Strain Fitness in Magnetospirillum magneticum AMB-1 around AMB_RS18630

Experiment: 150_nonmag_1

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	150_nonmag_1
4,045,531	-				-0.3
4,045,531	-				-0.6
4,045,568	+		AMB_RS18625	0.12	+0.5
4,045,568	+		AMB_RS18625	0.12	-1.1
4,045,569	-		AMB_RS18625	0.12	-0.4
4,045,569	-		AMB_RS18625	0.12	+0.9
4,045,569	-		AMB_RS18625	0.12	+0.6
4,045,569	-		AMB_RS18625	0.12	-0.1
4,045,577	+		AMB_RS18625	0.13	-1.1
4,045,577	+		AMB_RS18625	0.13	-0.1
4,045,577	+		AMB_RS18625	0.13	-1.5
4,045,577	+		AMB_RS18625	0.13	+0.5
4,045,578	-		AMB_RS18625	0.13	+0.1
4,045,578	-		AMB_RS18625	0.13	-1.0
4,045,646	+		AMB_RS18625	0.20	+1.5
4,045,646	+		AMB_RS18625	0.20	+0.1
4,045,647	-		AMB_RS18625	0.20	-0.2
4,045,735	-		AMB_RS18625	0.29	-1.5
4,045,758	+		AMB_RS18625	0.32	-0.4
4,045,759	-		AMB_RS18625	0.32	+0.5
4,045,772	+		AMB_RS18625	0.33	-0.7
4,045,772	+		AMB_RS18625	0.33	-0.9
4,045,772	+		AMB_RS18625	0.33	-1.1
4,045,772	+		AMB_RS18625	0.33	+0.4
4,045,881	+		AMB_RS18625	0.45	+1.6
4,045,881	+		AMB_RS18625	0.45	-0.6
4,045,884	+		AMB_RS18625	0.45	-1.0
4,045,884	+		AMB_RS18625	0.45	+0.2
4,045,884	+		AMB_RS18625	0.45	-0.7
4,045,884	+		AMB_RS18625	0.45	-0.8
4,045,884	+		AMB_RS18625	0.45	-0.3
4,045,885	-		AMB_RS18625	0.45	+1.5
4,045,885	-		AMB_RS18625	0.45	-1.0
4,045,885	-		AMB_RS18625	0.45	-2.9
4,045,885	-		AMB_RS18625	0.45	-0.2
4,045,885	-		AMB_RS18625	0.45	-0.4
4,045,885	-		AMB_RS18625	0.45	+1.3
4,045,885	-		AMB_RS18625	0.45	-0.7
4,045,885	-		AMB_RS18625	0.45	+0.8
4,045,885	-		AMB_RS18625	0.45	-0.4
4,045,896	+		AMB_RS18625	0.46	-0.1
4,045,934	-		AMB_RS18625	0.50	-0.3
4,045,934	-		AMB_RS18625	0.50	-0.2
4,046,007	+		AMB_RS18625	0.58	+0.1
4,046,007	+		AMB_RS18625	0.58	-0.1
4,046,021	-		AMB_RS18625	0.59	+0.5
4,046,021	-		AMB_RS18625	0.59	-0.5
4,046,021	-		AMB_RS18625	0.59	-0.0
4,046,046	+		AMB_RS18625	0.62	-0.1
4,046,047	-		AMB_RS18625	0.62	+0.2
4,046,047	-		AMB_RS18625	0.62	-0.3
4,046,047	-		AMB_RS18625	0.62	-1.3
4,046,047	-		AMB_RS18625	0.62	-0.5
4,046,093	-		AMB_RS18625	0.67	+0.3
4,046,113	+		AMB_RS18625	0.69	-0.1
4,046,114	-		AMB_RS18625	0.69	+0.1
4,046,114	-		AMB_RS18625	0.69	+0.1
4,046,149	+		AMB_RS18625	0.72	-0.9
4,046,149	+		AMB_RS18625	0.72	-0.5
4,046,149	+		AMB_RS18625	0.72	-1.1
4,046,149	+		AMB_RS18625	0.72	-0.3
4,046,149	+		AMB_RS18625	0.72	-1.3
4,046,149	+		AMB_RS18625	0.72	-0.6
4,046,150	-		AMB_RS18625	0.73	-1.4
4,046,150	-		AMB_RS18625	0.73	+3.5
4,046,150	-		AMB_RS18625	0.73	-0.4
4,046,150	-		AMB_RS18625	0.73	-0.6
4,046,194	+		AMB_RS18625	0.77	-1.5
4,046,194	+		AMB_RS18625	0.77	-0.6
4,046,195	-		AMB_RS18625	0.77	-1.4
4,046,195	-		AMB_RS18625	0.77	-0.5
4,046,233	+		AMB_RS18625	0.81	-0.6
4,046,233	+		AMB_RS18625	0.81	-0.1
4,046,233	+		AMB_RS18625	0.81	-0.5
4,046,236	+		AMB_RS18625	0.82	-0.0
4,046,261	+		AMB_RS18625	0.84	-0.5
4,046,261	+		AMB_RS18625	0.84	-0.3
4,046,261	+		AMB_RS18625	0.84	-0.2
4,046,262	-		AMB_RS18625	0.84	-0.7
4,046,465	+				+0.9
4,046,467	+				+0.3
4,046,467	+				-3.0
4,046,467	+				+0.4
4,046,467	+				-1.3
4,046,467	+				-0.7
4,046,467	+				+0.1
4,046,467	+				-1.7
4,046,467	+				-0.5
4,046,467	+				-0.8
4,046,468	-				+0.1
4,046,468	-				-0.3
4,046,468	-				-0.5
4,046,468	-				-0.8
4,046,468	-				-1.9
4,046,468	-				-0.6
4,046,546	-				-0.3
4,046,546	-				+0.1
4,046,676	+		AMB_RS18630	0.18	+0.1
4,046,677	-		AMB_RS18630	0.18	-0.2
4,046,677	-		AMB_RS18630	0.18	-0.6
4,046,687	-		AMB_RS18630	0.19	-0.4
4,046,687	-		AMB_RS18630	0.19	+0.1
4,046,719	+		AMB_RS18630	0.21	-0.5
4,046,738	-		AMB_RS18630	0.23	+0.5
4,046,746	+		AMB_RS18630	0.23	-0.5
4,046,746	+		AMB_RS18630	0.23	-0.2
4,046,746	+		AMB_RS18630	0.23	-0.2
4,046,746	+		AMB_RS18630	0.23	-1.2
4,046,746	+		AMB_RS18630	0.23	+0.5
4,046,746	+		AMB_RS18630	0.23	+0.5
4,046,747	-		AMB_RS18630	0.23	-0.2
4,046,748	+		AMB_RS18630	0.23	-0.4
4,046,748	+		AMB_RS18630	0.23	-2.7
4,046,748	+		AMB_RS18630	0.23	+0.2
4,046,748	+		AMB_RS18630	0.23	-0.9
4,046,749	-		AMB_RS18630	0.23	+0.0
4,046,749	-		AMB_RS18630	0.23	+0.3
4,046,749	-		AMB_RS18630	0.23	-0.2
4,046,784	-		AMB_RS18630	0.26	-1.5
4,046,784	-		AMB_RS18630	0.26	-0.0
4,046,784	-		AMB_RS18630	0.26	-0.7
4,046,809	+		AMB_RS18630	0.28	-1.1
4,046,810	-		AMB_RS18630	0.28	-0.4
4,046,877	+		AMB_RS18630	0.32	+0.0
4,046,878	-		AMB_RS18630	0.32	-0.5
4,046,878	-		AMB_RS18630	0.32	-0.7
4,046,931	+		AMB_RS18630	0.36	-0.0
4,046,931	+		AMB_RS18630	0.36	-0.2
4,046,932	-		AMB_RS18630	0.36	+0.2
4,046,932	-		AMB_RS18630	0.36	-0.4
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	-0.4
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	-2.3
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	-0.7
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	-1.1
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	+2.1
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	+0.3
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	-0.3
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	-0.1
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	+0.5
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	-1.1
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	-0.6
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	-1.0
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	+0.5
4,047,058	+		AMB_RS18630	0.45	+0.3
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	-0.4
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	-0.0
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	+0.1
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	-1.3
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	+0.6
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	+0.2
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	+0.5
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	+0.5
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	+1.2
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	-0.8
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	-0.7
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	-0.0
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	-1.4
4,047,059	-		AMB_RS18630	0.45	-0.7
4,047,060	+		AMB_RS18630	0.45	-0.1
4,047,060	+		AMB_RS18630	0.45	-1.5
4,047,061	-		AMB_RS18630	0.45	-0.5
4,047,061	-		AMB_RS18630	0.45	-1.2
4,047,061	-		AMB_RS18630	0.45	-0.7
4,047,082	+		AMB_RS18630	0.47	-1.9
4,047,082	+		AMB_RS18630	0.47	+1.5
4,047,082	+		AMB_RS18630	0.47	-0.1
4,047,083	-		AMB_RS18630	0.47	-0.1
4,047,088	-		AMB_RS18630	0.47	-1.7
4,047,165	+		AMB_RS18630	0.52	+0.5
4,047,165	+		AMB_RS18630	0.52	-0.7
4,047,200	+		AMB_RS18630	0.55	-1.5
4,047,263	+		AMB_RS18630	0.59	+1.9
4,047,263	+		AMB_RS18630	0.59	+0.4
4,047,263	+		AMB_RS18630	0.59	+0.1
4,047,264	-		AMB_RS18630	0.59	+0.5
4,047,264	-		AMB_RS18630	0.59	-0.4
4,047,264	-		AMB_RS18630	0.59	+0.0
4,047,264	-		AMB_RS18630	0.59	+0.0
4,047,342	+		AMB_RS18630	0.65	+0.2
4,047,376	+		AMB_RS18630	0.67	-1.2
4,047,377	-		AMB_RS18630	0.67	-0.2
4,047,377	-		AMB_RS18630	0.67	-0.3
4,047,377	-		AMB_RS18630	0.67	+1.5
4,047,419	-		AMB_RS18630	0.70	+2.1
4,047,419	-		AMB_RS18630	0.70	-0.4
4,047,491	+		AMB_RS18630	0.75	+0.7
4,047,491	+		AMB_RS18630	0.75	-2.3
4,047,492	-		AMB_RS18630	0.75	-0.9
4,047,540	+		AMB_RS18630	0.79	-0.2
4,047,635	+		AMB_RS18630	0.85	-0.5
4,047,636	-		AMB_RS18630	0.85	-0.8
4,047,722	+				-1.3
4,047,841	+				-1.3
4,047,841	+				-0.5
4,047,841	+				+0.1
4,047,841	+				-1.2
4,047,842	-				-0.9
4,047,854	-				-1.4
4,047,888	+				+1.0
4,047,888	+				-0.4
4,047,891	-				-0.6
4,047,891	-				+1.5
4,047,891	-				-0.2
4,047,895	-				-0.2
4,047,916	+				-0.6
4,047,917	-				-1.1
4,047,950	+				+0.2
4,047,995	+				+0.1
4,047,996	-				-0.3
4,047,996	-				+0.2
4,048,045	+		AMB_RS18635	0.13	-1.7
4,048,055	-		AMB_RS18635	0.14	-2.5
4,048,055	-		AMB_RS18635	0.14	-0.7
4,048,055	-		AMB_RS18635	0.14	-0.7
4,048,055	-		AMB_RS18635	0.14	-0.6
4,048,055	-		AMB_RS18635	0.14	-0.7
4,048,055	-		AMB_RS18635	0.14	-0.7
4,048,057	-		AMB_RS18635	0.14	-0.0
4,048,265	-		AMB_RS18635	0.28	+1.1
4,048,312	-		AMB_RS18635	0.31	-0.4
4,048,453	+		AMB_RS18635	0.40	+0.3
4,048,481	-		AMB_RS18635	0.42	+0.0
4,048,530	+		AMB_RS18635	0.45	-0.9
4,048,531	-		AMB_RS18635	0.46	-0.3
4,048,531	-		AMB_RS18635	0.46	-0.9
4,048,531	-		AMB_RS18635	0.46	+0.2
4,048,555	+		AMB_RS18635	0.47	-0.7
4,048,555	+		AMB_RS18635	0.47	-1.3
4,048,556	-		AMB_RS18635	0.47	-0.3
4,048,556	-		AMB_RS18635	0.47	+0.2
4,048,556	-		AMB_RS18635	0.47	-0.9
4,048,632	+		AMB_RS18635	0.52	-0.3
4,048,632	+		AMB_RS18635	0.52	+1.2
4,048,632	+		AMB_RS18635	0.52	-0.5
4,048,632	+		AMB_RS18635	0.52	-1.1
4,048,632	+		AMB_RS18635	0.52	+0.2
4,048,636	+		AMB_RS18635	0.52	-0.2
4,048,637	-		AMB_RS18635	0.53	+0.5
4,048,642	+		AMB_RS18635	0.53	-0.4
4,048,642	+		AMB_RS18635	0.53	-0.1
4,048,643	-		AMB_RS18635	0.53	-0.3
4,048,643	-		AMB_RS18635	0.53	-1.5
4,048,643	-		AMB_RS18635	0.53	-1.5
4,048,643	-		AMB_RS18635	0.53	+0.5
4,048,653	+		AMB_RS18635	0.54	+3.2
4,048,653	+		AMB_RS18635	0.54	-0.4
4,048,653	+		AMB_RS18635	0.54	-1.3
4,048,654	-		AMB_RS18635	0.54	-1.5
4,048,700	+		AMB_RS18635	0.57	-0.6
4,048,739	+		AMB_RS18635	0.59	-0.1
4,048,740	-		AMB_RS18635	0.59	-0.3
4,048,741	+		AMB_RS18635	0.59	-0.1