Strain Fitness in Magnetospirillum magneticum AMB-1 around AMB_RS00470

Experiment: 30_an_nonmag_2

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	30_an_nonmag_2
103,912	+				-0.7
103,912	+				-1.5
103,912	+				-0.2
103,912	+				-0.2
103,912	+				+0.2
103,912	+				-1.3
103,912	+				+1.0
103,912	+				-0.1
103,913	-				+1.8
103,913	-				-2.2
103,913	-				-0.2
103,913	-				-0.2
103,913	-				+0.2
103,913	-				-1.8
103,913	-				-0.5
103,913	-				-2.3
103,913	-				-4.0
103,913	-				-3.4
103,913	-				+1.8
103,981	+				-2.4
103,981	+				+0.8
103,982	-				-2.1
103,982	-				-3.3
103,988	+				-0.6
103,989	-				-0.5
103,989	-				+0.8
103,989	-				-0.2
103,989	-				-3.0
103,989	-				-2.2
103,989	-				-3.1
103,989	-				-1.0
104,026	+		AMB_RS00470	0.12	+0.2
104,026	+		AMB_RS00470	0.12	-1.7
104,027	-		AMB_RS00470	0.13	-3.3
104,027	-		AMB_RS00470	0.13	-1.6
104,027	-		AMB_RS00470	0.13	-0.2
104,090	+		AMB_RS00470	0.19	-2.1
104,090	+		AMB_RS00470	0.19	-1.3
104,090	+		AMB_RS00470	0.19	-1.8
104,090	+		AMB_RS00470	0.19	+1.8
104,090	+		AMB_RS00470	0.19	-1.7
104,090	+		AMB_RS00470	0.19	-0.6
104,091	-		AMB_RS00470	0.19	-0.5
104,091	-		AMB_RS00470	0.19	-1.7
104,091	-		AMB_RS00470	0.19	-0.1
104,091	-		AMB_RS00470	0.19	-0.2
104,170	+		AMB_RS00470	0.28	-1.5
104,171	-		AMB_RS00470	0.28	-2.3
104,171	-		AMB_RS00470	0.28	-4.2
104,245	-		AMB_RS00470	0.36	-2.2
104,245	-		AMB_RS00470	0.36	-0.5
104,248	+		AMB_RS00470	0.36	-0.2
104,248	+		AMB_RS00470	0.36	-0.7
104,248	+		AMB_RS00470	0.36	-0.8
104,249	-		AMB_RS00470	0.36	-3.3
104,249	-		AMB_RS00470	0.36	+1.8
104,249	-		AMB_RS00470	0.36	-1.8
104,249	-		AMB_RS00470	0.36	-1.0
104,249	-		AMB_RS00470	0.36	-1.5
104,249	-		AMB_RS00470	0.36	-3.3
104,249	-		AMB_RS00470	0.36	-0.2
104,265	+		AMB_RS00470	0.38	-1.9
104,265	+		AMB_RS00470	0.38	-1.7
104,265	+		AMB_RS00470	0.38	-2.1
104,265	+		AMB_RS00470	0.38	+0.1
104,265	+		AMB_RS00470	0.38	-1.0
104,266	-		AMB_RS00470	0.38	-0.2
104,266	-		AMB_RS00470	0.38	-1.6
104,296	+		AMB_RS00470	0.41	-0.5
104,296	+		AMB_RS00470	0.41	+0.2
104,296	+		AMB_RS00470	0.41	+0.2
104,296	+		AMB_RS00470	0.41	-1.2
104,297	-		AMB_RS00470	0.41	-1.2
104,297	-		AMB_RS00470	0.41	-2.6
104,297	-		AMB_RS00470	0.41	-1.1
104,297	-		AMB_RS00470	0.41	-1.7
104,297	-		AMB_RS00470	0.41	-0.2
104,297	-		AMB_RS00470	0.41	-1.3
104,297	-		AMB_RS00470	0.41	-1.9
104,297	-		AMB_RS00470	0.41	+0.2
104,297	-		AMB_RS00470	0.41	-1.4
104,353	+		AMB_RS00470	0.47	-1.4
104,353	+		AMB_RS00470	0.47	-0.2
104,353	+		AMB_RS00470	0.47	-1.5
104,353	+		AMB_RS00470	0.47	-1.0
104,353	+		AMB_RS00470	0.47	+0.2
104,353	+		AMB_RS00470	0.47	-1.3
104,353	+		AMB_RS00470	0.47	-1.0
104,353	+		AMB_RS00470	0.47	+0.2
104,353	+		AMB_RS00470	0.47	-0.8
104,354	-		AMB_RS00470	0.47	-2.0
104,354	-		AMB_RS00470	0.47	-1.4
104,354	-		AMB_RS00470	0.47	-0.6
104,354	-		AMB_RS00470	0.47	-4.7
104,354	-		AMB_RS00470	0.47	-1.0
104,355	+		AMB_RS00470	0.47	-0.6
104,355	+		AMB_RS00470	0.47	-2.0
104,355	+		AMB_RS00470	0.47	-0.5
104,355	+		AMB_RS00470	0.47	-2.2
104,355	+		AMB_RS00470	0.47	-1.9
104,356	-		AMB_RS00470	0.47	-2.4
104,356	-		AMB_RS00470	0.47	-0.9
104,500	-		AMB_RS00470	0.63	-0.5
104,574	+		AMB_RS00470	0.71	-0.5
104,574	+		AMB_RS00470	0.71	-1.8
104,575	-		AMB_RS00470	0.71	-2.8
104,575	-		AMB_RS00470	0.71	-2.5
104,671	+		AMB_RS00470	0.81	-0.5
104,671	+		AMB_RS00470	0.81	-0.5
104,671	+		AMB_RS00470	0.81	-1.2
104,671	+		AMB_RS00470	0.81	-2.8
104,672	-		AMB_RS00470	0.81	-0.8
104,672	-		AMB_RS00470	0.81	-1.4
104,672	-		AMB_RS00470	0.81	-2.1
104,672	-		AMB_RS00470	0.81	-0.8
104,682	-		AMB_RS00470	0.82	-1.0
104,689	-		AMB_RS00470	0.83	-0.5
104,808	+				-1.1
104,809	-				-1.2
104,870	+				+0.8
104,870	+				+0.0
104,870	+				-1.2
104,870	+				-1.4
104,871	-				-1.2
104,871	-				-1.7
104,871	-				-2.0
104,912	+				-2.4
104,913	-				-3.4
104,913	-				-1.7
104,913	-				-2.3
104,913	-				-1.9
104,913	-				-2.2
104,913	-				-0.6
104,916	-				-1.3
104,982	-				-2.2
104,982	-				+0.2
105,057	+		AMB_RS00475	0.14	-0.5
105,057	+		AMB_RS00475	0.14	-1.2
105,058	-		AMB_RS00475	0.14	-1.8
105,058	-		AMB_RS00475	0.14	-1.8
105,085	-		AMB_RS00475	0.15	-2.5
105,085	-		AMB_RS00475	0.15	-2.5
105,085	-		AMB_RS00475	0.15	-1.5
105,146	+		AMB_RS00475	0.20	-1.6
105,147	-		AMB_RS00475	0.20	-1.9
105,147	-		AMB_RS00475	0.20	-2.7
105,147	-		AMB_RS00475	0.20	-2.1
105,147	-		AMB_RS00475	0.20	+0.3
105,147	-		AMB_RS00475	0.20	+0.1
105,172	-		AMB_RS00475	0.21	-2.4
105,172	-		AMB_RS00475	0.21	-1.2
105,193	+		AMB_RS00475	0.23	+1.2
105,194	-		AMB_RS00475	0.23	+0.8
105,220	+		AMB_RS00475	0.25	-1.9
105,220	+		AMB_RS00475	0.25	-1.7
105,220	+		AMB_RS00475	0.25	-3.9
105,221	-		AMB_RS00475	0.25	-1.5
105,302	+		AMB_RS00475	0.30	-0.5
105,302	+		AMB_RS00475	0.30	-2.0
105,302	+		AMB_RS00475	0.30	-1.0
105,302	+		AMB_RS00475	0.30	+0.8
105,302	+		AMB_RS00475	0.30	-2.0
105,303	-		AMB_RS00475	0.30	-0.5
105,395	+		AMB_RS00475	0.36	-3.3
105,396	-		AMB_RS00475	0.36	-1.5
105,407	-		AMB_RS00475	0.37	-1.4
105,429	+		AMB_RS00475	0.39	+0.2
105,430	-		AMB_RS00475	0.39	-0.5
105,430	-		AMB_RS00475	0.39	-1.0
105,554	+		AMB_RS00475	0.47	-1.3
105,554	+		AMB_RS00475	0.47	-0.5
105,554	+		AMB_RS00475	0.47	+0.6
105,555	-		AMB_RS00475	0.47	-1.4
105,555	-		AMB_RS00475	0.47	-0.7
105,555	-		AMB_RS00475	0.47	-2.2
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-2.2
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-0.5
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-2.5
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-1.7
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-0.9
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-1.2
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-3.3
105,557	-		AMB_RS00475	0.47	-1.4
105,557	-		AMB_RS00475	0.47	-0.2
105,557	-		AMB_RS00475	0.47	+0.2
105,569	+		AMB_RS00475	0.48	+0.2
105,572	+		AMB_RS00475	0.48	+0.5
105,573	-		AMB_RS00475	0.48	-0.8
105,573	-		AMB_RS00475	0.48	-0.8
105,725	+		AMB_RS00475	0.58	-3.3
105,726	-		AMB_RS00475	0.59	-2.2
105,726	-		AMB_RS00475	0.59	-2.0
105,726	-		AMB_RS00475	0.59	-2.3
105,726	-		AMB_RS00475	0.59	-1.3
105,729	+		AMB_RS00475	0.59	-1.2
105,729	+		AMB_RS00475	0.59	-2.7
105,729	+		AMB_RS00475	0.59	-0.5
105,729	+		AMB_RS00475	0.59	-0.4
105,730	-		AMB_RS00475	0.59	+0.0
105,730	-		AMB_RS00475	0.59	-1.0
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-1.3
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	+1.8
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.9
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-2.4
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.8
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-1.2
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-1.9
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.2
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-3.7
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-2.0
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-1.3
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	+0.6
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	+0.8
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-1.0
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	+0.9
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-1.5
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	+0.8
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-0.5
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-0.2
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-3.9
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.8
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-1.5
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-0.5
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-1.9
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-0.8
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-0.7
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+1.3
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.2
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-0.8
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-2.7
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-2.4
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-2.8
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-1.4
105,790	+		AMB_RS00475	0.63	-1.5
105,790	+		AMB_RS00475	0.63	-1.3
105,790	+		AMB_RS00475	0.63	-1.9
105,791	-		AMB_RS00475	0.63	-1.8
105,830	-		AMB_RS00475	0.66	-0.5