Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS21250

Experiment: M9+polygalacturonate

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	M9+polygalacturonate
4,589,375	+		DZA65_RS21245	0.26	+1.1
4,589,376	-		DZA65_RS21245	0.26	+1.4
4,589,376	-		DZA65_RS21245	0.26	-0.5
4,589,376	-		DZA65_RS21245	0.26	+0.3
4,589,376	-		DZA65_RS21245	0.26	+1.3
4,589,376	-		DZA65_RS21245	0.26	+0.3
4,589,376	-		DZA65_RS21245	0.26	+0.3
4,589,390	+		DZA65_RS21245	0.28	-0.6
4,589,390	+		DZA65_RS21245	0.28	-0.8
4,589,390	+		DZA65_RS21245	0.28	+1.1
4,589,390	+		DZA65_RS21245	0.28	-0.5
4,589,390	+		DZA65_RS21245	0.28	+0.5
4,589,390	+		DZA65_RS21245	0.28	-1.8
4,589,391	-		DZA65_RS21245	0.28	-0.9
4,589,391	-		DZA65_RS21245	0.28	+0.6
4,589,391	-		DZA65_RS21245	0.28	-0.2
4,589,391	-				-2.1
4,589,436	+		DZA65_RS21245	0.32	+0.7
4,589,436	+		DZA65_RS21245	0.32	-0.2
4,589,436	+		DZA65_RS21245	0.32	-0.8
4,589,436	+		DZA65_RS21245	0.32	+0.1
4,589,436	+		DZA65_RS21245	0.32	-0.1
4,589,437	-		DZA65_RS21245	0.32	-1.3
4,589,437	-		DZA65_RS21245	0.32	+1.3
4,589,437	-		DZA65_RS21245	0.32	+0.2
4,589,437	-		DZA65_RS21245	0.32	-1.5
4,589,455	+		DZA65_RS21245	0.33	+1.1
4,589,455	+		DZA65_RS21245	0.33	+0.4
4,589,455	+		DZA65_RS21245	0.33	+0.5
4,589,455	+		DZA65_RS21245	0.33	+2.6
4,589,456	-		DZA65_RS21245	0.34	-0.1
4,589,456	-		DZA65_RS21245	0.34	+1.1
4,589,456	-		DZA65_RS21245	0.34	+0.5
4,589,473	+		DZA65_RS21245	0.35	-0.2
4,589,615	+		DZA65_RS21245	0.48	-0.0
4,589,641	+		DZA65_RS21245	0.50	-0.1
4,589,642	-		DZA65_RS21245	0.50	-0.6
4,589,677	+		DZA65_RS21245	0.53	+1.6
4,589,677	+		DZA65_RS21245	0.53	+0.5
4,589,712	+		DZA65_RS21245	0.56	+0.0
4,589,713	-		DZA65_RS21245	0.56	-1.1
4,589,777	+		DZA65_RS21245	0.62	+0.5
4,589,778	-		DZA65_RS21245	0.62	+0.3
4,589,778	-		DZA65_RS21245	0.62	-1.3
4,589,778	-		DZA65_RS21245	0.62	+0.1
4,589,778	-		DZA65_RS21245	0.62	+0.0
4,589,778	-		DZA65_RS21245	0.62	-0.9
4,589,802	+		DZA65_RS21245	0.64	+0.7
4,589,802	+		DZA65_RS21245	0.64	-0.9
4,589,802	+		DZA65_RS21245	0.64	+0.1
4,589,802	+		DZA65_RS21245	0.64	+0.4
4,589,803	-		DZA65_RS21245	0.64	+1.1
4,589,803	-		DZA65_RS21245	0.64	+0.8
4,589,803	-		DZA65_RS21245	0.64	-0.5
4,589,803	-		DZA65_RS21245	0.64	+0.8
4,589,803	-		DZA65_RS21245	0.64	+0.1
4,589,803	-		DZA65_RS21245	0.64	+0.3
4,589,808	+		DZA65_RS21245	0.65	+0.5
4,589,838	+		DZA65_RS21245	0.67	-2.8
4,589,877	+		DZA65_RS21245	0.71	+0.5
4,589,878	-		DZA65_RS21245	0.71	+1.4
4,589,878	-		DZA65_RS21245	0.71	-0.9
4,589,885	+		DZA65_RS21245	0.71	+0.2
4,589,885	+		DZA65_RS21245	0.71	+1.1
4,589,885	+		DZA65_RS21245	0.71	-0.9
4,589,885	+		DZA65_RS21245	0.71	+0.3
4,589,885	+		DZA65_RS21245	0.71	+0.1
4,589,885	+		DZA65_RS21245	0.71	-0.0
4,589,885	+		DZA65_RS21245	0.71	-0.5
4,589,885	+		DZA65_RS21245	0.71	-0.8
4,589,886	-		DZA65_RS21245	0.72	+0.3
4,589,886	-		DZA65_RS21245	0.72	+0.1
4,589,886	-		DZA65_RS21245	0.72	+0.1
4,589,886	-		DZA65_RS21245	0.72	-0.6
4,589,886	-		DZA65_RS21245	0.72	-2.1
4,589,886	-		DZA65_RS21245	0.72	+0.6
4,589,886	-		DZA65_RS21245	0.72	+2.1
4,589,989	-		DZA65_RS21245	0.81	+0.7
4,590,027	+		DZA65_RS21245	0.84	-0.2
4,590,028	-		DZA65_RS21245	0.84	-0.7
4,590,041	+		DZA65_RS21245	0.85	+0.1
4,590,042	-		DZA65_RS21245	0.85	+1.5
4,590,052	+		DZA65_RS21245	0.86	-1.6
4,590,052	+		DZA65_RS21245	0.86	+0.3
4,590,052	+		DZA65_RS21245	0.86	-1.3
4,590,053	-		DZA65_RS21245	0.86	-1.9
4,590,070	+		DZA65_RS21245	0.88	+1.6
4,590,070	+		DZA65_RS21245	0.88	-0.2
4,590,071	-		DZA65_RS21245	0.88	-0.5
4,590,071	-		DZA65_RS21245	0.88	-1.3
4,590,239	-				+1.7
4,590,421	+		DZA65_RS21250	0.11	+0.6
4,590,421	+		DZA65_RS21250	0.11	+0.5
4,590,429	+		DZA65_RS21250	0.12	-0.3
4,590,429	+		DZA65_RS21250	0.12	+1.6
4,590,430	-		DZA65_RS21250	0.12	+1.1
4,590,435	+		DZA65_RS21250	0.13	+1.4
4,590,435	+		DZA65_RS21250	0.13	-1.0
4,590,435	+		DZA65_RS21250	0.13	-0.5
4,590,436	-		DZA65_RS21250	0.13	-1.7
4,590,436	-		DZA65_RS21250	0.13	+0.4
4,590,436	-		DZA65_RS21250	0.13	+1.5
4,590,436	-		DZA65_RS21250	0.13	+0.6
4,590,504	+		DZA65_RS21250	0.19	+0.1
4,590,505	-		DZA65_RS21250	0.19	+0.2
4,590,505	-		DZA65_RS21250	0.19	-0.3
4,590,505	-		DZA65_RS21250	0.19	+0.1
4,590,575	+		DZA65_RS21250	0.26	+0.6
4,590,626	+		DZA65_RS21250	0.31	+0.1
4,590,626	+		DZA65_RS21250	0.31	-0.2
4,590,626	+		DZA65_RS21250	0.31	+0.8
4,590,627	-		DZA65_RS21250	0.31	-1.5
4,590,627	-		DZA65_RS21250	0.31	-0.5
4,590,627	-		DZA65_RS21250	0.31	+0.6
4,590,627	-		DZA65_RS21250	0.31	+1.1
4,590,627	-		DZA65_RS21250	0.31	-0.3
4,590,650	-		DZA65_RS21250	0.33	+0.7
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	-0.7
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+1.6
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	-0.7
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+0.1
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+1.1
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+1.3
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+0.1
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+0.6
4,590,813	+		DZA65_RS21250	0.49	+1.1
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+0.3
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+1.1
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+0.4
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.9
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+1.3
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+0.1
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.2
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.2
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.5
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+1.6
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.4
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+0.7
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.4
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-0.1
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	+0.5
4,590,814	-		DZA65_RS21250	0.49	-1.3
4,590,868	+		DZA65_RS21250	0.54	-0.5
4,590,869	-		DZA65_RS21250	0.54	+1.1
4,590,901	+		DZA65_RS21250	0.58	-1.0
4,590,901	+		DZA65_RS21250	0.58	+0.5
4,590,902	-		DZA65_RS21250	0.58	-0.3
4,590,910	+		DZA65_RS21250	0.58	+0.3
4,590,975	+		DZA65_RS21250	0.65	+0.2
4,590,976	-		DZA65_RS21250	0.65	+0.1
4,590,978	+		DZA65_RS21250	0.65	-0.3
4,590,978	+		DZA65_RS21250	0.65	-0.8
4,590,978	+		DZA65_RS21250	0.65	-0.8
4,590,979	-		DZA65_RS21250	0.65	-1.3
4,591,015	-		DZA65_RS21250	0.69	-0.1
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	-2.1
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	+1.9
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	+0.3
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	+1.1
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	-0.9
4,591,044	+		DZA65_RS21250	0.71	+0.3
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	+0.4
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	+0.4
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	-0.4
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	+1.2
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	+0.3
4,591,045	-		DZA65_RS21250	0.71	+0.3
4,591,137	-		DZA65_RS21250	0.80	+0.6
4,591,137	-		DZA65_RS21250	0.80	+1.1
4,591,181	+		DZA65_RS21250	0.85	+1.5
4,591,204	-		DZA65_RS21250	0.87	-2.7
4,591,204	-		DZA65_RS21250	0.87	+0.7
4,591,209	-		DZA65_RS21250	0.87	-2.3
4,591,359	+				+0.1
4,591,359	+				-0.1
4,591,359	+				+1.1
4,591,395	+				-0.0
4,591,395	+				-2.5
4,591,396	-				+0.6
4,591,425	+				-0.2
4,591,426	-				-0.9
4,591,453	+				-0.6
4,591,453	+				+0.5
4,591,542	+		DZA65_RS21255	0.12	-0.2
4,591,542	+		DZA65_RS21255	0.12	+0.5
4,591,542	+		DZA65_RS21255	0.12	+0.2
4,591,542	+		DZA65_RS21255	0.12	+1.1
4,591,543	-		DZA65_RS21255	0.12	+0.3
4,591,543	-		DZA65_RS21255	0.12	-0.4
4,591,543	-		DZA65_RS21255	0.12	-0.0
4,591,606	+		DZA65_RS21255	0.18	-0.2
4,591,606	+		DZA65_RS21255	0.18	+0.3
4,591,606	+		DZA65_RS21255	0.18	+0.2
4,591,606	+		DZA65_RS21255	0.18	+0.8
4,591,606	+		DZA65_RS21255	0.18	-1.3
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.4
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.7
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	-0.7
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	-0.2
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.6
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.3
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	-0.9
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	+0.8
4,591,607	-		DZA65_RS21255	0.18	-1.4
4,591,663	+		DZA65_RS21255	0.23	+0.4
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	-0.2
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	+2.1
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	-1.1
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	+0.1
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	+0.4
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	-0.2
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	-0.1
4,591,664	-		DZA65_RS21255	0.23	+0.1
4,591,699	+		DZA65_RS21255	0.26	+0.2
4,591,699	+		DZA65_RS21255	0.26	-1.5
4,591,700	-		DZA65_RS21255	0.26	+2.1
4,591,700	-		DZA65_RS21255	0.26	+1.5
4,591,700	-		DZA65_RS21255	0.26	-0.4
4,591,700	-		DZA65_RS21255	0.26	-0.3
4,591,714	-		DZA65_RS21255	0.28	+0.7
4,591,730	-		DZA65_RS21255	0.29	+0.2
4,591,730	-		DZA65_RS21255	0.29	-0.2
4,591,825	+		DZA65_RS21255	0.38	+2.4
4,591,826	-		DZA65_RS21255	0.38	+0.6
4,591,867	+		DZA65_RS21255	0.42	-0.9
4,591,867	+		DZA65_RS21255	0.42	+1.1
4,591,867	+		DZA65_RS21255	0.42	+0.1
4,591,867	+		DZA65_RS21255	0.42	-0.7
4,591,867	+		DZA65_RS21255	0.42	-0.7
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	-0.0
4,591,868	-				+1.1
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	-1.1
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	+0.7
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	-1.5
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	-0.7
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	-1.5
4,591,868	-		DZA65_RS21255	0.42	-0.1
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	-0.1
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	-0.4
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	-0.6
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	+0.3
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	-1.8
4,591,869	+		DZA65_RS21255	0.42	+0.1
4,591,870	-		DZA65_RS21255	0.42	-0.0
4,591,870	-		DZA65_RS21255	0.42	-1.5
4,591,870	-		DZA65_RS21255	0.42	-0.2
4,591,870	-		DZA65_RS21255	0.42	+1.3
4,591,870	-		DZA65_RS21255	0.42	+0.1
4,591,882	+		DZA65_RS21255	0.43	-0.1
4,591,905	+		DZA65_RS21255	0.45	-0.5
4,591,906	-		DZA65_RS21255	0.46	+2.1
4,591,906	-		DZA65_RS21255	0.46	-0.7
4,591,906	-		DZA65_RS21255	0.46	-0.0
4,591,906	-		DZA65_RS21255	0.46	+1.2
4,591,957	+		DZA65_RS21255	0.50	+0.5
4,591,957	+		DZA65_RS21255	0.50	+0.1
4,591,957	+		DZA65_RS21255	0.50	+0.1
4,591,958	-		DZA65_RS21255	0.50	+0.8
4,591,968	+		DZA65_RS21255	0.51	+0.5
4,592,044	+		DZA65_RS21255	0.58	+0.1
4,592,045	-		DZA65_RS21255	0.58	-1.5
4,592,089	-		DZA65_RS21255	0.63	+0.3
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	-0.5
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+0.7
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	-0.1
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	-1.7
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+0.7
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	-0.2
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+0.7
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+1.1
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+0.5
4,592,131	+		DZA65_RS21255	0.66	+0.6
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	+0.7
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	+0.5
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	-1.5
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	-0.4
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	-0.2
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	+0.4
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	+0.6
4,592,132	-		DZA65_RS21255	0.67	-0.3
4,592,133	+		DZA65_RS21255	0.67	+0.1
4,592,134	-		DZA65_RS21255	0.67	-0.3
4,592,134	-		DZA65_RS21255	0.67	+0.4
4,592,195	+		DZA65_RS21255	0.72	+1.1
4,592,195	+		DZA65_RS21255	0.72	+2.4
4,592,196	-		DZA65_RS21255	0.73	+0.6
4,592,277	+		DZA65_RS21255	0.80	+1.3
4,592,277	+		DZA65_RS21255	0.80	-1.7
4,592,277	+		DZA65_RS21255	0.80	+0.6
4,592,278	-		DZA65_RS21255	0.80	+1.2
4,592,278	-		DZA65_RS21255	0.80	+0.1
4,592,278	-		DZA65_RS21255	0.80	-1.1
4,592,278	-		DZA65_RS21255	0.80	+0.6
4,592,278	-		DZA65_RS21255	0.80	-1.4
4,592,315	+		DZA65_RS21255	0.84	+0.1
4,592,315	+		DZA65_RS21255	0.84	+0.1
4,592,316	-		DZA65_RS21255	0.84	-0.7
4,592,316	-		DZA65_RS21255	0.84	+1.2
4,592,316	-		DZA65_RS21255	0.84	+0.4
4,592,337	+		DZA65_RS21255	0.86	-2.3
4,592,337	+		DZA65_RS21255	0.86	-1.4
4,592,337	+		DZA65_RS21255	0.86	-0.5
4,592,338	-		DZA65_RS21255	0.86	-0.5
4,592,338	-		DZA65_RS21255	0.86	-0.4