Strain Fitness in Sphingobium sp. HT1-2 around GFF5284

Experiment: EMM_noCarbon with D-Glucose and Ammonium Sulfate

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	EMM_noCarbon with D-Glucose and Ammonium Sulfate
5,274,356	+		GFF5283	0.51	+0.5
5,274,371	-		GFF5283	0.52	+0.3
5,274,371	-		GFF5283	0.52	-0.9
5,274,377	-		GFF5283	0.52	+0.1
5,274,411	+		GFF5283	0.54	-0.7
5,274,430	+		GFF5283	0.55	-0.2
5,274,438	-		GFF5283	0.55	-1.0
5,274,438	-		GFF5283	0.55	-0.6
5,274,438	-		GFF5283	0.55	-0.8
5,274,453	+		GFF5283	0.56	+0.7
5,274,453	+		GFF5283	0.56	-0.8
5,274,455	-		GFF5283	0.56	-1.7
5,274,458	+		GFF5283	0.57	-0.1
5,274,485	-		GFF5283	0.58	-1.5
5,274,500	-		GFF5283	0.59	+0.0
5,274,502	+		GFF5283	0.59	+0.4
5,274,510	-		GFF5283	0.59	+0.2
5,274,512	+		GFF5283	0.59	-0.1
5,274,526	-		GFF5283	0.60	-0.3
5,274,531	+		GFF5283	0.60	+0.0
5,274,531	+		GFF5283	0.60	-1.6
5,274,531	+		GFF5283	0.60	-0.3
5,274,536	+		GFF5283	0.61	-1.9
5,274,536	+		GFF5283	0.61	+0.0
5,274,544	-		GFF5283	0.61	-1.6
5,274,547	+		GFF5283	0.61	+0.3
5,274,552	+		GFF5283	0.61	-1.0
5,274,560	-		GFF5283	0.62	+0.3
5,274,560	-		GFF5283	0.62	-0.4
5,274,562	+		GFF5283	0.62	-1.2
5,274,614	-		GFF5283	0.65	-0.5
5,274,614	-		GFF5283	0.65	+0.6
5,274,616	+		GFF5283	0.65	-0.4
5,274,618	+		GFF5283	0.65	+1.4
5,274,623	+		GFF5283	0.65	-0.1
5,274,623	+		GFF5283	0.65	-1.3
5,274,623	+		GFF5283	0.65	-2.0
5,274,623	+		GFF5283	0.65	-0.2
5,274,623	+		GFF5283	0.65	+0.4
5,274,623	+		GFF5283	0.65	-0.2
5,274,623	+		GFF5283	0.65	-0.2
5,274,623	+		GFF5283	0.65	+0.5
5,274,623	+		GFF5283	0.65	-1.0
5,274,631	-		GFF5283	0.65	-0.4
5,274,631	-		GFF5283	0.65	-0.6
5,274,631	-		GFF5283	0.65	-0.8
5,274,631	-		GFF5283	0.65	-0.2
5,274,631	-		GFF5283	0.65	-0.7
5,274,631	-		GFF5283	0.65	+0.0
5,274,631	-		GFF5283	0.65	+0.6
5,274,635	+		GFF5283	0.66	-0.5
5,274,643	-		GFF5283	0.66	-1.1
5,274,653	+		GFF5283	0.67	+0.5
5,274,655	+		GFF5283	0.67	+0.5
5,274,655	+		GFF5283	0.67	-1.2
5,274,657	+		GFF5283	0.67	-0.3
5,274,657	+		GFF5283	0.67	-0.4
5,274,675	-		GFF5283	0.68	-1.6
5,274,676	+		GFF5283	0.68	-1.7
5,274,686	+		GFF5283	0.68	+0.1
5,274,687	+		GFF5283	0.68	+1.2
5,274,693	+		GFF5283	0.69	-0.9
5,274,700	-		GFF5283	0.69	-0.6
5,274,746	+		GFF5283	0.71	-0.9
5,274,750	+		GFF5283	0.72	-1.8
5,274,750	+		GFF5283	0.72	+0.7
5,274,751	+		GFF5283	0.72	+0.4
5,274,754	-		GFF5283	0.72	+0.7
5,274,754	-		GFF5283	0.72	-0.8
5,274,754	-		GFF5283	0.72	-0.9
5,274,754	-		GFF5283	0.72	-0.7
5,274,756	+		GFF5283	0.72	+0.6
5,274,778	-		GFF5283	0.73	-0.7
5,274,778	-		GFF5283	0.73	-0.9
5,274,782	+		GFF5283	0.73	-0.4
5,274,784	+		GFF5283	0.73	-0.1
5,274,810	+		GFF5283	0.75	-1.6
5,274,811	+		GFF5283	0.75	-0.6
5,274,811	+		GFF5283	0.75	-0.6
5,274,811	+		GFF5283	0.75	-1.7
5,274,819	+		GFF5283	0.75	+0.2
5,274,824	+		GFF5283	0.75	-2.0
5,274,864	-		GFF5283	0.77	-0.3
5,274,867	+		GFF5283	0.78	-0.5
5,274,907	+		GFF5283	0.80	-1.4
5,274,907	+		GFF5283	0.80	-0.5
5,274,912	+		GFF5283	0.80	+0.0
5,274,912	+		GFF5283	0.80	-2.0
5,274,920	-		GFF5283	0.80	+1.3
5,274,920	-		GFF5283	0.80	-0.4
5,274,922	-		GFF5283	0.80	-0.9
5,274,925	+		GFF5283	0.81	-0.4
5,274,925	+		GFF5283	0.81	+1.4
5,274,925	-		GFF5283	0.81	-1.2
5,274,938	-		GFF5283	0.81	+0.3
5,274,987	-		GFF5283	0.84	-1.6
5,275,011	+		GFF5283	0.85	-1.3
5,275,029	-		GFF5283	0.86	-1.8
5,275,029	-		GFF5283	0.86	+1.2
5,275,036	-		GFF5283	0.86	-0.6
5,275,055	-		GFF5283	0.87	-1.8
5,275,055	-		GFF5283	0.87	+0.0
5,275,057	+		GFF5283	0.87	+0.2
5,275,065	-		GFF5283	0.88	+0.0
5,275,065	-		GFF5283	0.88	-0.5
5,275,065	-		GFF5283	0.88	+0.1
5,275,086	+		GFF5283	0.89	-0.2
5,275,093	+		GFF5283	0.89	-1.3
5,275,093	+		GFF5283	0.89	-1.5
5,275,128	+				-1.2
5,275,128	-				-1.6
5,275,129	+				-0.2
5,275,129	-				-1.6
5,275,129	-				-0.8
5,275,130	-				-0.8
5,275,130	-				-0.4
5,275,133	+				-1.1
5,275,136	-				+0.6
5,275,145	+				+0.5
5,275,153	+				-1.1
5,275,153	+				-0.1
5,275,153	+				-0.2
5,275,153	-				-2.8
5,275,153	-				-0.9
5,275,153	-				-0.8
5,275,161	-				-0.6
5,275,173	-				+0.2
5,275,177	+				-0.3
5,275,180	-				-0.4
5,275,180	-				+0.1
5,275,181	-				-0.5
5,275,181	-				-2.6
5,275,185	-				-0.6
5,275,215	+				+0.2
5,275,247	-				-0.5
5,275,247	-				-0.5
5,275,247	-				-0.7
5,275,252	+				-1.7
5,275,252	+				-0.0
5,275,254	+				-0.0
5,275,254	+				-0.4
5,275,262	-				-1.1
5,275,262	-				-0.5
5,275,262	-				-0.7
5,275,262	-				-0.8
5,275,264	+				-0.1
5,275,265	-				+0.6
5,275,282	+				+2.4
5,275,288	+				-0.3
5,275,288	+				+0.1
5,275,288	+				+0.8
5,275,290	-				-0.3
5,275,296	+				-2.4
5,275,296	-				-0.8
5,275,296	-				-1.1
5,275,296	-				-0.8
5,275,298	+				-0.5
5,275,298	+				-0.5
5,275,298	+				+0.2
5,275,306	-				+0.2
5,275,306	-				+0.1
5,275,316	+				+0.0
5,275,316	+				+0.6
5,275,316	+				-0.2
5,275,316	+				+1.2
5,275,324	-				-1.4
5,275,324	-				-3.2
5,275,369	+				-1.3
5,275,396	-		GFF5284	0.12	-2.9
5,275,401	+		GFF5284	0.12	+0.4
5,275,411	-		GFF5284	0.14	-1.4
5,275,454	+		GFF5284	0.19	+0.4
5,275,467	+		GFF5284	0.21	-0.8
5,275,467	+		GFF5284	0.21	+1.3
5,275,467	+		GFF5284	0.21	-0.5
5,275,468	-		GFF5284	0.21	-0.7
5,275,468	-		GFF5284	0.21	-2.5
5,275,475	-		GFF5284	0.22	+1.8
5,275,475	-		GFF5284	0.22	+0.9
5,275,475	-		GFF5284	0.22	+0.1
5,275,475	-		GFF5284	0.22	+0.8
5,275,475	-		GFF5284	0.22	-2.2
5,275,475	-		GFF5284	0.22	-2.2
5,275,485	-		GFF5284	0.24	+0.3
5,275,509	+		GFF5284	0.27	-1.4
5,275,517	-		GFF5284	0.28	-1.6
5,275,522	-		GFF5284	0.28	+0.0
5,275,534	+		GFF5284	0.30	-2.3
5,275,534	+		GFF5284	0.30	-1.0
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.9
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-1.9
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.4
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.3
5,275,558	+		GFF5284	0.33	+0.3
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.0
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.4
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.7
5,275,558	+		GFF5284	0.33	+0.2
5,275,558	+		GFF5284	0.33	-0.6
5,275,563	+		GFF5284	0.34	-0.4
5,275,566	-		GFF5284	0.34	+0.5
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-0.5
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-0.6
5,275,566	-		GFF5284	0.34	+0.5
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-1.1
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-1.6
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-2.0
5,275,566	-		GFF5284	0.34	+0.2
5,275,566	-		GFF5284	0.34	-1.1
5,275,571	-		GFF5284	0.35	-0.1
5,275,578	+		GFF5284	0.36	-1.9
5,275,586	-		GFF5284	0.37	-2.2
5,275,588	+		GFF5284	0.37	-0.4
5,275,603	+		GFF5284	0.39	-0.4
5,275,604	-		GFF5284	0.40	-0.1
5,275,606	-		GFF5284	0.40	+0.6
5,275,619	+		GFF5284	0.42	+0.4
5,275,627	-		GFF5284	0.43	+0.5
5,275,627	-		GFF5284	0.43	-1.2
5,275,627	-		GFF5284	0.43	+0.4
5,275,627	-		GFF5284	0.43	-0.7
5,275,642	+		GFF5284	0.45	-1.6
5,275,642	+		GFF5284	0.45	-0.8
5,275,642	+		GFF5284	0.45	+0.8
5,275,645	-		GFF5284	0.45	+0.6
5,275,645	-		GFF5284	0.45	-1.4
5,275,650	+		GFF5284	0.46	-0.8
5,275,650	-		GFF5284	0.46	-0.4
5,275,650	-		GFF5284	0.46	-1.1
5,275,650	-		GFF5284	0.46	-0.9
5,275,692	+		GFF5284	0.51	-0.1
5,275,697	+		GFF5284	0.52	-1.3
5,275,700	-		GFF5284	0.52	+0.2
5,275,709	+		GFF5284	0.54	+0.0
5,275,717	+		GFF5284	0.55	-0.1
5,275,742	+		GFF5284	0.58	-0.2
5,275,742	+		GFF5284	0.58	-1.4
5,275,742	+		GFF5284	0.58	+0.5
5,275,742	+		GFF5284	0.58	-0.6
5,275,747	+		GFF5284	0.59	-0.1
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-1.2
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-0.1
5,275,750	-		GFF5284	0.59	+0.1
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-1.1
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-1.1
5,275,750	-		GFF5284	0.59	-1.3
5,275,764	-		GFF5284	0.61	+0.7
5,275,764	-		GFF5284	0.61	-0.3
5,275,776	+		GFF5284	0.63	-1.4
5,275,781	+		GFF5284	0.63	-0.4
5,275,796	+		GFF5284	0.65	+0.3
5,275,804	-		GFF5284	0.66	-0.9
5,275,807	+		GFF5284	0.67	-1.0
5,275,811	+		GFF5284	0.67	-1.4
5,275,833	+		GFF5284	0.70	-1.3
5,275,861	-		GFF5284	0.74	-1.0
5,275,865	+		GFF5284	0.75	-1.8
5,275,865	+		GFF5284	0.75	-0.5
5,275,865	+		GFF5284	0.75	+0.8
5,275,865	+		GFF5284	0.75	-1.4
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.9
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.4
5,275,873	-		GFF5284	0.76	+0.2
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-1.1
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.3
5,275,873	-		GFF5284	0.76	+0.8
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.4
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-0.3
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-1.8
5,275,873	-		GFF5284	0.76	-2.5
5,275,878	-		GFF5284	0.76	+1.2
5,275,891	-		GFF5284	0.78	-1.3
5,275,892	+		GFF5284	0.78	-0.4
5,275,892	+		GFF5284	0.78	+0.9
5,275,900	-		GFF5284	0.79	+0.2
5,275,905	-		GFF5284	0.80	-0.3
5,275,919	+		GFF5284	0.82	+0.5
5,275,933	+		GFF5284	0.84	-1.5
5,275,941	+		GFF5284	0.85	-1.4
5,275,956	-		GFF5284	0.87	-1.2
5,275,956	-		GFF5284	0.87	+0.4
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5,276,653	+		GFF5285	0.38	-0.5
5,276,661	-		GFF5285	0.38	-0.0
5,276,661	-		GFF5285	0.38	+0.1
5,276,661	-		GFF5285	0.38	-0.1
5,276,661	-		GFF5285	0.38	+0.5
5,276,672	+		GFF5285	0.39	+0.3
5,276,672	+		GFF5285	0.39	+0.6
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5,276,680	-		GFF5285	0.40	-1.3
5,276,680	-		GFF5285	0.40	+0.9
5,276,686	+		GFF5285	0.40	+0.5
5,276,692	+		GFF5285	0.41	+0.5
5,276,692	+		GFF5285	0.41	-0.4
5,276,701	-		GFF5285	0.41	+0.5
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5,276,707	+		GFF5285	0.42	-1.1
5,276,713	-		GFF5285	0.42	+0.3
5,276,771	-		GFF5285	0.47	+0.4
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