Strain Fitness in Escherichia coli HS(pFamp)R (ATCC 700891) around OHPLBJKB_04237

Experiment: N4 MOI10

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	N4 MOI10
4,454,392	-				+0.4
4,454,392	-				-0.5
4,454,392	-				-0.7
4,454,392	-				-0.1
4,454,392	-				-0.4
4,454,462	+				-0.4
4,454,462	+				+0.2
4,454,462	+				+0.2
4,454,462	+				-0.4
4,454,462	+				-0.7
4,454,462	+				+0.5
4,454,462	+				+0.0
4,454,462	+				-1.1
4,454,462	+				-0.4
4,454,462	+				-0.4
4,454,462	+				+0.0
4,454,463	-				+1.6
4,454,463	-				-0.0
4,454,463	-				+0.2
4,454,463	-				-0.3
4,454,463	-				-0.0
4,454,539	+				-0.1
4,454,539	+				+0.7
4,454,539	+				+0.2
4,454,539	+				+0.2
4,454,539	+				+0.7
4,454,540	-				-0.2
4,454,540	-				+0.4
4,454,600	-		OHPLBJKB_04236	0.18	-1.0
4,454,607	+		OHPLBJKB_04236	0.18	+0.3
4,454,608	-		OHPLBJKB_04236	0.19	+2.4
4,454,608	-		OHPLBJKB_04236	0.19	-0.8
4,454,609	+		OHPLBJKB_04236	0.19	-0.9
4,454,680	+		OHPLBJKB_04236	0.28	-0.8
4,454,680	+		OHPLBJKB_04236	0.28	+0.1
4,454,680	+		OHPLBJKB_04236	0.28	+0.3
4,454,680	+		OHPLBJKB_04236	0.28	-0.3
4,454,681	-		OHPLBJKB_04236	0.28	-1.0
4,454,681	-		OHPLBJKB_04236	0.28	+0.2
4,454,681	-		OHPLBJKB_04236	0.28	+0.1
4,454,681	-		OHPLBJKB_04236	0.28	-0.7
4,454,681	-		OHPLBJKB_04236	0.28	-0.4
4,454,705	+		OHPLBJKB_04236	0.31	-0.7
4,454,706	-		OHPLBJKB_04236	0.31	-0.5
4,454,745	+		OHPLBJKB_04236	0.36	-0.4
4,454,745	+		OHPLBJKB_04236	0.36	-0.4
4,454,746	-		OHPLBJKB_04236	0.37	+0.5
4,454,746	-		OHPLBJKB_04236	0.37	-0.1
4,454,746	-		OHPLBJKB_04236	0.37	+0.5
4,454,757	+		OHPLBJKB_04236	0.38	+0.5
4,454,776	-		OHPLBJKB_04236	0.41	-0.5
4,454,776	-		OHPLBJKB_04236	0.41	+0.7
4,454,859	+		OHPLBJKB_04236	0.51	+1.0
4,454,859	+		OHPLBJKB_04236	0.51	-0.2
4,454,860	-		OHPLBJKB_04236	0.52	-0.2
4,454,860	-		OHPLBJKB_04236	0.52	-0.2
4,454,860	-		OHPLBJKB_04236	0.52	+0.5
4,454,965	+		OHPLBJKB_04236	0.65	-0.9
4,454,966	-		OHPLBJKB_04236	0.65	-0.3
4,454,969	+		OHPLBJKB_04236	0.66	-0.1
4,455,026	+		OHPLBJKB_04236	0.73	+0.6
4,455,026	+		OHPLBJKB_04236	0.73	-1.0
4,455,029	+		OHPLBJKB_04236	0.74	-0.3
4,455,029	+		OHPLBJKB_04236	0.74	-0.9
4,455,030	-		OHPLBJKB_04236	0.74	-1.1
4,455,093	+		OHPLBJKB_04236	0.82	-0.7
4,455,093	+		OHPLBJKB_04236	0.82	-0.6
4,455,129	+		OHPLBJKB_04236	0.87	-1.2
4,455,129	+		OHPLBJKB_04236	0.87	-0.5
4,455,129	+		OHPLBJKB_04236	0.87	+1.0
4,455,152	+		OHPLBJKB_04236	0.90	-0.0
4,455,152	+		OHPLBJKB_04236	0.90	+0.5
4,455,152	+		OHPLBJKB_04236	0.90	+0.2
4,455,152	+		OHPLBJKB_04236	0.90	-0.0
4,455,152	+		OHPLBJKB_04236	0.90	-0.7
4,455,152	+		OHPLBJKB_04236	0.90	-0.6
4,455,152	+		OHPLBJKB_04236	0.90	+0.2
4,455,152	+		OHPLBJKB_04236	0.90	-0.3
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	+0.2
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	+0.8
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	-0.1
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	+0.5
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	-1.0
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	+0.5
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	-0.9
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	+0.2
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	-0.8
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	+0.1
4,455,153	-		OHPLBJKB_04236	0.90	+0.6
4,455,156	+				+0.1
4,455,156	+				-0.1
4,455,156	+				-1.5
4,455,156	+				+1.0
4,455,156	+				-0.2
4,455,156	+				-0.5
4,455,156	+				+0.1
4,455,156	+				-0.7
4,455,156	+				+0.3
4,455,157	-				-1.2
4,455,157	-				+0.1
4,455,157	-				+0.4
4,455,157	-				-0.5
4,455,157	-				+0.8
4,455,158	+				-0.6
4,455,158	+				-0.1
4,455,158	+				+0.2
4,455,159	-				+0.3
4,455,159	-				-0.4
4,455,229	-				+0.2
4,455,236	+				-0.2
4,455,378	+				+0.7
4,455,378	+				-0.3
4,455,400	-				-0.8
4,455,454	+				-0.9
4,455,455	-				+0.4
4,455,455	-				+0.1
4,455,502	+				+0.7
4,455,503	-				-0.6
4,455,503	-				-0.2
4,455,664	-		OHPLBJKB_04237	0.13	+0.2
4,455,741	+		OHPLBJKB_04237	0.17	-0.1
4,455,742	-		OHPLBJKB_04237	0.17	-0.2
4,455,878	+		OHPLBJKB_04237	0.23	-1.4
4,455,878	+		OHPLBJKB_04237	0.23	-1.2
4,455,878	+		OHPLBJKB_04237	0.23	-0.1
4,455,879	-		OHPLBJKB_04237	0.23	-1.1
4,455,936	-		OHPLBJKB_04237	0.26	-0.5
4,455,956	+		OHPLBJKB_04237	0.27	+0.1
4,456,059	+		OHPLBJKB_04237	0.32	-0.6
4,456,059	+		OHPLBJKB_04237	0.32	+1.1
4,456,059	+		OHPLBJKB_04237	0.32	+1.0
4,456,060	-		OHPLBJKB_04237	0.32	+0.1
4,456,060	-		OHPLBJKB_04237	0.32	-0.3
4,456,060	-		OHPLBJKB_04237	0.32	-1.6
4,456,060	-		OHPLBJKB_04237	0.32	+0.4
4,456,085	-		OHPLBJKB_04237	0.33	-1.1
4,456,085	-		OHPLBJKB_04237	0.33	+0.3
4,456,103	+		OHPLBJKB_04237	0.34	-1.4
4,456,104	-		OHPLBJKB_04237	0.34	-1.7
4,456,167	-		OHPLBJKB_04237	0.37	-1.1
4,456,235	+		OHPLBJKB_04237	0.40	-0.4
4,456,236	-		OHPLBJKB_04237	0.40	-1.8
4,456,262	+		OHPLBJKB_04237	0.41	+1.6
4,456,263	-		OHPLBJKB_04237	0.41	+0.1
4,456,263	-		OHPLBJKB_04237	0.41	-0.2
4,456,263	-		OHPLBJKB_04237	0.41	-1.4
4,456,263	-		OHPLBJKB_04237	0.41	-0.9
4,456,360	-		OHPLBJKB_04237	0.45	-1.2
4,456,410	+		OHPLBJKB_04237	0.48	+0.3
4,456,414	+		OHPLBJKB_04237	0.48	-0.9
4,456,414	+		OHPLBJKB_04237	0.48	+1.2
4,456,414	+		OHPLBJKB_04237	0.48	-2.0
4,456,414	+		OHPLBJKB_04237	0.48	-0.7
4,456,415	-		OHPLBJKB_04237	0.48	-0.8
4,456,415	-		OHPLBJKB_04237	0.48	-0.4
4,456,426	+		OHPLBJKB_04237	0.48	+1.1
4,456,579	-		OHPLBJKB_04237	0.56	+0.1
4,456,588	+		OHPLBJKB_04237	0.56	-0.8
4,456,588	+		OHPLBJKB_04237	0.56	-2.6
4,456,589	-		OHPLBJKB_04237	0.56	-0.5
4,456,675	+		OHPLBJKB_04237	0.60	-1.6
4,456,675	+		OHPLBJKB_04237	0.60	-1.3
4,456,736	-		OHPLBJKB_04237	0.63	-2.2
4,456,750	+		OHPLBJKB_04237	0.63	-0.0
4,456,751	-		OHPLBJKB_04237	0.64	-0.6
4,456,779	+		OHPLBJKB_04237	0.65	-1.5
4,456,851	+		OHPLBJKB_04237	0.68	-1.1
4,456,911	+		OHPLBJKB_04237	0.71	-0.7
4,456,937	-		OHPLBJKB_04237	0.72	-0.1
4,457,019	+		OHPLBJKB_04237	0.76	+0.1
4,457,020	-		OHPLBJKB_04237	0.76	-0.9
4,457,050	+		OHPLBJKB_04237	0.77	+1.6
4,457,051	-		OHPLBJKB_04237	0.77	-0.4
4,457,055	+		OHPLBJKB_04237	0.78	-0.6
4,457,056	-		OHPLBJKB_04237	0.78	-0.1
4,457,065	+		OHPLBJKB_04237	0.78	+0.6
4,457,066	-		OHPLBJKB_04237	0.78	+0.2
4,457,106	+		OHPLBJKB_04237	0.80	-1.2
4,457,106	+		OHPLBJKB_04237	0.80	+0.3
4,457,107	-		OHPLBJKB_04237	0.80	-0.3
4,457,107	-		OHPLBJKB_04237	0.80	-2.3
4,457,107	-		OHPLBJKB_04237	0.80	-0.9
4,457,170	+		OHPLBJKB_04237	0.83	+0.4
4,457,180	+		OHPLBJKB_04237	0.83	-0.6
4,457,287	+		OHPLBJKB_04237	0.88	+0.2
4,457,287	+		OHPLBJKB_04237	0.88	-0.2
4,457,426	+				-0.7
4,457,427	-				+0.8
4,457,437	+				-0.3
4,457,437	+				+0.6
4,457,438	-				-0.3
4,457,559	+				-0.2
4,457,605	+				+1.1
4,457,605	+				-0.1
4,457,605	+				+0.5
4,457,605	+				+0.2
4,457,605	+				+1.2
4,457,605	+				-0.3
4,457,605	+				+0.7
4,457,605	+				-0.8
4,457,605	+				+0.6
4,457,605	+				-1.2
4,457,605	+				-0.1
4,457,606	-				-0.2
4,457,606	-				+0.3
4,457,606	-				-0.5
4,457,606	-				-0.3
4,457,607	+				-1.0
4,457,607	+				+0.6
4,457,607	+				+2.1
4,457,607	+				+0.7
4,457,607	+				+0.1
4,457,608	-				+0.8
4,457,608	-				-0.0
4,457,608	-				-0.9
4,457,608	-				-0.2
4,457,609	+				+0.4
4,457,609	+				-0.5
4,457,610	-				-1.0
4,457,610	-				+0.2
4,457,610	-				-2.1
4,457,624	+				-0.0
4,457,624	+				-0.2
4,457,624	+				-1.1
4,457,625	-				+0.6
4,457,625	-				+0.2
4,457,625	-				+0.3
4,457,626	+				+0.2
4,457,627	-				+0.0
4,457,627	-				-0.2
4,457,627	-				+0.0
4,457,788	+		OHPLBJKB_04238	0.23	-0.3
4,457,788	+		OHPLBJKB_04238	0.23	+0.7
4,457,788	+		OHPLBJKB_04238	0.23	-1.4
4,457,789	-		OHPLBJKB_04238	0.23	-0.5
4,457,789	-		OHPLBJKB_04238	0.23	-0.7
4,457,789	-		OHPLBJKB_04238	0.23	+0.3
4,457,789	-		OHPLBJKB_04238	0.23	+0.1
4,457,789	-		OHPLBJKB_04238	0.23	+0.3
4,457,789	-		OHPLBJKB_04238	0.23	+0.3
4,457,789	-		OHPLBJKB_04238	0.23	-0.6
4,457,838	+		OHPLBJKB_04238	0.30	-0.0
4,457,975	-		OHPLBJKB_04238	0.49	-0.1
4,457,975	-		OHPLBJKB_04238	0.49	+0.8
4,458,215	+		OHPLBJKB_04238	0.83	+0.2
4,458,216	-		OHPLBJKB_04238	0.83	-0.3
4,458,231	+		OHPLBJKB_04238	0.85	+0.2
4,458,231	+		OHPLBJKB_04238	0.85	-0.7
4,458,232	-		OHPLBJKB_04238	0.85	+0.1
4,458,232	-		OHPLBJKB_04238	0.85	-0.5
4,458,275	+				-0.4
4,458,341	-				+0.1
4,458,412	+				+0.3
4,458,413	-				-1.1
4,458,488	+		OHPLBJKB_04239	0.17	+0.1
4,458,488	+		OHPLBJKB_04239	0.17	-0.2
4,458,488	+		OHPLBJKB_04239	0.17	-0.9
4,458,488	+		OHPLBJKB_04239	0.17	+0.1
4,458,510	+		OHPLBJKB_04239	0.19	+0.3