Strain Fitness in Sphingobium sp. HT1-2 around GFF5285

Experiment: EMM_noCarbon with D-Glucose and Ammonium Sulfate

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	EMM_noCarbon with D-Glucose and Ammonium Sulfate
5,275,153	+				-1.9
5,275,153	+				-0.7
5,275,153	+				-2.3
5,275,153	-				-2.9
5,275,153	-				-0.5
5,275,153	-				-1.9
5,275,161	-				-0.4
5,275,173	-				+0.6
5,275,177	+				-2.9
5,275,180	-				-0.7
5,275,180	-				-0.1
5,275,181	-				+0.1
5,275,181	-				+0.6
5,275,185	-				-1.0
5,275,215	+				-0.7
5,275,247	-				-0.2
5,275,247	-				-0.7
5,275,247	-				-0.3
5,275,252	+				-0.2
5,275,252	+				-0.4
5,275,254	+				-1.2
5,275,254	+				+0.0
5,275,262	-				+0.3
5,275,262	-				-2.2
5,275,262	-				-1.6
5,275,262	-				-1.0
5,275,264	+				-0.2
5,275,265	-				-0.2
5,275,282	+				-0.1
5,275,288	+				-0.8
5,275,288	+				-0.9
5,275,288	+				+0.1
5,275,290	-				+0.5
5,275,296	+				+0.1
5,275,296	-				+0.4
5,275,296	-				-1.2
5,275,296	-				-0.7
5,275,298	+				+0.1
5,275,298	+				-1.2
5,275,298	+				-1.2
5,275,306	-				-2.5
5,275,306	-				+0.9
5,275,316	+				-1.4
5,275,316	+				-1.3
5,275,316	+				-2.6
5,275,316	+				-0.2
5,275,324	-				-0.6
5,275,324	-				-1.1
5,275,369	+				-0.1
5,275,396	-		GFF5284	0.12	-3.1
5,275,401	+		GFF5284	0.12	+1.1
5,275,411	-		GFF5284	0.14	-2.2
5,275,454	+		GFF5284	0.19	+1.1
5,275,467	+		GFF5284	0.21	-1.5
5,275,467	+		GFF5284	0.21	-0.2
5,275,467	+		GFF5284	0.21	-0.8
5,275,468	-		GFF5284	0.21	-0.4
5,275,468	-		GFF5284	0.21	-1.6
5,275,475	-		GFF5284	0.22	+0.3
5,275,475	-		GFF5284	0.22	+0.3
5,275,475	-		GFF5284	0.22	-0.3
5,275,475	-		GFF5284	0.22	-1.2
5,275,475	-		GFF5284	0.22	+1.0
5,275,475	-		GFF5284	0.22	-2.3
5,275,485	-		GFF5284	0.24	+0.2
5,275,509	+		GFF5284	0.27	-0.9
5,275,517	-		GFF5284	0.28	+0.2
5,275,522	-		GFF5284	0.28	+0.6
5,275,534	+		GFF5284	0.30	-0.4
5,275,534	+		GFF5284	0.30	+0.1
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.8
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-1.1
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-1.3
5,275,558	+		GFF5284	0.33	+0.7
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.5
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-2.2
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.2
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.8
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.6
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.1
5,275,563	+		GFF5284	0.34	-0.3
5,275,566	-		GFF5284	0.34	+0.1
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-1.5
5,275,566	-		GFF5284	0.34	+0.8
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-0.4
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-1.2
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-1.7
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-0.6
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-1.2
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-0.8
5,275,571	-		GFF5284	0.35	+0.8
5,275,578	+		GFF5284	0.36	-1.1
5,275,586	-		GFF5284	0.37	-0.0
5,275,588	+		GFF5284	0.37	+0.8
5,275,603	+		GFF5284	0.39	+0.7
5,275,604	-		GFF5284	0.40	+0.8
5,275,606	-		GFF5284	0.40	+0.5
5,275,619	+		GFF5284	0.42	-0.8
5,275,627	-		GFF5284	0.43	+1.2
5,275,627	-		GFF5284	0.43	+0.1
5,275,627	-		GFF5284	0.43	-0.3
5,275,627	-		GFF5284	0.43	-1.4
5,275,642	+		GFF5284	0.45	-0.7
5,275,642	+		GFF5284	0.45	+0.4
5,275,642	+		GFF5284	0.45	+0.3
5,275,645	-		GFF5284	0.45	-1.5
5,275,645	-		GFF5284	0.45	-0.7
5,275,650	+		GFF5284	0.46	-0.2
5,275,650	-		GFF5284	0.46	-1.5
5,275,650	-		GFF5284	0.46	-0.2
5,275,650	-		GFF5284	0.46	-1.1
5,275,692	+		GFF5284	0.51	-1.8
5,275,697	+		GFF5284	0.52	-0.6
5,275,700	-		GFF5284	0.52	-0.8
5,275,709	+		GFF5284	0.54	+0.9
5,275,717	+		GFF5284	0.55	+0.4
5,275,742	+		GFF5284	0.58	-0.0
5,275,742	+		GFF5284	0.58	-0.2
5,275,742	+		GFF5284	0.58	-0.2
5,275,742	+		GFF5284	0.58	-0.2
5,275,747	+		GFF5284	0.59	-0.6
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-0.3
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-0.5
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-0.3
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-0.4
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-1.2
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-1.1
5,275,764	-		GFF5284	0.61	+0.9
5,275,764	-		GFF5284	0.61	-1.8
5,275,776	+		GFF5284	0.63	-1.2
5,275,781	+		GFF5284	0.63	-1.6
5,275,796	+		GFF5284	0.65	-1.8
5,275,804	-		GFF5284	0.66	+0.3
5,275,807	+		GFF5284	0.67	-1.2
5,275,811	+		GFF5284	0.67	-1.4
5,275,833	+		GFF5284	0.70	+0.2
5,275,861	-		GFF5284	0.74	+0.7
5,275,865	+		GFF5284	0.75	-0.9
5,275,865	+		GFF5284	0.75	-0.9
5,275,865	+		GFF5284	0.75	-0.1
5,275,865	+		GFF5284	0.75	-0.5
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.3
5,275,873	-		GFF5284	0.76	+0.8
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.8
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.0
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-2.4
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.8
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.2
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.9
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.5
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.6
5,275,878	-		GFF5284	0.76	-1.7
5,275,891	-		GFF5284	0.78	-2.1
5,275,892	+		GFF5284	0.78	+0.6
5,275,892	+		GFF5284	0.78	-0.1
5,275,900	-		GFF5284	0.79	-0.4
5,275,905	-		GFF5284	0.80	-1.5
5,275,919	+		GFF5284	0.82	+0.7
5,275,933	+		GFF5284	0.84	+0.1
5,275,941	+		GFF5284	0.85	-0.5
5,275,956	-		GFF5284	0.87	+0.1
5,275,956	-		GFF5284	0.87	+1.0
5,275,965	-		GFF5284	0.88	-0.9
5,275,984	+				-0.5
5,276,007	+				-0.9
5,276,012	+				-1.3
5,276,012	+				-1.0
5,276,012	+				-0.9
5,276,012	+				-0.9
5,276,015	-				-0.5
5,276,025	-				-0.1
5,276,050	+				+0.3
5,276,050	+				-0.1
5,276,050	+				-0.2
5,276,050	+				-0.9
5,276,050	+				+0.0
5,276,050	+				-0.9
5,276,053	+				-1.4
5,276,053	+				-2.0
5,276,053	+				-1.2
5,276,053	+				-1.0
5,276,053	+				-0.7
5,276,053	+				+0.2
5,276,053	+				-1.1
5,276,058	-				+0.2
5,276,058	-				-1.9
5,276,061	-				-3.3
5,276,061	-				-1.8
5,276,061	-				-0.4
5,276,061	-				+0.2
5,276,061	-				-1.2
5,276,061	-				+1.0
5,276,061	-				-0.1
5,276,061	-				-0.7
5,276,061	-				-1.2
5,276,061	-				-1.4
5,276,061	-				-2.2
5,276,089	+				-1.3
5,276,146	+				-1.7
5,276,154	-				+0.1
5,276,156	+				+0.4
5,276,161	+				+0.0
5,276,168	-				-1.9
5,276,176	-				-1.1
5,276,185	+				-0.9
5,276,185	+				-0.1
5,276,185	+				-0.8
5,276,185	+				-1.1
5,276,185	+				-0.2
5,276,185	+				-0.1
5,276,185	+				-1.2
5,276,185	+				-0.7
5,276,185	+				+0.3
5,276,185	+				+0.1
5,276,185	+				+0.2
5,276,185	+				+0.2
5,276,185	+				-0.8
5,276,185	+				-1.1
5,276,185	+				-0.1
5,276,187	+				+0.0
5,276,193	-				+1.0
5,276,193	-				+0.4
5,276,195	-				-0.5
5,276,236	+				-1.8
5,276,242	-				-0.4
5,276,244	-				-0.5
5,276,244	-				-0.7
5,276,244	-				-0.9
5,276,261	-				-0.3
5,276,270	-				-0.5
5,276,272	+				-1.2
5,276,272	+				-0.4
5,276,272	+				-2.1
5,276,280	-				+0.2
5,276,280	-				-1.8
5,276,285	+				-0.9
5,276,285	+				-0.4
5,276,285	+				-0.2
5,276,289	+		GFF5285	0.10	-1.3
5,276,292	+		GFF5285	0.10	-2.5
5,276,293	-		GFF5285	0.11	+1.0
5,276,293	-		GFF5285	0.11	-1.9
5,276,295	+		GFF5285	0.11	-2.1
5,276,302	+		GFF5285	0.11	-0.7
5,276,302	+		GFF5285	0.11	-0.5
5,276,302	+		GFF5285	0.11	-1.2
5,276,303	-		GFF5285	0.11	-0.2
5,276,307	+		GFF5285	0.12	+0.6
5,276,316	+		GFF5285	0.12	-0.1
5,276,326	+		GFF5285	0.13	+1.3
5,276,326	+		GFF5285	0.13	-1.1
5,276,326	+		GFF5285	0.13	-0.4
5,276,334	-		GFF5285	0.14	-1.0
5,276,336	-		GFF5285	0.14	-0.4
5,276,343	+		GFF5285	0.14	-2.2
5,276,355	-		GFF5285	0.15	-0.2
5,276,369	+		GFF5285	0.16	+1.5
5,276,369	+		GFF5285	0.16	-0.1
5,276,377	-		GFF5285	0.17	+0.2
5,276,408	-		GFF5285	0.19	+0.5
5,276,435	+		GFF5285	0.21	-0.7
5,276,435	+		GFF5285	0.21	+0.3
5,276,435	+		GFF5285	0.21	+0.2
5,276,435	+		GFF5285	0.21	+0.2
5,276,443	-		GFF5285	0.22	-0.4
5,276,443	-		GFF5285	0.22	-0.2
5,276,443	-		GFF5285	0.22	+0.6
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-0.9
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-1.2
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-1.0
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-0.5
5,276,445	+		GFF5285	0.22	+0.7
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-0.1
5,276,445	+		GFF5285	0.22	+1.0
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-1.9
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-1.8
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-0.7
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-1.2
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-2.2
5,276,445	+		GFF5285	0.22	+1.1
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-0.4
5,276,445	+		GFF5285	0.22	+0.3
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-0.4
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-0.8
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-0.2
5,276,445	+		GFF5285	0.22	+0.3
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-2.1
5,276,445	+		GFF5285	0.22	+0.8
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-0.7
5,276,445	+		GFF5285	0.22	-0.1
5,276,453	-		GFF5285	0.23	+0.1
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-3.8
5,276,453	-		GFF5285	0.23	+0.6
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-0.9
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-1.2
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-0.2
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-1.2
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-0.4
5,276,453	-		GFF5285	0.23	+0.0
5,276,453	-		GFF5285	0.23	+0.1
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-1.2
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-0.2
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-2.5
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-0.3
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-0.7
5,276,453	-		GFF5285	0.23	-0.5
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5,277,148	+		GFF5285	0.75	+0.8
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