS09975	0.45	-0.5
2,109,672	-		DZA65_RS09975	0.45	-0.6
2,109,672	-		DZA65_RS09975	0.45	-1.6
2,109,691	-		DZA65_RS09975	0.46	-1.0
2,109,735	+		DZA65_RS09975	0.47	-0.3
2,109,766	+		DZA65_RS09975	0.49	-1.3
2,109,767	-		DZA65_RS09975	0.49	+1.0
2,109,767	-		DZA65_RS09975	0.49	-1.6
2,109,844	+		DZA65_RS09975	0.52	-1.6
2,109,844	+		DZA65_RS09975	0.52	+0.7
2,109,849	+		DZA65_RS09975	0.52	+0.9
2,109,849	+		DZA65_RS09975	0.52	+0.7
2,109,849	+		DZA65_RS09975	0.52	-1.9
2,109,849	+		DZA65_RS09975	0.52	-0.6
2,109,850	-		DZA65_RS09975	0.53	+0.6
2,109,850	-		DZA65_RS09975	0.53	-2.1
2,109,850	-		DZA65_RS09975	0.53	-1.1
2,109,910	+		DZA65_RS09975	0.55	+0.2
2,109,937	+		DZA65_RS09975	0.56	-0.7
2,109,991	+		DZA65_RS09975	0.59	-0.6
2,109,992	-		DZA65_RS09975	0.59	-1.6
2,110,074	+		DZA65_RS09975	0.62	+0.7
2,110,074	+		DZA65_RS09975	0.62	-1.3
2,110,074	+		DZA65_RS09975	0.62	-2.1
2,110,074	+		DZA65_RS09975	0.62	-2.3
2,110,074	+		DZA65_RS09975	0.62	-0.9
2,110,074	+		DZA65_RS09975	0.62	-0.9
2,110,075	-		DZA65_RS09975	0.62	-1.1
2,110,075	-		DZA65_RS09975	0.62	-0.1
2,110,075	-		DZA65_RS09975	0.62	-0.6
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