Strain Fitness in Rhodanobacter sp. FW510-T8 around OKGIIK_04085

Experiment: R2A_PIPES pH 4

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	R2A_PIPES pH 4
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	+0.3
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-1.5
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.7
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.9
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.1
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-1.7
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	+0.4
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-1.4
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.9
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.7
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.6
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-2.0
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.1
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-1.3
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.3
895,209	+	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.3
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.9
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-1.3
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.3
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.1
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-1.5
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-3.3
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-2.9
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.7
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.3
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.1
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.7
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.7
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.9
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	+0.0
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-2.4
895,210	-	sbm	OKGIIK_04075	0.90	-0.3
895,242	+				-0.3
895,242	+				-2.4
895,242	+				-1.0
895,242	+				-0.6
895,242	+				-0.7
895,242	+				-0.9
895,242	+				+0.2
895,242	+				-1.3
895,242	+				-1.0
895,242	+				-0.8
895,242	+				-0.5
895,243	-				-1.9
895,243	-				-2.3
895,243	-				-1.3
895,243	-				-0.3
895,243	-				-0.2
895,243	-				-2.5
895,243	-				-0.9
895,243	-				-0.1
895,243	-				-0.9
895,243	-				+0.7
895,245	+				-0.3
895,245	+				-0.9
895,245	+				-1.6
895,245	+				-1.7
895,245	+				+0.9
895,245	+				+0.9
895,246	-				+0.1
895,246	-				+0.1
895,246	-				-0.7
895,246	-				-2.3
895,246	-				-0.3
895,246	-				+1.7
895,246	-				-0.6
895,246	-				+0.2
895,292	+				-0.1
895,292	+				-0.9
895,292	+				-0.3
895,292	+				-1.7
895,292	+				-0.7
895,292	+				+0.7
895,292	+				+0.7
895,292	+				-0.7
895,292	+				-0.7
895,293	-				-1.1
895,293	-				+0.2
895,293	-				-0.7
895,293	-				-0.1
895,293	-				-1.5
895,293	-				-0.3
895,293	-				+1.7
895,293	-				+1.3
895,293	-				-0.3
895,293	-				-3.3
895,293	-				-0.3
895,293	-				-0.7
895,293	-				-0.3
895,293	-				-0.1
895,427	+				+0.9
895,427	+				+0.9
895,427	+				-1.0
895,427	+				-1.9
895,427	+				-1.1
895,428	-				-2.2
895,428	-				-0.7
895,428	-				-0.3
895,428	-				-0.5
895,428	-				-0.9
895,428	-				-1.5
895,429	-				-1.1
895,533	+				-0.7
895,533	+				+0.2
895,533	+				+0.1
895,533	+				+0.7
895,533	+				-1.2
895,533	+				-0.1
895,533	+				-1.8
895,533	+				-1.3
895,533	+				-0.7
895,533	+				-1.2
895,533	+				-0.3
895,533	+				-1.3
895,534	-				-0.7
895,534	-				-1.3
895,534	-				-0.7
895,552	-				-0.7
895,566	+				-1.1
895,566	+				-0.8
895,566	+				-1.1
895,566	+				-1.3
895,566	+				-1.1
895,566	+				-0.2
895,566	+				-0.3
895,566	+				+0.7
895,566	+				-0.3
895,566	+				+0.3
895,566	+				-3.4
895,566	+				-1.2
895,566	+				-0.7
895,566	+				-1.1
895,566	+				-0.9
895,566	+				-1.1
895,566	+				-1.5
895,566	+				-0.9
895,566	+				-2.3
895,566	+				-1.4
895,566	+				-0.3
895,566	+				-0.1
895,566	+				+0.3
895,566	+				+0.3
895,566	+				-1.5
895,567	-				-1.1
895,567	-				-1.8
895,567	-				-1.3
895,567	-				-1.1
895,567	-				-2.4
895,567	-				-0.3
895,567	-				-0.5
895,567	-				-0.3
895,567	-				-1.1
895,567	-				-0.3
895,567	-				-1.4
895,567	-				-0.5
895,567	-				-0.9
895,567	-				-0.7
895,567	-				-3.0
895,567	-				-0.9
895,567	-				-0.3
895,567	-				+1.8
895,567	-				+1.3
895,598	+				-0.3
895,598	+				+0.1
895,598	+				-1.8
895,598	+				-0.3
895,599	-				-1.7
895,599	-				+0.4
895,599	-				-0.9
895,599	-				-1.8
895,602	+				+1.7
895,602	+				-0.7
895,602	+				-1.1
895,602	+				+0.4
895,602	+				+0.3
895,602	+				-0.7
895,602	+				-2.2
895,602	+				-0.1
895,602	+				-1.1
895,602	+				-1.7
895,602	+				+0.3
895,602	+				-0.5
895,602	+				-2.8
895,602	+				-0.3
895,602	+				+0.1
895,602	+				-0.2
895,602	+				-2.2
895,602	+				-1.9
895,602	+				-0.5
895,602	+				-1.8
895,602	+				-0.1
895,602	+				-0.3
895,602	+				+0.1
895,602	+				-2.5
895,602	+				-2.5
895,602	+				-2.7
895,603	-				-0.3
895,603	-				-0.8
895,603	-				+0.7
895,603	-				-0.7
895,603	-				+1.3
895,603	-				+0.3
895,603	-				-1.5
895,603	-				-0.1
895,603	-				-1.7
895,603	-				-0.7
895,603	-				-0.9
895,603	-				-1.7
895,603	-				-0.3
895,603	-				+0.4
895,603	-				-0.2
895,603	-				-2.2
895,603	-				-2.3
895,603	-				-0.9
895,603	-				+1.1
895,603	-				-0.6
895,603	-				-1.3
895,603	-				-0.7
895,614	+				-2.2
895,614	+				+0.7
895,614	+				-0.5
895,614	+				+0.3
895,614	+				-1.5
895,614	+				-1.3
895,614	+				-1.5
895,614	+				-0.7
895,614	+				+0.2
895,614	+				-0.7
895,615	-				+1.3
895,615	-				-0.4
895,615	-				-1.3
895,615	-				-1.5
895,615	-				+0.7
895,615	-				-2.1
895,615	-				+0.3
895,615	-				-1.3
895,642	+				-1.7
895,642	+				+1.3
895,642	+				-1.1
895,642	+				+1.3
895,642	+				+0.1
895,642	+				-1.3
895,642	+				-0.9
895,642	+				-0.3
895,642	+				-1.3
895,642	+				-1.3
895,642	+				-1.2
895,642	+				-1.9
895,642	+				-1.8
895,642	+				-1.1
895,642	+				-1.3
895,642	+				-0.6
895,643	-				-1.1
895,643	-				-0.1
895,643	-				+0.3
895,643	-				-0.7
895,643	-				-1.1
895,643	-				-0.9
895,643	-				-1.7
895,643	-				-1.3
895,643	-				-1.5
895,643	-				-1.7
895,643	-				+0.3
895,653	+				-0.7
895,653	+				-0.2
895,653	+				-2.0
895,653	+				-0.9
895,653	+				-2.1
895,653	+				-0.7
895,653	+				-1.2
895,654	-				-2.0
895,654	-				+0.4
895,654	-				+0.7
895,654	-				-1.1
895,654	-				-3.0
895,654	-				-1.7
895,654	-				-1.8
895,654	-				-1.7
895,835	+				-0.0
895,835	+				-0.7
895,835	+				-0.3
895,835	+				-0.3
895,835	+				-1.3
895,835	+				-0.8
895,835	+				-1.1
895,836	-				-0.7
895,836	-				-2.2
895,836	-				-2.0
895,836	-				-0.1
895,836	-				-0.3
895,836	-				-1.3
895,866	+		OKGIIK_04080	0.13	+0.7
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-0.9
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-0.9
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-0.2
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	+0.2
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-1.7
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-0.7
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-0.3
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-1.1
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-0.7
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-1.5
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-1.7
896,046	+		OKGIIK_04080	0.80	-0.9
896,047	-		OKGIIK_04080	0.80	-0.1
896,047	-		OKGIIK_04080	0.80	+0.1
896,047	-		OKGIIK_04080	0.80	-0.1
896,047	-		OKGIIK_04080	0.80	-1.8
896,047	-		OKGIIK_04080	0.80	-1.6
896,101	+				-1.8
896,101	+				-0.3
896,101	+				+0.7
896,101	+				-0.9
896,101	+				-1.9
896,101	+				-0.7
896,102	-				-0.3
896,102	-				-0.3
896,102	-				-0.3
896,102	-				-0.7
896,102	-				-1.5
896,102	-				-0.3
896,102	-				-1.0
896,102	-				-1.7
896,102	-				-1.3
896,105	-				-0.9
896,121	+				+1.7
896,121	+				+0.7
896,121	+				-0.7
896,121	+				-3.9
896,121	+				-0.8
896,121	+				-0.9
896,122	-				-0.9
896,122	-				-0.3
896,122	-				+0.9
896,122	-				-0.1
896,122	-				+0.1
896,122	-				-0.9
896,122	-				+0.9
896,122	-				-0.3
896,122	-				-0.7
896,122	-				-0.9
896,161	+				-0.1
896,161	+				-1.3
896,161	+				-0.7
896,162	-				-0.3
896,162	-				-0.2
896,162	-				-0.9
896,162	-				-0.7
896,162	-				-1.8
896,162	-				-1.1
896,162	-				-2.0
896,197	-		OKGIIK_04085	0.21	-0.7
896,197	-		OKGIIK_04085	0.21	-3.3
896,197	-		OKGIIK_04085	0.21	-2.4
896,306	+		OKGIIK_04085	0.76	-0.7
896,307	-		OKGIIK_04085	0.77	-0.7
896,307	-		OKGIIK_04085	0.77	-0.3
896,341	+				+0.1
896,341	+				-1.2
896,341	+				-2.2
896,341	+				-2.3
896,341	+				-0.3
896,341	+				-0.3
896,341	+				-0.1
896,341	+				+0.7
896,341	+				-1.5
896,341	+				-0.3
896,341	+				-0.7
896,341	+				-1.9
896,342	-				-1.1
896,342	-				-0.5
896,342	-				-1.5
896,342	-				-0.2
896,342	-				-1.3
896,342	-				-2.0
896,342	-				+0.5
896,342	-				-0.1
896,342	-				-1.7
896,342	-				-3.4
896,342	-				+0.1
896,342	-				-0.3
896,342	-				-2.0
896,342	-				-1.5
896,342	-				-1.1
896,342	-				-0.5
896,342	-				-1.5
896,342	-				-0.5
896,342	-				-1.1
896,342	-				-1.6
896,342	-				-0.7
896,342	-				-0.2
896,342	-				+0.3
896,343	+				-1.8
896,343	+				-0.7
896,343	+				-0.7
896,343	+				-0.3
896,343	+				-0.4
896,343	+				+0.7
896,343	+				-0.5
896,343	+				+1.3
896,343	+				-0.7
896,343	+				-0.9
896,343	+				+0.9
896,343	+				-1.7
896,344	-				+0.3
896,344	-				-1.3
896,344	-				+0.3
896,344	-				-0.7
896,344	-				-0.7
896,344	-				-1.3
896,344	-				-0.9
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896,344	-				-0.3
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