Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23

Strain Fitness in Dickeya dianthicola ME23 around DZA65_RS16415

Experiment: LB

Only strains with sufficient reads to estimate fitness are shown, but the strain fitness values are still rather noisy and may be biased towards zero. Strains near the edge of a gene are not shown as being associated with that gene (they are in grey). Strains in the central 10-90% of a gene are color coded by the insertion's strand. Usually, "+" means that the selectable marker is encoded on the forward strand, i.e., transcribed rightward.

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Per-strain Table

Position	Strand	LocusTag	Fraction	LB
				remove
3,558,379	+	DZA65_RS16410	0.61	+0.2
3,558,379	+	DZA65_RS16410	0.61	+0.2
3,558,379	+	DZA65_RS16410	0.61	+1.7
3,558,380	-	DZA65_RS16410	0.61	-0.0
3,558,382	+	DZA65_RS16410	0.61	+0.2
3,558,413	+	DZA65_RS16410	0.62	+0.4
3,558,439	+	DZA65_RS16410	0.63	-0.3
3,558,439	+	DZA65_RS16410	0.63	-0.9
3,558,439	+	DZA65_RS16410	0.63	-0.3
3,558,439	+	DZA65_RS16410	0.63	-0.6
3,558,440	-	DZA65_RS16410	0.63	+1.6
3,558,440	-	DZA65_RS16410	0.63	-0.8
3,558,440	-	DZA65_RS16410	0.63	-0.3
3,558,521	+	DZA65_RS16410	0.66	+1.2
3,558,521	+	DZA65_RS16410	0.66	-1.0
3,558,521	+	DZA65_RS16410	0.66	-0.4
3,558,522	-	DZA65_RS16410	0.66	-0.2
3,558,553	+	DZA65_RS16410	0.68	-0.6
3,558,553	+	DZA65_RS16410	0.68	+0.5
3,558,554	-	DZA65_RS16410	0.68	+0.8
3,558,554	-	DZA65_RS16410	0.68	-0.6
3,558,554	-	DZA65_RS16410	0.68	+0.1
3,558,620	+	DZA65_RS16410	0.70	-0.8
3,558,620	+	DZA65_RS16410	0.70	-0.4
3,558,621	-	DZA65_RS16410	0.70	-1.0
3,558,621	-	DZA65_RS16410	0.70	-0.6
3,558,621	-	DZA65_RS16410	0.70	-0.3
3,558,621	-	DZA65_RS16410	0.70	+0.2
3,558,621	-	DZA65_RS16410	0.70	-0.3
3,558,667	+	DZA65_RS16410	0.72	-0.8
3,558,668	-	DZA65_RS16410	0.72	-0.4
3,558,670	+	DZA65_RS16410	0.72	+0.2
3,558,670	+	DZA65_RS16410	0.72	+0.1
3,558,670	+	DZA65_RS16410	0.72	+0.4
3,558,671	-	DZA65_RS16410	0.72	-1.3
3,558,671	-	DZA65_RS16410	0.72	+0.2
3,558,671	-	DZA65_RS16410	0.72	-0.0
3,558,671	-	DZA65_RS16410	0.72	+0.6
3,558,671	-	DZA65_RS16410	0.72	+1.0
3,558,671	-	DZA65_RS16410	0.72	-0.9
3,558,671	-	DZA65_RS16410	0.72	-0.0
3,558,671	-	DZA65_RS16410	0.72	+0.6
3,558,698	+	DZA65_RS16410	0.74	+1.0
3,558,699	-	DZA65_RS16410	0.74	-0.2
3,558,708	-	DZA65_RS16410	0.74	-0.8
3,558,848	+	DZA65_RS16410	0.80	+1.0
3,558,848	+	DZA65_RS16410	0.80	-0.6
3,558,848	+	DZA65_RS16410	0.80	-2.3
3,558,848	+	DZA65_RS16410	0.80	+0.8
3,558,848	+	DZA65_RS16410	0.80	+0.6
3,558,848	+	DZA65_RS16410	0.80	+0.1
3,558,849	-	DZA65_RS16410	0.80	-1.7
3,558,849	-	DZA65_RS16410	0.80	+0.7
3,558,849	-	DZA65_RS16410	0.80	-0.1
3,558,849	-	DZA65_RS16410	0.80	-2.5
3,558,849	-	DZA65_RS16410	0.80	+1.0
3,558,867	+	DZA65_RS16410	0.80	-1.0
3,558,867	+	DZA65_RS16410	0.80	-1.1
3,558,867	+	DZA65_RS16410	0.80	-0.3
3,558,867	+	DZA65_RS16410	0.80	+0.5
3,558,867	+	DZA65_RS16410	0.80	-0.5
3,558,867	+	DZA65_RS16410	0.80	-0.2
3,558,868	-	DZA65_RS16410	0.80	-0.0
3,558,868	-	DZA65_RS16410	0.80	-1.2
3,558,868	-	DZA65_RS16410	0.80	-1.3
3,558,868	-	DZA65_RS16410	0.80	+1.8
3,558,868	-	DZA65_RS16410	0.80	-1.0
3,558,868	-	DZA65_RS16410	0.80	-1.6
3,558,868	-	DZA65_RS16410	0.80	+0.4
3,558,869	+	DZA65_RS16410	0.80	-0.0
3,558,869	+	DZA65_RS16410	0.80	-0.0
3,558,869	+			-0.0
3,558,870	-	DZA65_RS16410	0.80	+1.0
3,558,870	-	DZA65_RS16410	0.80	-1.0
3,558,870	-	DZA65_RS16410	0.80	-0.0
3,558,870	-	DZA65_RS16410	0.80	-1.1
3,558,952	+	DZA65_RS16410	0.84	-0.3
3,558,953	-	DZA65_RS16410	0.84	-0.3
3,558,953	-	DZA65_RS16410	0.84	+0.2
3,558,953	-	DZA65_RS16410	0.84	+0.5
3,559,008	+	DZA65_RS16410	0.86	+0.3
3,559,008	+	DZA65_RS16410	0.86	+1.2
3,559,008	+	DZA65_RS16410	0.86	-0.1
3,559,008	+	DZA65_RS16410	0.86	-0.2
3,559,008	+	DZA65_RS16410	0.86	-1.1
3,559,008	+	DZA65_RS16410	0.86	-0.2
3,559,008	+	DZA65_RS16410	0.86	+1.0
3,559,008	+	DZA65_RS16410	0.86	-0.8
3,559,009	-	DZA65_RS16410	0.86	+0.5
3,559,009	-	DZA65_RS16410	0.86	-0.6
3,559,009	-	DZA65_RS16410	0.86	-0.0
3,559,009	-	DZA65_RS16410	0.86	+0.3
3,559,025	-	DZA65_RS16410	0.87	-1.0
3,559,025	-	DZA65_RS16410	0.87	-1.3
3,559,042	+	DZA65_RS16410	0.87	+0.0
3,559,042	+	DZA65_RS16410	0.87	-1.2
3,559,042	+	DZA65_RS16410	0.87	-0.3
3,559,043	-	DZA65_RS16410	0.87	-1.0
3,559,043	-	DZA65_RS16410	0.87	-0.0
3,559,043	-	DZA65_RS16410	0.87	-1.2
3,559,069	+	DZA65_RS16410	0.89	-0.6
3,559,069	+	DZA65_RS16410	0.89	-0.0
3,559,069	+	DZA65_RS16410	0.89	-0.8
3,559,070	-	DZA65_RS16410	0.89	-0.3
3,559,070	-	DZA65_RS16410	0.89	-0.3
3,559,070	-	DZA65_RS16410	0.89	-0.2
3,559,070	-	DZA65_RS16410	0.89	-0.9
3,559,070	-			-1.9
3,559,070	-	DZA65_RS16410	0.89	-1.0
3,559,070	-	DZA65_RS16410	0.89	+0.5
3,559,070	-	DZA65_RS16410	0.89	-1.5
3,559,070	-	DZA65_RS16410	0.89	-0.0
3,559,070	-	DZA65_RS16410	0.89	-0.9
3,559,070	-	DZA65_RS16410	0.89	+0.2
3,559,094	+	DZA65_RS16410	0.90	-0.6
3,559,094	+	DZA65_RS16410	0.90	-0.3
3,559,094	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.7
3,559,094	+	DZA65_RS16410	0.90	-0.0
3,559,095	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.6
3,559,095	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.2
3,559,095	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.8
3,559,095	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.6
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.8
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	-1.0
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	-1.3
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	-0.2
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	-2.2
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	-0.6
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.6
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.3
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	+1.0
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.4
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	-0.0
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	-1.6
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.3
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.2
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	+1.6
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	-0.2
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	+1.6
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	-2.2
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.5
3,559,096	+	DZA65_RS16410	0.90	-1.1
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	+0.4
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-1.6
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.0
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.2
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.3
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-1.6
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.5
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.0
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.1
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-1.3
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-1.0
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.1
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.8
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	+0.1
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-1.3
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.6
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.8
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	+0.1
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.6
3,559,097	-			-0.6
3,559,097	-	DZA65_RS16410	0.90	+0.4
3,559,100	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.4
3,559,100	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.1
3,559,100	+	DZA65_RS16410	0.90	+0.1
3,559,100	+	DZA65_RS16410	0.90	-1.3
3,559,100	+	DZA65_RS16410	0.90	+1.4
3,559,101	-	DZA65_RS16410	0.90	-3.3
3,559,101	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.5
3,559,101	-	DZA65_RS16410	0.90	-0.6
3,559,101	-	DZA65_RS16410	0.90	+0.3
3,559,120	+			-2.6
3,559,120	+			-0.7
3,559,120	+			-0.8
3,559,120	+			-0.8
3,559,121	-			-0.0
3,559,121	-			+0.5
3,559,121	-			+2.0
3,559,121	-			-0.0
3,559,121	-			+0.4
3,559,121	-			-0.9
3,559,121	-			-1.3
3,559,121	-			+1.0
3,559,164	-			-0.6
3,559,270	+			+1.6
3,559,270	+			-0.4
3,559,271	-			-1.6
3,559,294	+			+0.7
3,559,295	-			-0.0
3,559,353	+			+1.1
3,559,354	-			-0.8
3,559,354	-			+0.2
3,559,354	-			+0.6
3,559,363	+			+1.0
3,559,363	+			+0.2
3,559,364	-			-0.6
3,559,364	-			-2.9
3,559,372	+			+0.4
3,559,450	-	DZA65_RS16415	0.16	-0.4
3,559,450	-	DZA65_RS16415	0.16	-0.9
3,559,465	+	DZA65_RS16415	0.19	-1.0
3,559,465	+	DZA65_RS16415	0.19	-0.8
3,559,551	+	DZA65_RS16415	0.33	-0.4
3,559,551	+	DZA65_RS16415	0.33	-0.3
3,559,551	+	DZA65_RS16415	0.33	-0.3
3,559,552	-	DZA65_RS16415	0.33	-1.0
3,559,552	-	DZA65_RS16415	0.33	-0.6
3,559,552	-	DZA65_RS16415	0.33	-1.0
3,559,552	-	DZA65_RS16415	0.33	+2.0
3,559,555	+	DZA65_RS16415	0.33	+0.6
3,559,555	+	DZA65_RS16415	0.33	-0.1
3,559,555	+	DZA65_RS16415	0.33	-1.6
3,559,555	+	DZA65_RS16415	0.33	-0.3
3,559,555	+	DZA65_RS16415	0.33	-0.0
3,559,555	+	DZA65_RS16415	0.33	+1.0
3,559,555	+	DZA65_RS16415	0.33	+0.2
3,559,555	+	DZA65_RS16415	0.33	+0.7
3,559,556	-			+0.2
3,559,556	-			-0.3
3,559,556	-	DZA65_RS16415	0.34	-0.8
3,559,556	-	DZA65_RS16415	0.34	-0.6
3,559,556	-	DZA65_RS16415	0.34	-0.0
3,559,556	-	DZA65_RS16415	0.34	-0.0
3,559,556	-	DZA65_RS16415	0.34	-0.0
3,559,581	+	DZA65_RS16415	0.38	+0.6
3,559,581	+	DZA65_RS16415	0.38	-0.8
3,559,581	+	DZA65_RS16415	0.38	-0.3
3,559,581	+	DZA65_RS16415	0.38	-0.4
3,559,582	-	DZA65_RS16415	0.38	-0.6
3,559,611	+	DZA65_RS16415	0.43	-1.6
3,559,611	+	DZA65_RS16415	0.43	-0.2
3,559,612	-	DZA65_RS16415	0.43	+0.1
3,559,612	-	DZA65_RS16415	0.43	+0.6
3,559,653	+	DZA65_RS16415	0.50	-0.0
3,559,653	+	DZA65_RS16415	0.50	-0.6
3,559,654	-	DZA65_RS16415	0.50	+1.2
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