Strain Fitness in Magnetospirillum magneticum AMB-1 around AMB_RS08595

Experiment: 150_initial_2

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	150_initial_2
1,838,571	+				-0.4
1,838,572	-				-0.2
1,838,572	-				-0.2
1,838,572	-				-0.9
1,838,572	-				+0.4
1,838,579	+				-0.9
1,838,579	+				+0.4
1,838,579	+				-0.0
1,838,579	+				-0.2
1,838,579	+				-0.1
1,838,579	+				+0.1
1,838,579	+				+0.1
1,838,580	-				-0.1
1,838,580	-				-0.3
1,838,580	-				-0.8
1,838,580	-				-0.4
1,838,580	-				-0.2
1,838,580	-				-1.0
1,839,170	-				-0.6
1,839,170	-				-0.2
1,839,237	+				-0.1
1,839,237	+				-0.2
1,839,333	+				-0.5
1,839,493	+				-0.8
1,839,494	-				-0.6
1,839,643	+				-0.6
1,839,662	+				-0.3
1,839,663	-				-0.2
1,839,676	+				-0.3
1,839,676	+				-0.9
1,839,677	-				-0.3
1,839,677	-				-0.2
1,839,677	-				-0.1
1,839,709	+				+0.1
1,839,709	+				-0.0
1,839,709	+				-0.6
1,839,709	+				-0.2
1,839,709	+				-1.1
1,839,710	-				+0.7
1,839,710	-				+0.4
1,839,710	-				+0.2
1,839,728	+				-0.3
1,839,755	+				-0.8
1,839,795	+		AMB_RS08595	0.10	-1.0
1,839,795	+		AMB_RS08595	0.10	+0.5
1,839,795	+		AMB_RS08595	0.10	-0.1
1,839,795	+		AMB_RS08595	0.10	-3.1
1,839,795	+		AMB_RS08595	0.10	-0.6
1,839,795	+		AMB_RS08595	0.10	+0.4
1,839,796	-		AMB_RS08595	0.10	-1.2
1,839,796	-		AMB_RS08595	0.10	-1.6
1,839,796	-		AMB_RS08595	0.10	+0.2
1,839,796	-		AMB_RS08595	0.10	+0.7
1,839,819	+		AMB_RS08595	0.11	-0.3
1,839,820	-		AMB_RS08595	0.11	-0.5
1,839,820	-		AMB_RS08595	0.11	-0.4
1,839,828	+		AMB_RS08595	0.11	+0.1
1,839,828	+		AMB_RS08595	0.11	-0.2
1,839,829	-		AMB_RS08595	0.11	+0.5
1,839,829	-		AMB_RS08595	0.11	-3.3
1,839,892	+		AMB_RS08595	0.13	-0.2
1,839,892	+		AMB_RS08595	0.13	+0.1
1,839,893	-		AMB_RS08595	0.13	+0.2
1,839,919	+		AMB_RS08595	0.14	+0.2
1,839,919	+		AMB_RS08595	0.14	+0.0
1,839,919	+		AMB_RS08595	0.14	+0.0
1,839,920	-		AMB_RS08595	0.14	-0.4
1,840,037	+		AMB_RS08595	0.18	-0.1
1,840,038	-		AMB_RS08595	0.18	+0.6
1,840,038	-		AMB_RS08595	0.18	-1.5
1,840,038	-		AMB_RS08595	0.18	-0.3
1,840,038	-		AMB_RS08595	0.18	-0.0
1,840,039	+		AMB_RS08595	0.18	+1.7
1,840,039	+		AMB_RS08595	0.18	+1.5
1,840,039	+		AMB_RS08595	0.18	-2.5
1,840,039	+		AMB_RS08595	0.18	-0.6
1,840,040	-		AMB_RS08595	0.18	-0.6
1,840,040	-		AMB_RS08595	0.18	+0.4
1,840,040	-		AMB_RS08595	0.18	-0.2
1,840,040	-		AMB_RS08595	0.18	-0.4
1,840,141	+		AMB_RS08595	0.21	+1.5
1,840,141	+		AMB_RS08595	0.21	-0.6
1,840,142	-		AMB_RS08595	0.21	+0.1
1,840,142	-		AMB_RS08595	0.21	+0.1
1,840,274	+		AMB_RS08595	0.26	-1.5
1,840,294	+		AMB_RS08595	0.26	-0.1
1,840,295	-		AMB_RS08595	0.26	+0.3
1,840,295	-		AMB_RS08595	0.26	+2.2
1,840,388	-		AMB_RS08595	0.29	+0.4
1,840,388	-		AMB_RS08595	0.29	-0.7
1,840,393	+		AMB_RS08595	0.29	+0.2
1,840,394	-		AMB_RS08595	0.29	+0.4
1,840,448	+		AMB_RS08595	0.31	-0.4
1,840,449	-		AMB_RS08595	0.31	-0.5
1,840,511	+		AMB_RS08595	0.33	-0.3
1,840,587	+		AMB_RS08595	0.36	-0.6
1,840,588	-		AMB_RS08595	0.36	-0.1
1,840,652	+		AMB_RS08595	0.38	-0.0
1,840,652	+		AMB_RS08595	0.38	-1.0
1,840,653	-		AMB_RS08595	0.38	-2.2
1,840,784	-		AMB_RS08595	0.42	+1.5
1,840,784	-		AMB_RS08595	0.42	-0.2
1,840,784	-		AMB_RS08595	0.42	-0.3
1,841,061	+		AMB_RS08595	0.51	+0.0
1,841,061	+		AMB_RS08595	0.51	-1.1
1,841,114	+		AMB_RS08595	0.52	-1.6
1,841,114	+		AMB_RS08595	0.52	+0.1
1,841,114	+		AMB_RS08595	0.52	-0.1
1,841,116	+		AMB_RS08595	0.52	+1.9
1,841,116	+		AMB_RS08595	0.52	-2.6
1,841,117	-		AMB_RS08595	0.52	-1.1
1,841,117	-		AMB_RS08595	0.52	+0.4
1,841,117	-		AMB_RS08595	0.52	-0.5
1,841,206	+		AMB_RS08595	0.55	-0.4
1,841,206	+		AMB_RS08595	0.55	-0.5
1,841,206	+		AMB_RS08595	0.55	-1.4
1,841,206	+		AMB_RS08595	0.55	-0.2
1,841,207	-		AMB_RS08595	0.55	-0.5
1,841,207	-		AMB_RS08595	0.55	+0.6
1,841,207	-		AMB_RS08595	0.55	-0.4
1,841,207	-		AMB_RS08595	0.55	-0.2
1,841,207	-		AMB_RS08595	0.55	-0.6
1,841,207	-		AMB_RS08595	0.55	-0.0
1,841,207	-		AMB_RS08595	0.55	-0.4
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	+0.6
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-0.1
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-0.2
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-2.1
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-0.3
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-0.5
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-0.3
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-1.1
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-0.1
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-0.2
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	+0.0
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-0.2
1,841,208	+		AMB_RS08595	0.55	-0.3
1,841,209	-		AMB_RS08595	0.55	-1.2
1,841,209	-		AMB_RS08595	0.55	-3.0
1,841,209	-		AMB_RS08595	0.55	+0.4
1,841,239	+		AMB_RS08595	0.56	+0.3
1,841,239	+		AMB_RS08595	0.56	-0.3
1,841,239	+		AMB_RS08595	0.56	-0.1
1,841,239	+		AMB_RS08595	0.56	-0.2
1,841,239	+		AMB_RS08595	0.56	-1.6
1,841,240	-		AMB_RS08595	0.56	-0.5
1,841,240	-		AMB_RS08595	0.56	-0.5
1,841,240	-		AMB_RS08595	0.56	-2.2
1,841,240	-		AMB_RS08595	0.56	-0.1
1,841,243	+		AMB_RS08595	0.56	-0.2
1,841,244	-		AMB_RS08595	0.56	+0.1
1,841,268	+		AMB_RS08595	0.57	-3.6
1,841,290	+		AMB_RS08595	0.58	-0.9
1,841,291	-		AMB_RS08595	0.58	-1.3
1,841,291	-		AMB_RS08595	0.58	-1.0
1,841,315	+		AMB_RS08595	0.59	+0.0
1,841,316	-		AMB_RS08595	0.59	-1.3
1,841,316	-		AMB_RS08595	0.59	+0.4
1,841,456	+		AMB_RS08595	0.63	-0.2
1,841,456	+		AMB_RS08595	0.63	+0.1
1,841,457	-		AMB_RS08595	0.63	+0.3
1,841,457	-		AMB_RS08595	0.63	+1.4
1,841,457	-		AMB_RS08595	0.63	+0.8
1,841,498	+		AMB_RS08595	0.65	-0.2
1,841,498	+		AMB_RS08595	0.65	+0.5
1,841,498	+		AMB_RS08595	0.65	-0.3
1,841,498	+		AMB_RS08595	0.65	-0.2
1,841,498	+		AMB_RS08595	0.65	+2.0
1,841,499	-		AMB_RS08595	0.65	-0.8
1,841,499	-		AMB_RS08595	0.65	-0.3
1,841,499	-		AMB_RS08595	0.65	+0.1
1,841,499	-		AMB_RS08595	0.65	+0.2
1,841,799	-		AMB_RS08595	0.74	+0.7
1,842,049	+		AMB_RS08595	0.82	-0.9
1,842,049	+		AMB_RS08595	0.82	-0.3
1,842,049	+		AMB_RS08595	0.82	+0.3
1,842,049	+		AMB_RS08595	0.82	-0.2
1,842,120	+		AMB_RS08595	0.84	+0.9
1,842,120	+		AMB_RS08595	0.84	-0.3
1,842,121	-		AMB_RS08595	0.84	-0.4
1,842,129	+		AMB_RS08595	0.85	+0.2
1,842,129	+		AMB_RS08595	0.85	-0.1
1,842,129	+		AMB_RS08595	0.85	-0.6
1,842,130	-		AMB_RS08595	0.85	-0.3
1,842,130	-		AMB_RS08595	0.85	-1.2
1,842,251	+		AMB_RS08595	0.89	-0.8
1,842,251	+		AMB_RS08595	0.89	+2.7
1,842,252	-		AMB_RS08595	0.89	+0.7
1,842,333	+				-1.4
1,842,333	+				+0.4
1,842,334	-				-1.4
1,842,334	-				+0.0
1,842,334	-				-0.7
1,842,334	-				-0.2
1,842,334	-				-0.8
1,842,334	-				-0.3
1,842,334	-				-0.5
1,842,334	-				-0.8
1,842,334	-				-0.8
1,842,334	-				-0.2
1,842,335	+				-0.3
1,842,335	+				-0.5
1,842,336	-				-1.4
1,842,336	-				-0.2
1,842,499	+				-0.5
1,842,500	-				-1.4
1,842,549	+				+0.2
1,842,603	-				+0.5
1,842,896	+		AMB_RS08600	0.15	-0.2
1,842,968	+		AMB_RS08600	0.19	-0.9
1,842,983	+		AMB_RS08600	0.20	+0.8
1,843,034	+		AMB_RS08600	0.23	-0.0
1,843,034	+		AMB_RS08600	0.23	-0.2
1,843,040	+		AMB_RS08600	0.23	-1.3
1,843,040	+		AMB_RS08600	0.23	-0.5
1,843,040	+		AMB_RS08600	0.23	-0.6
1,843,040	+		AMB_RS08600	0.23	-0.0
1,843,041	-		AMB_RS08600	0.23	-1.2
1,843,041	-		AMB_RS08600	0.23	-0.4
1,843,043	+		AMB_RS08600	0.23	+0.8
1,843,043	+		AMB_RS08600	0.23	-0.6
1,843,044	-		AMB_RS08600	0.23	+0.7
1,843,104	-		AMB_RS08600	0.26	-0.4
1,843,310	-		AMB_RS08600	0.37	-0.4
1,843,310	-		AMB_RS08600	0.37	-0.4
1,843,349	-		AMB_RS08600	0.39	-0.2
1,843,349	-		AMB_RS08600	0.39	-0.2
1,843,355	+		AMB_RS08600	0.40	-0.1
1,843,407	+		AMB_RS08600	0.42	+0.4
1,843,408	-		AMB_RS08600	0.42	-0.3
1,843,408	-		AMB_RS08600	0.42	-0.6
1,843,409	+		AMB_RS08600	0.42	-0.6
1,843,410	-		AMB_RS08600	0.42	-0.1
1,843,410	-		AMB_RS08600	0.42	-0.0
1,843,410	-		AMB_RS08600	0.42	-0.7
1,843,410	-		AMB_RS08600	0.42	-1.2
1,843,421	-		AMB_RS08600	0.43	-0.6