Strain Fitness in Escherichia coli HS(pFamp)R (ATCC 700891) around OHPLBJKB_04260

Experiment: vio MOI10

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	vio MOI10
4,476,651	+				+0.0
4,476,676	+				+0.3
4,476,676	+				+0.7
4,476,676	+				-0.5
4,476,676	+				-0.2
4,476,677	-				-0.9
4,476,677	-				-0.4
4,476,690	+				+0.6
4,476,690	+				+0.8
4,476,700	-				-0.2
4,476,755	-				-0.6
4,476,755	-				-0.2
4,476,809	+				-0.6
4,476,830	+				+0.5
4,476,833	+				+1.5
4,476,874	+				+1.2
4,476,917	+				-1.5
4,476,922	-				+0.2
4,477,022	+		OHPLBJKB_04259	0.18	-0.5
4,477,022	+		OHPLBJKB_04259	0.18	-0.6
4,477,044	+		OHPLBJKB_04259	0.21	-0.1
4,477,064	-		OHPLBJKB_04259	0.23	-0.5
4,477,065	+		OHPLBJKB_04259	0.24	+0.5
4,477,065	+		OHPLBJKB_04259	0.24	-1.4
4,477,066	-		OHPLBJKB_04259	0.24	-1.2
4,477,066	-		OHPLBJKB_04259	0.24	+0.3
4,477,066	-		OHPLBJKB_04259	0.24	-0.3
4,477,066	-		OHPLBJKB_04259	0.24	+0.7
4,477,203	+		OHPLBJKB_04259	0.42	-1.0
4,477,203	+		OHPLBJKB_04259	0.42	+1.9
4,477,204	-		OHPLBJKB_04259	0.42	-1.5
4,477,252	+		OHPLBJKB_04259	0.49	-1.2
4,477,253	-		OHPLBJKB_04259	0.49	+0.6
4,477,282	+		OHPLBJKB_04259	0.53	-0.4
4,477,394	+		OHPLBJKB_04259	0.68	-1.6
4,477,395	-		OHPLBJKB_04259	0.68	-0.7
4,477,403	+		OHPLBJKB_04259	0.69	-1.2
4,477,403	+		OHPLBJKB_04259	0.69	+3.3
4,477,403	+		OHPLBJKB_04259	0.69	-0.8
4,477,404	-		OHPLBJKB_04259	0.69	-1.5
4,477,425	+		OHPLBJKB_04259	0.72	-2.0
4,477,429	+		OHPLBJKB_04259	0.73	-0.5
4,477,430	-		OHPLBJKB_04259	0.73	-1.2
4,477,430	-		OHPLBJKB_04259	0.73	+0.3
4,477,448	+		OHPLBJKB_04259	0.75	-0.9
4,477,448	+		OHPLBJKB_04259	0.75	-1.2
4,477,449	-		OHPLBJKB_04259	0.75	-0.5
4,477,449	-		OHPLBJKB_04259	0.75	-1.0
4,477,449	-		OHPLBJKB_04259	0.75	+0.1
4,477,468	+		OHPLBJKB_04259	0.78	-0.2
4,477,468	+		OHPLBJKB_04259	0.78	-0.9
4,477,469	-		OHPLBJKB_04259	0.78	-0.3
4,477,469	-		OHPLBJKB_04259	0.78	-1.0
4,477,469	-		OHPLBJKB_04259	0.78	-0.2
4,477,469	-		OHPLBJKB_04259	0.78	-0.8
4,477,522	+		OHPLBJKB_04259	0.85	+0.3
4,477,522	+		OHPLBJKB_04259	0.85	-1.5
4,477,522	+		OHPLBJKB_04259	0.85	+1.1
4,477,523	-		OHPLBJKB_04259	0.85	-1.1
4,477,546	-		OHPLBJKB_04259	0.89	-2.8
4,477,586	+				-0.8
4,477,586	+				-0.9
4,477,587	-				-0.5
4,477,601	-				-1.4
4,477,602	+				-1.8
4,477,602	+				-1.6
4,477,602	+				-1.2
4,477,674	+				-0.2
4,477,706	+				-1.1
4,477,707	-				-1.4
4,477,806	+		OHPLBJKB_04260	0.13	-2.8
4,477,806	+		OHPLBJKB_04260	0.13	+1.3
4,477,806	+		OHPLBJKB_04260	0.13	-2.5
4,477,807	-		OHPLBJKB_04260	0.13	-0.8
4,477,840	+		OHPLBJKB_04260	0.15	-0.8
4,477,851	+		OHPLBJKB_04260	0.16	-0.3
4,477,860	+		OHPLBJKB_04260	0.17	-1.3
4,477,884	-		OHPLBJKB_04260	0.19	+0.8
4,477,972	+		OHPLBJKB_04260	0.25	-1.5
4,477,972	+		OHPLBJKB_04260	0.25	-1.4
4,477,973	-		OHPLBJKB_04260	0.25	-2.6
4,477,973	-		OHPLBJKB_04260	0.25	+0.0
4,477,973	-		OHPLBJKB_04260	0.25	-1.7
4,478,030	+		OHPLBJKB_04260	0.29	-2.4
4,478,030	+		OHPLBJKB_04260	0.29	-2.4
4,478,030	+		OHPLBJKB_04260	0.29	-0.8
4,478,030	+		OHPLBJKB_04260	0.29	-2.4
4,478,030	+		OHPLBJKB_04260	0.29	-1.4
4,478,031	-		OHPLBJKB_04260	0.29	+0.5
4,478,031	-		OHPLBJKB_04260	0.29	-1.5
4,478,031	-		OHPLBJKB_04260	0.29	-2.9
4,478,052	+		OHPLBJKB_04260	0.31	+0.0
4,478,052	+		OHPLBJKB_04260	0.31	-0.2
4,478,052	+		OHPLBJKB_04260	0.31	-0.2
4,478,093	+		OHPLBJKB_04260	0.34	-3.2
4,478,093	+		OHPLBJKB_04260	0.34	-2.0
4,478,094	-		OHPLBJKB_04260	0.34	-0.8
4,478,141	+		OHPLBJKB_04260	0.38	-0.8
4,478,142	-		OHPLBJKB_04260	0.38	-0.8
4,478,142	-		OHPLBJKB_04260	0.38	+0.0
4,478,208	+		OHPLBJKB_04260	0.42	-3.0
4,478,209	-		OHPLBJKB_04260	0.43	-1.7
4,478,209	-		OHPLBJKB_04260	0.43	-1.2
4,478,209	-		OHPLBJKB_04260	0.43	+0.2
4,478,210	+		OHPLBJKB_04260	0.43	-0.8
4,478,210	+		OHPLBJKB_04260	0.43	-1.7
4,478,211	-		OHPLBJKB_04260	0.43	-2.3
4,478,211	-		OHPLBJKB_04260	0.43	-1.2
4,478,368	-		OHPLBJKB_04260	0.54	-0.7
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-0.8
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.6
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.3
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-0.7
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.6
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.5
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.6
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.0
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.5
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.0
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.5
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.7
4,478,394	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.0
4,478,395	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.5
4,478,395	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-3.0
4,478,395	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.0
4,478,395	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.0
4,478,395	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-0.8
4,478,396	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.3
4,478,396	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.1
4,478,396	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.4
4,478,396	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.3
4,478,396	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.1
4,478,396	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.0
4,478,396	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.5
4,478,396	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.2
4,478,396	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.6
4,478,396	+		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.2
4,478,397	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.4
4,478,397	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-0.5
4,478,397	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.0
4,478,397	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-0.7
4,478,397	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-2.4
4,478,397	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-1.0
4,478,397	-		OHPLBJKB_04260	0.56	-0.7
4,478,498	+		OHPLBJKB_04260	0.64	-1.7
4,478,499	-		OHPLBJKB_04260	0.64	-2.2
4,478,552	+		OHPLBJKB_04260	0.68	-1.5
4,478,552	+		OHPLBJKB_04260	0.68	-0.9
4,478,608	+		OHPLBJKB_04260	0.72	-2.4
4,478,640	+		OHPLBJKB_04260	0.74	-1.1
4,478,641	-		OHPLBJKB_04260	0.75	-1.7
4,478,641	-		OHPLBJKB_04260	0.75	-1.5
4,478,668	-		OHPLBJKB_04260	0.76	-2.0
4,478,686	+		OHPLBJKB_04260	0.78	-2.1
4,478,720	+		OHPLBJKB_04260	0.80	-1.7
4,478,720	+		OHPLBJKB_04260	0.80	-1.0
4,478,729	+		OHPLBJKB_04260	0.81	-1.7
4,478,730	-		OHPLBJKB_04260	0.81	-1.4
4,478,732	+		OHPLBJKB_04260	0.81	-1.4
4,478,732	+		OHPLBJKB_04260	0.81	-2.4
4,479,030	+				-0.4
4,479,030	+				+0.6
4,479,030	+				-2.4
4,479,030	+				-1.1
4,479,030	+				+0.2
4,479,031	-				-0.7
4,479,034	+				-2.2
4,479,034	+				-0.5
4,479,034	+				-2.4
4,479,034	+				-1.7
4,479,035	-				-0.4
4,479,035	-				+0.5
4,479,066	-				-1.7
4,479,128	+		OHPLBJKB_04261	0.14	+1.0
4,479,129	-		OHPLBJKB_04261	0.14	-1.1
4,479,346	-		OHPLBJKB_04261	0.34	-0.3
4,479,379	+		OHPLBJKB_04261	0.37	-0.7
4,479,379	+		OHPLBJKB_04261	0.37	-1.8
4,479,380	-		OHPLBJKB_04261	0.37	-0.4
4,479,390	-		OHPLBJKB_04261	0.38	-1.2
4,479,457	-		OHPLBJKB_04261	0.44	+0.3
4,479,457	-		OHPLBJKB_04261	0.44	+0.3
4,479,545	+		OHPLBJKB_04261	0.52	-1.0
4,479,645	+		OHPLBJKB_04261	0.61	-1.7
4,479,646	-		OHPLBJKB_04261	0.61	-1.0
4,479,678	+		OHPLBJKB_04261	0.64	-1.9
4,479,679	-		OHPLBJKB_04261	0.65	-1.7
4,479,697	+		OHPLBJKB_04261	0.66	-0.9
4,479,721	+		OHPLBJKB_04261	0.68	-1.1
4,479,740	+		OHPLBJKB_04261	0.70	-0.8
4,479,840	-		OHPLBJKB_04261	0.79	-0.4
4,479,918	-		OHPLBJKB_04261	0.87	-0.2
4,479,918	-		OHPLBJKB_04261	0.87	-1.2
4,479,924	+		OHPLBJKB_04261	0.87	-1.5
4,479,924	+		OHPLBJKB_04261	0.87	-0.5
4,479,950	+		OHPLBJKB_04261	0.90	-0.2
4,479,950	+		OHPLBJKB_04261	0.90	-0.1