Strain Fitness in Magnetospirillum magneticum AMB-1 around AMB_RS05545

Experiment: 30_initial_1

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	30_initial_1
1,153,937	+				-0.7
1,153,937	+				+0.6
1,153,938	-				-0.3
1,153,938	-				+0.7
1,153,938	-				-1.2
1,154,110	-				+0.5
1,154,110	-				-1.8
1,154,110	-				-0.0
1,154,110	-				+0.1
1,154,157	+				+0.2
1,154,158	-				-0.0
1,154,158	-				-0.9
1,154,274	+				-1.8
1,154,294	+				+0.6
1,154,295	+				+0.5
1,154,295	+				+0.5
1,154,296	-				-0.6
1,154,296	-				+0.1
1,154,296	-				+0.8
1,154,296	-				-0.2
1,154,296	-				-0.9
1,154,296	-				-0.2
1,154,296	-				-0.1
1,154,296	-				-0.1
1,154,335	-				-0.5
1,154,335	-				-0.4
1,154,352	+				+1.0
1,154,353	-				-2.2
1,154,430	+				-0.1
1,154,430	+				+0.4
1,154,430	+				-1.9
1,154,430	+				-1.1
1,154,430	+				-0.9
1,154,430	+				+0.1
1,154,430	+				+0.0
1,154,431	-				-0.3
1,154,431	-				-1.2
1,154,431	-				+0.4
1,154,431	-				+0.4
1,154,431	-				+0.4
1,154,431	-				+0.7
1,154,431	-				-0.5
1,154,431	-				-0.7
1,154,431	-				+0.1
1,154,431	-				-0.4
1,154,431	-				-0.5
1,154,439	+				-0.8
1,154,504	+				+0.4
1,154,505	-				-0.4
1,154,505	-				-0.6
1,154,564	-				-2.2
1,154,569	-				-0.4
1,154,569	-				-0.5
1,154,569	-				-0.2
1,154,569	-				-0.3
1,154,673	+				+0.0
1,154,674	-				+0.1
1,154,727	+				+0.8
1,154,727	+				-0.2
1,154,728	-				-1.2
1,154,728	-				-1.1
1,154,819	-				-0.2
1,154,819	-				-0.3
1,154,819	-				-1.8
1,154,819	-				-0.7
1,155,035	+		AMB_RS05545	0.12	-0.1
1,155,035	+		AMB_RS05545	0.12	+0.1
1,155,035	+		AMB_RS05545	0.12	-1.2
1,155,035	+		AMB_RS05545	0.12	-0.2
1,155,035	+		AMB_RS05545	0.12	-1.6
1,155,035	+		AMB_RS05545	0.12	-1.6
1,155,035	+		AMB_RS05545	0.12	-0.3
1,155,035	+		AMB_RS05545	0.12	-1.0
1,155,035	+		AMB_RS05545	0.12	-0.8
1,155,036	-		AMB_RS05545	0.12	-0.5
1,155,036	-		AMB_RS05545	0.12	-0.9
1,155,036	-		AMB_RS05545	0.12	+0.0
1,155,036	-		AMB_RS05545	0.12	-1.1
1,155,036	-		AMB_RS05545	0.12	-0.5
1,155,036	-		AMB_RS05545	0.12	+0.4
1,155,036	-		AMB_RS05545	0.12	+0.2
1,155,240	+		AMB_RS05545	0.22	-0.8
1,155,241	-		AMB_RS05545	0.22	+1.4
1,155,283	+		AMB_RS05545	0.24	+0.1
1,155,284	-		AMB_RS05545	0.25	-0.3
1,155,303	+		AMB_RS05545	0.26	-0.0
1,155,303	+		AMB_RS05545	0.26	-1.0
1,155,304	-		AMB_RS05545	0.26	+0.4
1,155,304	-		AMB_RS05545	0.26	+0.1
1,155,304	-		AMB_RS05545	0.26	-0.6
1,155,304	-		AMB_RS05545	0.26	-0.7
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	+1.7
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	-0.0
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	-0.3
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	+0.3
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	+0.4
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	+0.0
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	-0.7
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	-0.0
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	+0.3
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	-0.5
1,155,311	+		AMB_RS05545	0.26	+0.0
1,155,312	-		AMB_RS05545	0.26	-0.1
1,155,312	-		AMB_RS05545	0.26	+0.6
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	+0.1
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	+1.1
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	+0.1
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	-0.2
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	-0.1
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	-0.5
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	-0.1
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	-0.5
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	-0.1
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	-1.0
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	+0.2
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	-0.7
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	-0.4
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	+0.7
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	+0.0
1,155,323	+		AMB_RS05545	0.27	-0.6
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.1
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	+0.4
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.2
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.1
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-1.1
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	+0.2
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	+1.2
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	+0.0
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-1.2
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	+0.8
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-1.8
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.2
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.4
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.2
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.3
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.5
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-1.4
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	+0.4
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	+0.2
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	+0.0
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.5
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.2
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.8
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	-0.2
1,155,324	-		AMB_RS05545	0.27	+0.3
1,155,326	+		AMB_RS05545	0.27	-1.1
1,155,326	+		AMB_RS05545	0.27	-0.2
1,155,326	+		AMB_RS05545	0.27	+0.7
1,155,326	+		AMB_RS05545	0.27	+1.8
1,155,326	+		AMB_RS05545	0.27	+0.0
1,155,327	-		AMB_RS05545	0.27	-0.8
1,155,327	-		AMB_RS05545	0.27	-0.4
1,155,327	-		AMB_RS05545	0.27	-0.5
1,155,434	+		AMB_RS05545	0.32	-0.1
1,155,434	+		AMB_RS05545	0.32	-0.0
1,155,434	+		AMB_RS05545	0.32	+0.3
1,155,435	-		AMB_RS05545	0.32	-0.3
1,155,435	-		AMB_RS05545	0.32	-0.4
1,155,435	-		AMB_RS05545	0.32	-1.4
1,155,619	+		AMB_RS05545	0.42	-0.5
1,155,619	+		AMB_RS05545	0.42	+0.1
1,155,620	-		AMB_RS05545	0.42	-0.4
1,155,620	-		AMB_RS05545	0.42	-0.5
1,155,620	-		AMB_RS05545	0.42	+0.4
1,155,620	-		AMB_RS05545	0.42	-0.6
1,155,783	+		AMB_RS05545	0.50	-1.7
1,155,783	+		AMB_RS05545	0.50	-0.7
1,155,784	-		AMB_RS05545	0.50	-1.5
1,155,784	-		AMB_RS05545	0.50	-0.1
1,155,800	+		AMB_RS05545	0.51	+0.4
1,155,801	-		AMB_RS05545	0.51	-0.1
1,155,814	+		AMB_RS05545	0.52	-1.1
1,155,814	+		AMB_RS05545	0.52	+0.6
1,155,814	+		AMB_RS05545	0.52	+0.8
1,155,814	+		AMB_RS05545	0.52	-0.4
1,155,814	+		AMB_RS05545	0.52	-0.3
1,155,814	+		AMB_RS05545	0.52	-0.1
1,155,814	+		AMB_RS05545	0.52	-0.2
1,155,814	+		AMB_RS05545	0.52	-0.2
1,155,814	+		AMB_RS05545	0.52	+0.3
1,155,815	-		AMB_RS05545	0.52	-0.1
1,155,815	-		AMB_RS05545	0.52	+0.1
1,155,815	-		AMB_RS05545	0.52	-0.4
1,155,815	-		AMB_RS05545	0.52	+0.6
1,155,815	-		AMB_RS05545	0.52	+0.2
1,155,815	-		AMB_RS05545	0.52	-2.1
1,155,815	-		AMB_RS05545	0.52	-0.0
1,155,815	-		AMB_RS05545	0.52	-0.4
1,155,829	+		AMB_RS05545	0.52	-1.1
1,155,896	+		AMB_RS05545	0.56	-0.8
1,155,896	+		AMB_RS05545	0.56	-0.2
1,155,896	+		AMB_RS05545	0.56	-0.1
1,155,896	+		AMB_RS05545	0.56	-0.0
1,155,896	+		AMB_RS05545	0.56	-2.6
1,155,897	-		AMB_RS05545	0.56	-0.5
1,155,897	-		AMB_RS05545	0.56	-0.2
1,155,897	-		AMB_RS05545	0.56	+0.1
1,155,897	-		AMB_RS05545	0.56	-0.6
1,155,897	-		AMB_RS05545	0.56	+0.1
1,155,897	-		AMB_RS05545	0.56	-1.5
1,155,897	-		AMB_RS05545	0.56	+0.0
1,155,944	+		AMB_RS05545	0.58	-0.7
1,155,944	+		AMB_RS05545	0.58	-0.1
1,155,944	+		AMB_RS05545	0.58	-0.0
1,155,945	-		AMB_RS05545	0.58	-0.7
1,155,945	-		AMB_RS05545	0.58	+0.7
1,155,945	-		AMB_RS05545	0.58	-0.3
1,155,945	-		AMB_RS05545	0.58	+0.7
1,156,053	+		AMB_RS05545	0.64	+0.6
1,156,054	-		AMB_RS05545	0.64	-0.3
1,156,098	+		AMB_RS05545	0.66	-1.6
1,156,130	+		AMB_RS05545	0.68	-0.3
1,156,130	+		AMB_RS05545	0.68	-1.2
1,156,130	+		AMB_RS05545	0.68	-0.5
1,156,130	+		AMB_RS05545	0.68	+0.7
1,156,130	+		AMB_RS05545	0.68	-0.7
1,156,131	-		AMB_RS05545	0.68	+0.7
1,156,131	-		AMB_RS05545	0.68	-0.1
1,156,294	+		AMB_RS05545	0.76	+0.6
1,156,294	+		AMB_RS05545	0.76	-0.3
1,156,351	+		AMB_RS05545	0.79	+0.0
1,156,351	+		AMB_RS05545	0.79	-0.4
1,156,351	+		AMB_RS05545	0.79	+0.3
1,156,351	+		AMB_RS05545	0.79	-0.8
1,156,351	+		AMB_RS05545	0.79	-0.0
1,156,351	+		AMB_RS05545	0.79	+1.0
1,156,352	-		AMB_RS05545	0.79	-0.6
1,156,352	-		AMB_RS05545	0.79	+0.8
1,156,352	-		AMB_RS05545	0.79	-0.0
1,156,391	+		AMB_RS05545	0.81	-0.2
1,156,391	+		AMB_RS05545	0.81	-0.0
1,156,391	+		AMB_RS05545	0.81	-1.4
1,156,391	+		AMB_RS05545	0.81	-0.4
1,156,391	+		AMB_RS05545	0.81	-0.3
1,156,391	+		AMB_RS05545	0.81	+0.4
1,156,392	-		AMB_RS05545	0.81	-0.2
1,156,392	-		AMB_RS05545	0.81	-1.2
1,156,392	-		AMB_RS05545	0.81	+1.0
1,156,392	-		AMB_RS05545	0.81	+0.7
1,156,452	+		AMB_RS05545	0.84	-0.1
1,156,453	-		AMB_RS05545	0.84	-0.0
1,156,453	-		AMB_RS05545	0.84	+0.2
1,156,499	-		AMB_RS05545	0.87	-0.0
1,156,557	+		AMB_RS05545	0.90	+0.1
1,156,557	+		AMB_RS05545	0.90	+0.8
1,156,557	+		AMB_RS05545	0.90	-0.3
1,156,613	+				-0.8
1,156,613	+				+0.1
1,156,613	+				-0.3
1,156,614	-				-0.4
1,156,614	-				+0.0
1,156,614	-				-0.3
1,156,614	-				+0.4
1,156,614	-				-0.7
1,156,614	-				-2.2
1,156,908	+		AMB_RS05550	0.20	-0.1
1,156,908	+		AMB_RS05550	0.20	-0.1
1,156,908	+		AMB_RS05550	0.20	+0.6
1,156,908	+		AMB_RS05550	0.20	-0.2
1,156,908	+		AMB_RS05550	0.20	+0.1
1,156,908	+		AMB_RS05550	0.20	+0.3
1,156,909	-		AMB_RS05550	0.20	-0.6
1,156,909	-		AMB_RS05550	0.20	-0.6
1,156,909	-		AMB_RS05550	0.20	-0.9
1,156,909	-		AMB_RS05550	0.20	-0.0
1,156,909	-		AMB_RS05550	0.20	-0.4
1,156,929	+		AMB_RS05550	0.23	+0.1
1,157,199	+		AMB_RS05550	0.59	-1.7
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