Strain Fitness in Magnetospirillum magneticum AMB-1 around AMB_RS21970

Experiment: 30_nonmag_2

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	30_nonmag_2
4,746,144	-		AMB_RS21960	0.77	-0.0
4,746,337	+				-1.7
4,746,369	+				-0.1
4,746,370	-				-0.1
4,746,384	+				-0.2
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	-2.8
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	+0.3
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	-2.5
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	-1.5
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	+0.9
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	-0.1
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	-0.8
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	+0.6
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	+1.4
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	-0.4
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	+0.3
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	-0.5
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	-0.8
4,746,592	+		AMB_RS21965	0.27	-0.1
4,746,593	-		AMB_RS21965	0.27	-0.2
4,746,593	-		AMB_RS21965	0.27	+0.0
4,746,593	-		AMB_RS21965	0.27	-0.6
4,746,593	-		AMB_RS21965	0.27	-1.3
4,746,593	-		AMB_RS21965	0.27	+0.1
4,746,593	-		AMB_RS21965	0.27	+0.7
4,746,593	-		AMB_RS21965	0.27	-0.6
4,746,593	-		AMB_RS21965	0.27	+0.8
4,746,593	-		AMB_RS21965	0.27	-0.1
4,746,593	-		AMB_RS21965	0.27	+0.7
4,746,596	+		AMB_RS21965	0.28	+0.1
4,746,596	+		AMB_RS21965	0.28	+0.4
4,746,926	+				+1.3
4,746,926	+				-0.3
4,746,926	+				+2.5
4,746,971	+				-1.4
4,746,971	+				+0.6
4,746,971	+				-0.9
4,746,972	-				-1.0
4,746,972	-				+0.3
4,746,972	-				-0.1
4,746,972	-				-2.7
4,746,972	-				-1.6
4,746,972	-				+0.5
4,746,975	+				-0.3
4,746,976	-				-0.3
4,746,976	-				+1.0
4,746,976	-				-0.2
4,746,976	-				-0.7
4,746,976	-				-0.8
4,746,983	+				+0.5
4,746,983	+				+0.8
4,746,983	+				+0.4
4,746,983	+				+0.4
4,746,984	-				-0.4
4,746,984	-				-1.7
4,746,984	-				-0.1
4,747,066	+				-0.1
4,747,066	+				+1.4
4,747,067	-				+0.2
4,747,067	-				-0.2
4,747,067	-				-0.9
4,747,067	-				+0.9
4,747,067	-				-0.3
4,747,067	-				-0.0
4,747,093	+				-2.2
4,747,094	-				-2.6
4,747,185	+				-0.0
4,747,185	+				-0.4
4,747,185	+				+0.3
4,747,185	+				+0.7
4,747,185	+				+0.5
4,747,186	-				-1.5
4,747,186	-				-0.4
4,747,186	-				-0.1
4,747,255	-				-0.2
4,747,255	-				-0.8
4,747,494	+		AMB_RS21970	0.20	+0.7
4,747,494	+		AMB_RS21970	0.20	+0.3
4,747,494	+		AMB_RS21970	0.20	-0.0
4,747,494	+		AMB_RS21970	0.20	-0.8
4,747,494	+		AMB_RS21970	0.20	+2.2
4,747,494	+		AMB_RS21970	0.20	+1.5
4,747,494	+		AMB_RS21970	0.20	-0.3
4,747,494	+		AMB_RS21970	0.20	-0.5
4,747,495	-		AMB_RS21970	0.20	-0.7
4,747,495	-		AMB_RS21970	0.20	-1.8
4,747,495	-		AMB_RS21970	0.20	-0.3
4,747,495	-		AMB_RS21970	0.20	-0.1
4,747,495	-		AMB_RS21970	0.20	-1.0
4,747,495	-		AMB_RS21970	0.20	-1.4
4,747,495	-		AMB_RS21970	0.20	+0.1
4,747,495	-		AMB_RS21970	0.20	+1.6
4,747,495	-		AMB_RS21970	0.20	-2.5
4,747,495	-		AMB_RS21970	0.20	-0.1
4,747,704	+		AMB_RS21970	0.31	-0.1
4,747,704	+		AMB_RS21970	0.31	-0.5
4,747,705	-		AMB_RS21970	0.31	-0.1
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	+0.5
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	-2.8
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	+1.4
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	+1.4
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	+0.5
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	+0.1
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	-0.1
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	-0.8
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	-0.5
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	+0.3
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	+0.4
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	-0.2
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	-0.1
4,747,821	+		AMB_RS21970	0.38	-0.8
4,747,822	-		AMB_RS21970	0.38	-0.2
4,747,822	-		AMB_RS21970	0.38	-0.0
4,747,822	-		AMB_RS21970	0.38	+0.9
4,747,822	-		AMB_RS21970	0.38	+0.2
4,747,822	-		AMB_RS21970	0.38	+0.8
4,747,822	-		AMB_RS21970	0.38	+0.2
4,747,833	+		AMB_RS21970	0.38	-1.3
4,747,833	+		AMB_RS21970	0.38	-1.0
4,747,833	+		AMB_RS21970	0.38	+0.4
4,747,833	+		AMB_RS21970	0.38	-0.0
4,747,833	+		AMB_RS21970	0.38	-1.1
4,747,833	+		AMB_RS21970	0.38	+0.1
4,747,834	-		AMB_RS21970	0.38	+0.8
4,747,834	-		AMB_RS21970	0.38	+0.4
4,747,834	-		AMB_RS21970	0.38	-0.9
4,747,834	-		AMB_RS21970	0.38	+0.6
4,747,834	-		AMB_RS21970	0.38	+0.4
4,747,834	-		AMB_RS21970	0.38	-0.9
4,747,834	-		AMB_RS21970	0.38	-1.2
4,747,834	-		AMB_RS21970	0.38	+0.8
4,747,834	-		AMB_RS21970	0.38	+0.1
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-1.0
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-0.1
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-0.6
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-2.7
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	+0.5
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-1.0
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-0.0
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-1.6
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	+0.5
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-0.2
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-0.4
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-0.4
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-0.7
4,747,881	+		AMB_RS21970	0.41	-0.2
4,747,881	-		AMB_RS21970	0.41	-0.2
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	+0.5
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-0.5
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	+1.2
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-0.9
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	+0.9
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-3.3
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-1.7
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	+0.2
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-0.1
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-2.2
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-0.7
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-1.7
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	+0.3
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-3.0
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	+0.3
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-0.2
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	+0.5
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	+0.7
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	+1.5
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-1.1
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	+1.6
4,747,882	-		AMB_RS21970	0.41	-1.0
4,747,905	+		AMB_RS21970	0.42	+0.2
4,747,905	+		AMB_RS21970	0.42	+1.9
4,747,905	+		AMB_RS21970	0.42	+0.2
4,747,905	+		AMB_RS21970	0.42	+0.3
4,747,905	+		AMB_RS21970	0.42	-1.5
4,747,905	+		AMB_RS21970	0.42	+0.1
4,747,905	+		AMB_RS21970	0.42	+0.3
4,747,905	+		AMB_RS21970	0.42	-0.0
4,747,906	-		AMB_RS21970	0.42	-0.1
4,747,906	-		AMB_RS21970	0.42	-3.0
4,747,906	-		AMB_RS21970	0.42	+0.1
4,747,906	-		AMB_RS21970	0.42	-0.2
4,747,915	+		AMB_RS21970	0.43	-3.3
4,747,915	+		AMB_RS21970	0.43	-1.1
4,747,915	+		AMB_RS21970	0.43	-0.3
4,747,916	-		AMB_RS21970	0.43	+0.1
4,747,916	-		AMB_RS21970	0.43	+0.3
4,747,916	-		AMB_RS21970	0.43	+0.2
4,747,916	-		AMB_RS21970	0.43	-0.2
4,747,916	-		AMB_RS21970	0.43	-0.2
4,747,916	-		AMB_RS21970	0.43	-0.6
4,747,916	-		AMB_RS21970	0.43	+0.2
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	-2.4
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	-1.0
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	+0.5
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	+1.1
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	-0.7
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	+0.7
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	+0.3
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	+0.2
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	-0.6
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	+0.6
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	-2.0
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	-0.1
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	-0.3
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	-2.0
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	+0.3
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	-0.0
4,747,983	+		AMB_RS21970	0.46	-0.2
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-0.1
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.1
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-0.4
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+1.3
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.2
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.9
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-2.5
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-0.0
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.4
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.4
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-0.8
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.6
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-0.8
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.3
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-0.5
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-3.2
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-0.5
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.6
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-0.2
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.0
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.9
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-1.2
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-1.7
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+0.6
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-0.0
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	-0.9
4,747,984	-		AMB_RS21970	0.46	+1.0
4,748,034	+		AMB_RS21970	0.49	+0.9
4,748,035	-		AMB_RS21970	0.49	+0.7
4,748,035	-		AMB_RS21970	0.49	+0.1
4,748,035	-		AMB_RS21970	0.49	-0.4
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	+2.2
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.0
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.0
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	+0.1
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	+1.6
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-1.4
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.0
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.1
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.1
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.3
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.4
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.1
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.3
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-2.8
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.4
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-0.5
4,748,196	+		AMB_RS21970	0.58	-1.2
4,748,197	-		AMB_RS21970	0.58	+0.4
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