Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS06055

Experiment: Stem-Norland

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Stem-Norland
1,249,605	+		DZA65_RS06045	0.77	+0.3
1,249,668	-		DZA65_RS06045	0.83	-1.6
1,249,742	+		DZA65_RS06045	0.90	-1.1
1,249,742	+		DZA65_RS06045	0.90	-0.3
1,249,743	-		DZA65_RS06045	0.90	+1.3
1,249,754	+				-1.3
1,249,835	-				-2.4
1,249,871	+				-0.7
1,249,871	+				-1.0
1,249,871	+				+0.3
1,249,871	+				-1.1
1,249,871	+				-1.4
1,249,872	-				+1.8
1,249,878	+				+0.3
1,249,878	+				-1.7
1,249,878	+				-0.6
1,249,878	+				+0.5
1,249,878	+				+0.8
1,249,878	+				+2.8
1,249,878	+				-0.6
1,249,878	+				-1.4
1,249,879	-				+1.3
1,249,879	-				-2.6
1,249,879	-				-0.9
1,249,879	-				+1.3
1,249,879	-				-0.3
1,249,943	-				-0.9
1,249,943	-				-1.9
1,249,943	-				+0.3
1,250,049	+				-1.3
1,250,049	+				+0.2
1,250,049	+				-0.7
1,250,050	-				+0.1
1,250,050	-				+0.4
1,250,050	-				-0.8
1,250,050	-				-1.7
1,250,079	+		DZA65_RS06050	0.11	-1.3
1,250,167	+		DZA65_RS06050	0.30	-0.3
1,250,168	-		DZA65_RS06050	0.30	-0.4
1,250,168	-		DZA65_RS06050	0.30	+2.6
1,250,318	-		DZA65_RS06050	0.63	+1.6
1,250,318	-		DZA65_RS06050	0.63	-0.1
1,250,335	+		DZA65_RS06050	0.66	+1.4
1,250,335	+		DZA65_RS06050	0.66	+1.7
1,250,336	-		DZA65_RS06050	0.66	-1.6
1,250,336	-		DZA65_RS06050	0.66	-1.3
1,250,336	-		DZA65_RS06050	0.66	-0.4
1,250,336	-		DZA65_RS06050	0.66	-0.3
1,250,336	-		DZA65_RS06050	0.66	+1.0
1,250,341	+		DZA65_RS06050	0.68	-0.3
1,250,341	+		DZA65_RS06050	0.68	-1.7
1,250,342	-		DZA65_RS06050	0.68	+0.8
1,250,342	-		DZA65_RS06050	0.68	-1.3
1,250,342	-		DZA65_RS06050	0.68	+0.8
1,250,342	-		DZA65_RS06050	0.68	-1.4
1,250,345	+		DZA65_RS06050	0.68	-0.1
1,250,345	+		DZA65_RS06050	0.68	+0.6
1,250,345	+		DZA65_RS06050	0.68	+0.3
1,250,346	-		DZA65_RS06050	0.69	-2.1
1,250,346	-		DZA65_RS06050	0.69	-1.6
1,250,346	-		DZA65_RS06050	0.69	+1.1
1,250,367	+		DZA65_RS06050	0.73	+1.6
1,250,377	+		DZA65_RS06050	0.75	+1.3
1,250,378	-		DZA65_RS06050	0.76	-1.2
1,250,430	+		DZA65_RS06050	0.87	+0.3
1,250,430	+		DZA65_RS06050	0.87	+0.5
1,250,430	+		DZA65_RS06050	0.87	-1.7
1,250,430	+		DZA65_RS06050	0.87	-1.4
1,250,430	+		DZA65_RS06050	0.87	+1.7
1,250,430	+		DZA65_RS06050	0.87	-0.5
1,250,431	-		DZA65_RS06050	0.87	-2.0
1,250,431	-		DZA65_RS06050	0.87	-1.3
1,250,431	-		DZA65_RS06050	0.87	-2.3
1,250,431	-		DZA65_RS06050	0.87	-0.7
1,250,431	-		DZA65_RS06050	0.87	-0.1
1,250,446	-				+1.7
1,250,480	+				-1.1
1,250,486	+				-1.7
1,250,486	+				-0.3
1,250,504	+				+2.5
1,250,511	+				-1.1
1,250,511	+				-1.2
1,250,512	-				-0.3
1,250,512	-				+0.3
1,250,512	-				-1.3
1,250,512	-				+0.5
1,250,515	+				-0.0
1,250,515	+				-1.1
1,250,515	+				-1.3
1,250,515	+				+0.7
1,250,516	-				-0.1
1,250,516	-				-1.9
1,250,516	-				-0.0
1,250,516	-				-2.4
1,250,516	-				+0.2
1,250,518	-				-1.3
1,250,518	-				+0.1
1,250,520	+				-1.6
1,250,521	-				-1.1
1,250,521	-				-1.1
1,250,521	-				+0.5
1,250,521	-				-1.1
1,250,529	+				-1.4
1,250,540	-				-0.1
1,250,547	+				-1.3
1,250,551	+				-3.1
1,250,551	+				-0.6
1,250,587	+				-0.9
1,250,588	-				-1.1
1,250,595	+				-0.3
1,250,595	+				+0.5
1,250,596	-				-0.5
1,250,596	-				-1.3
1,250,596	-				-1.3
1,250,596	-				-1.2
1,250,734	+				-0.5
1,250,734	+				+1.3
1,250,778	+		DZA65_RS06055	0.12	+0.3
1,250,778	+		DZA65_RS06055	0.12	-1.0
1,250,778	+		DZA65_RS06055	0.12	+1.1
1,250,778	+		DZA65_RS06055	0.12	-0.5
1,250,779	-		DZA65_RS06055	0.12	+0.7
1,250,779	-		DZA65_RS06055	0.12	-0.7
1,250,779	-		DZA65_RS06055	0.12	+0.8
1,250,779	-		DZA65_RS06055	0.12	+0.6
1,250,779	-		DZA65_RS06055	0.12	+0.0
1,250,790	+		DZA65_RS06055	0.13	-0.3
1,250,791	-		DZA65_RS06055	0.13	-1.3
1,250,950	+		DZA65_RS06055	0.22	-0.5
1,250,950	+		DZA65_RS06055	0.22	+1.3
1,250,950	+		DZA65_RS06055	0.22	-1.2
1,250,951	-		DZA65_RS06055	0.22	-1.2
1,250,951	-		DZA65_RS06055	0.22	+1.3
1,250,951	-		DZA65_RS06055	0.22	+0.5
1,250,951	-		DZA65_RS06055	0.22	+0.7
1,250,971	+		DZA65_RS06055	0.23	-0.5
1,251,035	+		DZA65_RS06055	0.26	+0.3
1,251,035	+		DZA65_RS06055	0.26	+0.3
1,251,035	+		DZA65_RS06055	0.26	-1.7
1,251,035	+		DZA65_RS06055	0.26	+0.3
1,251,035	+		DZA65_RS06055	0.26	+2.3
1,251,035	+		DZA65_RS06055	0.26	-1.1
1,251,035	+		DZA65_RS06055	0.26	+1.3
1,251,036	-		DZA65_RS06055	0.26	-3.0
1,251,036	-		DZA65_RS06055	0.26	-0.0
1,251,036	-		DZA65_RS06055	0.26	+0.3
1,251,036	-		DZA65_RS06055	0.26	+0.3
1,251,036	-		DZA65_RS06055	0.26	-0.3
1,251,036	-		DZA65_RS06055	0.26	-2.2
1,251,099	+		DZA65_RS06055	0.30	+0.3
1,251,105	-		DZA65_RS06055	0.30	+0.3
1,251,186	-		DZA65_RS06055	0.35	+2.0
1,251,191	+		DZA65_RS06055	0.35	-2.2
1,251,192	-		DZA65_RS06055	0.35	+0.3
1,251,197	+		DZA65_RS06055	0.36	+0.5
1,251,197	+		DZA65_RS06055	0.36	-1.3
1,251,197	+		DZA65_RS06055	0.36	-0.5
1,251,313	-		DZA65_RS06055	0.42	+0.3
1,251,313	-		DZA65_RS06055	0.42	+0.7
1,251,313	-		DZA65_RS06055	0.42	-0.6
1,251,313	-		DZA65_RS06055	0.42	-1.7
1,251,313	-		DZA65_RS06055	0.42	-1.0
1,251,313	-		DZA65_RS06055	0.42	+0.9
1,251,313	-		DZA65_RS06055	0.42	-1.3
1,251,367	+		DZA65_RS06055	0.45	+0.6
1,251,367	+		DZA65_RS06055	0.45	-1.7
1,251,367	+		DZA65_RS06055	0.45	-1.3
1,251,381	-		DZA65_RS06055	0.46	-0.7
1,251,414	+		DZA65_RS06055	0.48	-2.1
1,251,414	+		DZA65_RS06055	0.48	-1.3
1,251,414	+		DZA65_RS06055	0.48	+1.3
1,251,414	+		DZA65_RS06055	0.48	-0.3
1,251,414	+		DZA65_RS06055	0.48	+0.2
1,251,414	+		DZA65_RS06055	0.48	-0.2
1,251,415	-		DZA65_RS06055	0.48	-0.3
1,251,415	-		DZA65_RS06055	0.48	-1.7
1,251,415	-		DZA65_RS06055	0.48	-1.7
1,251,415	-		DZA65_RS06055	0.48	+0.3
1,251,415	-		DZA65_RS06055	0.48	+0.7
1,251,415	-		DZA65_RS06055	0.48	-0.7
1,251,415	-		DZA65_RS06055	0.48	+0.7
1,251,415	-		DZA65_RS06055	0.48	+1.5
1,251,415	-		DZA65_RS06055	0.48	-0.8
1,251,461	+		DZA65_RS06055	0.51	+0.3
1,251,462	-		DZA65_RS06055	0.51	-0.1
1,251,462	-		DZA65_RS06055	0.51	-1.9
1,251,464	+		DZA65_RS06055	0.51	+1.8
1,251,465	-		DZA65_RS06055	0.51	-0.7
1,251,465	-		DZA65_RS06055	0.51	-0.1
1,251,465	-		DZA65_RS06055	0.51	+1.3
1,251,492	-		DZA65_RS06055	0.52	-1.7
1,251,498	-		DZA65_RS06055	0.53	+0.3
1,251,623	+		DZA65_RS06055	0.60	-0.6
1,251,623	+		DZA65_RS06055	0.60	-0.7
1,251,623	+		DZA65_RS06055	0.60	+0.4
1,251,623	+		DZA65_RS06055	0.60	-0.7
1,251,624	-		DZA65_RS06055	0.60	+1.9
1,251,624	-		DZA65_RS06055	0.60	+0.7
1,251,624	-		DZA65_RS06055	0.60	-2.1
1,251,624	-		DZA65_RS06055	0.60	+0.5
1,251,720	+		DZA65_RS06055	0.65	-0.5
1,251,720	+		DZA65_RS06055	0.65	-0.1
1,251,720	+		DZA65_RS06055	0.65	-1.6
1,251,750	+		DZA65_RS06055	0.67	+2.0
1,251,750	+		DZA65_RS06055	0.67	+0.6
1,251,750	+		DZA65_RS06055	0.67	+1.3
1,251,750	+		DZA65_RS06055	0.67	+1.3
1,251,750	+		DZA65_RS06055	0.67	-2.7
1,251,751	-		DZA65_RS06055	0.67	+0.5
1,251,751	-		DZA65_RS06055	0.67	-0.2
1,251,766	+		DZA65_RS06055	0.68	+0.6
1,251,766	+		DZA65_RS06055	0.68	-0.7
1,251,767	-		DZA65_RS06055	0.68	-0.4
1,251,767	-		DZA65_RS06055	0.68	+1.3
1,251,767	-		DZA65_RS06055	0.68	-0.2
1,251,767	-		DZA65_RS06055	0.68	-1.9
1,251,767	-		DZA65_RS06055	0.68	-1.1
1,251,767	-		DZA65_RS06055	0.68	-0.7
1,251,808	+		DZA65_RS06055	0.70	+1.3
1,251,809	-		DZA65_RS06055	0.70	-1.7
1,251,844	+		DZA65_RS06055	0.72	-2.2
1,251,848	+		DZA65_RS06055	0.72	+1.5
1,251,848	+		DZA65_RS06055	0.72	-0.5
1,251,854	+		DZA65_RS06055	0.73	+0.1
1,251,855	-		DZA65_RS06055	0.73	+0.3
1,251,855	-		DZA65_RS06055	0.73	-1.6
1,251,930	-		DZA65_RS06055	0.77	+1.3
1,251,930	-		DZA65_RS06055	0.77	-1.2
1,251,930	-		DZA65_RS06055	0.77	+0.3
1,251,930	-		DZA65_RS06055	0.77	-0.7
1,252,014	-		DZA65_RS06055	0.82	-0.3
1,252,014	-		DZA65_RS06055	0.82	-2.1
1,252,075	+		DZA65_RS06055	0.85	-3.3
1,252,075	+		DZA65_RS06055	0.85	-1.3
1,252,075	+		DZA65_RS06055	0.85	-0.1
1,252,075	+		DZA65_RS06055	0.85	+0.4
1,252,076	-		DZA65_RS06055	0.85	+3.3
1,252,076	-		DZA65_RS06055	0.85	-1.1
1,252,076	-		DZA65_RS06055	0.85	-1.9
1,252,265	+				-0.1
1,252,265	+				-0.2
1,252,266	-				-1.6
1,252,266	-				-0.6
1,252,269	+				+0.4
1,252,269	+				-0.1
1,252,269	+				+0.5
1,252,269	+				-1.1
1,252,269	+				+2.3
1,252,269	+				-1.1
1,252,269	+				-0.9
1,252,269	+				-1.1
1,252,269	+				+0.5
1,252,269	+				-0.3
1,252,269	+				+0.6
1,252,269	+				+0.6
1,252,270	-				-2.3
1,252,270	-				+0.7
1,252,270	-				+0.3
1,252,270	-				+1.3
1,252,270	-				+0.3
1,252,270	-				-0.6
1,252,270	-				-1.1
1,252,270	-				-1.1
1,252,270	-				+1.9
1,252,270	-				-0.4
1,252,297	+				-0.1
1,252,297	+				-0.7
1,252,297	+				+0.5
1,252,298	-				+1.8
1,252,298	-				+1.3
1,252,298	-				+0.8
1,252,298	-				+1.8
1,252,332	+				-0.9
1,252,333	-				-2.7
1,252,375	+				+1.4
1,252,375	+				-1.1
1,252,375	+				+1.3
1,252,468	+				-0.1
1,252,468	+				+1.3
1,252,468	+				-0.7
1,252,468	+				+1.3
1,252,468	+				-0.7
1,252,469	-				-0.6
1,252,469	-				-1.9
1,252,537	+		DZA65_RS06060	0.12	-0.7
1,252,537	+		DZA65_RS06060	0.12	-0.5
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1,252,874	+		DZA65_RS06060	0.30	-1.2
1,252,875	-		DZA65_RS06060	0.31	+0.4
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1,252,880	-		DZA65_RS06060	0.31	-0.1
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1,252,890	+		DZA65_RS06060	0.31	-1.3
1,252,891	-		DZA65_RS06060	0.31	+0.3
1,252,891	-		DZA65_RS06060	0.31	+0.3
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1,252,891	-		DZA65_RS06060	0.31	+1.1
1,252,921	+		DZA65_RS06060	0.33	-0.3
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1,252,921	+		DZA65_RS06060	0.33	+1.3
1,252,921	+		DZA65_RS06060	0.33	-1.7
1,252,921	+				+1.7
1,252,922	-		DZA65_RS06060	0.33	-1.2
1,252,922	-		DZA65_RS06060	0.33	+0.7
1,252,922	-		DZA65_RS06060	0.33	-1.1
1,252,922	-		DZA65_RS06060	0.33	+2.4
1,252,922	-		DZA65_RS06060	0.33	+1.3
1,252,965	+		DZA65_RS06060	0.36	-1.3
1,252,966	-		DZA65_RS06060	0.36	-1.6
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1,252,966	-		DZA65_RS06060	0.36	+1.3
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1,253,038	+		DZA65_RS06060	0.40	-0.3
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1,253,179	+		DZA65_RS06060	0.47	+1.3
1,253,179	+		DZA65_RS06060	0.47	-0.9
1,253,179	+		DZA65_RS06060	0.47	-0.3
1,253,179	+		DZA65_RS06060	0.47	-0.3
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1,253,179	+		DZA65_RS06060	0.47	-2.1
1,253,179	+		DZA65_RS06060	0.47	-0.2
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1,253,179	+		DZA65_RS06060	0.47	-1.1
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1,253,179	+		DZA65_RS06060	0.47	-0.6
1,253,179	+		DZA65_RS06060	0.47	-2.6
1,253,180	-		DZA65_RS06060	0.48	-1.1
1,253,180	-		DZA65_RS06060	0.48	+0.7
1,253,180	-		DZA65_RS06060	0.48	-0.7
1,253,180	-		DZA65_RS06060	0.48	-1.9
1,253,180	-				-2.1
1,253,180	-		DZA65_RS06060	0.48	-0.6
1,253,180	-		DZA65_RS06060	0.48	+0.3
1,253,180	-		DZA65_RS06060	0.48	+0.8
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1,253,194	+		DZA65_RS06060	0.48	-0.1
1,253,194	+		DZA65_RS06060	0.48	-0.6
1,253,195	-		DZA65_RS06060	0.48	-2.6
1,253,195	-		DZA65_RS06060	0.48	-0.1
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1,253,278	-		DZA65_RS06060	0.53	+0.5