Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS08075

Experiment: Stem-Atlantic

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Stem-Atlantic
1,686,835	+		DZA65_RS08070	0.41	-1.2
1,686,872	+		DZA65_RS08070	0.44	+0.2
1,686,873	-		DZA65_RS08070	0.44	+0.7
1,686,890	-		DZA65_RS08070	0.45	-2.6
1,686,890	-		DZA65_RS08070	0.45	+1.7
1,686,890	-		DZA65_RS08070	0.45	-1.7
1,687,338	+		DZA65_RS08070	0.77	+1.4
1,687,563	+				-0.7
1,687,589	+				-1.9
1,687,729	+				-0.3
1,687,729	+				-0.1
1,687,803	-				+0.7
1,687,834	+				-0.8
1,687,834	+				-1.4
1,687,834	+				-0.6
1,687,834	+				-0.3
1,687,835	-				-0.9
1,687,837	-				-0.5
1,687,837	-				-0.3
1,687,883	+				-1.3
1,687,884	-				-1.2
1,687,977	-				+1.8
1,688,026	+				-0.8
1,688,027	-				-1.7
1,688,033	+		DZA65_RS08075	0.10	-0.6
1,688,126	+		DZA65_RS08075	0.15	-0.8
1,688,126	+		DZA65_RS08075	0.15	-0.9
1,688,127	-		DZA65_RS08075	0.15	+1.7
1,688,127	-		DZA65_RS08075	0.15	-1.5
1,688,127	-		DZA65_RS08075	0.15	-1.9
1,688,261	+		DZA65_RS08075	0.21	-1.9
1,688,261	+		DZA65_RS08075	0.21	+0.1
1,688,261	+		DZA65_RS08075	0.21	-0.2
1,688,262	-		DZA65_RS08075	0.21	-0.9
1,688,262	-		DZA65_RS08075	0.21	-0.7
1,688,264	+		DZA65_RS08075	0.21	-0.9
1,688,264	+		DZA65_RS08075	0.21	-0.6
1,688,264	+		DZA65_RS08075	0.21	-1.7
1,688,265	-		DZA65_RS08075	0.21	-2.7
1,688,265	-		DZA65_RS08075	0.21	-0.1
1,688,265	-		DZA65_RS08075	0.21	+0.2
1,688,355	+		DZA65_RS08075	0.25	-0.2
1,688,368	-		DZA65_RS08075	0.26	-0.3
1,688,400	+		DZA65_RS08075	0.28	-2.0
1,688,419	-		DZA65_RS08075	0.28	-0.3
1,688,419	-		DZA65_RS08075	0.28	-0.3
1,688,472	-		DZA65_RS08075	0.31	-0.3
1,688,472	-		DZA65_RS08075	0.31	-1.3
1,688,567	+		DZA65_RS08075	0.35	-1.8
1,688,598	+		DZA65_RS08075	0.37	-2.3
1,688,598	+		DZA65_RS08075	0.37	+0.2
1,688,598	+		DZA65_RS08075	0.37	-1.2
1,688,598	+				-0.9
1,688,598	+		DZA65_RS08075	0.37	-0.3
1,688,598	+		DZA65_RS08075	0.37	+0.2
1,688,598	+		DZA65_RS08075	0.37	+0.1
1,688,599	-		DZA65_RS08075	0.37	-1.7
1,688,599	-		DZA65_RS08075	0.37	-0.3
1,688,599	-		DZA65_RS08075	0.37	-2.0
1,688,599	-		DZA65_RS08075	0.37	-0.6
1,688,599	-		DZA65_RS08075	0.37	+0.9
1,688,602	+		DZA65_RS08075	0.37	-0.9
1,688,602	+		DZA65_RS08075	0.37	+1.0
1,688,603	-		DZA65_RS08075	0.37	-1.7
1,688,603	-		DZA65_RS08075	0.37	+0.7
1,688,603	-		DZA65_RS08075	0.37	+0.2
1,688,621	+		DZA65_RS08075	0.38	+0.3
1,688,702	+		DZA65_RS08075	0.42	+1.4
1,688,702	+		DZA65_RS08075	0.42	-0.3
1,688,703	-		DZA65_RS08075	0.42	+0.1
1,688,706	+		DZA65_RS08075	0.42	-0.3
1,688,707	-		DZA65_RS08075	0.42	-0.3
1,688,715	+		DZA65_RS08075	0.42	-0.9
1,688,715	+		DZA65_RS08075	0.42	-2.7
1,688,715	+		DZA65_RS08075	0.42	-2.4
1,688,715	+		DZA65_RS08075	0.42	-2.5
1,688,715	+		DZA65_RS08075	0.42	-1.1
1,688,715	+		DZA65_RS08075	0.42	+0.2
1,688,716	-		DZA65_RS08075	0.42	-1.7
1,688,716	-		DZA65_RS08075	0.42	-0.7
1,688,751	+		DZA65_RS08075	0.44	-0.2
1,688,751	+		DZA65_RS08075	0.44	-1.1
1,688,751	+		DZA65_RS08075	0.44	+1.2
1,688,751	+		DZA65_RS08075	0.44	+0.2
1,688,751	+		DZA65_RS08075	0.44	-0.5
1,688,751	+		DZA65_RS08075	0.44	+0.2
1,688,752	-		DZA65_RS08075	0.44	+0.1
1,688,752	-		DZA65_RS08075	0.44	-0.3
1,688,752	-		DZA65_RS08075	0.44	+0.7
1,688,752	-		DZA65_RS08075	0.44	-1.1
1,688,752	-		DZA65_RS08075	0.44	-1.3
1,688,754	+		DZA65_RS08075	0.44	+1.0
1,688,754	+		DZA65_RS08075	0.44	-0.1
1,688,754	+		DZA65_RS08075	0.44	-0.7
1,688,755	-		DZA65_RS08075	0.44	-0.3
1,688,755	-		DZA65_RS08075	0.44	-0.1
1,688,763	+		DZA65_RS08075	0.45	-1.2
1,688,763	+		DZA65_RS08075	0.45	-0.9
1,688,764	-		DZA65_RS08075	0.45	-1.3
1,688,764	-		DZA65_RS08075	0.45	+0.2
1,688,764	-		DZA65_RS08075	0.45	+2.0
1,688,764	-		DZA65_RS08075	0.45	-1.3
1,688,764	-		DZA65_RS08075	0.45	-0.7
1,688,833	+		DZA65_RS08075	0.48	-0.9
1,688,833	+		DZA65_RS08075	0.48	+1.2
1,688,833	+		DZA65_RS08075	0.48	+0.3
1,688,833	+		DZA65_RS08075	0.48	+2.2
1,688,835	+		DZA65_RS08075	0.48	-0.9
1,688,835	+		DZA65_RS08075	0.48	-1.3
1,688,835	+		DZA65_RS08075	0.48	+0.4
1,688,835	+		DZA65_RS08075	0.48	-2.5
1,688,836	-		DZA65_RS08075	0.48	-0.3
1,688,836	-		DZA65_RS08075	0.48	-0.2
1,688,911	-		DZA65_RS08075	0.52	+1.1
1,688,911	-		DZA65_RS08075	0.52	-0.7
1,688,911	-		DZA65_RS08075	0.52	+0.9
1,688,985	+		DZA65_RS08075	0.55	+1.0
1,688,986	-		DZA65_RS08075	0.55	+0.7
1,688,986	-		DZA65_RS08075	0.55	-1.3
1,688,986	-		DZA65_RS08075	0.55	+0.1
1,688,986	-		DZA65_RS08075	0.55	-0.3
1,689,003	+		DZA65_RS08075	0.56	-0.9
1,689,003	+		DZA65_RS08075	0.56	-2.2
1,689,004	-		DZA65_RS08075	0.56	-0.5
1,689,078	+				-1.7
1,689,084	+		DZA65_RS08075	0.60	-3.0
1,689,084	+		DZA65_RS08075	0.60	-1.2
1,689,085	-		DZA65_RS08075	0.60	-0.1
1,689,085	-		DZA65_RS08075	0.60	-1.3
1,689,085	-		DZA65_RS08075	0.60	-0.6
1,689,085	-		DZA65_RS08075	0.60	-1.3
1,689,146	+		DZA65_RS08075	0.63	-1.8
1,689,195	+		DZA65_RS08075	0.65	-0.3
1,689,195	+		DZA65_RS08075	0.65	-1.7
1,689,196	-		DZA65_RS08075	0.65	-0.6
1,689,253	-		DZA65_RS08075	0.68	-0.2
1,689,253	-		DZA65_RS08075	0.68	-0.9
1,689,287	+		DZA65_RS08075	0.69	-0.3
1,689,287	+		DZA65_RS08075	0.69	-2.2
1,689,302	+		DZA65_RS08075	0.70	-0.9
1,689,302	+		DZA65_RS08075	0.70	-0.9
1,689,303	-		DZA65_RS08075	0.70	-0.3
1,689,411	+		DZA65_RS08075	0.75	-0.9
1,689,411	+		DZA65_RS08075	0.75	-1.3
1,689,411	+		DZA65_RS08075	0.75	+1.1
1,689,412	-		DZA65_RS08075	0.75	+0.7
1,689,412	-		DZA65_RS08075	0.75	-1.1
1,689,412	-		DZA65_RS08075	0.75	+0.7
1,689,412	-		DZA65_RS08075	0.75	-2.3
1,689,519	+		DZA65_RS08075	0.80	+0.2
1,689,520	-		DZA65_RS08075	0.80	-0.3
1,689,520	-		DZA65_RS08075	0.80	-1.3
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	+0.1
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-1.2
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-2.9
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-1.2
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-0.9
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	+0.7
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-2.3
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	+1.7
1,689,526	+		DZA65_RS08075	0.81	-1.9
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	-1.2
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	-2.2
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	-0.3
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	+0.7
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	-0.3
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	-0.3
1,689,527	-		DZA65_RS08075	0.81	-0.9
1,689,577	-		DZA65_RS08075	0.83	-1.1
1,689,627	-				+0.3
1,689,689	+		DZA65_RS08075	0.88	+0.3
1,689,690	-		DZA65_RS08075	0.89	+2.2
1,689,698	+		DZA65_RS08075	0.89	-1.9
1,689,702	+		DZA65_RS08075	0.89	-2.3
1,689,702	+		DZA65_RS08075	0.89	-0.7
1,689,702	+		DZA65_RS08075	0.89	-1.9
1,689,703	-		DZA65_RS08075	0.89	-2.7
1,689,750	+				+0.1
1,689,779	+				-2.5
1,689,795	-				-0.7
1,689,801	-				-1.4
1,689,801	-				-0.9
1,689,834	+				-1.7
1,689,834	+				-1.7
1,689,843	+				+0.7
1,689,844	-				-0.0
1,689,844	-				+0.1
1,689,846	+				+0.7
1,689,880	-				-2.2
1,689,910	+				-0.8
1,689,915	+				-1.3
1,689,916	-				-1.9
1,689,916	-				-0.1
1,689,918	-				-0.7
1,689,973	-				-1.7
1,689,988	+				+1.3
1,689,993	+				+0.5
1,689,993	+				-0.4
1,689,998	-				+2.4
1,690,014	+				+2.2
1,690,014	+				-0.9
1,690,015	-				-0.9
1,690,015	-				-0.2
1,690,047	-				+1.0
1,690,128	+				-0.9
1,690,129	-				-0.2
1,690,166	-				+0.4
1,690,207	+				+0.4
1,690,280	+		DZA65_RS08080	0.12	+0.3
1,690,280	+		DZA65_RS08080	0.12	+0.7
1,690,280	+		DZA65_RS08080	0.12	-0.1
1,690,280	+		DZA65_RS08080	0.12	-1.2
1,690,281	-		DZA65_RS08080	0.12	-0.5
1,690,296	+		DZA65_RS08080	0.13	+1.5
1,690,315	+		DZA65_RS08080	0.14	-1.7
1,690,315	+		DZA65_RS08080	0.14	-0.9
1,690,315	+		DZA65_RS08080	0.14	+2.2
1,690,315	+		DZA65_RS08080	0.14	-0.2
1,690,315	+		DZA65_RS08080	0.14	-0.3
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	-0.5
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+0.4
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+0.4
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+0.7
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+1.7
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	-1.2
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	+1.1
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	-2.2
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	-1.6
1,690,316	-		DZA65_RS08080	0.14	-1.3
1,690,330	+		DZA65_RS08080	0.15	+0.1
1,690,331	-		DZA65_RS08080	0.15	+0.3
1,690,331	-		DZA65_RS08080	0.15	+1.7
1,690,331	-		DZA65_RS08080	0.15	+0.8
1,690,438	+		DZA65_RS08080	0.21	+0.1
1,690,439	-		DZA65_RS08080	0.21	+0.2
1,690,479	+		DZA65_RS08080	0.23	+0.5
1,690,479	+		DZA65_RS08080	0.23	-0.2
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	+2.4
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	+1.2
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	-1.1
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	-0.9
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	+1.2
1,690,480	-		DZA65_RS08080	0.23	+0.5
1,690,482	+		DZA65_RS08080	0.23	+0.7
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	-1.4
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	+2.2
1,690,525	+		DZA65_RS08080	0.25	-0.5
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