Strain Fitness in Magnetospirillum magneticum AMB-1 around AMB_RS14780

Experiment: without_iron1

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	without_iron1
3,135,986	+		AMB_RS14775	0.21	-0.5
3,135,986	+		AMB_RS14775	0.21	-0.2
3,135,986	+		AMB_RS14775	0.21	+0.8
3,135,986	+		AMB_RS14775	0.21	-0.2
3,135,986	+		AMB_RS14775	0.21	+0.3
3,135,986	+		AMB_RS14775	0.21	-0.0
3,135,987	-		AMB_RS14775	0.22	-0.2
3,135,987	-		AMB_RS14775	0.22	-0.4
3,135,987	-		AMB_RS14775	0.22	-0.5
3,135,987	-		AMB_RS14775	0.22	-1.8
3,135,987	-		AMB_RS14775	0.22	-0.5
3,135,987	-		AMB_RS14775	0.22	+0.9
3,135,987	-		AMB_RS14775	0.22	-1.0
3,135,987	-		AMB_RS14775	0.22	-1.1
3,136,035	-		AMB_RS14775	0.26	-0.8
3,136,035	-		AMB_RS14775	0.26	-0.6
3,136,037	+		AMB_RS14775	0.26	+0.0
3,136,037	+		AMB_RS14775	0.26	-0.6
3,136,037	+		AMB_RS14775	0.26	+0.3
3,136,037	+		AMB_RS14775	0.26	-0.1
3,136,037	+		AMB_RS14775	0.26	-0.4
3,136,037	+		AMB_RS14775	0.26	-0.3
3,136,038	-		AMB_RS14775	0.26	+0.2
3,136,038	-		AMB_RS14775	0.26	+0.2
3,136,038	-		AMB_RS14775	0.26	-0.3
3,136,038	-		AMB_RS14775	0.26	+0.4
3,136,151	+		AMB_RS14775	0.35	+0.1
3,136,152	-		AMB_RS14775	0.35	-0.6
3,136,152	-		AMB_RS14775	0.35	-1.1
3,136,152	-		AMB_RS14775	0.35	-0.4
3,136,152	-		AMB_RS14775	0.35	-3.5
3,136,168	+		AMB_RS14775	0.37	-0.3
3,136,168	+		AMB_RS14775	0.37	-0.8
3,136,253	+		AMB_RS14775	0.44	-0.4
3,136,253	+		AMB_RS14775	0.44	-0.9
3,136,254	-		AMB_RS14775	0.44	+0.2
3,136,291	+		AMB_RS14775	0.47	-0.2
3,136,292	-		AMB_RS14775	0.47	+0.4
3,136,329	-		AMB_RS14775	0.50	+0.2
3,136,382	+		AMB_RS14775	0.55	-0.1
3,136,383	-		AMB_RS14775	0.55	+0.1
3,136,383	-		AMB_RS14775	0.55	-0.4
3,136,383	-		AMB_RS14775	0.55	-0.7
3,136,383	-		AMB_RS14775	0.55	+0.6
3,136,423	+		AMB_RS14775	0.58	-0.2
3,136,423	+		AMB_RS14775	0.58	-0.6
3,136,423	+		AMB_RS14775	0.58	-0.2
3,136,423	+		AMB_RS14775	0.58	+0.2
3,136,423	+		AMB_RS14775	0.58	-0.5
3,136,423	+		AMB_RS14775	0.58	-2.4
3,136,423	+		AMB_RS14775	0.58	-1.4
3,136,424	-		AMB_RS14775	0.58	-1.4
3,136,424	-		AMB_RS14775	0.58	+1.9
3,136,424	-		AMB_RS14775	0.58	+1.2
3,136,424	-		AMB_RS14775	0.58	-3.0
3,136,424	-		AMB_RS14775	0.58	-0.6
3,136,424	-		AMB_RS14775	0.58	-0.4
3,136,424	-		AMB_RS14775	0.58	-0.1
3,136,424	-		AMB_RS14775	0.58	-0.2
3,136,479	-		AMB_RS14775	0.63	+0.0
3,136,479	-		AMB_RS14775	0.63	-0.2
3,136,479	-		AMB_RS14775	0.63	+0.2
3,136,479	-		AMB_RS14775	0.63	+0.4
3,136,490	+		AMB_RS14775	0.64	-0.1
3,136,490	+		AMB_RS14775	0.64	-0.0
3,136,490	+		AMB_RS14775	0.64	-0.1
3,136,490	+		AMB_RS14775	0.64	+0.1
3,136,490	+		AMB_RS14775	0.64	-0.6
3,136,491	-		AMB_RS14775	0.64	-0.1
3,136,491	-		AMB_RS14775	0.64	-0.2
3,136,491	-		AMB_RS14775	0.64	-0.4
3,136,491	-		AMB_RS14775	0.64	-0.3
3,136,491	-		AMB_RS14775	0.64	-0.2
3,136,626	+		AMB_RS14775	0.75	-0.2
3,136,691	+		AMB_RS14775	0.80	+0.5
3,136,691	+		AMB_RS14775	0.80	-0.0
3,136,692	-		AMB_RS14775	0.80	+1.5
3,136,692	-		AMB_RS14775	0.80	-0.3
3,136,692	-		AMB_RS14775	0.80	-0.4
3,136,715	+		AMB_RS14775	0.82	+0.9
3,136,716	-		AMB_RS14775	0.82	-0.3
3,136,716	-		AMB_RS14775	0.82	-0.1
3,136,759	+		AMB_RS14775	0.86	+0.0
3,136,922	+				+2.8
3,136,922	+				-1.4
3,136,974	-				+0.2
3,136,994	+				-0.3
3,136,994	+				-0.7
3,136,994	+				-0.1
3,136,994	+				-0.0
3,136,994	+				-0.8
3,136,994	+				+0.2
3,136,994	+				-0.9
3,136,994	+				+0.7
3,136,994	+				+0.7
3,136,995	-				-0.6
3,136,995	-				-0.7
3,136,995	-				+0.6
3,136,995	-				-0.4
3,136,995	-				+0.3
3,136,995	-				-0.4
3,136,995	-				+1.2
3,136,997	-				-2.6
3,137,106	-				-0.1
3,137,418	+				-1.8
3,137,418	+				-0.2
3,137,419	-				-0.1
3,137,419	-				-0.1
3,137,419	-				-0.1
3,137,419	-				-0.0
3,137,474	+				+0.4
3,137,475	-				-0.5
3,137,475	-				-0.2
3,137,535	-				-0.4
3,137,535	-				+0.3
3,137,535	-				+0.5
3,137,535	-				+0.2
3,137,555	+		AMB_RS14780	0.10	-1.8
3,137,555	+		AMB_RS14780	0.10	-0.5
3,137,555	+		AMB_RS14780	0.10	-0.5
3,137,556	-		AMB_RS14780	0.10	+1.4
3,137,556	-		AMB_RS14780	0.10	-0.2
3,137,556	-		AMB_RS14780	0.10	+0.2
3,137,723	+		AMB_RS14780	0.13	+0.2
3,137,855	+		AMB_RS14780	0.15	-0.1
3,138,035	+		AMB_RS14780	0.18	-0.4
3,138,035	+		AMB_RS14780	0.18	-0.2
3,138,036	-		AMB_RS14780	0.18	-0.2
3,138,056	+		AMB_RS14780	0.19	+0.4
3,138,056	+		AMB_RS14780	0.19	-0.8
3,138,056	+		AMB_RS14780	0.19	+0.5
3,138,056	+		AMB_RS14780	0.19	-1.2
3,138,057	-		AMB_RS14780	0.19	-0.0
3,138,057	-		AMB_RS14780	0.19	-0.4
3,138,057	-		AMB_RS14780	0.19	-1.3
3,138,057	-		AMB_RS14780	0.19	+0.0
3,138,266	+		AMB_RS14780	0.22	-0.7
3,138,266	+		AMB_RS14780	0.22	-0.1
3,138,266	+		AMB_RS14780	0.22	+0.4
3,138,266	+		AMB_RS14780	0.22	+0.2
3,138,266	+		AMB_RS14780	0.22	+0.3
3,138,266	+		AMB_RS14780	0.22	-0.4
3,138,266	+		AMB_RS14780	0.22	-0.1
3,138,267	-		AMB_RS14780	0.22	+0.2
3,138,267	-		AMB_RS14780	0.22	+0.7
3,138,267	-		AMB_RS14780	0.22	-0.7
3,138,267	-		AMB_RS14780	0.22	-0.2
3,138,267	-		AMB_RS14780	0.22	+0.6
3,138,267	-		AMB_RS14780	0.22	-0.3
3,138,267	-		AMB_RS14780	0.22	+0.1
3,138,267	-		AMB_RS14780	0.22	-0.0
3,138,267	-		AMB_RS14780	0.22	-0.5
3,138,422	+		AMB_RS14780	0.25	-0.9
3,138,733	+		AMB_RS14780	0.30	+0.2
3,138,733	+		AMB_RS14780	0.30	+0.1
3,138,734	-		AMB_RS14780	0.30	-0.7
3,138,941	+		AMB_RS14780	0.33	-0.0
3,138,941	+		AMB_RS14780	0.33	-1.0
3,138,941	+		AMB_RS14780	0.33	-0.2
3,138,983	+		AMB_RS14780	0.34	+0.0
3,138,983	+		AMB_RS14780	0.34	-2.6
3,138,984	-		AMB_RS14780	0.34	-0.5
3,138,984	-		AMB_RS14780	0.34	-2.1
3,138,984	-		AMB_RS14780	0.34	-0.2
3,139,136	+		AMB_RS14780	0.37	-0.7
3,139,136	+		AMB_RS14780	0.37	+0.1
3,139,137	-		AMB_RS14780	0.37	+0.3
3,139,235	+		AMB_RS14780	0.38	-1.1
3,139,236	-		AMB_RS14780	0.38	+0.5
3,139,236	-		AMB_RS14780	0.38	-0.2
3,139,236	-		AMB_RS14780	0.38	-0.9
3,139,253	+		AMB_RS14780	0.39	-0.2
3,139,253	+		AMB_RS14780	0.39	-0.1
3,139,253	+		AMB_RS14780	0.39	-0.5
3,139,253	+		AMB_RS14780	0.39	-0.5
3,139,253	+		AMB_RS14780	0.39	-0.2
3,139,253	+		AMB_RS14780	0.39	+0.3
3,139,254	-		AMB_RS14780	0.39	+0.2
3,139,254	-		AMB_RS14780	0.39	+0.1
3,139,254	-		AMB_RS14780	0.39	-0.8
3,139,325	+		AMB_RS14780	0.40	-0.7
3,139,325	+		AMB_RS14780	0.40	+0.2
3,139,325	+		AMB_RS14780	0.40	-0.9
3,139,326	-		AMB_RS14780	0.40	-0.0
3,139,326	-		AMB_RS14780	0.40	-0.1
3,139,760	+		AMB_RS14780	0.47	-0.7
3,139,977	-		AMB_RS14780	0.51	-0.1
3,139,977	-		AMB_RS14780	0.51	-1.4
3,139,977	-		AMB_RS14780	0.51	-0.7
3,139,977	-		AMB_RS14780	0.51	+0.2
3,139,977	-		AMB_RS14780	0.51	-1.2
3,139,977	-		AMB_RS14780	0.51	+0.1
3,139,977	-		AMB_RS14780	0.51	-0.3
3,140,009	+		AMB_RS14780	0.51	+0.4
3,140,009	+		AMB_RS14780	0.51	-0.6
3,140,018	+		AMB_RS14780	0.52	-0.6
3,140,018	+		AMB_RS14780	0.52	-0.6
3,140,018	+		AMB_RS14780	0.52	+0.1
3,140,018	+		AMB_RS14780	0.52	+0.1
3,140,139	-		AMB_RS14780	0.54	-0.0
3,140,219	+		AMB_RS14780	0.55	+0.2
3,140,220	-		AMB_RS14780	0.55	+0.1
3,140,364	-		AMB_RS14780	0.57	-0.5
3,140,411	+		AMB_RS14780	0.58	-0.2
3,140,411	+		AMB_RS14780	0.58	-0.3
3,140,411	+		AMB_RS14780	0.58	+0.2
3,140,525	+		AMB_RS14780	0.60	+1.6
3,140,525	+		AMB_RS14780	0.60	-0.2
3,140,525	+		AMB_RS14780	0.60	-0.0
3,140,525	+		AMB_RS14780	0.60	-1.4
3,140,526	-		AMB_RS14780	0.60	-0.4
3,140,526	-		AMB_RS14780	0.60	+0.0
3,140,526	-		AMB_RS14780	0.60	-0.8
3,140,526	-		AMB_RS14780	0.60	-0.0
3,140,532	-		AMB_RS14780	0.60	+1.7
3,140,594	+		AMB_RS14780	0.61	+1.2
3,140,594	+		AMB_RS14780	0.61	-1.2
3,140,594	+		AMB_RS14780	0.61	-0.2
3,140,594	+		AMB_RS14780	0.61	+0.9
3,140,594	+		AMB_RS14780	0.61	-0.0
3,140,594	+		AMB_RS14780	0.61	-0.5
3,140,595	-		AMB_RS14780	0.61	-0.3
3,140,595	-		AMB_RS14780	0.61	-0.4
3,140,595	-		AMB_RS14780	0.61	-3.2
3,140,600	+		AMB_RS14780	0.61	+0.1
3,140,600	+		AMB_RS14780	0.61	+1.0
3,140,600	+		AMB_RS14780	0.61	+0.2
3,140,600	+		AMB_RS14780	0.61	-0.7
3,140,600	+		AMB_RS14780	0.61	-0.1
3,140,600	+		AMB_RS14780	0.61	+0.6
3,140,601	-		AMB_RS14780	0.61	-0.3
3,140,601	-		AMB_RS14780	0.61	+0.0
3,140,601	-		AMB_RS14780	0.61	-0.4
3,140,601	-		AMB_RS14780	0.61	-0.0
3,140,601	-		AMB_RS14780	0.61	+0.1
3,140,661	-		AMB_RS14780	0.62	+0.1
3,140,714	+		AMB_RS14780	0.63	-0.5
3,140,715	-		AMB_RS14780	0.63	+0.2
3,140,715	-		AMB_RS14780	0.63	-0.9
3,140,715	-		AMB_RS14780	0.63	+1.0
3,140,715	-		AMB_RS14780	0.63	-0.4
3,140,717	+		AMB_RS14780	0.63	-0.1
3,140,742	-		AMB_RS14780	0.64	-0.2
3,141,161	+		AMB_RS14780	0.71	+0.2
3,141,161	+		AMB_RS14780	0.71	-0.2
3,141,161	+		AMB_RS14780	0.71	+0.1
3,141,162	-		AMB_RS14780	0.71	-0.1
3,141,162	-		AMB_RS14780	0.71	-0.1
3,141,233	+		AMB_RS14780	0.72	-0.4
3,141,234	-		AMB_RS14780	0.72	-0.4
3,141,234	-		AMB_RS14780	0.72	-0.2
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