Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS16415

Experiment: M9+polygalacturonate

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

Per-strain Table

Position	Strand	Gene	LocusTag	Fraction	M9+polygalacturonate
3,558,379	+		DZA65_RS16410	0.61	+0.8
3,558,379	+		DZA65_RS16410	0.61	-0.5
3,558,379	+		DZA65_RS16410	0.61	+0.1
3,558,380	-		DZA65_RS16410	0.61	+0.2
3,558,382	+		DZA65_RS16410	0.61	+0.8
3,558,413	+		DZA65_RS16410	0.62	+0.3
3,558,439	+		DZA65_RS16410	0.63	-0.1
3,558,439	+		DZA65_RS16410	0.63	-0.3
3,558,439	+		DZA65_RS16410	0.63	-0.2
3,558,439	+		DZA65_RS16410	0.63	-0.1
3,558,440	-		DZA65_RS16410	0.63	-1.3
3,558,440	-		DZA65_RS16410	0.63	+0.1
3,558,440	-		DZA65_RS16410	0.63	-1.1
3,558,521	+		DZA65_RS16410	0.66	-0.2
3,558,521	+		DZA65_RS16410	0.66	-0.5
3,558,521	+		DZA65_RS16410	0.66	+0.7
3,558,522	-		DZA65_RS16410	0.66	-0.1
3,558,553	+		DZA65_RS16410	0.68	-0.1
3,558,553	+		DZA65_RS16410	0.68	+0.8
3,558,554	-		DZA65_RS16410	0.68	-0.3
3,558,554	-		DZA65_RS16410	0.68	+0.1
3,558,554	-		DZA65_RS16410	0.68	-0.3
3,558,620	+		DZA65_RS16410	0.70	+0.6
3,558,620	+		DZA65_RS16410	0.70	-1.2
3,558,621	-		DZA65_RS16410	0.70	-2.7
3,558,621	-		DZA65_RS16410	0.70	+0.9
3,558,621	-		DZA65_RS16410	0.70	+0.5
3,558,621	-		DZA65_RS16410	0.70	-1.5
3,558,621	-		DZA65_RS16410	0.70	+0.0
3,558,667	+		DZA65_RS16410	0.72	-1.5
3,558,668	-		DZA65_RS16410	0.72	+1.8
3,558,670	+		DZA65_RS16410	0.72	+1.2
3,558,670	+		DZA65_RS16410	0.72	-1.3
3,558,670	+		DZA65_RS16410	0.72	+0.3
3,558,671	-		DZA65_RS16410	0.72	-0.8
3,558,671	-		DZA65_RS16410	0.72	-2.5
3,558,671	-		DZA65_RS16410	0.72	+0.1
3,558,671	-		DZA65_RS16410	0.72	+0.1
3,558,671	-		DZA65_RS16410	0.72	-1.1
3,558,671	-		DZA65_RS16410	0.72	-0.5
3,558,671	-		DZA65_RS16410	0.72	-0.3
3,558,671	-		DZA65_RS16410	0.72	+0.1
3,558,698	+		DZA65_RS16410	0.74	+1.2
3,558,699	-		DZA65_RS16410	0.74	+0.4
3,558,708	-		DZA65_RS16410	0.74	-0.1
3,558,848	+		DZA65_RS16410	0.80	+0.5
3,558,848	+		DZA65_RS16410	0.80	-2.1
3,558,848	+		DZA65_RS16410	0.80	-1.1
3,558,848	+		DZA65_RS16410	0.80	+0.2
3,558,848	+		DZA65_RS16410	0.80	-0.3
3,558,848	+		DZA65_RS16410	0.80	+0.5
3,558,849	-		DZA65_RS16410	0.80	+0.3
3,558,849	-		DZA65_RS16410	0.80	-0.8
3,558,849	-		DZA65_RS16410	0.80	-0.6
3,558,849	-		DZA65_RS16410	0.80	+0.5
3,558,849	-		DZA65_RS16410	0.80	+0.5
3,558,867	+		DZA65_RS16410	0.80	-0.7
3,558,867	+		DZA65_RS16410	0.80	-0.5
3,558,867	+		DZA65_RS16410	0.80	+0.3
3,558,867	+		DZA65_RS16410	0.80	-0.5
3,558,867	+		DZA65_RS16410	0.80	-0.0
3,558,867	+		DZA65_RS16410	0.80	-0.5
3,558,868	-		DZA65_RS16410	0.80	+0.1
3,558,868	-		DZA65_RS16410	0.80	-0.8
3,558,868	-		DZA65_RS16410	0.80	-0.1
3,558,868	-		DZA65_RS16410	0.80	+0.8
3,558,868	-		DZA65_RS16410	0.80	-0.8
3,558,868	-		DZA65_RS16410	0.80	-0.8
3,558,868	-		DZA65_RS16410	0.80	-0.5
3,558,869	+		DZA65_RS16410	0.80	+0.5
3,558,869	+		DZA65_RS16410	0.80	-0.5
3,558,869	+				-0.5
3,558,870	-		DZA65_RS16410	0.80	+0.1
3,558,870	-		DZA65_RS16410	0.80	-0.8
3,558,870	-		DZA65_RS16410	0.80	+2.5
3,558,870	-		DZA65_RS16410	0.80	-0.5
3,558,952	+		DZA65_RS16410	0.84	-0.8
3,558,953	-		DZA65_RS16410	0.84	+0.5
3,558,953	-		DZA65_RS16410	0.84	+0.4
3,558,953	-		DZA65_RS16410	0.84	+0.3
3,559,008	+		DZA65_RS16410	0.86	-0.6
3,559,008	+		DZA65_RS16410	0.86	-0.3
3,559,008	+		DZA65_RS16410	0.86	-0.1
3,559,008	+		DZA65_RS16410	0.86	-0.1
3,559,008	+		DZA65_RS16410	0.86	+0.5
3,559,008	+		DZA65_RS16410	0.86	+0.5
3,559,008	+		DZA65_RS16410	0.86	+0.8
3,559,008	+		DZA65_RS16410	0.86	-1.5
3,559,009	-		DZA65_RS16410	0.86	+0.1
3,559,009	-		DZA65_RS16410	0.86	-2.7
3,559,009	-		DZA65_RS16410	0.86	+0.5
3,559,009	-		DZA65_RS16410	0.86	-1.1
3,559,025	-		DZA65_RS16410	0.87	-0.1
3,559,025	-		DZA65_RS16410	0.87	-0.5
3,559,042	+		DZA65_RS16410	0.87	-0.5
3,559,042	+		DZA65_RS16410	0.87	-0.3
3,559,042	+		DZA65_RS16410	0.87	-0.1
3,559,043	-		DZA65_RS16410	0.87	+0.1
3,559,043	-		DZA65_RS16410	0.87	+0.1
3,559,043	-		DZA65_RS16410	0.87	+1.0
3,559,069	+		DZA65_RS16410	0.89	-0.4
3,559,069	+		DZA65_RS16410	0.89	-2.1
3,559,069	+		DZA65_RS16410	0.89	-0.4
3,559,070	-		DZA65_RS16410	0.89	-0.2
3,559,070	-		DZA65_RS16410	0.89	-1.2
3,559,070	-		DZA65_RS16410	0.89	+0.2
3,559,070	-		DZA65_RS16410	0.89	+0.4
3,559,070	-				+1.2
3,559,070	-		DZA65_RS16410	0.89	-1.3
3,559,070	-		DZA65_RS16410	0.89	-0.2
3,559,070	-		DZA65_RS16410	0.89	-0.1
3,559,070	-		DZA65_RS16410	0.89	-0.8
3,559,070	-		DZA65_RS16410	0.89	-0.9
3,559,070	-		DZA65_RS16410	0.89	-0.9
3,559,094	+		DZA65_RS16410	0.90	+0.1
3,559,094	+		DZA65_RS16410	0.90	+0.0
3,559,094	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.5
3,559,094	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.7
3,559,095	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.8
3,559,095	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.8
3,559,095	-		DZA65_RS16410	0.90	-1.2
3,559,095	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.5
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	+0.2
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-2.1
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-1.1
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	+0.3
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-1.5
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.5
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.5
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	+0.9
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.1
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	+1.2
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-2.1
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.3
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	+0.2
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.8
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-2.5
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-1.3
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	+0.5
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.7
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	+0.7
3,559,096	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.4
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.5
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.2
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	+1.2
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-0.2
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.7
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.1
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.1
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-0.2
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-0.2
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-1.1
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-0.5
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-0.1
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-0.1
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.5
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-0.6
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-0.5
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.0
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.5
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-1.8
3,559,097	-				-0.8
3,559,097	-		DZA65_RS16410	0.90	-2.1
3,559,100	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.5
3,559,100	+		DZA65_RS16410	0.90	-0.6
3,559,100	+		DZA65_RS16410	0.90	+0.2
3,559,100	+		DZA65_RS16410	0.90	+1.7
3,559,100	+		DZA65_RS16410	0.90	-1.1
3,559,101	-		DZA65_RS16410	0.90	-2.5
3,559,101	-		DZA65_RS16410	0.90	-0.3
3,559,101	-		DZA65_RS16410	0.90	+0.5
3,559,101	-		DZA65_RS16410	0.90	-0.6
3,559,120	+				+0.0
3,559,120	+				+1.3
3,559,120	+				+0.2
3,559,120	+				+0.5
3,559,121	-				+1.4
3,559,121	-				-0.3
3,559,121	-				+2.7
3,559,121	-				+1.5
3,559,121	-				+0.3
3,559,121	-				+0.1
3,559,121	-				-1.3
3,559,121	-				+0.1
3,559,164	-				-1.5
3,559,270	+				-0.8
3,559,270	+				+0.5
3,559,271	-				-0.1
3,559,294	+				+0.9
3,559,295	-				+0.8
3,559,353	+				+1.1
3,559,354	-				+0.5
3,559,354	-				-1.8
3,559,354	-				-0.8
3,559,363	+				-0.9
3,559,363	+				+1.1
3,559,364	-				+0.1
3,559,364	-				-0.4
3,559,372	+				+0.0
3,559,450	-		DZA65_RS16415	0.16	+1.1
3,559,450	-		DZA65_RS16415	0.16	-0.5
3,559,465	+		DZA65_RS16415	0.19	+0.0
3,559,465	+		DZA65_RS16415	0.19	+0.5
3,559,551	+		DZA65_RS16415	0.33	+1.3
3,559,551	+		DZA65_RS16415	0.33	+0.7
3,559,551	+		DZA65_RS16415	0.33	-1.5
3,559,552	-		DZA65_RS16415	0.33	+0.7
3,559,552	-		DZA65_RS16415	0.33	-1.8
3,559,552	-		DZA65_RS16415	0.33	+0.1
3,559,552	-		DZA65_RS16415	0.33	-0.8
3,559,555	+		DZA65_RS16415	0.33	-2.1
3,559,555	+		DZA65_RS16415	0.33	+0.3
3,559,555	+		DZA65_RS16415	0.33	+0.1
3,559,555	+		DZA65_RS16415	0.33	-0.5
3,559,555	+		DZA65_RS16415	0.33	-0.1
3,559,555	+		DZA65_RS16415	0.33	-1.5
3,559,555	+		DZA65_RS16415	0.33	-1.1
3,559,555	+		DZA65_RS16415	0.33	+1.5
3,559,556	-				-1.1
3,559,556	-				-1.1
3,559,556	-		DZA65_RS16415	0.34	+0.7
3,559,556	-		DZA65_RS16415	0.34	+1.1
3,559,556	-		DZA65_RS16415	0.34	+0.5
3,559,556	-		DZA65_RS16415	0.34	+0.4
3,559,556	-		DZA65_RS16415	0.34	+0.2
3,559,581	+		DZA65_RS16415	0.38	+1.5
3,559,581	+		DZA65_RS16415	0.38	+0.5
3,559,581	+		DZA65_RS16415	0.38	+0.5
3,559,581	+		DZA65_RS16415	0.38	-0.3
3,559,582	-		DZA65_RS16415	0.38	-0.5
3,559,611	+		DZA65_RS16415	0.43	+0.9
3,559,611	+		DZA65_RS16415	0.43	-1.1
3,559,612	-		DZA65_RS16415	0.43	-0.6
3,559,612	-		DZA65_RS16415	0.43	+1.1
3,559,653	+		DZA65_RS16415	0.50	+0.5
3,559,653	+		DZA65_RS16415	0.50	-1.1
3,559,654	-		DZA65_RS16415	0.50	+0.5
3,559,699	+		DZA65_RS16415	0.57	+0.6
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