Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS13865

Experiment: Stem-Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Stem-Atlantic
2,975,766	+		DZA65_RS13860	0.25	+0.9
2,975,766	+		DZA65_RS13860	0.25	-0.3
2,975,767	-		DZA65_RS13860	0.25	+1.4
2,975,767	-		DZA65_RS13860	0.25	-0.3
2,975,767	-		DZA65_RS13860	0.25	-2.3
2,975,772	+		DZA65_RS13860	0.25	-0.4
2,975,772	+		DZA65_RS13860	0.25	-2.6
2,975,772	+		DZA65_RS13860	0.25	+0.7
2,975,772	+		DZA65_RS13860	0.25	-0.7
2,975,773	-		DZA65_RS13860	0.26	-0.6
2,975,773	-		DZA65_RS13860	0.26	-1.3
2,975,815	+		DZA65_RS13860	0.29	-2.3
2,975,815	+		DZA65_RS13860	0.29	-0.9
2,975,815	+		DZA65_RS13860	0.29	-2.8
2,975,816	-		DZA65_RS13860	0.29	+0.0
2,975,816	-		DZA65_RS13860	0.29	-0.7
2,975,819	-		DZA65_RS13860	0.30	-0.4
2,975,844	+		DZA65_RS13860	0.32	+0.6
2,975,844	+		DZA65_RS13860	0.32	-1.7
2,975,850	+		DZA65_RS13860	0.32	-1.3
2,975,850	+		DZA65_RS13860	0.32	-0.3
2,975,851	-		DZA65_RS13860	0.32	-1.9
2,975,885	-		DZA65_RS13860	0.35	+0.4
2,975,886	+		DZA65_RS13860	0.36	-0.3
2,975,886	+		DZA65_RS13860	0.36	-3.5
2,975,886	+		DZA65_RS13860	0.36	-0.7
2,975,886	+		DZA65_RS13860	0.36	-3.0
2,975,886	+		DZA65_RS13860	0.36	-0.9
2,975,887	-		DZA65_RS13860	0.36	-3.2
2,975,887	-		DZA65_RS13860	0.36	-0.8
2,975,887	-		DZA65_RS13860	0.36	-2.7
2,975,991	+		DZA65_RS13860	0.45	-1.2
2,976,052	+		DZA65_RS13860	0.50	-1.5
2,976,052	+		DZA65_RS13860	0.50	-1.2
2,976,052	+		DZA65_RS13860	0.50	+0.7
2,976,052	+		DZA65_RS13860	0.50	-0.9
2,976,053	-		DZA65_RS13860	0.50	+0.7
2,976,053	-		DZA65_RS13860	0.50	-1.6
2,976,053	-		DZA65_RS13860	0.50	-0.3
2,976,053	-		DZA65_RS13860	0.50	-0.9
2,976,053	-		DZA65_RS13860	0.50	+0.7
2,976,053	-		DZA65_RS13860	0.50	+0.7
2,976,053	-		DZA65_RS13860	0.50	+1.7
2,976,053	-		DZA65_RS13860	0.50	-1.5
2,976,056	+		DZA65_RS13860	0.51	-0.3
2,976,057	-		DZA65_RS13860	0.51	-1.1
2,976,097	-		DZA65_RS13860	0.54	-1.3
2,976,106	+		DZA65_RS13860	0.55	-1.5
2,976,107	-		DZA65_RS13860	0.55	-0.9
2,976,168	+		DZA65_RS13860	0.61	+0.4
2,976,182	-		DZA65_RS13860	0.62	-0.0
2,976,211	+		DZA65_RS13860	0.64	-0.5
2,976,212	-		DZA65_RS13860	0.65	-1.9
2,976,212	-		DZA65_RS13860	0.65	-1.6
2,976,212	-		DZA65_RS13860	0.65	-1.0
2,976,216	+		DZA65_RS13860	0.65	-1.9
2,976,217	-		DZA65_RS13860	0.65	-1.6
2,976,217	-		DZA65_RS13860	0.65	+1.3
2,976,217	-		DZA65_RS13860	0.65	-0.3
2,976,217	-		DZA65_RS13860	0.65	-1.3
2,976,328	+		DZA65_RS13860	0.75	-0.9
2,976,339	-		DZA65_RS13860	0.76	-1.1
2,976,366	+		DZA65_RS13860	0.78	-2.1
2,976,366	+		DZA65_RS13860	0.78	-0.5
2,976,366	+		DZA65_RS13860	0.78	-0.3
2,976,398	+		DZA65_RS13860	0.81	-1.6
2,976,468	+		DZA65_RS13860	0.87	-1.5
2,976,469	-		DZA65_RS13860	0.87	-2.8
2,976,522	+				+0.1
2,976,522	+				-0.3
2,976,522	+				-0.3
2,976,523	-				-2.1
2,976,523	-				-2.6
2,976,523	-				-2.5
2,976,523	-				+1.1
2,976,557	-				-0.3
2,976,590	+				-1.6
2,976,590	+				+1.2
2,976,591	-				-0.9
2,976,594	+				-1.6
2,976,594	+				-1.6
2,976,594	+				-2.3
2,976,594	+				+1.4
2,976,594	+				-1.0
2,976,594	+				-1.3
2,976,594	+				-0.9
2,976,595	-				-0.3
2,976,595	-				-0.9
2,976,595	-				-2.1
2,976,595	-				-0.3
2,976,595	-				-1.6
2,976,595	-				+0.1
2,976,595	-				-1.1
2,976,595	-				-1.3
2,976,631	+				-1.8
2,976,631	+				-0.6
2,976,631	+				+1.3
2,976,632	-				-0.0
2,976,632	-				-1.1
2,976,632	-				+0.4
2,976,632	-				-0.1
2,976,644	+				-1.5
2,976,645	-				+0.5
2,976,663	+				-1.3
2,976,664	-				+0.7
2,976,664	-				+0.7
2,976,729	+				+0.7
2,976,730	-				-0.2
2,976,730	-				+0.0
2,976,730	-				+0.7
2,976,730	-				-0.3
2,976,734	-				-0.3
2,976,734	-				-0.9
2,976,734	-				-0.3
2,976,739	+				+0.2
2,976,739	+				+0.7
2,976,740	-				-1.3
2,976,740	-				-1.9
2,976,793	+				-0.7
2,976,794	-				+0.7
2,976,794	-				-0.9
2,976,794	-				-0.3
2,976,814	-				-0.9
2,976,925	+				+0.0
2,976,965	+				-1.8
2,976,965	+				-0.3
2,976,965	+				-3.0
2,976,965	+				-1.3
2,976,966	-				-0.4
2,976,986	+				-0.0
2,976,986	+				-1.6
2,976,986	+				-0.3
2,976,986	+				+0.3
2,976,987	-				-1.3
2,977,088	+		DZA65_RS13865	0.10	-2.2
2,977,090	+		DZA65_RS13865	0.10	-1.6
2,977,090	+		DZA65_RS13865	0.10	-2.1
2,977,091	-		DZA65_RS13865	0.10	-0.1
2,977,096	+		DZA65_RS13865	0.10	+0.3
2,977,096	+		DZA65_RS13865	0.10	-0.9
2,977,097	-		DZA65_RS13865	0.10	-0.6
2,977,097	-		DZA65_RS13865	0.10	+0.7
2,977,116	+		DZA65_RS13865	0.11	-1.6
2,977,116	+		DZA65_RS13865	0.11	-1.3
2,977,116	+		DZA65_RS13865	0.11	-2.1
2,977,117	-		DZA65_RS13865	0.11	+1.2
2,977,216	+		DZA65_RS13865	0.14	-1.9
2,977,217	-		DZA65_RS13865	0.14	+0.3
2,977,243	+		DZA65_RS13865	0.15	+0.3
2,977,243	+		DZA65_RS13865	0.15	-2.1
2,977,243	+		DZA65_RS13865	0.15	-2.1
2,977,244	-		DZA65_RS13865	0.15	+0.7
2,977,244	-		DZA65_RS13865	0.15	+0.0
2,977,244	-		DZA65_RS13865	0.15	-1.8
2,977,244	-		DZA65_RS13865	0.15	-1.3
2,977,244	-		DZA65_RS13865	0.15	-0.3
2,977,412	-		DZA65_RS13865	0.20	-1.2
2,977,429	+		DZA65_RS13865	0.20	-0.6
2,977,429	+		DZA65_RS13865	0.20	+0.7
2,977,430	-		DZA65_RS13865	0.20	-0.3
2,977,430	-		DZA65_RS13865	0.20	-0.9
2,977,430	-		DZA65_RS13865	0.20	-3.7
2,977,430	-		DZA65_RS13865	0.20	-1.0
2,977,450	+		DZA65_RS13865	0.21	-0.9
2,977,450	+		DZA65_RS13865	0.21	-2.6
2,977,450	+		DZA65_RS13865	0.21	-0.9
2,977,451	-		DZA65_RS13865	0.21	-0.9
2,977,477	+		DZA65_RS13865	0.21	+0.1
2,977,477	+		DZA65_RS13865	0.21	+0.6
2,977,477	+		DZA65_RS13865	0.21	+0.1
2,977,477	+		DZA65_RS13865	0.21	+0.7
2,977,478	-		DZA65_RS13865	0.21	-0.2
2,977,497	-		DZA65_RS13865	0.22	+0.1
2,977,498	+		DZA65_RS13865	0.22	-1.1
2,977,498	+		DZA65_RS13865	0.22	+0.1
2,977,498	+		DZA65_RS13865	0.22	-1.3
2,977,498	+		DZA65_RS13865	0.22	-1.4
2,977,498	+		DZA65_RS13865	0.22	-0.6
2,977,498	+				-1.6
2,977,499	-		DZA65_RS13865	0.22	-1.3
2,977,499	-		DZA65_RS13865	0.22	-0.9
2,977,499	-		DZA65_RS13865	0.22	-0.9
2,977,499	-		DZA65_RS13865	0.22	-0.1
2,977,590	-		DZA65_RS13865	0.25	-0.3
2,977,590	-		DZA65_RS13865	0.25	-2.2
2,977,591	+		DZA65_RS13865	0.25	-0.7
2,977,591	+		DZA65_RS13865	0.25	-1.8
2,977,591	+		DZA65_RS13865	0.25	-2.1
2,977,591	+		DZA65_RS13865	0.25	+1.2
2,977,591	+		DZA65_RS13865	0.25	-2.1
2,977,592	-		DZA65_RS13865	0.25	-1.3
2,977,592	-		DZA65_RS13865	0.25	-0.5
2,977,592	-		DZA65_RS13865	0.25	-1.6
2,977,637	+		DZA65_RS13865	0.26	-1.9
2,977,638	-		DZA65_RS13865	0.26	+1.1
2,977,707	+		DZA65_RS13865	0.28	-0.9
2,977,707	+		DZA65_RS13865	0.28	+1.4
2,977,707	+		DZA65_RS13865	0.28	+0.1
2,977,707	+		DZA65_RS13865	0.28	-1.3
2,977,731	-		DZA65_RS13865	0.29	-2.1
2,977,731	-		DZA65_RS13865	0.29	+1.7
2,977,731	-		DZA65_RS13865	0.29	-0.6
2,977,747	+		DZA65_RS13865	0.29	-0.9
2,977,753	+		DZA65_RS13865	0.29	-2.9
2,977,753	+		DZA65_RS13865	0.29	-0.7
2,977,772	+		DZA65_RS13865	0.30	-0.0
2,977,772	+		DZA65_RS13865	0.30	-0.7
2,977,773	-		DZA65_RS13865	0.30	-0.3
2,977,773	-		DZA65_RS13865	0.30	-1.1
2,977,773	-		DZA65_RS13865	0.30	-1.3
2,977,790	+		DZA65_RS13865	0.31	-0.0
2,977,791	-		DZA65_RS13865	0.31	-0.3
2,977,791	-		DZA65_RS13865	0.31	-1.2
2,977,839	-		DZA65_RS13865	0.32	-0.4
2,977,839	-		DZA65_RS13865	0.32	-0.1
2,977,839	-		DZA65_RS13865	0.32	-0.6
2,977,871	+		DZA65_RS13865	0.33	-3.0
2,977,872	-		DZA65_RS13865	0.33	-0.7
2,977,920	+		DZA65_RS13865	0.34	+0.1
2,977,920	+		DZA65_RS13865	0.34	-1.3
2,977,935	+		DZA65_RS13865	0.35	-1.3
2,977,935	+		DZA65_RS13865	0.35	-1.3
2,977,935	+		DZA65_RS13865	0.35	+0.5
2,977,936	-		DZA65_RS13865	0.35	-2.2
2,977,938	+		DZA65_RS13865	0.35	-0.3
2,977,938	+		DZA65_RS13865	0.35	-2.1
2,977,938	+		DZA65_RS13865	0.35	-3.4
2,977,938	+		DZA65_RS13865	0.35	+0.5
2,977,938	+		DZA65_RS13865	0.35	-0.4
2,977,938	+		DZA65_RS13865	0.35	+0.4
2,977,939	-		DZA65_RS13865	0.35	+1.9
2,977,939	-		DZA65_RS13865	0.35	-1.3
2,977,939	-		DZA65_RS13865	0.35	-2.3
2,977,939	-		DZA65_RS13865	0.35	+1.3
2,978,009	-		DZA65_RS13865	0.37	-0.3
2,978,009	-		DZA65_RS13865	0.37	+1.3
2,978,009	-		DZA65_RS13865	0.37	-0.0
2,978,009	-		DZA65_RS13865	0.37	-0.4
2,978,009	-		DZA65_RS13865	0.37	-2.3
2,978,045	+		DZA65_RS13865	0.38	-0.9
2,978,046	-		DZA65_RS13865	0.38	-1.0
2,978,054	-		DZA65_RS13865	0.38	+0.1
2,978,109	-		DZA65_RS13865	0.40	+0.1
2,978,156	+		DZA65_RS13865	0.41	-2.1
2,978,157	-		DZA65_RS13865	0.41	-1.9
2,978,174	+		DZA65_RS13865	0.42	-2.3
2,978,174	+		DZA65_RS13865	0.42	-0.6
2,978,241	+		DZA65_RS13865	0.44	+0.7
2,978,241	+		DZA65_RS13865	0.44	-1.9
2,978,242	-		DZA65_RS13865	0.44	-1.9
2,978,242	-		DZA65_RS13865	0.44	+1.3
2,978,392	+		DZA65_RS13865	0.48	-0.9
2,978,392	+		DZA65_RS13865	0.48	+0.7
2,978,392	+		DZA65_RS13865	0.48	-0.6
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2,979,086	+		DZA65_RS13865	0.68	-1.0
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2,979,707	-		DZA65_RS13865	0.86	-0.1
2,979,707	-				-1.3
2,979,707	-		DZA65_RS13865	0.86	+0.1
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2,979,814	+		DZA65_RS13865	0.89	+1.3
2,979,814	+		DZA65_RS13865	0.89	-0.9
2,979,814	+		DZA65_RS13865	0.89	-1.3
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2,980,131	-				+0.7
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2,980,345	-				-1.6
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2,980,345	-				+0.7
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2,980,420	-				-0.3
2,980,420	-				-0.3
2,980,477	+				-3.3
2,980,477	+				-0.3
2,980,477	+				-0.9
2,980,513	+		DZA65_RS13870	0.11	-1.9
2,980,513	+		DZA65_RS13870	0.11	-1.6
2,980,513	+		DZA65_RS13870	0.11	-0.9
2,980,513	+		DZA65_RS13870	0.11	-2.1
2,980,513	+		DZA65_RS13870	0.11	-2.1
2,980,514	-		DZA65_RS13870	0.11	-2.1
2,980,514	-		DZA65_RS13870	0.11	-3.5
2,980,517	+		DZA65_RS13870	0.12	-0.3
2,980,517	+		DZA65_RS13870	0.12	-1.6
2,980,517	+		DZA65_RS13870	0.12	-2.3
2,980,518	-		DZA65_RS13870	0.12	-2.1
2,980,518	-		DZA65_RS13870	0.12	-3.5
2,980,552	+		DZA65_RS13870	0.16	-2.3
2,980,552	+		DZA65_RS13870	0.16	-2.6
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