Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS19305

Experiment: Stem-Norland

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	Stem-Norland
4,170,435	-		DZA65_RS19295	0.73	-3.0
4,170,465	-		DZA65_RS19295	0.77	+0.2
4,170,692	+				+1.5
4,170,783	-		DZA65_RS19300	0.15	+0.2
4,170,783	-		DZA65_RS19300	0.15	-0.1
4,170,788	+		DZA65_RS19300	0.16	+0.5
4,170,815	-		DZA65_RS19300	0.22	-0.8
4,170,815	-		DZA65_RS19300	0.22	-0.5
4,170,815	-		DZA65_RS19300	0.22	-0.0
4,170,892	+		DZA65_RS19300	0.38	-1.5
4,171,067	-		DZA65_RS19300	0.74	-1.0
4,171,103	+		DZA65_RS19300	0.82	+0.7
4,171,175	-				-2.0
4,171,223	-				+2.1
4,171,244	+				-1.4
4,171,272	+				-1.2
4,171,273	-				-0.7
4,171,273	-				+0.1
4,171,285	+				-0.9
4,171,316	+				+0.3
4,171,317	-				-0.1
4,171,318	+				+0.6
4,171,319	-				-0.1
4,171,321	-				+0.2
4,171,341	+				-0.4
4,171,341	+				+0.6
4,171,342	-				+0.7
4,171,342	-				-0.8
4,171,350	+				+0.2
4,171,350	+				-0.5
4,171,350	+				+1.8
4,171,350	+				-1.6
4,171,350	+				+0.5
4,171,350	+				+0.2
4,171,350	+				+0.8
4,171,351	-				-0.7
4,171,351	-				-0.0
4,171,351	-				-0.7
4,171,351	-				-0.8
4,171,351	-				+2.2
4,171,351	-				+0.4
4,171,401	+				-0.6
4,171,402	-				-0.5
4,171,402	-				-1.4
4,171,515	+				-0.4
4,171,548	+				-0.4
4,171,548	+				-0.4
4,171,548	+				-0.5
4,171,548	+				-0.1
4,171,549	-				-1.0
4,171,626	-		DZA65_RS19305	0.11	-0.1
4,171,637	+		DZA65_RS19305	0.11	+0.3
4,171,637	+		DZA65_RS19305	0.11	+2.2
4,171,638	-		DZA65_RS19305	0.11	+1.4
4,171,638	-		DZA65_RS19305	0.11	-1.4
4,171,691	+		DZA65_RS19305	0.14	-2.9
4,171,691	+		DZA65_RS19305	0.14	-1.1
4,171,691	+		DZA65_RS19305	0.14	+0.2
4,171,691	+		DZA65_RS19305	0.14	-1.5
4,171,691	+		DZA65_RS19305	0.14	-2.6
4,171,691	+		DZA65_RS19305	0.14	-0.4
4,171,692	-				-2.0
4,171,692	-		DZA65_RS19305	0.14	-1.1
4,171,692	-		DZA65_RS19305	0.14	-0.4
4,171,692	-		DZA65_RS19305	0.14	-0.8
4,171,692	-		DZA65_RS19305	0.14	+0.5
4,171,692	-		DZA65_RS19305	0.14	+0.3
4,171,692	-		DZA65_RS19305	0.14	-1.2
4,171,738	+		DZA65_RS19305	0.16	+0.2
4,171,739	-		DZA65_RS19305	0.16	-0.8
4,171,880	+		DZA65_RS19305	0.21	-2.6
4,171,881	-		DZA65_RS19305	0.22	-1.6
4,171,881	-		DZA65_RS19305	0.22	+0.0
4,171,881	-		DZA65_RS19305	0.22	-1.8
4,171,886	-		DZA65_RS19305	0.22	-0.8
4,171,917	+		DZA65_RS19305	0.23	-1.3
4,171,917	+		DZA65_RS19305	0.23	+1.2
4,171,917	+		DZA65_RS19305	0.23	-1.1
4,171,918	-		DZA65_RS19305	0.23	+0.6
4,171,918	-		DZA65_RS19305	0.23	+2.2
4,171,918	-		DZA65_RS19305	0.23	+0.7
4,171,918	-		DZA65_RS19305	0.23	-2.8
4,171,918	-		DZA65_RS19305	0.23	-1.4
4,171,918	-		DZA65_RS19305	0.23	+0.1
4,171,918	-		DZA65_RS19305	0.23	-0.4
4,171,921	+				-0.8
4,171,921	+		DZA65_RS19305	0.23	+1.0
4,171,921	+		DZA65_RS19305	0.23	+2.0
4,171,921	+				+0.2
4,171,921	+		DZA65_RS19305	0.23	+0.5
4,171,922	-		DZA65_RS19305	0.23	+0.9
4,171,922	-		DZA65_RS19305	0.23	-0.0
4,171,922	-		DZA65_RS19305	0.23	+0.9
4,171,922	-		DZA65_RS19305	0.23	-1.1
4,171,922	-		DZA65_RS19305	0.23	-1.0
4,171,922	-		DZA65_RS19305	0.23	+0.4
4,171,922	-		DZA65_RS19305	0.23	+0.2
4,171,922	-		DZA65_RS19305	0.23	-0.9
4,171,976	+		DZA65_RS19305	0.26	-0.7
4,171,976	+		DZA65_RS19305	0.26	+0.1
4,171,976	+		DZA65_RS19305	0.26	+0.2
4,171,977	-		DZA65_RS19305	0.26	-1.8
4,172,379	-		DZA65_RS19305	0.43	+1.1
4,172,379	-		DZA65_RS19305	0.43	-0.2
4,172,516	+		DZA65_RS19305	0.48	-0.5
4,172,516	+		DZA65_RS19305	0.48	-1.3
4,172,594	+		DZA65_RS19305	0.52	-1.8
4,172,595	-		DZA65_RS19305	0.52	+0.4
4,172,621	+		DZA65_RS19305	0.53	-1.1
4,172,622	-		DZA65_RS19305	0.53	-1.6
4,172,657	+		DZA65_RS19305	0.54	-1.5
4,172,658	-		DZA65_RS19305	0.54	-1.0
4,172,658	-		DZA65_RS19305	0.54	-0.8
4,172,701	+		DZA65_RS19305	0.56	-0.6
4,172,702	-		DZA65_RS19305	0.56	+0.4
4,173,003	-		DZA65_RS19305	0.69	+1.6
4,173,031	+				-0.4
4,173,031	+		DZA65_RS19305	0.70	-0.1
4,173,032	-		DZA65_RS19305	0.70	+0.6
4,173,032	-		DZA65_RS19305	0.70	-0.4
4,173,032	-		DZA65_RS19305	0.70	+0.6
4,173,032	-		DZA65_RS19305	0.70	+0.3
4,173,032	-		DZA65_RS19305	0.70	+1.9
4,173,032	-		DZA65_RS19305	0.70	-0.2
4,173,032	-		DZA65_RS19305	0.70	-1.4
4,173,047	-		DZA65_RS19305	0.71	+0.0
4,173,047	-		DZA65_RS19305	0.71	-0.3
4,173,101	+		DZA65_RS19305	0.73	-1.4
4,173,101	+		DZA65_RS19305	0.73	-1.6
4,173,101	+		DZA65_RS19305	0.73	-2.5
4,173,102	-		DZA65_RS19305	0.73	-1.8
4,173,102	-		DZA65_RS19305	0.73	-0.2
4,173,102	-		DZA65_RS19305	0.73	-0.4
4,173,102	-		DZA65_RS19305	0.73	-0.2
4,173,171	-		DZA65_RS19305	0.76	+0.8
4,173,171	-		DZA65_RS19305	0.76	+0.2
4,173,171	-		DZA65_RS19305	0.76	-0.5
4,173,171	-		DZA65_RS19305	0.76	-1.4
4,173,171	-		DZA65_RS19305	0.76	-0.8
4,173,347	+		DZA65_RS19305	0.83	-2.0
4,173,347	+		DZA65_RS19305	0.83	-0.8
4,173,347	+		DZA65_RS19305	0.83	-0.8
4,173,374	+		DZA65_RS19305	0.84	-1.1
4,173,395	+		DZA65_RS19305	0.85	-0.1
4,173,395	+		DZA65_RS19305	0.85	+3.2
4,173,395	+		DZA65_RS19305	0.85	+1.2
4,173,395	+		DZA65_RS19305	0.85	-0.2
4,173,396	-		DZA65_RS19305	0.85	+1.2
4,173,396	-		DZA65_RS19305	0.85	-0.8
4,173,396	-		DZA65_RS19305	0.85	-0.7
4,173,396	-		DZA65_RS19305	0.85	-1.3
4,173,396	-		DZA65_RS19305	0.85	-0.4
4,173,399	+		DZA65_RS19305	0.86	+0.1
4,173,400	-		DZA65_RS19305	0.86	-0.4
4,173,474	-		DZA65_RS19305	0.89	-0.1
4,173,481	+		DZA65_RS19305	0.89	-1.6
4,173,482	-		DZA65_RS19305	0.89	-2.4
4,173,524	+				-1.1
4,173,524	+				-1.4
4,173,524	+				-1.0
4,173,524	+				+0.2
4,173,524	+				-1.0
4,173,525	-				-2.4
4,173,525	-				-0.1
4,173,555	-				+0.9
4,173,578	+				+1.6
4,173,578	+				-1.3
4,173,578	+				-0.8
4,173,578	+				-1.7
4,173,578	+				-0.4
4,173,578	+				+2.4
4,173,578	+				-0.7
4,173,578	+				-1.1
4,173,579	-				-0.8
4,173,579	-				-0.0
4,173,579	-				+1.8
4,173,579	-				-0.4
4,173,579	-				-0.6
4,173,579	-				+0.2
4,173,579	-				+0.3
4,173,579	-				+0.8
4,173,579	-				+0.0
4,173,635	+				-0.8
4,173,635	+				-1.1
4,173,635	+				-1.4
4,173,635	+				+0.3
4,173,635	+				-1.0
4,173,636	-				-0.9
4,173,636	-				-0.0
4,173,636	-				-0.6
4,173,636	-				+0.3
4,173,644	+				-0.1
4,173,644	+				+0.2
4,173,644	+				+0.1
4,173,644	+				+2.1
4,173,645	-				-1.3
4,173,645	-				-0.1
4,173,648	+				+0.8
4,173,649	-				-0.9
4,173,649	-				-1.4
4,173,679	+				-2.6
4,173,679	+				-0.8
4,173,679	+				+1.6
4,173,679	+				-0.4
4,173,679	+				-0.3
4,173,680	-				-1.1
4,173,680	-				+0.4
4,173,680	-				+0.2
4,173,680	-				+3.2
4,173,680	-				-1.6
4,173,736	-				-0.8
4,173,740	+				-0.4
4,173,741	-				-1.1
4,173,788	-				-2.0
4,173,788	-				+0.3
4,173,793	-				-4.1
4,173,809	+				-1.9
4,173,837	+				-1.1
4,173,838	-				-1.8
4,173,838	-				-1.0
4,173,852	+				-0.4
4,173,852	+				+1.2
4,173,852	+				-1.4
4,173,852	+				+0.5
4,173,852	+				+1.8
4,173,852	+				-0.0
4,173,852	+				-0.1
4,173,852	+				-0.3
4,173,853	-				-0.9
4,173,853	-				+0.3
4,173,856	+				-1.1
4,173,856	+				+1.3
4,173,856	+				+1.2
4,173,856	+				+1.2
4,173,856	+				-0.4
4,173,856	+				-1.3
4,173,856	+				-0.8
4,173,856	+				-0.2
4,173,856	+				-0.0
4,173,856	+				-1.6
4,173,856	+				-0.4
4,173,856	+				-0.4
4,173,857	-				+0.8
4,173,858	+				+0.2
4,173,858	+				-2.8
4,173,859	-				+0.8
4,173,859	-				-1.3
4,173,859	-				+0.9
4,173,859	-				-1.1
4,173,859	-				+0.7
4,173,859	-				-0.1
4,173,863	+				-0.8
4,173,864	-				-0.5
4,173,868	-				+1.2
4,173,868	-				+0.8
4,173,940	-				-1.3
4,173,969	+				+0.5
4,173,969	+				+0.2
4,173,969	+				-0.8
4,173,969	+				-0.8
4,173,969	+				+0.1
4,173,969	+				+1.3
4,173,969	+				-0.6
4,173,969	+				-0.4
4,173,969	+				+0.4
4,173,970	-				-1.6
4,173,970	-				-0.6
4,173,970	-				-1.8
4,173,970	-				-0.1
4,173,970	-				+2.8
4,173,970	-				+0.2
4,173,970	-				-0.0
4,173,970	-				+0.7
4,173,970	-				-0.8
4,173,970	-				-0.6
4,173,970	-				-1.5
4,173,970	-				-1.0
4,173,970	-				-1.4
4,173,970	-				-1.1
4,173,978	+				-1.3
4,173,978	+				-1.0
4,173,978	+				-1.1
4,173,978	+				-2.0
4,173,978	+				+0.5
4,173,978	+				-0.1
4,173,978	+				+0.6
4,173,979	-				-2.2
4,173,979	-				-0.8
4,173,989	+				+0.2
4,173,989	+				+0.4
4,173,990	-				-2.8
4,173,990	-				-0.2
4,174,061	+				-0.0
4,174,061	+				+0.8
4,174,061	+				+1.5
4,174,062	-				+1.2
4,174,062	-				+2.2
4,174,128	+				-0.8
4,174,128	+				-0.7
4,174,129	-				-2.3
4,174,135	+				-2.3
4,174,135	+				-0.8
4,174,135	+				-1.0
4,174,144	+				+0.8
4,174,144	+				-1.0
4,174,144	+				-1.1
4,174,144	+				-1.6
4,174,144	+				-1.1
4,174,145	-				-3.3
4,174,145	-				+0.3
4,174,145	-				-1.4
4,174,186	-				+2.3
4,174,186	-				-3.0
4,174,195	+				-0.9
4,174,262	+				-0.2
4,174,263	-				-1.8
4,174,286	-				-2.2
4,174,318	+				-1.4
4,174,382	+				-1.8
4,174,382	+				-3.0
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