Private Fitness
Home
Find Gene
BLAST
Experiments
Organisms
Help
Gene
Fitness
Nearby
Cofit
Protein
Homologs
Top cofit genes for AMB_RS16780 from
Magnetospirillum magneticum AMB-1
plasmid pRiA4b ORF-3 family protein
SEED: TnpR protein
Rank
Hit
Name
Description
Conserved?
Cofitness
1
AMB
_RS18025
helix-turn-helix domain-containing protein
no
0.70
2
AMB
_RS07025
flagellar hook protein FlgE
no
0.70
3
AMB
_RS06000
replication protein
no
0.68
4
AMB
_RS05320
IS3 family transposase
no
0.67
5
AMB
_RS19840
hypothetical protein
no
0.67
6
AMB
_RS21660
hypothetical protein
no
0.67
7
AMB
_RS13235
cytochrome c553
no
0.66
8
AMB
_RS03500
DNA-protecting protein DprA
no
0.66
9
AMB
_RS05375
helix-turn-helix domain-containing protein
no
0.66
10
AMB
_RS06580
DUF1007 domain-containing protein
no
0.65
11
AMB
_RS24630
IS3 family transposase
no
0.65
12
AMB
_RS18135
enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein
no
0.65
13
AMB
_RS11065
hypothetical protein
no
0.65
14
AMB
_RS03655
hypothetical protein
no
0.64
15
AMB
_RS05250
hypothetical protein
no
0.64
16
AMB
_RS12375
response regulator
no
0.64
17
AMB
_RS07775
phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase
no
0.64
18
AMB
_RS16250
hypothetical protein
no
0.63
19
AMB
_RS20995
carboxypeptidase regulatory-like domain-containing protein
no
0.63
20
AMB
_RS03085
S-adenosylmethionine:tRNA ribosyltransferase-isomerase
no
0.63
Or look for
negative cofitness