Pairwise Alignments

Query, 334 a.a., nucleoid-associated protein from Pseudomonas simiae WCS417

Subject, 335 a.a., Nucleoid-associated protein PP_0973 from Pseudomonas putida KT2440

 Score =  608 bits (1569), Expect = e-179
 Identities = 295/333 (88%), Positives = 316/333 (94%)

Query: 1   MPIRHCIVHLIDKKPDGTPAVLHARDSELAESAAIENMLADLNESYNAKQGKAWGFFHAE 60
           MPIRHCIVHLIDKKPDG+PAVLHARDSELA S AIEN+LADLN+SYNAKQGKAWGFFH E
Sbjct: 1   MPIRHCIVHLIDKKPDGSPAVLHARDSELAASDAIENLLADLNDSYNAKQGKAWGFFHGE 60

Query: 61  SGAHPFSGWLKEYFDGGQDFTTFSRTAVEHLQKLMEESNLSTGGHVLFAHYQQGMTDYLA 120
           SGA+P SGWLK+Y D  +DFT FSR AVEHLQKLMEESNLSTGGH+LFAHYQQGMT+YLA
Sbjct: 61  SGAYPLSGWLKQYLDEEKDFTAFSRVAVEHLQKLMEESNLSTGGHILFAHYQQGMTEYLA 120

Query: 121 IALLHHSEGVAVTDELDVTPSRHLDLGQLHLAARINVSEWQNNKQSKQYISFIKGKNGKK 180
           IALLHHSEGVAV  +LDVTPSRHLDLGQLHLAARIN+SEW+NN+ S+QYISFIKGKNGKK
Sbjct: 121 IALLHHSEGVAVNAQLDVTPSRHLDLGQLHLAARINLSEWKNNQNSRQYISFIKGKNGKK 180

Query: 181 VSEYFRDFIGCQEGVDGPGETRTLLKAFSDFVESEDLPDESAREKTKTLVDYASSQAKLG 240
           VS+YFRDFIGCQEGVDGPGETRTLLKAFSDFVESEDLP+ESAREKT+TLV+YA++Q KLG
Sbjct: 181 VSDYFRDFIGCQEGVDGPGETRTLLKAFSDFVESEDLPEESAREKTQTLVEYATTQTKLG 240

Query: 241 EPMGLEELSGLIDEDRPKAFYDHIRNKDYGLSPEIPADKRTLNQFRRFTGRAEGLSISFE 300
           EP+ LEELS LIDEDRPKAFYDHIRNKDYGLSPEIPADKRTLNQFRRFTGRAEGLSISFE
Sbjct: 241 EPVTLEELSSLIDEDRPKAFYDHIRNKDYGLSPEIPADKRTLNQFRRFTGRAEGLSISFE 300

Query: 301 AHLLGDKIEYDEAAGTLIIKGLPTQLTDQLKRR 333
           AHLLGDK+EYDEAAGTLIIKGLPT L DQLKRR
Sbjct: 301 AHLLGDKVEYDEAAGTLIIKGLPTTLVDQLKRR 333