Strain Fitness in Magnetospirillum magneticum AMB-1 around AMB_RS16745

Experiment: 30_an_mag_2

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	30_an_mag_2
3,594,499	+		AMB_RS16740	0.22	-0.1
3,594,602	+		AMB_RS16740	0.31	+0.3
3,594,670	-		AMB_RS16740	0.37	+0.6
3,594,670	-		AMB_RS16740	0.37	-2.3
3,594,743	+		AMB_RS16740	0.43	+0.5
3,594,743	+		AMB_RS16740	0.43	-0.4
3,594,744	-		AMB_RS16740	0.43	-1.2
3,594,744	-		AMB_RS16740	0.43	-0.2
3,594,744	-		AMB_RS16740	0.43	-1.6
3,594,827	-		AMB_RS16740	0.50	-0.9
3,594,827	-		AMB_RS16740	0.50	-0.3
3,594,827	-		AMB_RS16740	0.50	+0.5
3,594,827	-		AMB_RS16740	0.50	-0.9
3,594,827	-		AMB_RS16740	0.50	-0.4
3,594,922	+		AMB_RS16740	0.58	+0.0
3,594,922	+		AMB_RS16740	0.58	-2.1
3,594,922	+		AMB_RS16740	0.58	+0.3
3,594,922	+		AMB_RS16740	0.58	+0.1
3,594,923	-		AMB_RS16740	0.58	-0.2
3,594,923	-		AMB_RS16740	0.58	-1.2
3,594,982	+		AMB_RS16740	0.63	-0.6
3,594,983	-		AMB_RS16740	0.63	-0.6
3,594,983	-		AMB_RS16740	0.63	+0.6
3,594,983	-		AMB_RS16740	0.63	+0.5
3,594,983	-		AMB_RS16740	0.63	-0.8
3,594,983	-		AMB_RS16740	0.63	+1.4
3,595,048	+		AMB_RS16740	0.68	-2.4
3,595,048	+		AMB_RS16740	0.68	+0.3
3,595,048	+		AMB_RS16740	0.68	+0.7
3,595,049	-		AMB_RS16740	0.69	-1.6
3,595,049	-		AMB_RS16740	0.69	-2.4
3,595,049	-		AMB_RS16740	0.69	-0.0
3,595,049	-		AMB_RS16740	0.69	+0.4
3,595,152	-		AMB_RS16740	0.77	+1.0
3,595,191	-		AMB_RS16740	0.81	-0.3
3,595,191	-		AMB_RS16740	0.81	-1.2
3,595,361	+				-1.9
3,595,361	+				+0.2
3,595,361	+				-2.3
3,595,361	+				-0.6
3,595,361	+				-0.2
3,595,362	-				+0.3
3,595,454	+				+0.4
3,595,455	-				-0.7
3,595,455	-				+0.3
3,595,455	-				+0.4
3,595,455	-				-0.9
3,595,482	+				-0.2
3,595,483	-				+0.4
3,595,494	-				+0.4
3,595,534	-				+0.4
3,595,559	+				-0.2
3,595,559	+				+1.0
3,595,687	+		AMB_RS16745	0.11	+0.2
3,595,688	-		AMB_RS16745	0.11	+1.4
3,595,715	+		AMB_RS16745	0.13	-2.2
3,595,716	-		AMB_RS16745	0.13	-0.9
3,595,716	-		AMB_RS16745	0.13	-0.9
3,595,796	+		AMB_RS16745	0.16	+1.4
3,595,796	+		AMB_RS16745	0.16	+0.3
3,595,797	-		AMB_RS16745	0.16	-0.4
3,595,860	+		AMB_RS16745	0.19	-1.8
3,595,860	+		AMB_RS16745	0.19	-0.9
3,595,860	+		AMB_RS16745	0.19	-0.2
3,595,860	+		AMB_RS16745	0.19	-0.1
3,595,861	-		AMB_RS16745	0.19	+0.7
3,595,936	-		AMB_RS16745	0.22	+1.5
3,595,942	+		AMB_RS16745	0.22	+0.3
3,595,942	+		AMB_RS16745	0.22	-1.4
3,595,942	+		AMB_RS16745	0.22	-0.4
3,595,942	+		AMB_RS16745	0.22	+0.3
3,595,943	-		AMB_RS16745	0.22	+0.3
3,596,006	-		AMB_RS16745	0.25	+0.4
3,596,061	+		AMB_RS16745	0.27	+0.1
3,596,061	+		AMB_RS16745	0.27	-0.2
3,596,061	+		AMB_RS16745	0.27	-0.6
3,596,061	+		AMB_RS16745	0.27	-0.6
3,596,061	+		AMB_RS16745	0.27	-0.3
3,596,062	-		AMB_RS16745	0.27	-2.1
3,596,062	-		AMB_RS16745	0.27	-2.2
3,596,062	-		AMB_RS16745	0.27	+0.3
3,596,062	-		AMB_RS16745	0.27	+0.5
3,596,171	+		AMB_RS16745	0.32	-0.9
3,596,172	-		AMB_RS16745	0.32	+0.4
3,596,172	-		AMB_RS16745	0.32	-0.1
3,596,649	-		AMB_RS16745	0.52	-0.0
3,596,888	+		AMB_RS16745	0.62	+0.9
3,596,889	-		AMB_RS16745	0.62	-1.6
3,596,889	-		AMB_RS16745	0.62	-1.7
3,597,022	+		AMB_RS16745	0.68	-1.6
3,597,023	-		AMB_RS16745	0.68	+0.7
3,597,023	-		AMB_RS16745	0.68	+0.8
3,597,027	-		AMB_RS16745	0.68	-0.2
3,597,051	+		AMB_RS16745	0.69	-0.6
3,597,052	-		AMB_RS16745	0.69	-1.2
3,597,154	-		AMB_RS16745	0.74	-0.1
3,597,244	+		AMB_RS16745	0.78	-2.7
3,597,320	-		AMB_RS16745	0.81	-0.4
3,597,467	-		AMB_RS16745	0.87	-1.4
3,597,470	-		AMB_RS16745	0.87	-0.6
3,597,470	-		AMB_RS16745	0.87	+0.4
3,597,472	+		AMB_RS16745	0.87	+1.4
3,597,492	-		AMB_RS16745	0.88	-0.2
3,597,659	-				+0.2
3,597,789	+				-1.8
3,597,821	+				-0.2
3,597,821	+				+0.4
3,597,821	+				+0.2
3,597,822	-				+0.4
3,597,822	-				+0.1
3,597,838	-				+0.4
3,598,028	+		AMB_RS16750	0.14	-1.2
3,598,029	-		AMB_RS16750	0.14	-0.9
3,598,029	-		AMB_RS16750	0.14	-1.2
3,598,036	-		AMB_RS16750	0.14	+0.2
3,598,047	+		AMB_RS16750	0.14	-0.4
3,598,047	+		AMB_RS16750	0.14	-0.5
3,598,047	+		AMB_RS16750	0.14	+0.8
3,598,047	+		AMB_RS16750	0.14	-3.5
3,598,047	+		AMB_RS16750	0.14	+0.7
3,598,048	-		AMB_RS16750	0.15	+0.0
3,598,048	-		AMB_RS16750	0.15	-0.0
3,598,048	-		AMB_RS16750	0.15	-0.4
3,598,048	-		AMB_RS16750	0.15	+0.7
3,598,089	+		AMB_RS16750	0.16	-0.8
3,598,090	-		AMB_RS16750	0.17	-1.4
3,598,090	-		AMB_RS16750	0.17	+0.0
3,598,090	-		AMB_RS16750	0.17	+1.4
3,598,090	-		AMB_RS16750	0.17	-2.3
3,598,271	+		AMB_RS16750	0.25	-1.8
3,598,271	+		AMB_RS16750	0.25	-2.2
3,598,271	+		AMB_RS16750	0.25	-0.3
3,598,272	-		AMB_RS16750	0.25	+0.3
3,598,362	+		AMB_RS16750	0.30	-0.4
3,598,363	-		AMB_RS16750	0.30	+0.5
3,598,363	-		AMB_RS16750	0.30	+0.4
3,598,363	-		AMB_RS16750	0.30	+0.0
3,598,451	+		AMB_RS16750	0.34	+0.4
3,598,451	+		AMB_RS16750	0.34	+0.1
3,598,451	+		AMB_RS16750	0.34	+0.3
3,598,451	+		AMB_RS16750	0.34	-1.9
3,598,452	-		AMB_RS16750	0.34	-2.4
3,598,452	-		AMB_RS16750	0.34	-0.6
3,598,452	-		AMB_RS16750	0.34	+0.2
3,598,452	-		AMB_RS16750	0.34	+0.4
3,598,467	-		AMB_RS16750	0.35	-1.3
3,598,467	-		AMB_RS16750	0.35	+0.4
3,598,544	+		AMB_RS16750	0.39	+0.1
3,598,544	+		AMB_RS16750	0.39	-1.6
3,598,584	+		AMB_RS16750	0.41	-0.9
3,598,584	+		AMB_RS16750	0.41	-1.2
3,598,584	+		AMB_RS16750	0.41	-0.6
3,598,585	-		AMB_RS16750	0.41	-2.4
3,598,658	+		AMB_RS16750	0.44	-0.0
3,598,659	-		AMB_RS16750	0.44	-0.6
3,598,659	-		AMB_RS16750	0.44	-0.1
3,598,671	+		AMB_RS16750	0.45	+0.1
3,598,671	+		AMB_RS16750	0.45	+0.4
3,598,672	-		AMB_RS16750	0.45	+0.7
3,598,672	-		AMB_RS16750	0.45	-1.2
3,598,672	-		AMB_RS16750	0.45	-0.8
3,598,677	+		AMB_RS16750	0.45	+0.5
3,598,678	-		AMB_RS16750	0.45	-1.3
3,598,691	+		AMB_RS16750	0.46	-1.9
3,598,692	-		AMB_RS16750	0.46	-1.4
3,598,692	-		AMB_RS16750	0.46	+0.1
3,598,767	-		AMB_RS16750	0.49	+0.0