Strain Fitness in Magnetospirillum magneticum AMB-1 around AMB_RS00480

Experiment: 150_mag_1

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	150_mag_1
105,554	+		AMB_RS00475	0.47	+0.1
105,554	+		AMB_RS00475	0.47	-0.6
105,554	+		AMB_RS00475	0.47	+1.1
105,555	-		AMB_RS00475	0.47	-0.8
105,555	-		AMB_RS00475	0.47	+0.2
105,555	-		AMB_RS00475	0.47	-0.2
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-1.2
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-0.9
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-0.9
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	+0.2
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-0.1
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-1.5
105,556	+		AMB_RS00475	0.47	-0.3
105,557	-		AMB_RS00475	0.47	+1.1
105,557	-		AMB_RS00475	0.47	-1.8
105,557	-		AMB_RS00475	0.47	-0.9
105,569	+		AMB_RS00475	0.48	-1.3
105,572	+		AMB_RS00475	0.48	+0.8
105,573	-		AMB_RS00475	0.48	-0.2
105,573	-		AMB_RS00475	0.48	-0.1
105,725	+		AMB_RS00475	0.58	-0.6
105,726	-		AMB_RS00475	0.59	-0.2
105,726	-		AMB_RS00475	0.59	-0.5
105,726	-		AMB_RS00475	0.59	-0.5
105,726	-		AMB_RS00475	0.59	+0.1
105,729	+		AMB_RS00475	0.59	-0.5
105,729	+		AMB_RS00475	0.59	-0.2
105,729	+		AMB_RS00475	0.59	-1.4
105,729	+		AMB_RS00475	0.59	-0.7
105,730	-		AMB_RS00475	0.59	+0.8
105,730	-		AMB_RS00475	0.59	+0.2
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.2
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.3
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	+0.7
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.4
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	+1.4
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	+0.0
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	+0.5
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.9
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-1.7
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-1.6
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.5
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-2.3
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.1
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.4
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-2.5
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.5
105,731	+		AMB_RS00475	0.59	-0.4
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.5
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-1.4
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.5
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.1
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.6
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-0.2
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.8
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.2
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.2
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+1.6
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.4
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.6
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-0.2
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	+0.2
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-1.0
105,732	-		AMB_RS00475	0.59	-0.1
105,790	+		AMB_RS00475	0.63	+0.1
105,790	+		AMB_RS00475	0.63	-0.4
105,790	+		AMB_RS00475	0.63	-0.1
105,791	-		AMB_RS00475	0.63	+0.2
105,830	-		AMB_RS00475	0.66	-0.1
106,064	+		AMB_RS00475	0.81	-0.6
106,064	+		AMB_RS00475	0.81	-0.3
106,118	+		AMB_RS00475	0.85	-0.7
106,118	+		AMB_RS00475	0.85	+0.9
106,119	-		AMB_RS00475	0.85	-1.4
106,303	+				+0.0
106,303	+				-1.0
106,326	+				+1.2
106,346	+				-0.1
106,404	+				+0.5
106,405	-				+0.6
106,405	-				-0.4
106,405	-				-0.7
106,421	+				-0.9
106,422	-				-0.7
106,422	-				-1.0
106,422	-				-0.9
106,422	-				-1.7
106,422	-				-0.4
106,422	-				-0.4
106,430	+				-1.0
106,430	+				-1.2
106,431	-				-0.6
106,431	-				+1.6
106,510	+				+0.0
106,510	+				-1.4
106,511	-				+0.6
106,602	+		AMB_RS00480	0.22	-0.9
106,602	+		AMB_RS00480	0.22	-1.8
106,660	-		AMB_RS00480	0.30	-0.6
106,660	-		AMB_RS00480	0.30	-0.9
106,731	+		AMB_RS00480	0.39	-1.4
106,732	-		AMB_RS00480	0.39	-1.1
106,732	-		AMB_RS00480	0.39	-0.4
106,732	-		AMB_RS00480	0.39	-0.5
106,891	-		AMB_RS00480	0.61	-0.2
106,902	-		AMB_RS00480	0.62	-0.5
106,902	-		AMB_RS00480	0.62	-0.9
106,954	-		AMB_RS00480	0.69	-0.4
106,983	-		AMB_RS00480	0.73	-0.7
107,017	+		AMB_RS00480	0.77	+0.6
107,086	+		AMB_RS00480	0.87	-0.7
107,086	+		AMB_RS00480	0.87	-0.1
107,087	-		AMB_RS00480	0.87	+4.0
107,143	-				-1.2
107,165	-				-1.5
107,304	+				-1.7
107,304	+				-0.0
107,304	+				-0.1
107,305	-				-1.7
107,305	-				+0.0
107,305	-				-0.4
107,305	-				-0.2
107,309	+				+0.4
107,309	+				+0.0
107,309	+				+0.0
107,309	+				-0.5
107,309	+				-0.5
107,309	+				-0.4
107,309	+				-0.5
107,310	-				-2.4
107,310	-				+0.0
107,410	+		AMB_RS00485	0.19	-0.1
107,411	-		AMB_RS00485	0.19	-0.0
107,411	-		AMB_RS00485	0.19	-1.2
107,411	-		AMB_RS00485	0.19	-0.0
107,548	-		AMB_RS00485	0.32	-0.6
107,590	+		AMB_RS00485	0.36	+0.6
107,590	+		AMB_RS00485	0.36	-0.2
107,591	-		AMB_RS00485	0.36	-0.1
107,647	-		AMB_RS00485	0.42	+0.4
107,802	+		AMB_RS00485	0.56	+0.6
107,802	+		AMB_RS00485	0.56	+0.3
107,802	+		AMB_RS00485	0.56	-0.3
107,803	-		AMB_RS00485	0.57	-0.1
107,803	-		AMB_RS00485	0.57	+0.3
107,803	-		AMB_RS00485	0.57	+1.4
107,803	-		AMB_RS00485	0.57	-0.7
107,803	-		AMB_RS00485	0.57	-0.1
107,803	-		AMB_RS00485	0.57	-0.2
107,803	-		AMB_RS00485	0.57	-0.4
107,873	-		AMB_RS00485	0.63	+0.0
107,902	+		AMB_RS00485	0.66	+0.6
107,903	-		AMB_RS00485	0.66	+0.3
107,904	+		AMB_RS00485	0.66	-0.7
107,904	+		AMB_RS00485	0.66	-1.7
107,904	+		AMB_RS00485	0.66	-0.3
107,905	-		AMB_RS00485	0.66	-0.2
107,946	+		AMB_RS00485	0.70	-0.4
107,947	-		AMB_RS00485	0.70	-1.8
107,947	-		AMB_RS00485	0.70	-0.4
107,947	-		AMB_RS00485	0.70	-0.5
107,947	-		AMB_RS00485	0.70	+0.2
107,962	-		AMB_RS00485	0.72	+0.3
107,973	+		AMB_RS00485	0.73	-1.2
107,973	+		AMB_RS00485	0.73	+0.1
107,973	+		AMB_RS00485	0.73	+0.1
107,973	+		AMB_RS00485	0.73	-0.7
107,973	+		AMB_RS00485	0.73	+0.4
107,974	-		AMB_RS00485	0.73	-1.4
108,025	+		AMB_RS00485	0.78	-1.5
108,025	+		AMB_RS00485	0.78	+0.3
108,025	+		AMB_RS00485	0.78	+1.5
108,026	-		AMB_RS00485	0.78	+0.4
108,026	-		AMB_RS00485	0.78	-0.6
108,026	-		AMB_RS00485	0.78	+0.8
108,054	+		AMB_RS00485	0.81	-0.3
108,054	+		AMB_RS00485	0.81	-0.3
108,055	-		AMB_RS00485	0.81	-0.5
108,055	-		AMB_RS00485	0.81	+0.2
108,088	+		AMB_RS00485	0.84	-0.4
108,089	-		AMB_RS00485	0.84	-0.8
108,165	-				-0.8
108,167	+				-0.1
108,167	+				+1.1
108,167	+				+0.1
108,167	+				-0.5
108,168	-				-0.2
108,168	-				+0.4
108,168	-				+0.9
108,168	-				-0.1
108,168	-				+0.6
108,168	-				-0.6
108,168	-				+0.4
108,168	-				+0.4